MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01

Total Repeats: 38984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010625	CAG	2	6	169193	169198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3502	NC_010625	CGAA	2	8	169205	169212	50 %	0 %	25 %	25 %	186470479
3503	NC_010625	CGAT	2	8	169225	169232	25 %	25 %	25 %	25 %	186470479
3504	NC_010625	CGG	2	6	169238	169243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470479
3505	NC_010625	GTT	2	6	169259	169264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186470479
3506	NC_010625	CAG	2	6	169265	169270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3507	NC_010625	GT	3	6	169321	169326	0 %	50 %	50 %	0 %	186470479
3508	NC_010625	CAC	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470479
3509	NC_010625	CAG	2	6	169364	169369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3510	NC_010625	GC	3	6	169372	169377	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3511	NC_010625	TCG	2	6	169473	169478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3512	NC_010625	GCA	2	6	169561	169566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3513	NC_010625	GCG	2	6	169585	169590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470479
3514	NC_010625	AGC	2	6	169617	169622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3515	NC_010625	TTC	2	6	169661	169666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470479
3516	NC_010625	CG	3	6	169690	169695	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3517	NC_010625	GC	3	6	169717	169722	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3518	NC_010625	CGT	2	6	169742	169747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3519	NC_010625	GAT	2	6	169748	169753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470479
3520	NC_010625	AGA	2	6	169762	169767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186470479
3521	NC_010625	GCG	2	6	169821	169826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470479
3522	NC_010625	CGC	2	6	169853	169858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470479
3523	NC_010625	AGA	2	6	169876	169881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186470479
3524	NC_010625	GTG	2	6	169950	169955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186470479
3525	NC_010625	CGA	2	6	170005	170010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3526	NC_010625	CG	3	6	170037	170042	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3527	NC_010625	CGC	2	6	170148	170153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470479
3528	NC_010625	GTCC	2	8	170185	170192	0 %	25 %	25 %	50 %	186470479
3529	NC_010625	GC	3	6	170249	170254	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3530	NC_010625	AAC	2	6	170259	170264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186470479
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3532	NC_010625	CG	4	8	170296	170303	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3533	NC_010625	CGTCGG	2	12	170350	170361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	186470479
3534	NC_010625	CGT	2	6	170381	170386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3535	NC_010625	CGG	3	9	170400	170408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470479
3536	NC_010625	CGG	2	6	170434	170439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470479
3537	NC_010625	CG	3	6	170469	170474	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3538	NC_010625	CGA	2	6	170545	170550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3539	NC_010625	GTC	2	6	170579	170584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3540	NC_010625	CAG	2	6	170648	170653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3541	NC_010625	ATC	2	6	170664	170669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470479
3542	NC_010625	TGCA	2	8	170689	170696	25 %	25 %	25 %	25 %	186470479
3543	NC_010625	CG	3	6	170707	170712	0 %	0 %	50 %	50 %	186470479
3544	NC_010625	CAG	2	6	170738	170743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470479
3545	NC_010625	TGC	2	6	170805	170810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
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3548	NC_010625	TCG	2	6	170995	171000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470479
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3550	NC_010625	CTGG	2	8	171053	171060	0 %	25 %	50 %	25 %	186470479
3551	NC_010625	CGA	2	6	171444	171449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470480
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3553	NC_010625	GCT	2	6	171501	171506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470480
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3555	NC_010625	CGG	2	6	171567	171572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470480
3556	NC_010625	TGT	2	6	171642	171647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186470480
3557	NC_010625	TTC	2	6	171695	171700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470480
3558	NC_010625	TGCGA	2	10	171767	171776	20 %	20 %	40 %	20 %	186470480
3559	NC_010625	CGA	2	6	171828	171833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470480
3560	NC_010625	CGTG	2	8	171867	171874	0 %	25 %	50 %	25 %	186470480
3561	NC_010625	G	6	6	171877	171882	0 %	0 %	100 %	0 %	186470480
3562	NC_010625	GCGA	2	8	171923	171930	25 %	0 %	50 %	25 %	186470480
3563	NC_010625	TGC	2	6	172010	172015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470480
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3565	NC_010625	CG	3	6	172053	172058	0 %	0 %	50 %	50 %	186470480
3566	NC_010625	CGC	2	6	172093	172098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470480
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3568	NC_010625	CGA	2	6	172128	172133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470480
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3570	NC_010625	CGC	2	6	172231	172236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470480
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3572	NC_010625	GCC	3	9	172259	172267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470480
3573	NC_010625	TCATT	2	10	172488	172497	20 %	60 %	0 %	20 %	186470481
3574	NC_010625	GC	3	6	172559	172564	0 %	0 %	50 %	50 %	186470481
3575	NC_010625	GCT	3	9	172575	172583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470481
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3578	NC_010625	CG	4	8	172666	172673	0 %	0 %	50 %	50 %	186470481
3579	NC_010625	TGC	2	6	172679	172684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470481
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3593	NC_010625	TGG	2	6	173234	173239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186470481
3594	NC_010625	GCT	2	6	173334	173339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470481
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3598	NC_010625	TCG	3	9	173510	173518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470481
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3602	NC_010625	TG	3	6	173641	173646	0 %	50 %	50 %	0 %	186470481
3603	NC_010625	GCC	2	6	173750	173755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470481
3604	NC_010625	ATGGC	2	10	173803	173812	20 %	20 %	40 %	20 %	186470481
3605	NC_010625	CGG	2	6	173820	173825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470481
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3609	NC_010625	CGA	2	6	174261	174266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470482
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3611	NC_010625	TGGGCG	2	12	174346	174357	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	186470482
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3622	NC_010625	TCGG	2	8	175040	175047	0 %	25 %	50 %	25 %	186470484
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3743	NC_010625	CTG	2	6	180439	180444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470490
3744	NC_010625	GCGA	2	8	180482	180489	25 %	0 %	50 %	25 %	186470490
3745	NC_010625	T	6	6	180491	180496	0 %	100 %	0 %	0 %	186470490
3746	NC_010625	CGC	2	6	180532	180537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470490
3747	NC_010625	ACG	2	6	180539	180544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470490
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3749	NC_010625	CGC	2	6	180564	180569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470490
3750	NC_010625	GC	5	10	180583	180592	0 %	0 %	50 %	50 %	186470490
3751	NC_010625	ACG	2	6	180602	180607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470490
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3843	NC_010625	CGA	2	6	184298	184303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470492
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3845	NC_010625	TGA	2	6	184348	184353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470492
3846	NC_010625	AATG	2	8	184354	184361	50 %	25 %	25 %	0 %	186470493
3847	NC_010625	GTC	2	6	184385	184390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470493
3848	NC_010625	GAC	3	9	184391	184399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470493
3849	NC_010625	GC	3	6	184408	184413	0 %	0 %	50 %	50 %	186470493
3850	NC_010625	TGC	2	6	184428	184433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470493
3851	NC_010625	ACGTGC	2	12	184581	184592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	186470493
3852	NC_010625	CAT	2	6	184594	184599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470493
3853	NC_010625	GGCG	2	8	184648	184655	0 %	0 %	75 %	25 %	186470493
3854	NC_010625	GAG	2	6	184730	184735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186470493
3855	NC_010625	GCG	2	6	184768	184773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470493
3856	NC_010625	CGC	2	6	184791	184796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470493
3857	NC_010625	TCG	2	6	184818	184823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470493
3858	NC_010625	TGA	2	6	184833	184838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470493
3859	NC_010625	CGC	2	6	184849	184854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470493
3860	NC_010625	CGCT	2	8	184922	184929	0 %	25 %	25 %	50 %	186470493
3861	NC_010625	CGCA	2	8	184994	185001	25 %	0 %	25 %	50 %	186470493
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3863	NC_010625	TGTCG	2	10	185412	185421	0 %	40 %	40 %	20 %	186470494
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3982	NC_010625	AC	3	6	189653	189658	50 %	0 %	0 %	50 %	186470498
3983	NC_010625	CGT	2	6	189687	189692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470498
3984	NC_010625	TGG	2	6	189716	189721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186470498
3985	NC_010625	TCG	2	6	189760	189765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470498
3986	NC_010625	CG	3	6	189789	189794	0 %	0 %	50 %	50 %	186470498
3987	NC_010625	GCC	2	6	189846	189851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470498
3988	NC_010625	ATCGC	2	10	189904	189913	20 %	20 %	20 %	40 %	186470498
3989	NC_010625	CGA	2	6	189992	189997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470498
3990	NC_010625	GCTC	2	8	190004	190011	0 %	25 %	25 %	50 %	186470498
3991	NC_010625	GCG	2	6	190019	190024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470498
3992	NC_010625	ATGC	2	8	190049	190056	25 %	25 %	25 %	25 %	186470498
3993	NC_010625	CATCGA	2	12	190059	190070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186470498
3994	NC_010625	GGCAG	2	10	190130	190139	20 %	0 %	60 %	20 %	186470498
3995	NC_010625	CGA	2	6	190277	190282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470498
3996	NC_010625	CGC	2	6	190295	190300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470498
3997	NC_010625	CAT	2	6	190302	190307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470498
3998	NC_010625	CGT	2	6	190328	190333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470498
3999	NC_010625	GC	3	6	190349	190354	0 %	0 %	50 %	50 %	186470498
4000	NC_010625	CG	3	6	190365	190370	0 %	0 %	50 %	50 %	186470498

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