MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010581	CAG	2	6	221232	221237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677184
4002	NC_010581	CG	3	6	221291	221296	0 %	0 %	50 %	50 %	182677184
4003	NC_010581	TC	3	6	221339	221344	0 %	50 %	0 %	50 %	182677184
4004	NC_010581	A	6	6	221593	221598	100 %	0 %	0 %	0 %	182677185
4005	NC_010581	TCC	2	6	221636	221641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677185
4006	NC_010581	GCG	2	6	221685	221690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677185
4007	NC_010581	GT	3	6	221703	221708	0 %	50 %	50 %	0 %	182677185
4008	NC_010581	GCTG	2	8	221710	221717	0 %	25 %	50 %	25 %	182677185
4009	NC_010581	CAT	2	6	221943	221948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677185
4010	NC_010581	AAT	2	6	222011	222016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677185
4011	NC_010581	GCCG	2	8	222037	222044	0 %	0 %	50 %	50 %	182677185
4012	NC_010581	TGG	2	6	222088	222093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677185
4013	NC_010581	GCT	2	6	222239	222244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677185
4014	NC_010581	GCT	2	6	222384	222389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677185
4015	NC_010581	CGGGC	2	10	222418	222427	0 %	0 %	60 %	40 %	182677185
4016	NC_010581	GAG	2	6	222516	222521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677185
4017	NC_010581	CAT	2	6	222577	222582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677185
4018	NC_010581	CGG	2	6	222583	222588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677185
4019	NC_010581	CGG	2	6	222609	222614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677185
4020	NC_010581	CTT	2	6	222777	222782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677185
4021	NC_010581	GGCC	2	8	222817	222824	0 %	0 %	50 %	50 %	182677186
4022	NC_010581	GGA	2	6	222825	222830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677186
4023	NC_010581	AGGGG	2	10	222864	222873	20 %	0 %	80 %	0 %	182677186
4024	NC_010581	CGA	2	6	222913	222918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677186
4025	NC_010581	TTC	2	6	222937	222942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677186
4026	NC_010581	CGTTG	2	10	223110	223119	0 %	40 %	40 %	20 %	182677186
4027	NC_010581	CAT	2	6	223134	223139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677186
4028	NC_010581	GC	3	6	223148	223153	0 %	0 %	50 %	50 %	182677186
4029	NC_010581	GAG	2	6	223183	223188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677186
4030	NC_010581	CGC	2	6	223192	223197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677186
4031	NC_010581	CG	3	6	223214	223219	0 %	0 %	50 %	50 %	182677186
4032	NC_010581	CTTC	2	8	223251	223258	0 %	50 %	0 %	50 %	182677186
4033	NC_010581	CGG	2	6	223296	223301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677186
4034	NC_010581	T	6	6	223374	223379	0 %	100 %	0 %	0 %	182677186
4035	NC_010581	TCA	2	6	223534	223539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677187
4036	NC_010581	ACA	2	6	223565	223570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677187
4037	NC_010581	TG	3	6	223593	223598	0 %	50 %	50 %	0 %	182677187
4038	NC_010581	TGATC	2	10	223793	223802	20 %	40 %	20 %	20 %	182677188
4039	NC_010581	GTT	2	6	223821	223826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677188
4040	NC_010581	GTT	2	6	224144	224149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677189
4041	NC_010581	GCG	2	6	224232	224237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677189
4042	NC_010581	GCC	2	6	224598	224603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677190
4043	NC_010581	GCCC	2	8	224625	224632	0 %	0 %	25 %	75 %	182677190
4044	NC_010581	T	6	6	224642	224647	0 %	100 %	0 %	0 %	182677190
4045	NC_010581	TCA	2	6	224732	224737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677190
4046	NC_010581	TCG	2	6	224759	224764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677190
4047	NC_010581	T	7	7	224771	224777	0 %	100 %	0 %	0 %	182677190
4048	NC_010581	GCT	2	6	224799	224804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677190
4049	NC_010581	AGC	2	6	224833	224838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677190
4050	NC_010581	GGC	2	6	224884	224889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4051	NC_010581	CGAT	2	8	224942	224949	25 %	25 %	25 %	25 %	182677190
4052	NC_010581	TGCGT	2	10	224964	224973	0 %	40 %	40 %	20 %	182677190
4053	NC_010581	GGC	2	6	224974	224979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4054	NC_010581	TCA	2	6	225005	225010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677190
4055	NC_010581	TC	3	6	225024	225029	0 %	50 %	0 %	50 %	182677190
4056	NC_010581	GCG	2	6	225038	225043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4057	NC_010581	TCGG	2	8	225046	225053	0 %	25 %	50 %	25 %	182677190
4058	NC_010581	CCT	2	6	225062	225067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677190
4059	NC_010581	GCG	2	6	225120	225125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4060	NC_010581	TTG	2	6	225143	225148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677190
4061	NC_010581	CGG	2	6	225158	225163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4062	NC_010581	CGG	2	6	225269	225274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4063	NC_010581	GGC	2	6	225310	225315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4064	NC_010581	CCG	2	6	225335	225340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677190
4065	NC_010581	CT	3	6	225344	225349	0 %	50 %	0 %	50 %	182677190
4066	NC_010581	GCT	2	6	225366	225371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677190
4067	NC_010581	CCT	2	6	225372	225377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677190
4068	NC_010581	GAT	2	6	225384	225389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677190
4069	NC_010581	GC	3	6	225417	225422	0 %	0 %	50 %	50 %	182677190
4070	NC_010581	ACC	2	6	225427	225432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677190
4071	NC_010581	ATC	2	6	225466	225471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677190
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4073	NC_010581	CGT	2	6	225492	225497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677190
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4078	NC_010581	TCG	2	6	225710	225715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677190
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4080	NC_010581	GGC	2	6	225780	225785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
4081	NC_010581	ATGACC	2	12	225814	225825	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182677190
4082	NC_010581	GAC	2	6	225840	225845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677190
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4084	NC_010581	GC	3	6	225971	225976	0 %	0 %	50 %	50 %	182677190
4085	NC_010581	GTCCG	2	10	226039	226048	0 %	20 %	40 %	40 %	182677190
4086	NC_010581	CGC	2	6	226107	226112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677190
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4092	NC_010581	GGC	2	6	226311	226316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677190
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4094	NC_010581	ATC	2	6	226381	226386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677190
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4102	NC_010581	GCA	2	6	226743	226748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677191
4103	NC_010581	GGA	2	6	226777	226782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677191
4104	NC_010581	CGGCG	2	10	226862	226871	0 %	0 %	60 %	40 %	182677191
4105	NC_010581	GCC	2	6	226967	226972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677191
4106	NC_010581	GCTC	2	8	226975	226982	0 %	25 %	25 %	50 %	182677191
4107	NC_010581	T	6	6	227061	227066	0 %	100 %	0 %	0 %	182677191
4108	NC_010581	GCTT	2	8	227135	227142	0 %	50 %	25 %	25 %	182677191
4109	NC_010581	GTT	2	6	227179	227184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677191
4110	NC_010581	GCC	2	6	227215	227220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677191
4111	NC_010581	ACC	2	6	227252	227257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677191
4112	NC_010581	CAA	2	6	227285	227290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677191
4113	NC_010581	CCGAG	2	10	227310	227319	20 %	0 %	40 %	40 %	182677192
4114	NC_010581	GCGAGC	2	12	227330	227341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182677192
4115	NC_010581	GGC	3	9	227344	227352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677192
4116	NC_010581	GC	3	6	227389	227394	0 %	0 %	50 %	50 %	182677192
4117	NC_010581	GCGA	2	8	227414	227421	25 %	0 %	50 %	25 %	182677192
4118	NC_010581	GGC	2	6	227455	227460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677192
4119	NC_010581	GCC	2	6	227486	227491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677192
4120	NC_010581	GCG	2	6	227519	227524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677192
4121	NC_010581	CGG	2	6	227547	227552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677192
4122	NC_010581	CG	4	8	227562	227569	0 %	0 %	50 %	50 %	182677192
4123	NC_010581	CGG	3	9	227601	227609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677192
4124	NC_010581	GCA	3	9	227628	227636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677192
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4232	NC_010581	GTC	2	6	231580	231585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677194
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4234	NC_010581	CGAGAT	2	12	231659	231670	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182677194
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4238	NC_010581	CGAG	2	8	231818	231825	25 %	0 %	50 %	25 %	182677194
4239	NC_010581	CAT	2	6	231827	231832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677194
4240	NC_010581	GAT	2	6	231909	231914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677194
4241	NC_010581	GCG	2	6	231957	231962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677195
4242	NC_010581	CAG	2	6	231986	231991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677195
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4488	NC_010581	GCC	2	6	245020	245025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4489	NC_010581	GCCTT	2	10	245057	245066	0 %	40 %	20 %	40 %	182677207
4490	NC_010581	GCC	2	6	245067	245072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4491	NC_010581	CGC	2	6	245094	245099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4492	NC_010581	GC	3	6	245126	245131	0 %	0 %	50 %	50 %	182677207
4493	NC_010581	TGGG	2	8	245150	245157	0 %	25 %	75 %	0 %	182677207
4494	NC_010581	CG	3	6	245216	245221	0 %	0 %	50 %	50 %	182677207
4495	NC_010581	CGGG	2	8	245248	245255	0 %	0 %	75 %	25 %	182677207
4496	NC_010581	TGC	2	6	245289	245294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677207
4497	NC_010581	GCGT	2	8	245306	245313	0 %	25 %	50 %	25 %	182677207
4498	NC_010581	CGC	2	6	245321	245326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4499	NC_010581	CGC	2	6	245343	245348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4500	NC_010581	CGCC	2	8	245354	245361	0 %	0 %	25 %	75 %	182677207

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