MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 2

Total Repeats: 2511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010676	ACCGC	2	10	3095	3104	20 %	0 %	20 %	60 %	187918718
2	NC_010676	GGCGC	2	10	3302	3311	0 %	0 %	60 %	40 %	187918718
3	NC_010676	TCGGA	2	10	3675	3684	20 %	20 %	40 %	20 %	187918718
4	NC_010676	GAGCG	2	10	3864	3873	20 %	0 %	60 %	20 %	187918718
5	NC_010676	ACGGT	2	10	4343	4352	20 %	20 %	40 %	20 %	187918719
6	NC_010676	GAAGC	2	10	5071	5080	40 %	0 %	40 %	20 %	187918719
7	NC_010676	CTGCG	2	10	5123	5132	0 %	20 %	40 %	40 %	187918719
8	NC_010676	CTGCG	2	10	8130	8139	0 %	20 %	40 %	40 %	187918723
9	NC_010676	GACGT	2	10	13289	13298	20 %	20 %	40 %	20 %	187918725
10	NC_010676	CGAAG	2	10	14282	14291	40 %	0 %	40 %	20 %	187918726
11	NC_010676	TGCGG	2	10	15498	15507	0 %	20 %	60 %	20 %	187918727
12	NC_010676	CGTGT	2	10	18580	18589	0 %	40 %	40 %	20 %	187918728
13	NC_010676	AACCA	2	10	20529	20538	60 %	0 %	0 %	40 %	187918731
14	NC_010676	CACGG	2	10	23116	23125	20 %	0 %	40 %	40 %	187918734
15	NC_010676	GCGTT	2	10	23525	23534	0 %	40 %	40 %	20 %	187918735
16	NC_010676	TGCGG	2	10	23652	23661	0 %	20 %	60 %	20 %	187918736
17	NC_010676	CGGCG	2	10	23771	23780	0 %	0 %	60 %	40 %	187918736
18	NC_010676	GCGTG	2	10	25505	25514	0 %	20 %	60 %	20 %	187918737
19	NC_010676	TGATC	2	10	27297	27306	20 %	40 %	20 %	20 %	187918739
20	NC_010676	CGGCC	2	10	27673	27682	0 %	0 %	40 %	60 %	187918739
21	NC_010676	GCTGC	2	10	29513	29522	0 %	20 %	40 %	40 %	187918741
22	NC_010676	AGCCG	2	10	30498	30507	20 %	0 %	40 %	40 %	187918742
23	NC_010676	TCGCG	2	10	31733	31742	0 %	20 %	40 %	40 %	187918743
24	NC_010676	GTGAT	2	10	33551	33560	20 %	40 %	40 %	0 %	187918744
25	NC_010676	CGACG	2	10	33660	33669	20 %	0 %	40 %	40 %	187918744
26	NC_010676	ACCGT	2	10	34142	34151	20 %	20 %	20 %	40 %	187918744
27	NC_010676	AGCGA	2	10	34860	34869	40 %	0 %	40 %	20 %	187918745
28	NC_010676	GCGAC	2	10	40553	40562	20 %	0 %	40 %	40 %	187918749
29	NC_010676	GACGT	2	10	41053	41062	20 %	20 %	40 %	20 %	187918749
30	NC_010676	GCGAA	2	10	41310	41319	40 %	0 %	40 %	20 %	187918750
31	NC_010676	GTTCG	2	10	41845	41854	0 %	40 %	40 %	20 %	187918750
32	NC_010676	CGATC	2	10	42228	42237	20 %	20 %	20 %	40 %	187918751
33	NC_010676	GCCTT	2	10	42308	42317	0 %	40 %	20 %	40 %	187918751
34	NC_010676	CGGCG	2	10	42706	42715	0 %	0 %	60 %	40 %	187918751
35	NC_010676	CAGCA	2	10	44161	44170	40 %	0 %	20 %	40 %	187918753
36	NC_010676	GCCGC	2	10	44516	44525	0 %	0 %	40 %	60 %	187918754
37	NC_010676	GCGGG	2	10	45706	45715	0 %	0 %	80 %	20 %	187918756
38	NC_010676	CGATG	2	10	46180	46189	20 %	20 %	40 %	20 %	187918756
39	NC_010676	CAGTT	2	10	47451	47460	20 %	40 %	20 %	20 %	187918757
40	NC_010676	ACCGA	2	10	48608	48617	40 %	0 %	20 %	40 %	187918758
41	NC_010676	ACCGA	2	10	48719	48728	40 %	0 %	20 %	40 %	187918758
42	NC_010676	GCGCG	2	10	50264	50273	0 %	0 %	60 %	40 %	187918760
43	NC_010676	GCGAC	2	10	51370	51379	20 %	0 %	40 %	40 %	187918761
44	NC_010676	GTCAC	2	10	52943	52952	20 %	20 %	20 %	40 %	187918762
45	NC_010676	CGCGC	2	10	54051	54060	0 %	0 %	40 %	60 %	187918763
46	NC_010676	GATTC	2	10	61173	61182	20 %	40 %	20 %	20 %	187918770
47	NC_010676	GGCGT	2	10	62378	62387	0 %	20 %	60 %	20 %	187918771
48	NC_010676	CTTCG	2	10	63571	63580	0 %	40 %	20 %	40 %	187918772
49	NC_010676	GAGCC	2	10	64513	64522	20 %	0 %	40 %	40 %	187918773
50	NC_010676	TTGAT	2	10	70107	70116	20 %	60 %	20 %	0 %	187918776
51	NC_010676	CCAAC	2	10	75873	75882	40 %	0 %	0 %	60 %	187918781
52	NC_010676	CTGCG	2	10	75893	75902	0 %	20 %	40 %	40 %	187918781
53	NC_010676	CATCG	2	10	78944	78953	20 %	20 %	20 %	40 %	187918784
54	NC_010676	CATCG	2	10	79430	79439	20 %	20 %	20 %	40 %	187918784
55	NC_010676	GCCGC	2	10	81284	81293	0 %	0 %	40 %	60 %	187918786
56	NC_010676	TCGGA	2	10	82474	82483	20 %	20 %	40 %	20 %	187918788
57	NC_010676	GGCGC	2	10	82979	82988	0 %	0 %	60 %	40 %	187918789
58	NC_010676	CGTTG	2	10	83931	83940	0 %	40 %	40 %	20 %	187918790
59	NC_010676	GGCGT	2	10	84217	84226	0 %	20 %	60 %	20 %	187918790
60	NC_010676	CGGCG	2	10	84435	84444	0 %	0 %	60 %	40 %	187918790
61	NC_010676	CGACG	2	10	84786	84795	20 %	0 %	40 %	40 %	187918790
62	NC_010676	CGCGC	2	10	86435	86444	0 %	0 %	40 %	60 %	187918791
63	NC_010676	CGCTT	2	10	87997	88006	0 %	40 %	20 %	40 %	187918793
64	NC_010676	GCCGA	2	10	89275	89284	20 %	0 %	40 %	40 %	187918794
65	NC_010676	AGCGA	2	10	89401	89410	40 %	0 %	40 %	20 %	187918794
66	NC_010676	GCGCC	2	10	89609	89618	0 %	0 %	40 %	60 %	187918794
67	NC_010676	CGGCG	2	10	91337	91346	0 %	0 %	60 %	40 %	187918795
68	NC_010676	CACGT	2	10	92432	92441	20 %	20 %	20 %	40 %	187918795
69	NC_010676	TGCGC	2	10	93041	93050	0 %	20 %	40 %	40 %	187918795
70	NC_010676	TTTGC	2	10	93642	93651	0 %	60 %	20 %	20 %	187918795
71	NC_010676	GCCGC	2	10	93771	93780	0 %	0 %	40 %	60 %	187918795
72	NC_010676	GCGCG	2	10	96658	96667	0 %	0 %	60 %	40 %	187918795
73	NC_010676	GCCAC	2	10	96926	96935	20 %	0 %	20 %	60 %	187918795
74	NC_010676	CGTCT	2	10	97158	97167	0 %	40 %	20 %	40 %	187918795
75	NC_010676	GTGCG	2	10	99494	99503	0 %	20 %	60 %	20 %	187918795
76	NC_010676	GCGCA	2	10	100081	100090	20 %	0 %	40 %	40 %	187918796
77	NC_010676	ATCAC	2	10	100241	100250	40 %	20 %	0 %	40 %	187918796
78	NC_010676	ACGTG	2	10	102102	102111	20 %	20 %	40 %	20 %	187918796
79	NC_010676	GCGCG	2	10	103896	103905	0 %	0 %	60 %	40 %	187918796
80	NC_010676	GCGCC	2	10	104109	104118	0 %	0 %	40 %	60 %	187918796
81	NC_010676	TTGCA	2	10	104732	104741	20 %	40 %	20 %	20 %	187918796
82	NC_010676	TGATC	2	10	105199	105208	20 %	40 %	20 %	20 %	187918797
83	NC_010676	TCGCC	2	10	105247	105256	0 %	20 %	20 %	60 %	187918797
84	NC_010676	GCGCT	2	10	106951	106960	0 %	20 %	40 %	40 %	187918798
85	NC_010676	CGGAC	2	10	107928	107937	20 %	0 %	40 %	40 %	187918798
86	NC_010676	GCCGA	2	10	108223	108232	20 %	0 %	40 %	40 %	187918798
87	NC_010676	ACGAT	2	10	109602	109611	40 %	20 %	20 %	20 %	187918799
88	NC_010676	GCGAG	2	10	111311	111320	20 %	0 %	60 %	20 %	187918800
89	NC_010676	GCGCC	2	10	112133	112142	0 %	0 %	40 %	60 %	187918801
90	NC_010676	CACGC	2	10	112164	112173	20 %	0 %	20 %	60 %	187918801
91	NC_010676	ACGTC	2	10	112682	112691	20 %	20 %	20 %	40 %	187918802
92	NC_010676	GCGCG	2	10	112866	112875	0 %	0 %	60 %	40 %	187918802
93	NC_010676	GCGAC	2	10	113990	113999	20 %	0 %	40 %	40 %	187918802
94	NC_010676	AAAGA	2	10	115798	115807	80 %	0 %	20 %	0 %	187918803
95	NC_010676	CGAAG	2	10	117249	117258	40 %	0 %	40 %	20 %	187918803
96	NC_010676	GCGCG	2	10	118591	118600	0 %	0 %	60 %	40 %	187918805
97	NC_010676	GGTCC	2	10	119559	119568	0 %	20 %	40 %	40 %	187918806
98	NC_010676	GATTG	2	10	121821	121830	20 %	40 %	40 %	0 %	187918807
99	NC_010676	CGCGC	2	10	123688	123697	0 %	0 %	40 %	60 %	187918808
100	NC_010676	CGCGC	2	10	123899	123908	0 %	0 %	40 %	60 %	187918808
101	NC_010676	CGGCT	2	10	124519	124528	0 %	20 %	40 %	40 %	187918809
102	NC_010676	GCTCG	2	10	124563	124572	0 %	20 %	40 %	40 %	187918809
103	NC_010676	GCGTG	2	10	126744	126753	0 %	20 %	60 %	20 %	187918811
104	NC_010676	CGGCG	2	10	127021	127030	0 %	0 %	60 %	40 %	187918811
105	NC_010676	CGATC	2	10	128506	128515	20 %	20 %	20 %	40 %	187918813
106	NC_010676	GCTCG	2	10	133522	133531	0 %	20 %	40 %	40 %	187918817
107	NC_010676	GGCGA	2	10	134066	134075	20 %	0 %	60 %	20 %	187918818
108	NC_010676	TCGCT	2	10	136410	136419	0 %	40 %	20 %	40 %	187918820
109	NC_010676	CAGCG	2	10	137429	137438	20 %	0 %	40 %	40 %	187918821
110	NC_010676	GTCGC	2	10	138394	138403	0 %	20 %	40 %	40 %	187918822
111	NC_010676	GAGCC	2	10	139231	139240	20 %	0 %	40 %	40 %	187918823
112	NC_010676	GCGCC	2	10	139425	139434	0 %	0 %	40 %	60 %	187918823
113	NC_010676	GTCCG	2	10	140663	140672	0 %	20 %	40 %	40 %	187918824
114	NC_010676	ACGCA	2	10	143780	143789	40 %	0 %	20 %	40 %	187918826
115	NC_010676	CCGGT	2	10	143900	143909	0 %	20 %	40 %	40 %	187918826
116	NC_010676	GACGC	2	10	144312	144321	20 %	0 %	40 %	40 %	187918827
117	NC_010676	CGAAT	2	10	147965	147974	40 %	20 %	20 %	20 %	187918830
118	NC_010676	CGAGG	2	10	148226	148235	20 %	0 %	60 %	20 %	187918830
119	NC_010676	GCCGC	2	10	148318	148327	0 %	0 %	40 %	60 %	187918830
120	NC_010676	GTTGG	2	10	148968	148977	0 %	40 %	60 %	0 %	187918831
121	NC_010676	TCGAT	2	10	150497	150506	20 %	40 %	20 %	20 %	187918832
122	NC_010676	GTGCC	2	10	150755	150764	0 %	20 %	40 %	40 %	187918833
123	NC_010676	TGCGA	2	10	152658	152667	20 %	20 %	40 %	20 %	187918835
124	NC_010676	CGGCC	2	10	153612	153621	0 %	0 %	40 %	60 %	187918836
125	NC_010676	AGGCG	2	10	153792	153801	20 %	0 %	60 %	20 %	187918836
126	NC_010676	TGCCA	2	10	154678	154687	20 %	20 %	20 %	40 %	187918837
127	NC_010676	GCAAG	2	10	155370	155379	40 %	0 %	40 %	20 %	187918838
128	NC_010676	ATGGG	2	10	156873	156882	20 %	20 %	60 %	0 %	187918839
129	NC_010676	GGCTG	2	10	159031	159040	0 %	20 %	60 %	20 %	187918840
130	NC_010676	GAATG	2	10	160656	160665	40 %	20 %	40 %	0 %	187918842
131	NC_010676	GCTGT	2	10	162291	162300	0 %	40 %	40 %	20 %	187918843
132	NC_010676	TCGCC	2	10	165368	165377	0 %	20 %	20 %	60 %	187918846
133	NC_010676	AGCGC	2	10	166538	166547	20 %	0 %	40 %	40 %	187918847
134	NC_010676	GCGTC	2	10	169248	169257	0 %	20 %	40 %	40 %	187918849
135	NC_010676	CGCGA	2	10	169883	169892	20 %	0 %	40 %	40 %	187918850
136	NC_010676	GCCGG	2	10	169969	169978	0 %	0 %	60 %	40 %	187918850
137	NC_010676	GCGCA	2	10	170271	170280	20 %	0 %	40 %	40 %	187918850
138	NC_010676	CGCGA	2	10	170297	170306	20 %	0 %	40 %	40 %	187918850
139	NC_010676	GGCAT	2	10	171449	171458	20 %	20 %	40 %	20 %	187918851
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248	NC_010676	TCTGG	2	10	318264	318273	0 %	40 %	40 %	20 %	187918984
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252	NC_010676	CCGCA	2	10	327759	327768	20 %	0 %	20 %	60 %	187918994
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254	NC_010676	CTTCA	2	10	334395	334404	20 %	40 %	0 %	40 %	187919000
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259	NC_010676	CGCTG	2	10	338241	338250	0 %	20 %	40 %	40 %	187919004
260	NC_010676	GCAAG	2	10	341885	341894	40 %	0 %	40 %	20 %	187919008
261	NC_010676	AGTCG	2	10	346002	346011	20 %	20 %	40 %	20 %	187919012
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