MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01

Total Repeats: 38984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010625	CCG	2	6	233047	233052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5003	NC_010625	CGC	2	6	233068	233073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5004	NC_010625	GCC	2	6	233153	233158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5005	NC_010625	CTG	2	6	233189	233194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
5006	NC_010625	TTC	2	6	233256	233261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470530
5007	NC_010625	GTCG	2	8	233270	233277	0 %	25 %	50 %	25 %	186470530
5008	NC_010625	CTG	2	6	233303	233308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
5009	NC_010625	GAC	2	6	233327	233332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470530
5010	NC_010625	ATG	3	9	233373	233381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470530
5011	NC_010625	GCC	2	6	233397	233402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5012	NC_010625	GCT	3	9	233557	233565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
5013	NC_010625	GCT	2	6	233617	233622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
5014	NC_010625	TAG	2	6	233628	233633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470530
5015	NC_010625	CTGG	2	8	233654	233661	0 %	25 %	50 %	25 %	186470530
5016	NC_010625	CCGG	2	8	233710	233717	0 %	0 %	50 %	50 %	186470530
5017	NC_010625	GCC	2	6	233723	233728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
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5019	NC_010625	CCG	2	6	233814	233819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5020	NC_010625	GCCG	2	8	233831	233838	0 %	0 %	50 %	50 %	186470530
5021	NC_010625	CCG	2	6	233881	233886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5022	NC_010625	GCC	2	6	233921	233926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5023	NC_010625	CGG	2	6	233974	233979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470530
5024	NC_010625	GCC	2	6	233982	233987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5025	NC_010625	GCC	2	6	233996	234001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
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5029	NC_010625	GCG	2	6	234156	234161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470530
5030	NC_010625	TGCC	2	8	234166	234173	0 %	25 %	25 %	50 %	186470530
5031	NC_010625	AGT	2	6	234190	234195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470530
5032	NC_010625	GATG	2	8	234260	234267	25 %	25 %	50 %	0 %	186470530
5033	NC_010625	GCC	2	6	234329	234334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
5034	NC_010625	GCG	2	6	234337	234342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470530
5035	NC_010625	CGC	2	6	234355	234360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
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5039	NC_010625	CGCC	2	8	234517	234524	0 %	0 %	25 %	75 %	186470530
5040	NC_010625	GCC	2	6	234590	234595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
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5042	NC_010625	GTCGT	2	10	234654	234663	0 %	40 %	40 %	20 %	186470530
5043	NC_010625	GCT	2	6	234704	234709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
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5045	NC_010625	TGA	2	6	234823	234828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470530
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5048	NC_010625	CGCTG	2	10	235019	235028	0 %	20 %	40 %	40 %	186470530
5049	NC_010625	GCC	3	9	235034	235042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470530
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5052	NC_010625	GC	3	6	235108	235113	0 %	0 %	50 %	50 %	186470530
5053	NC_010625	TCA	2	6	235279	235284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470530
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5057	NC_010625	GTC	2	6	235403	235408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470530
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5069	NC_010625	TGA	2	6	235811	235816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470530
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5092	NC_010625	CTGC	2	8	237012	237019	0 %	25 %	25 %	50 %	186470530
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5104	NC_010625	GC	3	6	237607	237612	0 %	0 %	50 %	50 %	186470530
5105	NC_010625	CAG	2	6	237638	237643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470530
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5109	NC_010625	CG	3	6	237707	237712	0 %	0 %	50 %	50 %	186470530
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5119	NC_010625	AGCA	2	8	238420	238427	50 %	0 %	25 %	25 %	186470531
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5121	NC_010625	CG	4	8	238492	238499	0 %	0 %	50 %	50 %	186470531
5122	NC_010625	TCGC	2	8	238513	238520	0 %	25 %	25 %	50 %	186470531
5123	NC_010625	CTT	2	6	238550	238555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470531
5124	NC_010625	GC	3	6	238556	238561	0 %	0 %	50 %	50 %	186470531
5125	NC_010625	CTG	2	6	238562	238567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470531
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5132	NC_010625	GC	3	6	238888	238893	0 %	0 %	50 %	50 %	186470531
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5141	NC_010625	CGGC	2	8	239293	239300	0 %	0 %	50 %	50 %	186470531
5142	NC_010625	CA	3	6	239919	239924	50 %	0 %	0 %	50 %	186470532
5143	NC_010625	TC	3	6	239942	239947	0 %	50 %	0 %	50 %	186470532
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5242	NC_010625	ATT	2	6	246972	246977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186470539
5243	NC_010625	CTT	2	6	247017	247022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470539
5244	NC_010625	AGA	2	6	247120	247125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186470539
5245	NC_010625	AAT	2	6	247199	247204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186470539
5246	NC_010625	TTGG	2	8	247228	247235	0 %	50 %	50 %	0 %	186470539
5247	NC_010625	TGC	2	6	247243	247248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470539
5248	NC_010625	AGCGC	2	10	247285	247294	20 %	0 %	40 %	40 %	186470539
5249	NC_010625	CCT	2	6	247307	247312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186470539
5250	NC_010625	CAC	2	6	247385	247390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470539
5251	NC_010625	TGGT	2	8	247701	247708	0 %	50 %	50 %	0 %	186470540
5252	NC_010625	TCC	2	6	247727	247732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186470540
5253	NC_010625	CTCGC	2	10	247775	247784	0 %	20 %	20 %	60 %	186470540
5254	NC_010625	CGT	2	6	247796	247801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
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5256	NC_010625	CTT	2	6	248034	248039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470540
5257	NC_010625	GAT	2	6	248070	248075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470540
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5259	NC_010625	CGA	2	6	248123	248128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5260	NC_010625	ACGC	2	8	248186	248193	25 %	0 %	25 %	50 %	186470540
5261	NC_010625	CGT	2	6	248220	248225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5262	NC_010625	TCAT	2	8	248236	248243	25 %	50 %	0 %	25 %	186470540
5263	NC_010625	CAC	2	6	248301	248306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470540
5264	NC_010625	CAC	2	6	248351	248356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470540
5265	NC_010625	CGT	2	6	248366	248371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5266	NC_010625	TGG	2	6	248384	248389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186470540
5267	NC_010625	GC	3	6	248469	248474	0 %	0 %	50 %	50 %	186470540
5268	NC_010625	TGA	2	6	248546	248551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186470540
5269	NC_010625	CGC	2	6	248609	248614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470540
5270	NC_010625	GC	3	6	248613	248618	0 %	0 %	50 %	50 %	186470540
5271	NC_010625	TGC	2	6	248654	248659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5272	NC_010625	TCGC	2	8	248686	248693	0 %	25 %	25 %	50 %	186470540
5273	NC_010625	CACCTG	2	12	248694	248705	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186470540
5274	NC_010625	TCG	2	6	248722	248727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5275	NC_010625	TCG	3	9	248741	248749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5276	NC_010625	CAGC	2	8	248769	248776	25 %	0 %	25 %	50 %	186470540
5277	NC_010625	CGG	2	6	248808	248813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470540
5278	NC_010625	CAC	2	6	248883	248888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470540
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5280	NC_010625	CGA	2	6	248943	248948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5281	NC_010625	CAG	2	6	248959	248964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5282	NC_010625	GTCCTG	2	12	248970	248981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
5283	NC_010625	CG	3	6	249015	249020	0 %	0 %	50 %	50 %	186470540
5284	NC_010625	T	6	6	249093	249098	0 %	100 %	0 %	0 %	186470540
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5294	NC_010625	CG	4	8	249516	249523	0 %	0 %	50 %	50 %	186470540
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5302	NC_010625	CGCC	2	8	249966	249973	0 %	0 %	25 %	75 %	186470540
5303	NC_010625	TCGACC	2	12	250135	250146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186470540
5304	NC_010625	TCG	2	6	250187	250192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470540
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5309	NC_010625	GCC	3	9	251015	251023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470541
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5313	NC_010625	TCA	2	6	251833	251838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470542
5314	NC_010625	CAG	2	6	252081	252086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470542
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5322	NC_010625	CGA	2	6	254372	254377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470543
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5324	NC_010625	TCA	2	6	254421	254426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470543
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5331	NC_010625	GGC	2	6	254655	254660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470544
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5333	NC_010625	CG	3	6	254681	254686	0 %	0 %	50 %	50 %	186470544
5334	NC_010625	CGG	2	6	254693	254698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470544
5335	NC_010625	AGCC	2	8	254713	254720	25 %	0 %	25 %	50 %	186470544
5336	NC_010625	GCC	2	6	254728	254733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470544
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5338	NC_010625	TCG	2	6	254782	254787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470544
5339	NC_010625	GAC	2	6	254800	254805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470544
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5341	NC_010625	ACG	2	6	254870	254875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470544
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5343	NC_010625	GGC	2	6	254957	254962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470544
5344	NC_010625	GC	3	6	254991	254996	0 %	0 %	50 %	50 %	186470544
5345	NC_010625	CCGT	2	8	255295	255302	0 %	25 %	25 %	50 %	186470545
5346	NC_010625	CGT	2	6	255352	255357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5347	NC_010625	CGC	2	6	255515	255520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5348	NC_010625	GCT	2	6	255524	255529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5349	NC_010625	AGG	2	6	255587	255592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186470545
5350	NC_010625	CAC	2	6	255624	255629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186470545
5351	NC_010625	GTC	2	6	255657	255662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5352	NC_010625	CG	3	6	255716	255721	0 %	0 %	50 %	50 %	186470545
5353	NC_010625	CTT	2	6	255786	255791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470545
5354	NC_010625	GTG	2	6	255798	255803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186470545
5355	NC_010625	GCC	2	6	255850	255855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5356	NC_010625	TTC	2	6	255885	255890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470545
5357	NC_010625	CGC	2	6	255932	255937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5358	NC_010625	GTC	2	6	255972	255977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5359	NC_010625	CG	3	6	255983	255988	0 %	0 %	50 %	50 %	186470545
5360	NC_010625	GGC	2	6	256040	256045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470545
5361	NC_010625	GTT	2	6	256086	256091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186470545
5362	NC_010625	CGAG	2	8	256097	256104	25 %	0 %	50 %	25 %	186470545
5363	NC_010625	AGC	2	6	256108	256113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5364	NC_010625	GCC	2	6	256171	256176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5365	NC_010625	GCC	2	6	256204	256209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5366	NC_010625	TGCG	2	8	256233	256240	0 %	25 %	50 %	25 %	186470545
5367	NC_010625	GTC	2	6	256263	256268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
5368	NC_010625	CGC	2	6	256290	256295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
5369	NC_010625	GGC	2	6	256331	256336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470545
5370	NC_010625	CGT	2	6	256397	256402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186470545
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5373	NC_010625	CGG	2	6	256519	256524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470545
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5383	NC_010625	GC	3	6	256885	256890	0 %	0 %	50 %	50 %	186470545
5384	NC_010625	CG	3	6	256953	256958	0 %	0 %	50 %	50 %	186470545
5385	NC_010625	CGC	2	6	256961	256966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470545
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5394	NC_010625	TTC	2	6	257898	257903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470547
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5404	NC_010625	GC	3	6	258422	258427	0 %	0 %	50 %	50 %	186470549
5405	NC_010625	GCA	2	6	258460	258465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470549
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5461	NC_010625	GC	4	8	261646	261653	0 %	0 %	50 %	50 %	186470551
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5473	NC_010625	CGG	2	6	262616	262621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470552
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5481	NC_010625	GCG	2	6	262794	262799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470552
5482	NC_010625	CACG	2	8	262817	262824	25 %	0 %	25 %	50 %	186470552
5483	NC_010625	GCA	2	6	262934	262939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470552
5484	NC_010625	CG	3	6	263038	263043	0 %	0 %	50 %	50 %	186470552
5485	NC_010625	CGG	2	6	263069	263074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470552
5486	NC_010625	GCG	3	9	263098	263106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470552
5487	NC_010625	GCG	2	6	263114	263119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470552
5488	NC_010625	CAT	2	6	263236	263241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186470553
5489	NC_010625	CG	3	6	263242	263247	0 %	0 %	50 %	50 %	186470553
5490	NC_010625	AGCC	2	8	263248	263255	25 %	0 %	25 %	50 %	186470553
5491	NC_010625	GAC	2	6	263299	263304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470553
5492	NC_010625	CCG	2	6	263315	263320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470553
5493	NC_010625	CCG	2	6	263354	263359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186470553
5494	NC_010625	GC	3	6	263364	263369	0 %	0 %	50 %	50 %	186470553
5495	NC_010625	TCT	2	6	263395	263400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186470553
5496	NC_010625	GCG	2	6	263407	263412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186470553
5497	NC_010625	CGTTGA	2	12	263447	263458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186470553
5498	NC_010625	CG	3	6	263462	263467	0 %	0 %	50 %	50 %	186470553
5499	NC_010625	AGC	2	6	263485	263490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470553
5500	NC_010625	CGA	2	6	263517	263522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186470553

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