MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 1375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	GCG	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921868
2	NC_010679	CCG	3	9	213	221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921868
3	NC_010679	GCC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921868
4	NC_010679	CGC	2	6	283	288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921868
5	NC_010679	TGC	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921868
6	NC_010679	GTT	2	6	364	369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921868
7	NC_010679	GTC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921868
8	NC_010679	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921869
9	NC_010679	ATC	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921869
10	NC_010679	CGT	2	6	955	960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921869
11	NC_010679	AGC	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
12	NC_010679	AGC	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
13	NC_010679	GCC	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921869
14	NC_010679	GTG	3	9	1134	1142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921869
15	NC_010679	CGA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
16	NC_010679	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921869
17	NC_010679	ACA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921869
18	NC_010679	CAA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921869
19	NC_010679	ATC	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921869
20	NC_010679	CTG	2	6	1610	1615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921869
21	NC_010679	CGT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921869
22	NC_010679	GCA	2	6	1659	1664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
23	NC_010679	GCT	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921869
24	NC_010679	AAC	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921869
25	NC_010679	TCA	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921869
26	NC_010679	GCC	3	9	1769	1777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921869
27	NC_010679	TGT	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921869
28	NC_010679	GAC	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
29	NC_010679	CGG	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921869
30	NC_010679	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921869
31	NC_010679	ACA	3	9	2058	2066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921869
32	NC_010679	CAG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921869
33	NC_010679	CGG	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921869
34	NC_010679	CAT	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921869
35	NC_010679	TCA	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921869
36	NC_010679	CGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
37	NC_010679	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
38	NC_010679	ACG	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
39	NC_010679	GCA	2	6	2617	2622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
40	NC_010679	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
41	NC_010679	GAC	2	6	2683	2688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
42	NC_010679	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921870
43	NC_010679	GCG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921870
44	NC_010679	GCT	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
45	NC_010679	GTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921870
46	NC_010679	GGC	2	6	3154	3159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921870
47	NC_010679	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921870
48	NC_010679	CGA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
49	NC_010679	TGC	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
50	NC_010679	TGC	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
51	NC_010679	ACG	2	6	3419	3424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921870
52	NC_010679	CGG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921870
53	NC_010679	GCT	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921870
54	NC_010679	TCA	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921870
55	NC_010679	GTT	2	6	3769	3774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921870
56	NC_010679	ACG	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921871
57	NC_010679	ACG	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921871
58	NC_010679	GGC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921871
59	NC_010679	GCC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921871
60	NC_010679	CAG	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921871
61	NC_010679	CGC	2	6	4216	4221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921871
62	NC_010679	GAA	2	6	4253	4258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921871
63	NC_010679	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921871
64	NC_010679	GCG	2	6	4282	4287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921871
65	NC_010679	TGC	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921871
66	NC_010679	CGG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921871
67	NC_010679	GCC	2	6	4571	4576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921871
68	NC_010679	TTC	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921871
69	NC_010679	CGT	3	9	4727	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
70	NC_010679	GTT	3	9	4776	4784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921872
71	NC_010679	TGC	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
72	NC_010679	ATG	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921872
73	NC_010679	GCG	2	6	5004	5009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921872
74	NC_010679	ACG	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921872
75	NC_010679	CAT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921872
76	NC_010679	ACT	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921872
77	NC_010679	TGC	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
78	NC_010679	AGC	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921872
79	NC_010679	GGC	2	6	5559	5564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921872
80	NC_010679	TGC	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
81	NC_010679	CGA	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921872
82	NC_010679	GTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
83	NC_010679	CAA	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921872
84	NC_010679	GCT	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
85	NC_010679	GAA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921872
86	NC_010679	CTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
87	NC_010679	GAC	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921872
88	NC_010679	TCG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921872
89	NC_010679	CGC	2	6	6320	6325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921872
90	NC_010679	ACA	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921872
91	NC_010679	CGC	2	6	6465	6470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921872
92	NC_010679	AGC	2	6	6569	6574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921872
93	NC_010679	GAA	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921872
94	NC_010679	AAG	2	6	6719	6724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921873
95	NC_010679	TCA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921873
96	NC_010679	GAC	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921873
97	NC_010679	ATG	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921873
98	NC_010679	ACG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921873
99	NC_010679	CAA	2	6	7378	7383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921873
100	NC_010679	ACA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921873
101	NC_010679	AAG	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921873
102	NC_010679	TCA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921873
103	NC_010679	CCG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921873
104	NC_010679	TAC	2	6	7712	7717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921873
105	NC_010679	GCT	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921874
106	NC_010679	GCC	2	6	7965	7970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921874
107	NC_010679	GGC	4	12	8160	8171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921874
108	NC_010679	GGC	2	6	8190	8195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921874
109	NC_010679	GGC	2	6	8306	8311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921874
110	NC_010679	CGG	2	6	8351	8356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921874
111	NC_010679	CAA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921874
112	NC_010679	TCG	2	6	8404	8409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921874
113	NC_010679	TCG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921874
114	NC_010679	AAT	2	6	8495	8500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187921875
115	NC_010679	CAA	2	6	8591	8596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921875
116	NC_010679	CAA	2	6	8642	8647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921875
117	NC_010679	ACC	2	6	8685	8690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921875
118	NC_010679	CAA	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921875
119	NC_010679	TCT	2	6	8924	8929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921875
120	NC_010679	CGG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921875
121	NC_010679	TGA	2	6	9052	9057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921875
122	NC_010679	CTA	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921875
123	NC_010679	CGG	2	6	9269	9274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921875
124	NC_010679	ACG	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921875
125	NC_010679	CGA	2	6	9389	9394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921875
126	NC_010679	ACT	2	6	9521	9526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921875
127	NC_010679	GTC	2	6	9599	9604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921875
128	NC_010679	CGG	2	6	9740	9745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921875
129	NC_010679	TCA	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921876
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253	NC_010679	GGC	2	6	20338	20343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921886
254	NC_010679	CGC	2	6	20349	20354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921886
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498	NC_010679	ACT	2	6	44417	44422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921932
499	NC_010679	AAC	2	6	44435	44440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921932
500	NC_010679	CGT	2	6	44513	44518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921933

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