MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	CCTC	2	8	244	251	0 %	25 %	0 %	75 %	182676826
2	NC_010580	GCTC	2	8	368	375	0 %	25 %	25 %	50 %	182676826
3	NC_010580	GATC	2	8	540	547	25 %	25 %	25 %	25 %	182676826
4	NC_010580	GGCC	2	8	628	635	0 %	0 %	50 %	50 %	182676827
5	NC_010580	GCAG	2	8	718	725	25 %	0 %	50 %	25 %	182676827
6	NC_010580	GGGC	2	8	916	923	0 %	0 %	75 %	25 %	182676827
7	NC_010580	TCAA	2	8	1712	1719	50 %	25 %	0 %	25 %	182676828
8	NC_010580	CGAT	2	8	2189	2196	25 %	25 %	25 %	25 %	182676828
9	NC_010580	GCCC	2	8	2556	2563	0 %	0 %	25 %	75 %	182676828
10	NC_010580	GCCA	2	8	2891	2898	25 %	0 %	25 %	50 %	182676829
11	NC_010580	TCAC	2	8	3419	3426	25 %	25 %	0 %	50 %	182676831
12	NC_010580	GGCG	2	8	3693	3700	0 %	0 %	75 %	25 %	182676831
13	NC_010580	GAAG	2	8	3837	3844	50 %	0 %	50 %	0 %	182676831
14	NC_010580	TTCT	2	8	4146	4153	0 %	75 %	0 %	25 %	182676832
15	NC_010580	GCTG	2	8	4499	4506	0 %	25 %	50 %	25 %	182676832
16	NC_010580	CGGC	2	8	4600	4607	0 %	0 %	50 %	50 %	182676832
17	NC_010580	GAAA	2	8	5208	5215	75 %	0 %	25 %	0 %	182676833
18	NC_010580	CGAA	2	8	5220	5227	50 %	0 %	25 %	25 %	182676833
19	NC_010580	GACC	2	8	5553	5560	25 %	0 %	25 %	50 %	182676833
20	NC_010580	CGAA	2	8	5924	5931	50 %	0 %	25 %	25 %	182676835
21	NC_010580	CGGT	2	8	6019	6026	0 %	25 %	50 %	25 %	182676835
22	NC_010580	ATCC	2	8	6172	6179	25 %	25 %	0 %	50 %	182676835
23	NC_010580	ATCT	2	8	6210	6217	25 %	50 %	0 %	25 %	182676835
24	NC_010580	TCCT	2	8	6327	6334	0 %	50 %	0 %	50 %	182676835
25	NC_010580	GCTC	2	8	7877	7884	0 %	25 %	25 %	50 %	182676835
26	NC_010580	AGGC	2	8	8221	8228	25 %	0 %	50 %	25 %	182676835
27	NC_010580	CAGC	2	8	8372	8379	25 %	0 %	25 %	50 %	182676836
28	NC_010580	TGCC	2	8	8477	8484	0 %	25 %	25 %	50 %	182676836
29	NC_010580	GCGA	2	8	10996	11003	25 %	0 %	50 %	25 %	182676839
30	NC_010580	GACT	2	8	11326	11333	25 %	25 %	25 %	25 %	182676840
31	NC_010580	GATC	2	8	12279	12286	25 %	25 %	25 %	25 %	182676841
32	NC_010580	ATCG	2	8	12406	12413	25 %	25 %	25 %	25 %	182676841
33	NC_010580	GCGG	2	8	12700	12707	0 %	0 %	75 %	25 %	182676841
34	NC_010580	TCGA	2	8	12872	12879	25 %	25 %	25 %	25 %	182676841
35	NC_010580	GCCC	2	8	13320	13327	0 %	0 %	25 %	75 %	182676841
36	NC_010580	CACG	2	8	13650	13657	25 %	0 %	25 %	50 %	182676841
37	NC_010580	CTTG	2	8	13860	13867	0 %	50 %	25 %	25 %	182676841
38	NC_010580	TCGA	2	8	13916	13923	25 %	25 %	25 %	25 %	182676841
39	NC_010580	AAAG	2	8	15708	15715	75 %	0 %	25 %	0 %	182676843
40	NC_010580	TCAA	2	8	17383	17390	50 %	25 %	0 %	25 %	182676844
41	NC_010580	GCTG	2	8	17537	17544	0 %	25 %	50 %	25 %	182676844
42	NC_010580	TTCA	2	8	17860	17867	25 %	50 %	0 %	25 %	182676844
43	NC_010580	TCGG	2	8	17973	17980	0 %	25 %	50 %	25 %	182676844
44	NC_010580	CTCC	2	8	17999	18006	0 %	25 %	0 %	75 %	182676844
45	NC_010580	GAGC	2	8	18477	18484	25 %	0 %	50 %	25 %	182676844
46	NC_010580	CAGT	2	8	18739	18746	25 %	25 %	25 %	25 %	182676844
47	NC_010580	GGCG	2	8	19224	19231	0 %	0 %	75 %	25 %	182676844
48	NC_010580	GCCT	2	8	19338	19345	0 %	25 %	25 %	50 %	182676844
49	NC_010580	GCGA	2	8	19714	19721	25 %	0 %	50 %	25 %	182676844
50	NC_010580	GCCA	2	8	20041	20048	25 %	0 %	25 %	50 %	182676844
51	NC_010580	CCGA	2	8	20392	20399	25 %	0 %	25 %	50 %	182676844
52	NC_010580	CGGT	2	8	20648	20655	0 %	25 %	50 %	25 %	182676844
53	NC_010580	GGAA	2	8	21138	21145	50 %	0 %	50 %	0 %	182676844
54	NC_010580	CATT	2	8	21875	21882	25 %	50 %	0 %	25 %	182676844
55	NC_010580	CGGG	2	8	22652	22659	0 %	0 %	75 %	25 %	182676844
56	NC_010580	CGGG	2	8	22892	22899	0 %	0 %	75 %	25 %	182676844
57	NC_010580	TGGC	2	8	23381	23388	0 %	25 %	50 %	25 %	182676844
58	NC_010580	TGGC	2	8	24128	24135	0 %	25 %	50 %	25 %	182676844
59	NC_010580	CGGG	2	8	24413	24420	0 %	0 %	75 %	25 %	182676844
60	NC_010580	GGCC	2	8	25198	25205	0 %	0 %	50 %	50 %	182676845
61	NC_010580	GCAC	2	8	25261	25268	25 %	0 %	25 %	50 %	182676845
62	NC_010580	GATC	2	8	25802	25809	25 %	25 %	25 %	25 %	182676845
63	NC_010580	GCAT	2	8	25999	26006	25 %	25 %	25 %	25 %	182676845
64	NC_010580	GTCG	2	8	26198	26205	0 %	25 %	50 %	25 %	182676845
65	NC_010580	CTGC	2	8	27256	27263	0 %	25 %	25 %	50 %	182676846
66	NC_010580	GCCG	2	8	27341	27348	0 %	0 %	50 %	50 %	182676846
67	NC_010580	TCGC	2	8	29073	29080	0 %	25 %	25 %	50 %	182676847
68	NC_010580	TTCA	2	8	29189	29196	25 %	50 %	0 %	25 %	182676847
69	NC_010580	GAGC	2	8	29707	29714	25 %	0 %	50 %	25 %	182676848
70	NC_010580	GCCA	2	8	29944	29951	25 %	0 %	25 %	50 %	182676848
71	NC_010580	TCGA	2	8	30026	30033	25 %	25 %	25 %	25 %	182676848
72	NC_010580	GAAA	2	8	30311	30318	75 %	0 %	25 %	0 %	182676849
73	NC_010580	AGCC	2	8	30633	30640	25 %	0 %	25 %	50 %	182676849
74	NC_010580	GATG	2	8	31327	31334	25 %	25 %	50 %	0 %	182676850
75	NC_010580	CATG	2	8	31665	31672	25 %	25 %	25 %	25 %	182676850
76	NC_010580	AGGG	2	8	31726	31733	25 %	0 %	75 %	0 %	182676850
77	NC_010580	GAAC	2	8	31879	31886	50 %	0 %	25 %	25 %	182676850
78	NC_010580	AAGA	2	8	31898	31905	75 %	0 %	25 %	0 %	182676850
79	NC_010580	GAAT	2	8	32485	32492	50 %	25 %	25 %	0 %	182676851
80	NC_010580	GTCA	2	8	33233	33240	25 %	25 %	25 %	25 %	182676852
81	NC_010580	ATCT	2	8	33250	33257	25 %	50 %	0 %	25 %	182676852
82	NC_010580	ATCA	2	8	34316	34323	50 %	25 %	0 %	25 %	182676854
83	NC_010580	CGAA	2	8	34392	34399	50 %	0 %	25 %	25 %	182676854
84	NC_010580	ATGC	2	8	34806	34813	25 %	25 %	25 %	25 %	182676855
85	NC_010580	TCGA	2	8	35034	35041	25 %	25 %	25 %	25 %	182676855
86	NC_010580	CCGT	2	8	36110	36117	0 %	25 %	25 %	50 %	182676858
87	NC_010580	AGCC	2	8	36245	36252	25 %	0 %	25 %	50 %	182676858
88	NC_010580	AGAA	2	8	36882	36889	75 %	0 %	25 %	0 %	182676860
89	NC_010580	TGAC	2	8	36894	36901	25 %	25 %	25 %	25 %	182676860
90	NC_010580	GCCG	2	8	36949	36956	0 %	0 %	50 %	50 %	182676861
91	NC_010580	CACC	2	8	37027	37034	25 %	0 %	0 %	75 %	182676861
92	NC_010580	CCTT	2	8	37096	37103	0 %	50 %	0 %	50 %	182676861
93	NC_010580	AGGA	2	8	37152	37159	50 %	0 %	50 %	0 %	182676861
94	NC_010580	CGGC	2	8	37371	37378	0 %	0 %	50 %	50 %	182676861
95	NC_010580	CATT	2	8	37478	37485	25 %	50 %	0 %	25 %	182676861
96	NC_010580	GGAT	2	8	37597	37604	25 %	25 %	50 %	0 %	182676862
97	NC_010580	ATTG	2	8	37686	37693	25 %	50 %	25 %	0 %	182676862
98	NC_010580	ACGA	2	8	37753	37760	50 %	0 %	25 %	25 %	182676862
99	NC_010580	CCGA	2	8	38638	38645	25 %	0 %	25 %	50 %	182676864
100	NC_010580	CTCA	2	8	39703	39710	25 %	25 %	0 %	50 %	182676865
101	NC_010580	TGGA	2	8	39978	39985	25 %	25 %	50 %	0 %	182676866
102	NC_010580	GCGA	2	8	40575	40582	25 %	0 %	50 %	25 %	182676867
103	NC_010580	TAGA	2	8	40704	40711	50 %	25 %	25 %	0 %	182676867
104	NC_010580	TGAA	2	8	40776	40783	50 %	25 %	25 %	0 %	182676867
105	NC_010580	CGAG	2	8	43012	43019	25 %	0 %	50 %	25 %	182676870
106	NC_010580	ATCA	2	8	44263	44270	50 %	25 %	0 %	25 %	182676873
107	NC_010580	GGCA	2	8	44320	44327	25 %	0 %	50 %	25 %	182676873
108	NC_010580	CAGA	2	8	44464	44471	50 %	0 %	25 %	25 %	182676873
109	NC_010580	TCCT	2	8	44784	44791	0 %	50 %	0 %	50 %	182676874
110	NC_010580	GCCG	2	8	46162	46169	0 %	0 %	50 %	50 %	182676878
111	NC_010580	AAGG	2	8	46824	46831	50 %	0 %	50 %	0 %	182676878
112	NC_010580	TCGT	2	8	46840	46847	0 %	50 %	25 %	25 %	182676878
113	NC_010580	CAAG	2	8	47132	47139	50 %	0 %	25 %	25 %	182676878
114	NC_010580	GGCG	2	8	49204	49211	0 %	0 %	75 %	25 %	182676880
115	NC_010580	CAGG	2	8	49219	49226	25 %	0 %	50 %	25 %	182676880
116	NC_010580	TGCC	2	8	49250	49257	0 %	25 %	25 %	50 %	182676880
117	NC_010580	TCGC	2	8	50166	50173	0 %	25 %	25 %	50 %	182676880
118	NC_010580	CTGG	2	8	50308	50315	0 %	25 %	50 %	25 %	182676880
119	NC_010580	CCAG	2	8	50338	50345	25 %	0 %	25 %	50 %	182676880
120	NC_010580	GATC	2	8	50419	50426	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
121	NC_010580	CGGC	2	8	50889	50896	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
122	NC_010580	ATCG	2	8	51911	51918	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
123	NC_010580	GCAG	2	8	52303	52310	25 %	0 %	50 %	25 %	182676880
124	NC_010580	CTTG	2	8	52387	52394	0 %	50 %	25 %	25 %	182676880
125	NC_010580	TCGA	2	8	52407	52414	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
126	NC_010580	TCGA	2	8	52422	52429	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
127	NC_010580	CCAG	2	8	52435	52442	25 %	0 %	25 %	50 %	182676880
128	NC_010580	CCTT	2	8	52704	52711	0 %	50 %	0 %	50 %	182676880
129	NC_010580	CCTT	2	8	52794	52801	0 %	50 %	0 %	50 %	182676880
130	NC_010580	CTGG	2	8	52865	52872	0 %	25 %	50 %	25 %	182676880
131	NC_010580	CGGC	2	8	52945	52952	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
132	NC_010580	GCCG	2	8	53165	53172	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
133	NC_010580	TCGA	2	8	53316	53323	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
134	NC_010580	TCAG	2	8	53745	53752	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
135	NC_010580	CGGG	2	8	53979	53986	0 %	0 %	75 %	25 %	182676880
136	NC_010580	GGCG	2	8	54044	54051	0 %	0 %	75 %	25 %	182676880
137	NC_010580	GGCG	2	8	54077	54084	0 %	0 %	75 %	25 %	182676880
138	NC_010580	GGAA	2	8	54115	54122	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.