MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010581	CGC	2	6	245442	245447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4502	NC_010581	GATG	2	8	245448	245455	25 %	25 %	50 %	0 %	182677207
4503	NC_010581	CTG	2	6	245488	245493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677207
4504	NC_010581	CG	3	6	245550	245555	0 %	0 %	50 %	50 %	182677207
4505	NC_010581	GCCTG	2	10	245574	245583	0 %	20 %	40 %	40 %	182677207
4506	NC_010581	CGG	2	6	245601	245606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677207
4507	NC_010581	TGA	2	6	245607	245612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677207
4508	NC_010581	GCC	2	6	245634	245639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677207
4509	NC_010581	TG	3	6	245647	245652	0 %	50 %	50 %	0 %	182677207
4510	NC_010581	GGCGCT	2	12	245667	245678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182677207
4511	NC_010581	GCG	2	6	245714	245719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677207
4512	NC_010581	TGG	2	6	246031	246036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677208
4513	NC_010581	ATT	2	6	246051	246056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677208
4514	NC_010581	CAGC	2	8	246100	246107	25 %	0 %	25 %	50 %	182677208
4515	NC_010581	GTG	2	6	246214	246219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677208
4516	NC_010581	GCG	2	6	246283	246288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4517	NC_010581	GC	3	6	246315	246320	0 %	0 %	50 %	50 %	182677208
4518	NC_010581	CCGCA	2	10	246327	246336	20 %	0 %	20 %	60 %	182677208
4519	NC_010581	GGC	2	6	246339	246344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4520	NC_010581	GCT	2	6	246423	246428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677208
4521	NC_010581	TGACCT	2	12	246434	246445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182677208
4522	NC_010581	CTG	2	6	246451	246456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677208
4523	NC_010581	GTC	2	6	246493	246498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677208
4524	NC_010581	TTGG	2	8	246505	246512	0 %	50 %	50 %	0 %	182677208
4525	NC_010581	CG	3	6	246546	246551	0 %	0 %	50 %	50 %	182677208
4526	NC_010581	GAT	2	6	246631	246636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677208
4527	NC_010581	CCA	2	6	246650	246655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677208
4528	NC_010581	GGC	2	6	246699	246704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4529	NC_010581	CCA	2	6	246740	246745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677208
4530	NC_010581	GCTC	2	8	246939	246946	0 %	25 %	25 %	50 %	182677208
4531	NC_010581	CGGT	2	8	246962	246969	0 %	25 %	50 %	25 %	182677208
4532	NC_010581	TTC	2	6	247021	247026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677208
4533	NC_010581	TTA	2	6	247067	247072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677208
4534	NC_010581	GGT	2	6	247104	247109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677208
4535	NC_010581	GCC	2	6	247207	247212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677208
4536	NC_010581	CGG	2	6	247236	247241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4537	NC_010581	ACGGC	2	10	247247	247256	20 %	0 %	40 %	40 %	182677208
4538	NC_010581	CGG	2	6	247335	247340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4539	NC_010581	AGG	2	6	247367	247372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677208
4540	NC_010581	GCG	2	6	247374	247379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4541	NC_010581	CCG	2	6	247448	247453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677208
4542	NC_010581	GTT	2	6	247470	247475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677208
4543	NC_010581	GCC	2	6	247477	247482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677208
4544	NC_010581	ATT	2	6	247499	247504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677208
4545	NC_010581	TC	3	6	247563	247568	0 %	50 %	0 %	50 %	182677208
4546	NC_010581	CGG	2	6	247599	247604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4547	NC_010581	TACCT	2	10	247610	247619	20 %	40 %	0 %	40 %	182677208
4548	NC_010581	CGG	2	6	247623	247628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4549	NC_010581	GTCG	2	8	247645	247652	0 %	25 %	50 %	25 %	182677208
4550	NC_010581	GGC	2	6	247653	247658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4551	NC_010581	TGT	2	6	247665	247670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677208
4552	NC_010581	GCG	2	6	247680	247685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4553	NC_010581	CG	3	6	247741	247746	0 %	0 %	50 %	50 %	182677208
4554	NC_010581	GCT	2	6	247794	247799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677208
4555	NC_010581	CGC	2	6	247811	247816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677208
4556	NC_010581	GCG	2	6	247870	247875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4557	NC_010581	GCT	2	6	247887	247892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677208
4558	NC_010581	GGC	2	6	247939	247944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677208
4559	NC_010581	GAA	2	6	247962	247967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677208
4560	NC_010581	GGGT	2	8	248353	248360	0 %	25 %	75 %	0 %	182677209
4561	NC_010581	CGT	2	6	248389	248394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677209
4562	NC_010581	TGC	2	6	248406	248411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677209
4563	NC_010581	GAT	2	6	248428	248433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677209
4564	NC_010581	TAT	2	6	248435	248440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677209
4565	NC_010581	CG	3	6	248496	248501	0 %	0 %	50 %	50 %	182677209
4566	NC_010581	CGC	2	6	248505	248510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677209
4567	NC_010581	CG	3	6	248580	248585	0 %	0 %	50 %	50 %	182677209
4568	NC_010581	TCA	2	6	248601	248606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677209
4569	NC_010581	ATA	2	6	248655	248660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677209
4570	NC_010581	CGA	2	6	248721	248726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677209
4571	NC_010581	CAC	2	6	248743	248748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677209
4572	NC_010581	CGT	2	6	248764	248769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677209
4573	NC_010581	ATG	2	6	248865	248870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677209
4574	NC_010581	GCC	2	6	248882	248887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677209
4575	NC_010581	ATT	2	6	248959	248964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677209
4576	NC_010581	CTCG	2	8	249016	249023	0 %	25 %	25 %	50 %	182677209
4577	NC_010581	TCT	2	6	249175	249180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677209
4578	NC_010581	A	6	6	249200	249205	100 %	0 %	0 %	0 %	182677209
4579	NC_010581	CATG	2	8	249420	249427	25 %	25 %	25 %	25 %	182677210
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4581	NC_010581	GAA	2	6	249596	249601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677210
4582	NC_010581	CG	3	6	249607	249612	0 %	0 %	50 %	50 %	182677210
4583	NC_010581	GCG	2	6	249692	249697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677210
4584	NC_010581	GAT	3	9	249758	249766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677210
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4586	NC_010581	GC	4	8	249828	249835	0 %	0 %	50 %	50 %	182677210
4587	NC_010581	CCTT	2	8	249846	249853	0 %	50 %	0 %	50 %	182677210
4588	NC_010581	ATC	2	6	249949	249954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677210
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4590	NC_010581	TCG	3	9	250029	250037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677210
4591	NC_010581	TCGA	2	8	250049	250056	25 %	25 %	25 %	25 %	182677210
4592	NC_010581	TGA	2	6	250057	250062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677210
4593	NC_010581	CGG	2	6	250090	250095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677210
4594	NC_010581	CGGCG	2	10	250133	250142	0 %	0 %	60 %	40 %	182677210
4595	NC_010581	TGA	2	6	250143	250148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677210
4596	NC_010581	TGGC	2	8	250251	250258	0 %	25 %	50 %	25 %	182677210
4597	NC_010581	CCCG	2	8	250262	250269	0 %	0 %	25 %	75 %	182677210
4598	NC_010581	CGGC	2	8	250281	250288	0 %	0 %	50 %	50 %	182677210
4599	NC_010581	GC	3	6	250301	250306	0 %	0 %	50 %	50 %	182677210
4600	NC_010581	CGC	2	6	250668	250673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677211
4601	NC_010581	CAGC	2	8	250854	250861	25 %	0 %	25 %	50 %	182677212
4602	NC_010581	AAC	2	6	250867	250872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677212
4603	NC_010581	AGA	2	6	250960	250965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677212
4604	NC_010581	TTC	2	6	251013	251018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677212
4605	NC_010581	GCC	2	6	251076	251081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677212
4606	NC_010581	TCG	2	6	251152	251157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677212
4607	NC_010581	CG	4	8	251162	251169	0 %	0 %	50 %	50 %	182677212
4608	NC_010581	GCG	2	6	251213	251218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677212
4609	NC_010581	ATT	2	6	251422	251427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677212
4610	NC_010581	CGG	2	6	251447	251452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677212
4611	NC_010581	CGC	2	6	251487	251492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677212
4612	NC_010581	TCG	2	6	251506	251511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677212
4613	NC_010581	CGG	2	6	251543	251548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677212
4614	NC_010581	CCGT	2	8	251595	251602	0 %	25 %	25 %	50 %	182677212
4615	NC_010581	GTC	2	6	251628	251633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677212
4616	NC_010581	GC	3	6	251676	251681	0 %	0 %	50 %	50 %	182677212
4617	NC_010581	CGC	3	9	251723	251731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677212
4618	NC_010581	GC	3	6	252109	252114	0 %	0 %	50 %	50 %	182677213
4619	NC_010581	GGC	2	6	252130	252135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677213
4620	NC_010581	GAG	3	9	252197	252205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677213
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4622	NC_010581	GAT	3	9	252541	252549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677214
4623	NC_010581	GC	4	8	252601	252608	0 %	0 %	50 %	50 %	182677214
4624	NC_010581	GTT	2	6	252643	252648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677214
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4733	NC_010581	CAA	2	6	259532	259537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677220
4734	NC_010581	GAA	2	6	259566	259571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677220
4735	NC_010581	GATC	2	8	259654	259661	25 %	25 %	25 %	25 %	182677220
4736	NC_010581	TCT	2	6	259731	259736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677220
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4738	NC_010581	AG	3	6	260103	260108	50 %	0 %	50 %	0 %	182677221
4739	NC_010581	CGCGC	2	10	260142	260151	0 %	0 %	40 %	60 %	182677221
4740	NC_010581	GA	3	6	260213	260218	50 %	0 %	50 %	0 %	182677221
4741	NC_010581	CGC	2	6	260248	260253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677221
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4869	NC_010581	CG	3	6	267185	267190	0 %	0 %	50 %	50 %	182677226
4870	NC_010581	ATATCG	2	12	267199	267210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	182677226
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4987	NC_010581	CG	3	6	274247	274252	0 %	0 %	50 %	50 %	182677234
4988	NC_010581	GCA	2	6	274491	274496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677235
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4990	NC_010581	CG	3	6	274653	274658	0 %	0 %	50 %	50 %	182677235
4991	NC_010581	CCG	2	6	274686	274691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677235
4992	NC_010581	GAT	2	6	274696	274701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677235
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