MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 2064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010679	TGC	2	6	29224	29229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921900
502	NC_010679	CCG	2	6	29263	29268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
503	NC_010679	CCG	2	6	29312	29317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
504	NC_010679	AGCG	2	8	29373	29380	25 %	0 %	50 %	25 %	187921900
505	NC_010679	GTA	2	6	29436	29441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921900
506	NC_010679	CGA	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921900
507	NC_010679	GCGAG	2	10	29624	29633	20 %	0 %	60 %	20 %	187921900
508	NC_010679	GT	3	6	29658	29663	0 %	50 %	50 %	0 %	187921900
509	NC_010679	ACGA	2	8	29677	29684	50 %	0 %	25 %	25 %	187921900
510	NC_010679	CGT	3	9	29691	29699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921900
511	NC_010679	GCC	2	6	29769	29774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
512	NC_010679	CGA	2	6	29780	29785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921900
513	NC_010679	GCGTCA	2	12	29810	29821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187921900
514	NC_010679	GCCGA	2	10	29851	29860	20 %	0 %	40 %	40 %	187921900
515	NC_010679	CAC	2	6	29931	29936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921900
516	NC_010679	GCC	2	6	30027	30032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
517	NC_010679	GCC	2	6	30063	30068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
518	NC_010679	ACC	3	9	30069	30077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921900
519	NC_010679	GCC	2	6	30078	30083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
520	NC_010679	CGC	2	6	30132	30137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
521	NC_010679	ATG	2	6	30359	30364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921901
522	NC_010679	GCA	2	6	30452	30457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921901
523	NC_010679	CGG	2	6	30484	30489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921901
524	NC_010679	CGCT	2	8	30534	30541	0 %	25 %	25 %	50 %	187921901
525	NC_010679	GTT	2	6	30545	30550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921901
526	NC_010679	GGCC	2	8	30580	30587	0 %	0 %	50 %	50 %	187921901
527	NC_010679	CGG	2	6	30594	30599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921901
528	NC_010679	CGCC	2	8	30639	30646	0 %	0 %	25 %	75 %	187921901
529	NC_010679	CGG	2	6	30663	30668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921901
530	NC_010679	ATG	2	6	30743	30748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921901
531	NC_010679	TTG	2	6	30785	30790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921901
532	NC_010679	CGC	2	6	30820	30825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921901
533	NC_010679	GCC	2	6	30833	30838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921901
534	NC_010679	CCG	2	6	30860	30865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921901
535	NC_010679	CCG	2	6	30939	30944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921901
536	NC_010679	AGC	2	6	30959	30964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921901
537	NC_010679	GCA	2	6	30980	30985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921901
538	NC_010679	AC	3	6	30988	30993	50 %	0 %	0 %	50 %	187921901
539	NC_010679	GATT	2	8	31238	31245	25 %	50 %	25 %	0 %	187921902
540	NC_010679	GGA	2	6	31284	31289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187921902
541	NC_010679	TC	3	6	31304	31309	0 %	50 %	0 %	50 %	187921902
542	NC_010679	GCGA	2	8	31324	31331	25 %	0 %	50 %	25 %	187921902
543	NC_010679	TTG	2	6	31355	31360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921902
544	NC_010679	CTT	2	6	31376	31381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921902
545	NC_010679	GCG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921902
546	NC_010679	GCC	2	6	31832	31837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921904
547	NC_010679	CGC	2	6	31859	31864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921904
548	NC_010679	CGA	2	6	31909	31914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921904
549	NC_010679	CGG	2	6	32073	32078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921905
550	NC_010679	TTGC	2	8	32162	32169	0 %	50 %	25 %	25 %	187921905
551	NC_010679	CGT	2	6	32188	32193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921906
552	NC_010679	TGC	2	6	32206	32211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921906
553	NC_010679	GAA	2	6	32242	32247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921906
554	NC_010679	GCG	2	6	32262	32267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921906
555	NC_010679	TCT	2	6	32393	32398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921906
556	NC_010679	GCCGA	2	10	32525	32534	20 %	0 %	40 %	40 %	187921906
557	NC_010679	GCC	2	6	32698	32703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921907
558	NC_010679	CG	3	6	32822	32827	0 %	0 %	50 %	50 %	187921907
559	NC_010679	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	187921907
560	NC_010679	CAC	3	9	32935	32943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921908
561	NC_010679	GCC	2	6	32987	32992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921908
562	NC_010679	TTA	2	6	33029	33034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187921908
563	NC_010679	GC	3	6	33145	33150	0 %	0 %	50 %	50 %	187921909
564	NC_010679	TGT	3	9	33171	33179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921909
565	NC_010679	CGG	2	6	33180	33185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921909
566	NC_010679	TAA	2	6	33207	33212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187921909
567	NC_010679	CGTC	2	8	33213	33220	0 %	25 %	25 %	50 %	187921909
568	NC_010679	GCA	2	6	33350	33355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921909
569	NC_010679	CAA	2	6	33519	33524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921910
570	NC_010679	CGG	2	6	33542	33547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921910
571	NC_010679	CGC	2	6	33635	33640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921910
572	NC_010679	TCG	2	6	33689	33694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921910
573	NC_010679	CCGG	2	8	33700	33707	0 %	0 %	50 %	50 %	187921910
574	NC_010679	GGT	2	6	33717	33722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921910
575	NC_010679	CG	3	6	33735	33740	0 %	0 %	50 %	50 %	187921910
576	NC_010679	GC	3	6	33759	33764	0 %	0 %	50 %	50 %	187921910
577	NC_010679	GATA	2	8	33768	33775	50 %	25 %	25 %	0 %	187921910
578	NC_010679	TCG	2	6	33821	33826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921910
579	NC_010679	TCGC	2	8	33868	33875	0 %	25 %	25 %	50 %	187921910
580	NC_010679	CTCG	2	8	33928	33935	0 %	25 %	25 %	50 %	187921910
581	NC_010679	TTC	2	6	33970	33975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921910
582	NC_010679	TCA	2	6	33978	33983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921910
583	NC_010679	TCC	2	6	33990	33995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187921911
584	NC_010679	CGT	2	6	34126	34131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921911
585	NC_010679	TC	3	6	34135	34140	0 %	50 %	0 %	50 %	187921911
586	NC_010679	GTT	2	6	34160	34165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921911
587	NC_010679	CG	3	6	34186	34191	0 %	0 %	50 %	50 %	187921911
588	NC_010679	GCA	2	6	34200	34205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921911
589	NC_010679	CTGG	2	8	34302	34309	0 %	25 %	50 %	25 %	187921912
590	NC_010679	TGCTT	2	10	34420	34429	0 %	60 %	20 %	20 %	187921912
591	NC_010679	GCGT	2	8	34592	34599	0 %	25 %	50 %	25 %	187921912
592	NC_010679	GACG	2	8	34742	34749	25 %	0 %	50 %	25 %	187921913
593	NC_010679	GCG	2	6	34898	34903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921913
594	NC_010679	ACT	2	6	34921	34926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921913
595	NC_010679	GAAC	2	8	34976	34983	50 %	0 %	25 %	25 %	187921913
596	NC_010679	TCG	2	6	35000	35005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921913
597	NC_010679	GCCA	2	8	35108	35115	25 %	0 %	25 %	50 %	187921914
598	NC_010679	CAACG	2	10	35182	35191	40 %	0 %	20 %	40 %	187921914
599	NC_010679	CAA	2	6	35245	35250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921914
600	NC_010679	GCT	2	6	35339	35344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921914
601	NC_010679	GCCG	2	8	35387	35394	0 %	0 %	50 %	50 %	187921914
602	NC_010679	CGA	2	6	35407	35412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921914
603	NC_010679	GCC	2	6	35630	35635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921915
604	NC_010679	GCT	2	6	35665	35670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921915
605	NC_010679	CGGG	2	8	35725	35732	0 %	0 %	75 %	25 %	187921915
606	NC_010679	CAC	2	6	35740	35745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921915
607	NC_010679	GCC	2	6	35762	35767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921915
608	NC_010679	AC	3	6	35768	35773	50 %	0 %	0 %	50 %	187921915
609	NC_010679	TCG	2	6	35781	35786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921915
610	NC_010679	TGCCG	2	10	35792	35801	0 %	20 %	40 %	40 %	187921915
611	NC_010679	CCG	2	6	35826	35831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921915
612	NC_010679	CG	3	6	35867	35872	0 %	0 %	50 %	50 %	187921915
613	NC_010679	ACA	2	6	35922	35927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921915
614	NC_010679	GCC	2	6	35953	35958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921915
615	NC_010679	GC	3	6	36041	36046	0 %	0 %	50 %	50 %	187921916
616	NC_010679	CTT	2	6	36057	36062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921916
617	NC_010679	ACG	2	6	36069	36074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921916
618	NC_010679	TGT	2	6	36171	36176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921916
619	NC_010679	AT	3	6	36249	36254	50 %	50 %	0 %	0 %	187921916
620	NC_010679	CAT	2	6	36321	36326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921916
621	NC_010679	CGA	2	6	36333	36338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921916
622	NC_010679	TGC	2	6	36374	36379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921916
623	NC_010679	CGT	2	6	36409	36414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921916
624	NC_010679	ACA	2	6	36419	36424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187921916
625	NC_010679	CTTTC	2	10	36430	36439	0 %	60 %	0 %	40 %	187921916
626	NC_010679	GCAA	2	8	36440	36447	50 %	0 %	25 %	25 %	187921916
627	NC_010679	CTG	2	6	36451	36456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921916
628	NC_010679	TGCGAT	2	12	36460	36471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187921916
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