MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010553	CGT	2	6	190593	190598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064689
3502	NC_010553	TGC	2	6	190646	190651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064689
3503	NC_010553	GC	3	6	190743	190748	0 %	0 %	50 %	50 %	172064689
3504	NC_010553	TGT	2	6	190784	190789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064689
3505	NC_010553	TGA	2	6	190799	190804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064689
3506	NC_010553	GTT	2	6	190878	190883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064689
3507	NC_010553	GAC	2	6	190893	190898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064689
3508	NC_010553	GAT	2	6	191013	191018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064689
3509	NC_010553	CGGT	2	8	191024	191031	0 %	25 %	50 %	25 %	172064689
3510	NC_010553	CGGA	2	8	191129	191136	25 %	0 %	50 %	25 %	172064689
3511	NC_010553	CTT	2	6	191195	191200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064689
3512	NC_010553	GC	3	6	191228	191233	0 %	0 %	50 %	50 %	172064689
3513	NC_010553	TCA	2	6	191285	191290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064689
3514	NC_010553	CGG	2	6	191377	191382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064690
3515	NC_010553	AGC	2	6	191439	191444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3516	NC_010553	GCT	2	6	191456	191461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3517	NC_010553	CGC	2	6	191501	191506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064690
3518	NC_010553	GC	3	6	191509	191514	0 %	0 %	50 %	50 %	172064690
3519	NC_010553	GCC	2	6	191530	191535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064690
3520	NC_010553	CGG	2	6	191536	191541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064690
3521	NC_010553	CGG	2	6	191680	191685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064690
3522	NC_010553	GCA	2	6	191704	191709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3523	NC_010553	CG	3	6	191763	191768	0 %	0 %	50 %	50 %	172064690
3524	NC_010553	TGC	2	6	191787	191792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3525	NC_010553	GAT	2	6	191807	191812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064690
3526	NC_010553	GTCGC	2	10	191848	191857	0 %	20 %	40 %	40 %	172064690
3527	NC_010553	GC	3	6	191883	191888	0 %	0 %	50 %	50 %	172064690
3528	NC_010553	GCAACT	2	12	191917	191928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	172064690
3529	NC_010553	TCGGCG	2	12	191982	191993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	172064690
3530	NC_010553	GGC	2	6	191996	192001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064690
3531	NC_010553	GATCG	2	10	192020	192029	20 %	20 %	40 %	20 %	172064690
3532	NC_010553	CCG	2	6	192086	192091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064690
3533	NC_010553	AGC	2	6	192162	192167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3534	NC_010553	GC	3	6	192193	192198	0 %	0 %	50 %	50 %	172064690
3535	NC_010553	GC	3	6	192204	192209	0 %	0 %	50 %	50 %	172064690
3536	NC_010553	GCG	2	6	192235	192240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064690
3537	NC_010553	CGA	2	6	192244	192249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3538	NC_010553	CTGC	2	8	192286	192293	0 %	25 %	25 %	50 %	172064690
3539	NC_010553	GAG	2	6	192359	192364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064690
3540	NC_010553	GCA	2	6	192376	192381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064690
3541	NC_010553	CGA	2	6	192456	192461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3542	NC_010553	TCG	2	6	192467	192472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3543	NC_010553	GTGC	2	8	192511	192518	0 %	25 %	50 %	25 %	172064691
3544	NC_010553	CGG	2	6	192532	192537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064691
3545	NC_010553	CAG	2	6	192556	192561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3546	NC_010553	CGA	2	6	192588	192593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064691
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3548	NC_010553	GTC	2	6	192625	192630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3549	NC_010553	AGC	2	6	192722	192727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3550	NC_010553	GC	3	6	192726	192731	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3551	NC_010553	ATG	2	6	192740	192745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064691
3552	NC_010553	GCAG	2	8	192768	192775	25 %	0 %	50 %	25 %	172064691
3553	NC_010553	TCG	2	6	192815	192820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3554	NC_010553	CGC	2	6	192856	192861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064691
3555	NC_010553	GC	3	6	192877	192882	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3556	NC_010553	GC	3	6	192913	192918	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3557	NC_010553	CGG	2	6	192925	192930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064691
3558	NC_010553	CGG	2	6	192948	192953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064691
3559	NC_010553	CCGG	2	8	193002	193009	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3560	NC_010553	ACGCCC	2	12	193035	193046	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	172064691
3561	NC_010553	GC	3	6	193062	193067	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3562	NC_010553	GAT	2	6	193068	193073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064691
3563	NC_010553	CTG	2	6	193108	193113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064691
3564	NC_010553	GCCG	2	8	193206	193213	0 %	0 %	50 %	50 %	172064691
3565	NC_010553	CTC	2	6	193285	193290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064691
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3567	NC_010553	GCA	2	6	193350	193355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064691
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3569	NC_010553	TCG	2	6	193388	193393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064691
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3572	NC_010553	TCG	2	6	193634	193639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064692
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3586	NC_010553	GACA	2	8	194137	194144	50 %	0 %	25 %	25 %	172064692
3587	NC_010553	CGA	2	6	194239	194244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064692
3588	NC_010553	CG	3	6	194265	194270	0 %	0 %	50 %	50 %	172064692
3589	NC_010553	GCGG	2	8	194295	194302	0 %	0 %	75 %	25 %	172064692
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3593	NC_010553	CTT	2	6	194472	194477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064692
3594	NC_010553	GGCC	2	8	194496	194503	0 %	0 %	50 %	50 %	172064692
3595	NC_010553	GAA	2	6	194521	194526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064692
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3599	NC_010553	GC	3	6	194684	194689	0 %	0 %	50 %	50 %	172064692
3600	NC_010553	GCT	2	6	194704	194709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064692
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3602	NC_010553	GCAGCC	2	12	194820	194831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	172064692
3603	NC_010553	GC	3	6	194835	194840	0 %	0 %	50 %	50 %	172064692
3604	NC_010553	CGG	2	6	194890	194895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064692
3605	NC_010553	CGG	2	6	194898	194903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064692
3606	NC_010553	CGA	2	6	194916	194921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064692
3607	NC_010553	CGA	2	6	194992	194997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064692
3608	NC_010553	GCA	2	6	195000	195005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064692
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3611	NC_010553	TGC	2	6	195269	195274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064692
3612	NC_010553	GCG	2	6	195275	195280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064692
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3744	NC_010553	CTT	2	6	203144	203149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064698
3745	NC_010553	TTG	2	6	203154	203159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064698
3746	NC_010553	CTTC	2	8	203726	203733	0 %	50 %	0 %	50 %	172064699
3747	NC_010553	TGCG	2	8	203877	203884	0 %	25 %	50 %	25 %	172064699
3748	NC_010553	CGT	2	6	204002	204007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064700
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3764	NC_010553	TCT	2	6	205349	205354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064701
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3864	NC_010553	CGA	2	6	211862	211867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064709
3865	NC_010553	GTG	2	6	211940	211945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064709
3866	NC_010553	GCT	2	6	211983	211988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064709
3867	NC_010553	GCAT	2	8	211997	212004	25 %	25 %	25 %	25 %	172064709
3868	NC_010553	TGA	2	6	212020	212025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064709
3869	NC_010553	CCG	2	6	212091	212096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064709
3870	NC_010553	GCA	2	6	212151	212156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064709
3871	NC_010553	GGTTCG	2	12	212217	212228	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	172064709
3872	NC_010553	TGA	2	6	212277	212282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064709
3873	NC_010553	G	6	6	212286	212291	0 %	0 %	100 %	0 %	172064709
3874	NC_010553	TGA	2	6	212304	212309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064709
3875	NC_010553	CTG	2	6	212442	212447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064709
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3877	NC_010553	CGG	2	6	212586	212591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064709
3878	NC_010553	TTGC	2	8	212715	212722	0 %	50 %	25 %	25 %	172064710
3879	NC_010553	GCG	2	6	212889	212894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064710
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3881	NC_010553	T	6	6	213075	213080	0 %	100 %	0 %	0 %	172064710
3882	NC_010553	GGTC	2	8	213104	213111	0 %	25 %	50 %	25 %	172064710
3883	NC_010553	ACTC	2	8	213428	213435	25 %	25 %	0 %	50 %	172064711
3884	NC_010553	CAT	2	6	213437	213442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064711
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3886	NC_010553	CACGTT	2	12	213500	213511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172064711
3887	NC_010553	TGA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064711
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3889	NC_010553	CGT	2	6	213611	213616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064711
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3892	NC_010553	CACCC	2	10	214060	214069	20 %	0 %	0 %	80 %	172064712
3893	NC_010553	CGCA	2	8	215101	215108	25 %	0 %	25 %	50 %	172064713
3894	NC_010553	CG	3	6	215165	215170	0 %	0 %	50 %	50 %	172064713
3895	NC_010553	CAA	2	6	215204	215209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064713
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3897	NC_010553	GACG	2	8	215283	215290	25 %	0 %	50 %	25 %	172064713
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3899	NC_010553	C	6	6	215368	215373	0 %	0 %	0 %	100 %	172064713
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3985	NC_010553	GCC	2	6	221145	221150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064726
3986	NC_010553	CGA	2	6	221167	221172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064726
3987	NC_010553	GAT	2	6	221240	221245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064726
3988	NC_010553	AGG	2	6	221268	221273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064726
3989	NC_010553	TGAC	2	8	221365	221372	25 %	25 %	25 %	25 %	172064727
3990	NC_010553	CGCA	2	8	221391	221398	25 %	0 %	25 %	50 %	172064727
3991	NC_010553	GTC	2	6	221410	221415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064727
3992	NC_010553	TCGC	2	8	221477	221484	0 %	25 %	25 %	50 %	172064727
3993	NC_010553	TTC	2	6	221737	221742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064728
3994	NC_010553	CCG	2	6	221806	221811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064728
3995	NC_010553	CAG	2	6	221928	221933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064728
3996	NC_010553	CTC	2	6	221952	221957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064728
3997	NC_010553	GCC	2	6	221961	221966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064728
3998	NC_010553	ACGAC	2	10	221987	221996	40 %	0 %	20 %	40 %	172064728
3999	NC_010553	GC	3	6	222214	222219	0 %	0 %	50 %	50 %	172064729
4000	NC_010553	CGCT	2	8	222225	222232	0 %	25 %	25 %	50 %	172064729

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