MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010581	CAT	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677026
502	NC_010581	GAT	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677026
503	NC_010581	TGGC	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	182677026
504	NC_010581	AGC	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677026
505	NC_010581	CAG	2	6	27770	27775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677027
506	NC_010581	CCA	2	6	27784	27789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677027
507	NC_010581	GAG	2	6	27849	27854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677027
508	NC_010581	CTT	2	6	27870	27875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677027
509	NC_010581	AAT	2	6	27877	27882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677027
510	NC_010581	CGT	2	6	27889	27894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677027
511	NC_010581	A	6	6	27936	27941	100 %	0 %	0 %	0 %	182677027
512	NC_010581	ATA	2	6	27949	27954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677027
513	NC_010581	ATCG	3	12	27997	28008	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
514	NC_010581	GTTCA	2	10	28021	28030	20 %	40 %	20 %	20 %	182677027
515	NC_010581	GGC	2	6	28060	28065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677027
516	NC_010581	GGC	2	6	28093	28098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677027
517	NC_010581	A	6	6	28151	28156	100 %	0 %	0 %	0 %	182677027
518	NC_010581	ATCG	2	8	28159	28166	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
519	NC_010581	GT	3	6	28191	28196	0 %	50 %	50 %	0 %	182677027
520	NC_010581	CAT	2	6	28228	28233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
521	NC_010581	CAG	2	6	28294	28299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677027
522	NC_010581	GAT	2	6	28327	28332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677027
523	NC_010581	GTT	2	6	28376	28381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677027
524	NC_010581	GGGA	2	8	28397	28404	25 %	0 %	75 %	0 %	182677027
525	NC_010581	TCCC	2	8	28425	28432	0 %	25 %	0 %	75 %	182677027
526	NC_010581	GGCA	2	8	28497	28504	25 %	0 %	50 %	25 %	182677027
527	NC_010581	CAT	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
528	NC_010581	CG	3	6	28609	28614	0 %	0 %	50 %	50 %	182677027
529	NC_010581	ATG	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677027
530	NC_010581	ATC	2	6	28672	28677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
531	NC_010581	ATC	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
532	NC_010581	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677027
533	NC_010581	AAT	2	6	28780	28785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677027
534	NC_010581	T	6	6	28843	28848	0 %	100 %	0 %	0 %	182677027
535	NC_010581	GC	3	6	29301	29306	0 %	0 %	50 %	50 %	182677028
536	NC_010581	GGA	2	6	29333	29338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677028
537	NC_010581	CGG	2	6	29378	29383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677028
538	NC_010581	CTG	2	6	29414	29419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677028
539	NC_010581	TGA	2	6	29426	29431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677028
540	NC_010581	GA	4	8	29457	29464	50 %	0 %	50 %	0 %	182677028
541	NC_010581	CGG	2	6	29507	29512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677028
542	NC_010581	GAT	2	6	29559	29564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677028
543	NC_010581	TGC	2	6	29566	29571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677028
544	NC_010581	GATG	2	8	29582	29589	25 %	25 %	50 %	0 %	182677028
545	NC_010581	CG	3	6	29954	29959	0 %	0 %	50 %	50 %	182677029
546	NC_010581	GAA	2	6	29995	30000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677029
547	NC_010581	CAT	2	6	30067	30072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677029
548	NC_010581	GCC	2	6	30100	30105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677029
549	NC_010581	GTCCA	2	10	30151	30160	20 %	20 %	20 %	40 %	182677029
550	NC_010581	CGG	2	6	30212	30217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677029
551	NC_010581	GAT	2	6	30240	30245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677029
552	NC_010581	CTG	2	6	30275	30280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677029
553	NC_010581	CGC	2	6	30324	30329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677029
554	NC_010581	GCTC	2	8	30339	30346	0 %	25 %	25 %	50 %	182677029
555	NC_010581	GCC	2	6	30361	30366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677029
556	NC_010581	CTG	2	6	30400	30405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677029
557	NC_010581	GCC	2	6	30435	30440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677029
558	NC_010581	GTC	2	6	30451	30456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677029
559	NC_010581	AGG	2	6	30536	30541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677030
560	NC_010581	CGG	2	6	30554	30559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677030
561	NC_010581	AGC	2	6	30678	30683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677030
562	NC_010581	GC	3	6	30682	30687	0 %	0 %	50 %	50 %	182677030
563	NC_010581	CGAT	2	8	30703	30710	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
564	NC_010581	GCC	2	6	30726	30731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677030
565	NC_010581	T	6	6	30762	30767	0 %	100 %	0 %	0 %	182677030
566	NC_010581	GCG	2	6	30846	30851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677030
567	NC_010581	ATC	2	6	30855	30860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677030
568	NC_010581	GAT	2	6	30864	30869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677030
569	NC_010581	GGC	2	6	30971	30976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677030
570	NC_010581	CAA	2	6	30977	30982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677030
571	NC_010581	TAA	2	6	31063	31068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677030
572	NC_010581	ATCG	2	8	31089	31096	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
573	NC_010581	CTT	2	6	31184	31189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677030
574	NC_010581	TCGC	2	8	31233	31240	0 %	25 %	25 %	50 %	182677030
575	NC_010581	ATCG	2	8	31256	31263	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
576	NC_010581	CTG	2	6	31297	31302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677030
577	NC_010581	GA	3	6	31340	31345	50 %	0 %	50 %	0 %	182677030
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579	NC_010581	CGGG	2	8	31385	31392	0 %	0 %	75 %	25 %	182677030
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581	NC_010581	CG	3	6	31450	31455	0 %	0 %	50 %	50 %	182677030
582	NC_010581	CGG	2	6	31492	31497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677030
583	NC_010581	CAA	2	6	31899	31904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677031
584	NC_010581	CCT	2	6	31925	31930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677031
585	NC_010581	GCC	2	6	31990	31995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677031
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588	NC_010581	AGG	2	6	32180	32185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677031
589	NC_010581	CG	3	6	32186	32191	0 %	0 %	50 %	50 %	182677031
590	NC_010581	GC	4	8	32253	32260	0 %	0 %	50 %	50 %	182677031
591	NC_010581	GGC	2	6	32296	32301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677031
592	NC_010581	GGC	2	6	32422	32427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677031
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594	NC_010581	GGCGA	2	10	32530	32539	20 %	0 %	60 %	20 %	182677031
595	NC_010581	CGC	3	9	32555	32563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677031
596	NC_010581	GAT	2	6	32646	32651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677031
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598	NC_010581	AAG	2	6	32729	32734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677031
599	NC_010581	GC	3	6	32784	32789	0 %	0 %	50 %	50 %	182677032
600	NC_010581	CGG	2	6	32859	32864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677032
601	NC_010581	GAC	2	6	32877	32882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677032
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607	NC_010581	CTCG	2	8	33171	33178	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
608	NC_010581	GCG	2	6	33189	33194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677032
609	NC_010581	CAT	2	6	33210	33215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677032
610	NC_010581	CG	3	6	33234	33239	0 %	0 %	50 %	50 %	182677032
611	NC_010581	CAGCG	2	10	33390	33399	20 %	0 %	40 %	40 %	182677032
612	NC_010581	GGA	2	6	33543	33548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677032
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615	NC_010581	CGC	2	6	33598	33603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677032
616	NC_010581	CGAC	2	8	33620	33627	25 %	0 %	25 %	50 %	182677032
617	NC_010581	CGA	2	6	33630	33635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677032
618	NC_010581	GCCT	2	8	33640	33647	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
619	NC_010581	CCT	2	6	33668	33673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677032
620	NC_010581	GCC	2	6	33705	33710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677032
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625	NC_010581	CGG	2	6	33931	33936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677033
626	NC_010581	GATT	2	8	33960	33967	25 %	50 %	25 %	0 %	182677033
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