MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 2071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	TTC	2	6	66	71	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676826
2	NC_010580	GTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676826
3	NC_010580	ATC	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676826
4	NC_010580	ATG	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676826
5	NC_010580	TCG	3	9	458	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676826
6	NC_010580	GTC	2	6	484	489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676826
7	NC_010580	GCA	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676826
8	NC_010580	CCA	2	6	573	578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676826
9	NC_010580	GCC	2	6	603	608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676827
10	NC_010580	TCC	2	6	642	647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676827
11	NC_010580	GGC	2	6	892	897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676827
12	NC_010580	CGC	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676827
13	NC_010580	TGC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676827
14	NC_010580	GTG	3	9	1004	1012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676827
15	NC_010580	ACC	2	6	1042	1047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676827
16	NC_010580	CGG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676827
17	NC_010580	CCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676827
18	NC_010580	AGG	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676827
19	NC_010580	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676827
20	NC_010580	CTT	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676827
21	NC_010580	GGC	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676827
22	NC_010580	GAA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676827
23	NC_010580	CGC	2	6	1547	1552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676828
24	NC_010580	ATC	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
25	NC_010580	TCA	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
26	NC_010580	GAA	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676828
27	NC_010580	GCC	2	6	1898	1903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676828
28	NC_010580	ATC	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
29	NC_010580	GCC	2	6	1944	1949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676828
30	NC_010580	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676828
31	NC_010580	GAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676828
32	NC_010580	GCG	2	6	2232	2237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676828
33	NC_010580	CAT	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
34	NC_010580	GGC	3	9	2286	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676828
35	NC_010580	GGC	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676828
36	NC_010580	GAC	3	9	2325	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676828
37	NC_010580	TCA	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
38	NC_010580	TCA	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676828
39	NC_010580	TTC	2	6	2754	2759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676829
40	NC_010580	GAC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676829
41	NC_010580	CTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676829
42	NC_010580	CGT	2	6	2845	2850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676829
43	NC_010580	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676829
44	NC_010580	AGG	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676829
45	NC_010580	GAG	2	6	2933	2938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676830
46	NC_010580	TCG	2	6	2952	2957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676830
47	NC_010580	GTG	2	6	2961	2966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676830
48	NC_010580	TTG	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676830
49	NC_010580	GTT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676830
50	NC_010580	GGC	3	9	3088	3096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676830
51	NC_010580	ATC	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676830
52	NC_010580	GCT	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676830
53	NC_010580	GGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676830
54	NC_010580	TCG	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676830
55	NC_010580	GCT	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676830
56	NC_010580	AGG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676830
57	NC_010580	CAT	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676831
58	NC_010580	TGA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676831
59	NC_010580	TCA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676831
60	NC_010580	CAT	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676831
61	NC_010580	TGA	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676831
62	NC_010580	GGC	2	6	3954	3959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676832
63	NC_010580	GCC	2	6	4083	4088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676832
64	NC_010580	CGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676832
65	NC_010580	GCG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676832
66	NC_010580	TGC	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676832
67	NC_010580	GCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676832
68	NC_010580	ATT	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676832
69	NC_010580	CTT	2	6	4689	4694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676832
70	NC_010580	CGA	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676832
71	NC_010580	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676832
72	NC_010580	CGA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676832
73	NC_010580	GAC	3	9	5105	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676833
74	NC_010580	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676833
75	NC_010580	TCG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676833
76	NC_010580	GCC	2	6	5384	5389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676833
77	NC_010580	CTG	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676834
78	NC_010580	AGA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676834
79	NC_010580	CGC	2	6	5775	5780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676834
80	NC_010580	TGC	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676834
81	NC_010580	CTG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676835
82	NC_010580	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676835
83	NC_010580	GGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676835
84	NC_010580	GAC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
85	NC_010580	ACA	2	6	6388	6393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676835
86	NC_010580	CGC	2	6	6423	6428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676835
87	NC_010580	GAT	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676835
88	NC_010580	TGG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676835
89	NC_010580	ATC	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676835
90	NC_010580	GCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676835
91	NC_010580	ATC	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676835
92	NC_010580	ACG	2	6	6778	6783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
93	NC_010580	GAA	2	6	6801	6806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676835
94	NC_010580	ATC	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676835
95	NC_010580	CAG	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
96	NC_010580	ACA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676835
97	NC_010580	AGC	2	6	6898	6903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
98	NC_010580	TGG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676835
99	NC_010580	CGA	2	6	7058	7063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
100	NC_010580	GGC	2	6	7070	7075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676835
101	NC_010580	TCG	3	9	7087	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676835
102	NC_010580	CCT	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676835
103	NC_010580	GAT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676835
104	NC_010580	TCG	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676835
105	NC_010580	TGG	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676835
106	NC_010580	TAT	2	6	7221	7226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676835
107	NC_010580	CAG	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676835
108	NC_010580	GGC	2	6	7575	7580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676835
109	NC_010580	CGC	2	6	7581	7586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676835
110	NC_010580	TGC	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676835
111	NC_010580	GAA	2	6	7689	7694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676835
112	NC_010580	GAA	2	6	7808	7813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676835
113	NC_010580	CTC	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676835
114	NC_010580	AGG	2	6	7840	7845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676835
115	NC_010580	GCC	2	6	7979	7984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676835
116	NC_010580	CCG	2	6	8074	8079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676835
117	NC_010580	GCA	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676836
118	NC_010580	TCA	2	6	8564	8569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676836
119	NC_010580	AAG	3	9	8660	8668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676837
120	NC_010580	TGG	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676837
121	NC_010580	CGA	2	6	8855	8860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676837
122	NC_010580	TCT	2	6	9825	9830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676838
123	NC_010580	TCG	2	6	9857	9862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676838
124	NC_010580	AGC	2	6	9945	9950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676838
125	NC_010580	TCG	2	6	9956	9961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676838
126	NC_010580	CTG	2	6	10003	10008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676838
127	NC_010580	GAA	2	6	10042	10047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676838
128	NC_010580	TGG	2	6	10512	10517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676839
129	NC_010580	GTA	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676839
130	NC_010580	AGA	2	6	10552	10557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676839
131	NC_010580	TCC	2	6	10645	10650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676839
132	NC_010580	GCA	2	6	10661	10666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676839
133	NC_010580	CCG	2	6	10670	10675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676839
134	NC_010580	TGG	2	6	10712	10717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676839
135	NC_010580	ACG	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676839
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139	NC_010580	CAA	2	6	11021	11026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676839
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143	NC_010580	TGC	2	6	11428	11433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676840
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159	NC_010580	TCC	2	6	12617	12622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676841
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163	NC_010580	CCT	2	6	12825	12830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676841
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241	NC_010580	TCG	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676844
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253	NC_010580	CCA	2	6	18686	18691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676844
254	NC_010580	GGC	2	6	18724	18729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
255	NC_010580	GGC	2	6	18754	18759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
256	NC_010580	TCA	2	6	18782	18787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676844
257	NC_010580	ATA	2	6	18836	18841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676844
258	NC_010580	GCG	2	6	18947	18952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
259	NC_010580	GCG	2	6	18961	18966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
260	NC_010580	TCT	2	6	18995	19000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676844
261	NC_010580	GGC	2	6	19027	19032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
262	NC_010580	AGG	2	6	19103	19108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676844
263	NC_010580	CGG	2	6	19113	19118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
264	NC_010580	GGT	2	6	19174	19179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676844
265	NC_010580	AAT	2	6	19186	19191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676844
266	NC_010580	ATC	3	9	19192	19200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676844
267	NC_010580	CGG	2	6	19308	19313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
268	NC_010580	CCG	2	6	19364	19369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676844
269	NC_010580	GGC	2	6	19399	19404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
270	NC_010580	CCA	2	6	19701	19706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676844
271	NC_010580	TGG	2	6	19731	19736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676844
272	NC_010580	CAA	2	6	19767	19772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676844
273	NC_010580	GGT	2	6	19806	19811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676844
274	NC_010580	GAA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676844
275	NC_010580	GCT	2	6	20094	20099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676844
276	NC_010580	AAT	2	6	20155	20160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676844
277	NC_010580	CGG	2	6	20199	20204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
278	NC_010580	TGA	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676844
279	NC_010580	CGT	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676844
280	NC_010580	CGG	2	6	20348	20353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
281	NC_010580	GGC	2	6	20358	20363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
282	NC_010580	GGC	2	6	20430	20435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
283	NC_010580	GCT	2	6	20448	20453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676844
284	NC_010580	GCC	2	6	20626	20631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676844
285	NC_010580	ACG	2	6	20747	20752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676844
286	NC_010580	CAA	2	6	20757	20762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676844
287	NC_010580	ATC	2	6	20878	20883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676844
288	NC_010580	GGC	2	6	20893	20898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
289	NC_010580	CGG	2	6	20967	20972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
290	NC_010580	CAA	2	6	21063	21068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676844
291	NC_010580	TGC	2	6	21188	21193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676844
292	NC_010580	CAG	2	6	21226	21231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676844
293	NC_010580	CGG	2	6	21245	21250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676844
294	NC_010580	CAG	2	6	21296	21301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676844
295	NC_010580	CGA	2	6	21326	21331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676844
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298	NC_010580	AGC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676844
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302	NC_010580	GAT	2	6	21697	21702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676844
303	NC_010580	AAT	2	6	21940	21945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676844
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379	NC_010580	CGC	2	6	26332	26337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676845
380	NC_010580	CGC	2	6	26348	26353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676845
381	NC_010580	TGG	2	6	26359	26364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676845
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411	NC_010580	CCG	2	6	27948	27953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676846
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499	NC_010580	CAT	2	6	36349	36354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676859
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