MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010581	ATC	2	6	305135	305140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677263
5502	NC_010581	GCATT	2	10	305187	305196	20 %	40 %	20 %	20 %	182677263
5503	NC_010581	TGC	2	6	305358	305363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677263
5504	NC_010581	GC	3	6	305390	305395	0 %	0 %	50 %	50 %	182677263
5505	NC_010581	GGC	2	6	305407	305412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677263
5506	NC_010581	AGC	2	6	305451	305456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677263
5507	NC_010581	TTC	2	6	305474	305479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677263
5508	NC_010581	TGC	2	6	305520	305525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677263
5509	NC_010581	CTT	2	6	305540	305545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677263
5510	NC_010581	TAA	2	6	305607	305612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677264
5511	NC_010581	ATC	4	12	305702	305713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677264
5512	NC_010581	GCA	2	6	305783	305788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677264
5513	NC_010581	TCCGT	2	10	305799	305808	0 %	40 %	20 %	40 %	182677264
5514	NC_010581	CCT	2	6	305872	305877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677264
5515	NC_010581	CCG	2	6	306017	306022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677264
5516	NC_010581	CG	3	6	306033	306038	0 %	0 %	50 %	50 %	182677264
5517	NC_010581	CGT	2	6	306041	306046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677264
5518	NC_010581	ATA	2	6	306047	306052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677264
5519	NC_010581	CAG	2	6	306119	306124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677264
5520	NC_010581	CTT	2	6	306133	306138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677264
5521	NC_010581	GCAA	2	8	306188	306195	50 %	0 %	25 %	25 %	182677264
5522	NC_010581	TGAAA	2	10	306265	306274	60 %	20 %	20 %	0 %	182677264
5523	NC_010581	TCAG	2	8	306291	306298	25 %	25 %	25 %	25 %	182677264
5524	NC_010581	TTGGC	2	10	306376	306385	0 %	40 %	40 %	20 %	182677264
5525	NC_010581	TGCC	2	8	307059	307066	0 %	25 %	25 %	50 %	182677265
5526	NC_010581	TTTC	2	8	307070	307077	0 %	75 %	0 %	25 %	182677265
5527	NC_010581	CGT	2	6	307094	307099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5528	NC_010581	CGC	2	6	307177	307182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677265
5529	NC_010581	GCCC	2	8	307238	307245	0 %	0 %	25 %	75 %	182677265
5530	NC_010581	AGC	2	6	307264	307269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5531	NC_010581	GGA	2	6	307301	307306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677265
5532	NC_010581	GCC	2	6	307332	307337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677265
5533	NC_010581	CCT	2	6	307364	307369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677265
5534	NC_010581	GC	4	8	307377	307384	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5535	NC_010581	ATC	2	6	307404	307409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677265
5536	NC_010581	AC	3	6	307482	307487	50 %	0 %	0 %	50 %	182677265
5537	NC_010581	GCGCC	2	10	307489	307498	0 %	0 %	40 %	60 %	182677265
5538	NC_010581	CGGC	2	8	307520	307527	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5539	NC_010581	CTGC	2	8	307539	307546	0 %	25 %	25 %	50 %	182677265
5540	NC_010581	GGC	2	6	307562	307567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677265
5541	NC_010581	CG	3	6	307571	307576	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5542	NC_010581	GC	3	6	307583	307588	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5543	NC_010581	GGC	2	6	307646	307651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677265
5544	NC_010581	GCG	2	6	307656	307661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677265
5545	NC_010581	CG	3	6	307675	307680	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5546	NC_010581	GAG	2	6	307704	307709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677265
5547	NC_010581	GGA	2	6	307739	307744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677265
5548	NC_010581	CCAA	2	8	307756	307763	50 %	0 %	0 %	50 %	182677265
5549	NC_010581	GTC	2	6	307770	307775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5550	NC_010581	GCGCT	2	10	307824	307833	0 %	20 %	40 %	40 %	182677265
5551	NC_010581	CGT	2	6	307850	307855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5552	NC_010581	TCG	2	6	307885	307890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5553	NC_010581	GAT	2	6	308033	308038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677265
5554	NC_010581	GC	3	6	308072	308077	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5555	NC_010581	CGG	2	6	308113	308118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677265
5556	NC_010581	GCG	2	6	308171	308176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677265
5557	NC_010581	TCA	2	6	308185	308190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677265
5558	NC_010581	ATG	2	6	308203	308208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677265
5559	NC_010581	GAC	2	6	308220	308225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5560	NC_010581	CG	3	6	308251	308256	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5561	NC_010581	CTC	2	6	308310	308315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677265
5562	NC_010581	GATC	2	8	308324	308331	25 %	25 %	25 %	25 %	182677265
5563	NC_010581	CGA	2	6	308332	308337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677265
5564	NC_010581	CG	3	6	308358	308363	0 %	0 %	50 %	50 %	182677265
5565	NC_010581	GCC	2	6	308408	308413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677265
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5569	NC_010581	TCG	2	6	308659	308664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677266
5570	NC_010581	CG	3	6	308687	308692	0 %	0 %	50 %	50 %	182677266
5571	NC_010581	TGG	2	6	308761	308766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677266
5572	NC_010581	CGG	2	6	308777	308782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677266
5573	NC_010581	CGC	2	6	308800	308805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677266
5574	NC_010581	GTGC	2	8	308806	308813	0 %	25 %	50 %	25 %	182677266
5575	NC_010581	TCGGA	2	10	308846	308855	20 %	20 %	40 %	20 %	182677266
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5578	NC_010581	TTCA	2	8	309007	309014	25 %	50 %	0 %	25 %	182677266
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5584	NC_010581	TGGCG	2	10	309931	309940	0 %	20 %	60 %	20 %	182677267
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5592	NC_010581	TGG	2	6	310245	310250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677267
5593	NC_010581	TTCC	2	8	310269	310276	0 %	50 %	0 %	50 %	182677267
5594	NC_010581	TCG	3	9	310284	310292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677267
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5597	NC_010581	CAT	2	6	310447	310452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677267
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5603	NC_010581	CACC	2	8	310662	310669	25 %	0 %	0 %	75 %	182677267
5604	NC_010581	TCA	2	6	310713	310718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677267
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5607	NC_010581	GAT	2	6	310978	310983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677267
5608	NC_010581	GCC	2	6	311030	311035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677267
5609	NC_010581	GGAAGG	2	12	311095	311106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677267
5610	NC_010581	GTC	2	6	311117	311122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677267
5611	NC_010581	GATT	2	8	311148	311155	25 %	50 %	25 %	0 %	182677267
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5616	NC_010581	TGC	2	6	311461	311466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677267
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5619	NC_010581	CGC	2	6	311604	311609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677267
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5622	NC_010581	GAA	2	6	311811	311816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677268
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5861	NC_010581	GCGTC	2	10	325452	325461	0 %	20 %	40 %	40 %	182677281
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