MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010581	CAA	2	6	167336	167341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677140
3002	NC_010581	GATCA	2	10	167443	167452	40 %	20 %	20 %	20 %	182677140
3003	NC_010581	CG	3	6	167472	167477	0 %	0 %	50 %	50 %	182677140
3004	NC_010581	GCG	2	6	167506	167511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3005	NC_010581	GGC	2	6	167578	167583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3006	NC_010581	CAT	2	6	167604	167609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677140
3007	NC_010581	CGC	2	6	167625	167630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3008	NC_010581	TCA	2	6	167633	167638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677140
3009	NC_010581	CGG	4	12	167738	167749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3010	NC_010581	CGTGG	2	10	167836	167845	0 %	20 %	60 %	20 %	182677140
3011	NC_010581	CAT	2	6	167866	167871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677140
3012	NC_010581	TGT	2	6	167872	167877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677140
3013	NC_010581	CGG	2	6	167982	167987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3014	NC_010581	T	6	6	167996	168001	0 %	100 %	0 %	0 %	182677140
3015	NC_010581	CGG	2	6	168023	168028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3016	NC_010581	TTC	2	6	168197	168202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677140
3017	NC_010581	GCC	2	6	168283	168288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3018	NC_010581	TGA	2	6	168290	168295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3019	NC_010581	GAT	2	6	168313	168318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3020	NC_010581	GAT	2	6	168322	168327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3021	NC_010581	CAA	2	6	168354	168359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677140
3022	NC_010581	CTC	2	6	168373	168378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677140
3023	NC_010581	CGG	2	6	168385	168390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3024	NC_010581	GGT	2	6	168430	168435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677140
3025	NC_010581	TCG	2	6	168456	168461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677140
3026	NC_010581	TGA	2	6	168462	168467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3027	NC_010581	CAGC	2	8	168474	168481	25 %	0 %	25 %	50 %	182677140
3028	NC_010581	CG	3	6	168540	168545	0 %	0 %	50 %	50 %	182677140
3029	NC_010581	TG	4	8	168672	168679	0 %	50 %	50 %	0 %	182677140
3030	NC_010581	CGC	2	6	168685	168690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3031	NC_010581	CTT	2	6	168763	168768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677140
3032	NC_010581	GCT	2	6	168783	168788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677140
3033	NC_010581	GCC	2	6	168789	168794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3034	NC_010581	GCCA	2	8	168911	168918	25 %	0 %	25 %	50 %	182677140
3035	NC_010581	AGA	2	6	168984	168989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677140
3036	NC_010581	GATC	2	8	169124	169131	25 %	25 %	25 %	25 %	182677141
3037	NC_010581	CAT	2	6	169228	169233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677141
3038	NC_010581	TTA	2	6	169284	169289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677141
3039	NC_010581	TCG	2	6	169290	169295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677141
3040	NC_010581	GCTC	2	8	169410	169417	0 %	25 %	25 %	50 %	182677141
3041	NC_010581	GGTC	2	8	169426	169433	0 %	25 %	50 %	25 %	182677141
3042	NC_010581	AGC	2	6	169464	169469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677141
3043	NC_010581	TTC	2	6	169515	169520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677141
3044	NC_010581	GAG	2	6	169550	169555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677141
3045	NC_010581	CGC	2	6	169568	169573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677141
3046	NC_010581	TTC	2	6	169622	169627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677141
3047	NC_010581	CTCA	2	8	170055	170062	25 %	25 %	0 %	50 %	182677142
3048	NC_010581	TCG	2	6	170224	170229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3049	NC_010581	CGCA	2	8	170233	170240	25 %	0 %	25 %	50 %	182677142
3050	NC_010581	GC	3	6	170254	170259	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3051	NC_010581	TCT	2	6	170263	170268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677142
3052	NC_010581	AAT	2	6	170273	170278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677142
3053	NC_010581	GGC	2	6	170362	170367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3054	NC_010581	ACG	2	6	170374	170379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3055	NC_010581	GCA	2	6	170450	170455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3056	NC_010581	TCGGCG	2	12	170531	170542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182677142
3057	NC_010581	TTC	2	6	170544	170549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677142
3058	NC_010581	GAC	2	6	170559	170564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3059	NC_010581	CAC	2	6	170577	170582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677142
3060	NC_010581	CAGG	2	8	170615	170622	25 %	0 %	50 %	25 %	182677142
3061	NC_010581	CGATC	2	10	170630	170639	20 %	20 %	20 %	40 %	182677142
3062	NC_010581	CCAGCG	2	12	170661	170672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677142
3063	NC_010581	GCG	2	6	170705	170710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3064	NC_010581	GA	3	6	170740	170745	50 %	0 %	50 %	0 %	182677142
3065	NC_010581	CG	3	6	170915	170920	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3066	NC_010581	GCC	2	6	170963	170968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3067	NC_010581	CGA	2	6	170999	171004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3068	NC_010581	CTG	2	6	171033	171038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3069	NC_010581	CTG	2	6	171077	171082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3070	NC_010581	AGGG	2	8	171103	171110	25 %	0 %	75 %	0 %	182677142
3071	NC_010581	CG	3	6	171127	171132	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3072	NC_010581	GATC	2	8	171158	171165	25 %	25 %	25 %	25 %	182677142
3073	NC_010581	GCTT	2	8	171174	171181	0 %	50 %	25 %	25 %	182677142
3074	NC_010581	CGA	2	6	171194	171199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3075	NC_010581	GCC	2	6	171226	171231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3076	NC_010581	GCC	3	9	171319	171327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3077	NC_010581	GCG	2	6	171352	171357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3078	NC_010581	CG	3	6	171398	171403	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3079	NC_010581	TGGC	2	8	171518	171525	0 %	25 %	50 %	25 %	182677142
3080	NC_010581	GC	3	6	171626	171631	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3081	NC_010581	GACC	2	8	171633	171640	25 %	0 %	25 %	50 %	182677142
3082	NC_010581	GT	3	6	171644	171649	0 %	50 %	50 %	0 %	182677142
3083	NC_010581	TCG	2	6	171655	171660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3084	NC_010581	TGA	2	6	171686	171691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677142
3085	NC_010581	GCT	2	6	171733	171738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3086	NC_010581	ATC	2	6	171808	171813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677142
3087	NC_010581	AGGCG	2	10	171818	171827	20 %	0 %	60 %	20 %	182677142
3088	NC_010581	CGG	2	6	171842	171847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3089	NC_010581	GGC	2	6	172050	172055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3090	NC_010581	GC	3	6	172182	172187	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3091	NC_010581	GAT	2	6	172230	172235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677143
3092	NC_010581	TCA	3	9	172273	172281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677143
3093	NC_010581	CG	3	6	172334	172339	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3094	NC_010581	G	6	6	172361	172366	0 %	0 %	100 %	0 %	182677143
3095	NC_010581	CGG	2	6	172368	172373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3096	NC_010581	GCG	2	6	172402	172407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3097	NC_010581	AGC	2	6	172516	172521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3098	NC_010581	TCC	2	6	172561	172566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677143
3099	NC_010581	ATGG	2	8	172638	172645	25 %	25 %	50 %	0 %	182677143
3100	NC_010581	ATA	2	6	172662	172667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677143
3101	NC_010581	GGTT	2	8	172715	172722	0 %	50 %	50 %	0 %	182677143
3102	NC_010581	GATCG	2	10	172767	172776	20 %	20 %	40 %	20 %	182677143
3103	NC_010581	GC	3	6	172795	172800	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3104	NC_010581	GCC	2	6	172857	172862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677143
3105	NC_010581	CGA	2	6	172871	172876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3106	NC_010581	GGAT	2	8	172934	172941	25 %	25 %	50 %	0 %	182677143
3107	NC_010581	CGA	2	6	172943	172948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3108	NC_010581	GC	3	6	172961	172966	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3109	NC_010581	TGA	2	6	172979	172984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677143
3110	NC_010581	GA	3	6	173005	173010	50 %	0 %	50 %	0 %	182677143
3111	NC_010581	GAG	2	6	173061	173066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677143
3112	NC_010581	GA	3	6	173152	173157	50 %	0 %	50 %	0 %	182677143
3113	NC_010581	GCG	2	6	173181	173186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3114	NC_010581	ACG	2	6	173263	173268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
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3116	NC_010581	GC	3	6	173284	173289	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3117	NC_010581	GGC	2	6	173292	173297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3118	NC_010581	CCTT	2	8	173353	173360	0 %	50 %	0 %	50 %	182677143
3119	NC_010581	AGA	2	6	173419	173424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677143
3120	NC_010581	GCG	2	6	173429	173434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3121	NC_010581	GGC	2	6	173552	173557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3122	NC_010581	ATC	3	9	173568	173576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677143
3123	NC_010581	TTTCGC	2	12	174317	174328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182677144
3124	NC_010581	GCG	2	6	174348	174353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677144
3125	NC_010581	G	6	6	174359	174364	0 %	0 %	100 %	0 %	182677144
3126	NC_010581	GCG	2	6	174510	174515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677144
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3131	NC_010581	ATG	2	6	174888	174893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677145
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3133	NC_010581	ATG	2	6	174912	174917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677145
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3150	NC_010581	ATC	2	6	175691	175696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677146
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3154	NC_010581	TGG	2	6	176014	176019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677146
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3239	NC_010581	GCGCG	2	10	179457	179466	0 %	0 %	60 %	40 %	182677150
3240	NC_010581	CTG	2	6	179475	179480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677150
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3242	NC_010581	CAG	2	6	179583	179588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677150
3243	NC_010581	GAT	2	6	179626	179631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677150
3244	NC_010581	TCG	2	6	179907	179912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677151
3245	NC_010581	CGA	2	6	179977	179982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677151
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3354	NC_010581	TAT	2	6	185520	185525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677156
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3358	NC_010581	TCG	2	6	185686	185691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677156
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