MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 2064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010679	GGC	2	6	85733	85738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921982
1502	NC_010679	ACATGA	2	12	85752	85763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187921982
1503	NC_010679	TGA	2	6	85879	85884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921982
1504	NC_010679	TCT	2	6	85888	85893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921983
1505	NC_010679	ATTCC	2	10	85938	85947	20 %	40 %	0 %	40 %	187921983
1506	NC_010679	GAC	2	6	85956	85961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921983
1507	NC_010679	CAC	2	6	86144	86149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921983
1508	NC_010679	ATCT	2	8	86179	86186	25 %	50 %	0 %	25 %	187921983
1509	NC_010679	CAGG	2	8	86197	86204	25 %	0 %	50 %	25 %	187921983
1510	NC_010679	CAT	2	6	86246	86251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921983
1511	NC_010679	GGC	2	6	86267	86272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921983
1512	NC_010679	AG	4	8	86378	86385	50 %	0 %	50 %	0 %	187921983
1513	NC_010679	AAG	2	6	86409	86414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921983
1514	NC_010679	GCT	2	6	86423	86428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921983
1515	NC_010679	GTGCC	2	10	86441	86450	0 %	20 %	40 %	40 %	187921983
1516	NC_010679	TGA	2	6	86485	86490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921983
1517	NC_010679	AAG	2	6	86544	86549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921983
1518	NC_010679	GGT	2	6	86772	86777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921983
1519	NC_010679	AAC	2	6	86802	86807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921983
1520	NC_010679	GCC	2	6	86828	86833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921983
1521	NC_010679	GTC	2	6	86840	86845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921983
1522	NC_010679	GGCGAC	2	12	87112	87123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187921984
1523	NC_010679	GGT	2	6	87130	87135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921984
1524	NC_010679	TTC	2	6	87162	87167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921984
1525	NC_010679	TGG	2	6	87213	87218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921984
1526	NC_010679	GTG	2	6	87357	87362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921984
1527	NC_010679	CGA	2	6	87388	87393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1528	NC_010679	CAG	2	6	87483	87488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1529	NC_010679	GTCT	2	8	87547	87554	0 %	50 %	25 %	25 %	187921984
1530	NC_010679	GCA	2	6	87618	87623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1531	NC_010679	TGC	2	6	87688	87693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1532	NC_010679	TGA	2	6	87724	87729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921984
1533	NC_010679	CCT	2	6	87757	87762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187921984
1534	NC_010679	CTT	2	6	87800	87805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921984
1535	NC_010679	CTG	2	6	87860	87865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1536	NC_010679	CGT	2	6	87878	87883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1537	NC_010679	ACA	2	6	87888	87893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921984
1538	NC_010679	GCA	2	6	87915	87920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1539	NC_010679	CAGA	2	8	87947	87954	50 %	0 %	25 %	25 %	187921984
1540	NC_010679	TGAT	2	8	88113	88120	25 %	50 %	25 %	0 %	187921984
1541	NC_010679	GAC	2	6	88151	88156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921984
1542	NC_010679	TGA	2	6	88441	88446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921984
1543	NC_010679	ACA	2	6	88473	88478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921984
1544	NC_010679	CAT	2	6	88548	88553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921984
1545	NC_010679	GGT	2	6	88582	88587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921984
1546	NC_010679	TCA	2	6	88632	88637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921984
1547	NC_010679	TCT	2	6	88648	88653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921984
1548	NC_010679	TCAA	2	8	88850	88857	50 %	25 %	0 %	25 %	187921985
1549	NC_010679	GCG	2	6	88897	88902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921985
1550	NC_010679	AC	3	6	88966	88971	50 %	0 %	0 %	50 %	187921985
1551	NC_010679	ACG	2	6	89005	89010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1552	NC_010679	GACG	2	8	89021	89028	25 %	0 %	50 %	25 %	187921985
1553	NC_010679	GGT	2	6	89059	89064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921985
1554	NC_010679	AAC	2	6	89133	89138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921985
1555	NC_010679	ATGG	2	8	89165	89172	25 %	25 %	50 %	0 %	187921985
1556	NC_010679	TAC	2	6	89295	89300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921985
1557	NC_010679	TGAT	2	8	89317	89324	25 %	50 %	25 %	0 %	187921985
1558	NC_010679	TGC	2	6	89440	89445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1559	NC_010679	ATC	2	6	89448	89453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921985
1560	NC_010679	AG	3	6	89458	89463	50 %	0 %	50 %	0 %	187921985
1561	NC_010679	CAC	2	6	89647	89652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921985
1562	NC_010679	GTT	2	6	89664	89669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921985
1563	NC_010679	GATTC	2	10	89680	89689	20 %	40 %	20 %	20 %	187921985
1564	NC_010679	GT	3	6	89742	89747	0 %	50 %	50 %	0 %	187921985
1565	NC_010679	GTTG	2	8	89839	89846	0 %	50 %	50 %	0 %	187921985
1566	NC_010679	ATGG	2	8	89891	89898	25 %	25 %	50 %	0 %	187921985
1567	NC_010679	TGGT	2	8	89908	89915	0 %	50 %	50 %	0 %	187921985
1568	NC_010679	GAT	2	6	89972	89977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921985
1569	NC_010679	CGT	2	6	90007	90012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1570	NC_010679	CG	3	6	90030	90035	0 %	0 %	50 %	50 %	187921985
1571	NC_010679	GGAAAA	2	12	90089	90100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921985
1572	NC_010679	GGA	2	6	90120	90125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187921985
1573	NC_010679	AACG	2	8	90134	90141	50 %	0 %	25 %	25 %	187921985
1574	NC_010679	GCA	2	6	90182	90187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1575	NC_010679	GGAG	2	8	90194	90201	25 %	0 %	75 %	0 %	187921985
1576	NC_010679	GTC	2	6	90386	90391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1577	NC_010679	GATCA	2	10	90399	90408	40 %	20 %	20 %	20 %	187921985
1578	NC_010679	GGC	2	6	90431	90436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921985
1579	NC_010679	TCAT	2	8	90593	90600	25 %	50 %	0 %	25 %	187921985
1580	NC_010679	GCG	2	6	90625	90630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921985
1581	NC_010679	ACG	2	6	90643	90648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1582	NC_010679	CGT	2	6	90661	90666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1583	NC_010679	GAC	2	6	90684	90689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921985
1584	NC_010679	GCGTC	2	10	90762	90771	0 %	20 %	40 %	40 %	187921985
1585	NC_010679	ACC	2	6	90784	90789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921985
1586	NC_010679	GATC	2	8	90812	90819	25 %	25 %	25 %	25 %	187921985
1587	NC_010679	GAA	2	6	90883	90888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921985
1588	NC_010679	AGGC	2	8	90899	90906	25 %	0 %	50 %	25 %	187921986
1589	NC_010679	GCC	2	6	90955	90960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921986
1590	NC_010679	GAGG	2	8	90991	90998	25 %	0 %	75 %	0 %	187921986
1591	NC_010679	TCAA	2	8	91187	91194	50 %	25 %	0 %	25 %	187921986
1592	NC_010679	GCT	2	6	91219	91224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921986
1593	NC_010679	CG	3	6	91308	91313	0 %	0 %	50 %	50 %	187921987
1594	NC_010679	CGCTA	2	10	91362	91371	20 %	20 %	20 %	40 %	187921987
1595	NC_010679	TGA	2	6	91463	91468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921987
1596	NC_010679	GGCCG	2	10	91477	91486	0 %	0 %	60 %	40 %	187921987
1597	NC_010679	TGAA	2	8	91522	91529	50 %	25 %	25 %	0 %	187921987
1598	NC_010679	A	6	6	91604	91609	100 %	0 %	0 %	0 %	187921988
1599	NC_010679	CGG	2	6	91655	91660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921988
1600	NC_010679	GGC	2	6	91662	91667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921988
1601	NC_010679	ACC	2	6	91729	91734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921988
1602	NC_010679	CGCCGG	2	12	91746	91757	0 %	0 %	50 %	50 %	187921988
1603	NC_010679	GTGG	2	8	91816	91823	0 %	25 %	75 %	0 %	187921988
1604	NC_010679	GAT	2	6	92003	92008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921989
1605	NC_010679	TTGG	2	8	92088	92095	0 %	50 %	50 %	0 %	187921989
1606	NC_010679	GGA	2	6	92096	92101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187921989
1607	NC_010679	TTCG	2	8	92134	92141	0 %	50 %	25 %	25 %	187921989
1608	NC_010679	CGC	2	6	92158	92163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921989
1609	NC_010679	CG	3	6	92279	92284	0 %	0 %	50 %	50 %	187921989
1610	NC_010679	CT	3	6	92462	92467	0 %	50 %	0 %	50 %	187921989
1611	NC_010679	GTC	2	6	92480	92485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921989
1612	NC_010679	TACGT	2	10	92494	92503	20 %	40 %	20 %	20 %	187921989
1613	NC_010679	CTG	2	6	92557	92562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921989
1614	NC_010679	CGCTCA	2	12	92689	92700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187921989
1615	NC_010679	GGC	2	6	92715	92720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921989
1616	NC_010679	CCAT	2	8	92743	92750	25 %	25 %	0 %	50 %	187921989
1617	NC_010679	CTG	2	6	92827	92832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921989
1618	NC_010679	ACG	2	6	92881	92886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921989
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1620	NC_010679	CCA	2	6	92957	92962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921989
1621	NC_010679	TCCGA	2	10	92991	93000	20 %	20 %	20 %	40 %	187921989
1622	NC_010679	CATT	2	8	93097	93104	25 %	50 %	0 %	25 %	187921989
1623	NC_010679	GGA	2	6	93119	93124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187921989
1624	NC_010679	CGA	2	6	93140	93145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921989
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1626	NC_010679	CGA	2	6	93223	93228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921990
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1991	NC_010679	GC	3	6	116422	116427	0 %	0 %	50 %	50 %	187922026
1992	NC_010679	TCCGA	2	10	116560	116569	20 %	20 %	20 %	40 %	187922027
1993	NC_010679	CCCA	2	8	116591	116598	25 %	0 %	0 %	75 %	187922027
1994	NC_010679	ACT	2	6	116662	116667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922027
1995	NC_010679	AAC	2	6	116690	116695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922028
1996	NC_010679	GC	3	6	116752	116757	0 %	0 %	50 %	50 %	187922028
1997	NC_010679	CCG	2	6	116759	116764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922028
1998	NC_010679	GCG	2	6	116768	116773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922028
1999	NC_010679	GAA	2	6	116856	116861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922028
2000	NC_010679	GAA	2	6	117163	117168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922029

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