MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 2958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010580	G	6	6	155797	155802	0 %	0 %	100 %	0 %	182676973
2502	NC_010580	CTG	2	6	155824	155829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676973
2503	NC_010580	CCG	2	6	155926	155931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676973
2504	NC_010580	GTG	2	6	156293	156298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676974
2505	NC_010580	GAC	2	6	156428	156433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676974
2506	NC_010580	CTT	2	6	156442	156447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676974
2507	NC_010580	GGC	2	6	156455	156460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676974
2508	NC_010580	TCC	2	6	156477	156482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676974
2509	NC_010580	TGA	2	6	156523	156528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676974
2510	NC_010580	CGA	2	6	156550	156555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676974
2511	NC_010580	CGC	2	6	156586	156591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676974
2512	NC_010580	A	6	6	156788	156793	100 %	0 %	0 %	0 %	182676974
2513	NC_010580	AGA	2	6	157497	157502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676975
2514	NC_010580	TGA	2	6	157503	157508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676975
2515	NC_010580	TAG	2	6	157620	157625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676975
2516	NC_010580	TGC	2	6	157640	157645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676975
2517	NC_010580	ATT	2	6	157648	157653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676975
2518	NC_010580	TCT	2	6	157666	157671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676975
2519	NC_010580	TGC	2	6	157683	157688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676975
2520	NC_010580	TAA	2	6	157760	157765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676975
2521	NC_010580	AGC	2	6	158010	158015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676976
2522	NC_010580	GGT	2	6	158026	158031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676976
2523	NC_010580	AG	3	6	158187	158192	50 %	0 %	50 %	0 %	182676976
2524	NC_010580	ATT	2	6	158252	158257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676976
2525	NC_010580	A	6	6	158294	158299	100 %	0 %	0 %	0 %	182676976
2526	NC_010580	ACGC	2	8	158333	158340	25 %	0 %	25 %	50 %	182676976
2527	NC_010580	GTT	2	6	158350	158355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676976
2528	NC_010580	TCGA	2	8	158471	158478	25 %	25 %	25 %	25 %	182676976
2529	NC_010580	CG	3	6	158490	158495	0 %	0 %	50 %	50 %	182676976
2530	NC_010580	GCCG	2	8	158518	158525	0 %	0 %	50 %	50 %	182676976
2531	NC_010580	TGT	2	6	158563	158568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676976
2532	NC_010580	CG	3	6	158685	158690	0 %	0 %	50 %	50 %	182676976
2533	NC_010580	GA	3	6	158691	158696	50 %	0 %	50 %	0 %	182676976
2534	NC_010580	CGT	2	6	158707	158712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676976
2535	NC_010580	ATT	2	6	158723	158728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676976
2536	NC_010580	GGT	2	6	158741	158746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676976
2537	NC_010580	GGC	2	6	158872	158877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676976
2538	NC_010580	GGAT	2	8	158929	158936	25 %	25 %	50 %	0 %	182676976
2539	NC_010580	AAGC	2	8	159072	159079	50 %	0 %	25 %	25 %	182676977
2540	NC_010580	TC	3	6	159081	159086	0 %	50 %	0 %	50 %	182676977
2541	NC_010580	CTT	2	6	159147	159152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676977
2542	NC_010580	CGG	2	6	159153	159158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676977
2543	NC_010580	AAG	2	6	159159	159164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676977
2544	NC_010580	ATC	2	6	159166	159171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676977
2545	NC_010580	GGA	2	6	159274	159279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676977
2546	NC_010580	GGC	2	6	159293	159298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676977
2547	NC_010580	TGGC	3	12	159317	159328	0 %	25 %	50 %	25 %	182676977
2548	NC_010580	TTCT	2	8	159420	159427	0 %	75 %	0 %	25 %	182676977
2549	NC_010580	GCT	2	6	159446	159451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676977
2550	NC_010580	GCCT	2	8	159521	159528	0 %	25 %	25 %	50 %	182676977
2551	NC_010580	CTTTT	2	10	159579	159588	0 %	80 %	0 %	20 %	182676978
2552	NC_010580	GGCC	2	8	159660	159667	0 %	0 %	50 %	50 %	182676978
2553	NC_010580	GCC	2	6	159727	159732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676978
2554	NC_010580	GGC	2	6	159755	159760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676978
2555	NC_010580	A	7	7	159887	159893	100 %	0 %	0 %	0 %	182676978
2556	NC_010580	AG	3	6	159981	159986	50 %	0 %	50 %	0 %	182676979
2557	NC_010580	ATC	2	6	160075	160080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676979
2558	NC_010580	CCT	2	6	160128	160133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676979
2559	NC_010580	GTT	2	6	160237	160242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676979
2560	NC_010580	AAT	2	6	160359	160364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676979
2561	NC_010580	ACC	2	6	160381	160386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676979
2562	NC_010580	TTC	2	6	160387	160392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676979
2563	NC_010580	ATC	2	6	160393	160398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676979
2564	NC_010580	CCT	2	6	160415	160420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676980
2565	NC_010580	GAA	2	6	160504	160509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676980
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2567	NC_010580	CCG	2	6	160615	160620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676980
2568	NC_010580	ACCA	2	8	160623	160630	50 %	0 %	0 %	50 %	182676980
2569	NC_010580	CTTC	2	8	160637	160644	0 %	50 %	0 %	50 %	182676980
2570	NC_010580	TGG	2	6	160670	160675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676980
2571	NC_010580	GA	3	6	160771	160776	50 %	0 %	50 %	0 %	182676980
2572	NC_010580	GGC	2	6	160872	160877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676980
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2574	NC_010580	GACGG	2	10	160917	160926	20 %	0 %	60 %	20 %	182676980
2575	NC_010580	AG	3	6	161012	161017	50 %	0 %	50 %	0 %	182676980
2576	NC_010580	CGA	2	6	161024	161029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676980
2577	NC_010580	CGCC	2	8	161063	161070	0 %	0 %	25 %	75 %	182676980
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2580	NC_010580	CAGG	2	8	161136	161143	25 %	0 %	50 %	25 %	182676980
2581	NC_010580	GACG	2	8	161190	161197	25 %	0 %	50 %	25 %	182676980
2582	NC_010580	CGG	2	6	161198	161203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676980
2583	NC_010580	CGATGA	2	12	161300	161311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182676980
2584	NC_010580	GAGC	2	8	161331	161338	25 %	0 %	50 %	25 %	182676980
2585	NC_010580	TTG	2	6	161356	161361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676980
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2587	NC_010580	A	6	6	161474	161479	100 %	0 %	0 %	0 %	182676980
2588	NC_010580	GGT	3	9	161514	161522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676980
2589	NC_010580	CGG	2	6	161558	161563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676980
2590	NC_010580	AAG	2	6	161612	161617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676980
2591	NC_010580	GCCG	2	8	161694	161701	0 %	0 %	50 %	50 %	182676980
2592	NC_010580	TGA	2	6	161738	161743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676980
2593	NC_010580	GGA	2	6	161963	161968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676980
2594	NC_010580	CTG	2	6	161970	161975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676980
2595	NC_010580	TGC	2	6	162031	162036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676980
2596	NC_010580	TCGGGA	2	12	162143	162154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182676980
2597	NC_010580	TGAT	2	8	162178	162185	25 %	50 %	25 %	0 %	182676980
2598	NC_010580	GGT	2	6	162225	162230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676980
2599	NC_010580	ATC	2	6	162244	162249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676980
2600	NC_010580	TGGCAT	2	12	162290	162301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676980
2601	NC_010580	GAC	2	6	162342	162347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676980
2602	NC_010580	CAT	2	6	162387	162392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676980
2603	NC_010580	GGC	2	6	162396	162401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676980
2604	NC_010580	ACG	2	6	162415	162420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676980
2605	NC_010580	CCAT	2	8	162422	162429	25 %	25 %	0 %	50 %	182676980
2606	NC_010580	GATG	2	8	162470	162477	25 %	25 %	50 %	0 %	182676980
2607	NC_010580	ATG	2	6	162481	162486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676980
2608	NC_010580	TTG	2	6	162595	162600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676980
2609	NC_010580	GCC	2	6	162610	162615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676980
2610	NC_010580	GCAA	2	8	162699	162706	50 %	0 %	25 %	25 %	182676980
2611	NC_010580	CTT	2	6	162912	162917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676981
2612	NC_010580	GGA	2	6	162959	162964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676981
2613	NC_010580	ATG	2	6	163249	163254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676981
2614	NC_010580	CAGG	2	8	163469	163476	25 %	0 %	50 %	25 %	182676981
2615	NC_010580	ATT	2	6	163551	163556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676981
2616	NC_010580	TTG	2	6	163623	163628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676981
2617	NC_010580	GCT	2	6	163675	163680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676981
2618	NC_010580	GT	3	6	163699	163704	0 %	50 %	50 %	0 %	182676981
2619	NC_010580	GTT	2	6	163717	163722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676981
2620	NC_010580	AGC	2	6	163728	163733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676981
2621	NC_010580	ATC	2	6	163764	163769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676981
2622	NC_010580	CAA	2	6	163788	163793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676981
2623	NC_010580	CGT	2	6	163827	163832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676981
2624	NC_010580	ATC	2	6	163938	163943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676981
2625	NC_010580	GAT	2	6	164025	164030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676981
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2629	NC_010580	GATG	2	8	164291	164298	25 %	25 %	50 %	0 %	182676982
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2631	NC_010580	TCA	2	6	164371	164376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676982
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2636	NC_010580	GCT	2	6	164578	164583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676982
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2652	NC_010580	CGT	2	6	165338	165343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676982
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2654	NC_010580	CGCTGA	2	12	165543	165554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676983
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2661	NC_010580	TGA	2	6	165768	165773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676983
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2744	NC_010580	TCCAAT	2	12	169737	169748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676989
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2865	NC_010580	GGA	2	6	175913	175918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676996
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