MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010581	ATG	2	6	114166	114171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677102
2003	NC_010581	GTC	2	6	114184	114189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2004	NC_010581	CG	3	6	114261	114266	0 %	0 %	50 %	50 %	182677102
2005	NC_010581	CGCT	2	8	114274	114281	0 %	25 %	25 %	50 %	182677102
2006	NC_010581	TCT	2	6	114371	114376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677102
2007	NC_010581	ACG	2	6	114406	114411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2008	NC_010581	CGG	2	6	114523	114528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677102
2009	NC_010581	TCT	2	6	114533	114538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677102
2010	NC_010581	GCT	2	6	114565	114570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2011	NC_010581	GTCG	2	8	114649	114656	0 %	25 %	50 %	25 %	182677102
2012	NC_010581	AT	3	6	114669	114674	50 %	50 %	0 %	0 %	182677102
2013	NC_010581	CGA	2	6	114678	114683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2014	NC_010581	GCA	2	6	114732	114737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2015	NC_010581	ACGG	2	8	114739	114746	25 %	0 %	50 %	25 %	182677102
2016	NC_010581	TGC	2	6	114767	114772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677102
2017	NC_010581	AAC	2	6	114793	114798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677102
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2021	NC_010581	TCT	2	6	114878	114883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677102
2022	NC_010581	CTT	2	6	114928	114933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677102
2023	NC_010581	GGAC	2	8	115021	115028	25 %	0 %	50 %	25 %	182677102
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2043	NC_010581	TTGC	2	8	116333	116340	0 %	50 %	25 %	25 %	182677103
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2121	NC_010581	CGA	2	6	120530	120535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677108
2122	NC_010581	TCA	2	6	120544	120549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677108
2123	NC_010581	CTC	2	6	120609	120614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677108
2124	NC_010581	CTT	2	6	120668	120673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677108
2125	NC_010581	GCG	2	6	120674	120679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677108
2126	NC_010581	GCC	2	6	120699	120704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677108
2127	NC_010581	TTC	2	6	120741	120746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677108
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2130	NC_010581	CGC	2	6	120860	120865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677108
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2132	NC_010581	CGATG	2	10	120890	120899	20 %	20 %	40 %	20 %	182677108
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2140	NC_010581	CGG	2	6	121320	121325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677108
2141	NC_010581	TCG	2	6	121426	121431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677108
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2145	NC_010581	GC	3	6	121605	121610	0 %	0 %	50 %	50 %	182677108
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2231	NC_010581	ATCG	2	8	127569	127576	25 %	25 %	25 %	25 %	182677112
2232	NC_010581	CCGT	2	8	127580	127587	0 %	25 %	25 %	50 %	182677112
2233	NC_010581	GGC	2	6	127863	127868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677112
2234	NC_010581	GCAAA	2	10	127873	127882	60 %	0 %	20 %	20 %	182677112
2235	NC_010581	GAT	2	6	127899	127904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677112
2236	NC_010581	CG	3	6	127931	127936	0 %	0 %	50 %	50 %	182677112
2237	NC_010581	CCG	2	6	127951	127956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677112
2238	NC_010581	GAT	2	6	127989	127994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677112
2239	NC_010581	CGCC	2	8	128008	128015	0 %	0 %	25 %	75 %	182677112
2240	NC_010581	AGCG	2	8	128026	128033	25 %	0 %	50 %	25 %	182677112
2241	NC_010581	CGCC	2	8	128051	128058	0 %	0 %	25 %	75 %	182677112
2242	NC_010581	GCGATC	2	12	128095	128106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182677112
2243	NC_010581	GCC	2	6	128228	128233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677112
2244	NC_010581	AGC	2	6	128290	128295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677112
2245	NC_010581	GCCCGA	2	12	128319	128330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677112
2246	NC_010581	GAC	2	6	128370	128375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677112
2247	NC_010581	CGA	2	6	128393	128398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677112
2248	NC_010581	TCG	2	6	128440	128445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677112
2249	NC_010581	CGTC	2	8	128456	128463	0 %	25 %	25 %	50 %	182677112
2250	NC_010581	GCG	2	6	128482	128487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677112
2251	NC_010581	GTTC	2	8	128522	128529	0 %	50 %	25 %	25 %	182677112
2252	NC_010581	GAT	2	6	128936	128941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677113
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2254	NC_010581	CGT	2	6	129062	129067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677113
2255	NC_010581	GAT	2	6	129168	129173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677113
2256	NC_010581	CA	3	6	129272	129277	50 %	0 %	0 %	50 %	182677113
2257	NC_010581	ACG	2	6	129349	129354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677113
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2259	NC_010581	TCG	2	6	129474	129479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677114
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2262	NC_010581	GGC	2	6	129590	129595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677114
2263	NC_010581	CG	3	6	129601	129606	0 %	0 %	50 %	50 %	182677114
2264	NC_010581	CTT	2	6	129616	129621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677114
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2271	NC_010581	CG	3	6	129944	129949	0 %	0 %	50 %	50 %	182677114
2272	NC_010581	TGG	3	9	129951	129959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677114
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2274	NC_010581	CGC	2	6	130039	130044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677114
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2278	NC_010581	GTGCC	2	10	130141	130150	0 %	20 %	40 %	40 %	182677115
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2281	NC_010581	CG	3	6	130240	130245	0 %	0 %	50 %	50 %	182677115
2282	NC_010581	GAC	2	6	130379	130384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677115
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2286	NC_010581	GA	3	6	130572	130577	50 %	0 %	50 %	0 %	182677115
2287	NC_010581	T	7	7	130578	130584	0 %	100 %	0 %	0 %	182677115
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2293	NC_010581	AAGGG	2	10	131013	131022	40 %	0 %	60 %	0 %	182677115
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2315	NC_010581	CGT	2	6	131852	131857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677116
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2340	NC_010581	CAT	3	9	133795	133803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677118
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2346	NC_010581	GGGA	2	8	134077	134084	25 %	0 %	75 %	0 %	182677118
2347	NC_010581	GAT	2	6	134122	134127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677118
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2349	NC_010581	TTC	2	6	134198	134203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677118
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2352	NC_010581	GCC	2	6	134440	134445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677119
2353	NC_010581	CAA	2	6	134545	134550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677119
2354	NC_010581	GCC	2	6	134647	134652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677119
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2357	NC_010581	GCC	2	6	134773	134778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677119
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2359	NC_010581	CG	3	6	134791	134796	0 %	0 %	50 %	50 %	182677119
2360	NC_010581	GCC	2	6	134810	134815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677119
2361	NC_010581	CAC	2	6	134830	134835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677119
2362	NC_010581	AT	3	6	134918	134923	50 %	50 %	0 %	0 %	182677119
2363	NC_010581	CGT	2	6	135046	135051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677119
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2365	NC_010581	CGG	2	6	135183	135188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677119
2366	NC_010581	CTG	2	6	135291	135296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677119
2367	NC_010581	TTG	2	6	135335	135340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677119
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2479	NC_010581	AAGC	2	8	141537	141544	50 %	0 %	25 %	25 %	182677123
2480	NC_010581	GCA	2	6	141586	141591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677123
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2483	NC_010581	GCTCG	2	10	141760	141769	0 %	20 %	40 %	40 %	182677123
2484	NC_010581	TTC	2	6	141800	141805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677123
2485	NC_010581	AAATC	2	10	141810	141819	60 %	20 %	0 %	20 %	182677123
2486	NC_010581	TGCG	2	8	141840	141847	0 %	25 %	50 %	25 %	182677123
2487	NC_010581	ATG	2	6	141897	141902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677123
2488	NC_010581	CAA	2	6	141943	141948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677123
2489	NC_010581	CGA	2	6	141996	142001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677123
2490	NC_010581	CA	3	6	142006	142011	50 %	0 %	0 %	50 %	182677123
2491	NC_010581	CCAG	2	8	142123	142130	25 %	0 %	25 %	50 %	182677123
2492	NC_010581	CGAT	2	8	142173	142180	25 %	25 %	25 %	25 %	182677123
2493	NC_010581	GC	3	6	142223	142228	0 %	0 %	50 %	50 %	182677123
2494	NC_010581	CCA	2	6	142248	142253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677123
2495	NC_010581	TGC	2	6	142261	142266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677123
2496	NC_010581	CAT	2	6	142303	142308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677123
2497	NC_010581	CAA	2	6	142366	142371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677123
2498	NC_010581	CAGC	2	8	142393	142400	25 %	0 %	25 %	50 %	182677123
2499	NC_010581	TCA	2	6	142405	142410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677123
2500	NC_010581	AC	3	6	142461	142466	50 %	0 %	0 %	50 %	182677123

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