MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010553	CG	3	6	169419	169424	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
3002	NC_010553	TTG	2	6	169425	169430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064675
3003	NC_010553	GCC	2	6	169463	169468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064675
3004	NC_010553	CG	3	6	169635	169640	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
3005	NC_010553	TGGC	2	8	169683	169690	0 %	25 %	50 %	25 %	172064675
3006	NC_010553	ACA	2	6	169759	169764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064675
3007	NC_010553	CGGG	2	8	169775	169782	0 %	0 %	75 %	25 %	172064675
3008	NC_010553	GAT	2	6	169834	169839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064675
3009	NC_010553	GC	3	6	170259	170264	0 %	0 %	50 %	50 %	172064676
3010	NC_010553	CGC	2	6	170272	170277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064676
3011	NC_010553	ACG	2	6	170293	170298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064676
3012	NC_010553	AAG	2	6	170319	170324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064676
3013	NC_010553	CTG	2	6	170389	170394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064676
3014	NC_010553	ACA	2	6	170413	170418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064676
3015	NC_010553	TGA	2	6	170435	170440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064676
3016	NC_010553	GAC	2	6	170538	170543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064676
3017	NC_010553	GCT	2	6	170588	170593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064676
3018	NC_010553	GGC	2	6	170732	170737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064676
3019	NC_010553	GC	4	8	170835	170842	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3020	NC_010553	GC	3	6	170860	170865	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3021	NC_010553	GCT	2	6	170882	170887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3022	NC_010553	CG	3	6	170890	170895	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3023	NC_010553	GC	3	6	170919	170924	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3024	NC_010553	ATC	2	6	171018	171023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064677
3025	NC_010553	GATC	2	8	171029	171036	25 %	25 %	25 %	25 %	172064677
3026	NC_010553	CAC	2	6	171069	171074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064677
3027	NC_010553	GAA	2	6	171075	171080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064677
3028	NC_010553	CGA	2	6	171140	171145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3029	NC_010553	AGG	2	6	171178	171183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064677
3030	NC_010553	GCG	2	6	171188	171193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064677
3031	NC_010553	GCGTG	2	10	171214	171223	0 %	20 %	60 %	20 %	172064677
3032	NC_010553	TTC	2	6	171237	171242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064677
3033	NC_010553	GCG	2	6	171277	171282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064677
3034	NC_010553	TCG	2	6	171298	171303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3035	NC_010553	CGC	2	6	171325	171330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064677
3036	NC_010553	CGC	2	6	171365	171370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064677
3037	NC_010553	GCG	2	6	171372	171377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064677
3038	NC_010553	GCCG	2	8	171404	171411	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3039	NC_010553	TGC	2	6	171412	171417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3040	NC_010553	TGACC	2	10	171452	171461	20 %	20 %	20 %	40 %	172064677
3041	NC_010553	CG	3	6	171557	171562	0 %	0 %	50 %	50 %	172064677
3042	NC_010553	CGA	2	6	171593	171598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3043	NC_010553	CGAC	2	8	171616	171623	25 %	0 %	25 %	50 %	172064677
3044	NC_010553	ATC	2	6	171631	171636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064677
3045	NC_010553	GGT	2	6	171738	171743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064677
3046	NC_010553	GTC	2	6	171744	171749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3047	NC_010553	CGG	2	6	171785	171790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064677
3048	NC_010553	CCGA	2	8	171807	171814	25 %	0 %	25 %	50 %	172064677
3049	NC_010553	GAA	2	6	171851	171856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064677
3050	NC_010553	GCGAAC	2	12	171960	171971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3051	NC_010553	CT	3	6	171972	171977	0 %	50 %	0 %	50 %	172064677
3052	NC_010553	GCA	2	6	172076	172081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3053	NC_010553	TAC	2	6	172104	172109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064677
3054	NC_010553	TCG	2	6	172131	172136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3055	NC_010553	CGC	2	6	172163	172168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064677
3056	NC_010553	GGT	2	6	172175	172180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064677
3057	NC_010553	GAA	2	6	172185	172190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064677
3058	NC_010553	CTA	2	6	172208	172213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064677
3059	NC_010553	TTC	2	6	172224	172229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064677
3060	NC_010553	TCG	2	6	172276	172281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064677
3061	NC_010553	GGC	2	6	172301	172306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064677
3062	NC_010553	GCG	2	6	172651	172656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064678
3063	NC_010553	ATCG	2	8	172701	172708	25 %	25 %	25 %	25 %	172064678
3064	NC_010553	CTGC	2	8	172733	172740	0 %	25 %	25 %	50 %	172064678
3065	NC_010553	CGA	2	6	172754	172759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064678
3066	NC_010553	CTG	2	6	172809	172814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064678
3067	NC_010553	ACG	2	6	172822	172827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064678
3068	NC_010553	CGA	2	6	172865	172870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064678
3069	NC_010553	CGT	2	6	172925	172930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064678
3070	NC_010553	GGC	4	12	172947	172958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064678
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3072	NC_010553	ACG	3	9	173123	173131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064679
3073	NC_010553	CGC	2	6	173132	173137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064679
3074	NC_010553	CAT	2	6	173287	173292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064679
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3077	NC_010553	TCG	3	9	173437	173445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064679
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3081	NC_010553	GC	3	6	173740	173745	0 %	0 %	50 %	50 %	172064680
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3083	NC_010553	CCG	5	15	173885	173899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064680
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3087	NC_010553	GC	3	6	174280	174285	0 %	0 %	50 %	50 %	172064680
3088	NC_010553	GCG	3	9	174332	174340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064680
3089	NC_010553	TGT	2	6	174357	174362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064680
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3091	NC_010553	CGC	2	6	174420	174425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064680
3092	NC_010553	GTT	2	6	174532	174537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064680
3093	NC_010553	TCG	2	6	174555	174560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064680
3094	NC_010553	GTG	2	6	174597	174602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064680
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3098	NC_010553	GC	3	6	174702	174707	0 %	0 %	50 %	50 %	172064680
3099	NC_010553	CAG	2	6	174728	174733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064680
3100	NC_010553	CAGC	2	8	174757	174764	25 %	0 %	25 %	50 %	172064680
3101	NC_010553	GGT	2	6	174811	174816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064680
3102	NC_010553	CCG	2	6	174830	174835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064680
3103	NC_010553	CTA	2	6	174865	174870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064680
3104	NC_010553	GGGC	2	8	174916	174923	0 %	0 %	75 %	25 %	172064680
3105	NC_010553	GC	3	6	175088	175093	0 %	0 %	50 %	50 %	172064681
3106	NC_010553	CAG	2	6	175141	175146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3107	NC_010553	CGA	2	6	175152	175157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3108	NC_010553	CGC	2	6	175164	175169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064681
3109	NC_010553	GCT	2	6	175179	175184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3110	NC_010553	GGC	2	6	175188	175193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064681
3111	NC_010553	GAC	2	6	175255	175260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3112	NC_010553	GCT	2	6	175269	175274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3113	NC_010553	TGA	2	6	175371	175376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064681
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3115	NC_010553	GGGGCG	2	12	175397	175408	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	172064681
3116	NC_010553	CTG	2	6	175429	175434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3117	NC_010553	CGG	2	6	175458	175463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064681
3118	NC_010553	TTC	2	6	175471	175476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064681
3119	NC_010553	CTG	2	6	175477	175482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064681
3120	NC_010553	GTG	2	6	175576	175581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064681
3121	NC_010553	GACG	2	8	175585	175592	25 %	0 %	50 %	25 %	172064681
3122	NC_010553	TCA	2	6	175631	175636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064681
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3124	NC_010553	GCC	2	6	175738	175743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064681
3125	NC_010553	GCT	2	6	175749	175754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064681
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3132	NC_010553	GC	3	6	176136	176141	0 %	0 %	50 %	50 %	172064681
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3144	NC_010553	CTG	2	6	176619	176624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064682
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3149	NC_010553	CGA	2	6	176753	176758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064682
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3230	NC_010553	CAGC	2	8	180082	180089	25 %	0 %	25 %	50 %	172064682
3231	NC_010553	GATTTC	2	12	180102	180113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172064682
3232	NC_010553	GCG	2	6	180126	180131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064682
3233	NC_010553	TGA	2	6	180139	180144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064682
3234	NC_010553	ACGA	2	8	180168	180175	50 %	0 %	25 %	25 %	172064682
3235	NC_010553	CTG	2	6	180177	180182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064682
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3237	NC_010553	TGG	2	6	180429	180434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064683
3238	NC_010553	CGG	2	6	180467	180472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064683
3239	NC_010553	CTG	2	6	180487	180492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064683
3240	NC_010553	GTCGC	2	10	180499	180508	0 %	20 %	40 %	40 %	172064683
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3484	NC_010553	CAG	2	6	189952	189957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064688
3485	NC_010553	TTG	2	6	189969	189974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064688
3486	NC_010553	TCG	2	6	189998	190003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064688
3487	NC_010553	CGT	2	6	190040	190045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064688
3488	NC_010553	GC	3	6	190047	190052	0 %	0 %	50 %	50 %	172064688
3489	NC_010553	GAA	2	6	190077	190082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064688
3490	NC_010553	TGC	2	6	190108	190113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064688
3491	NC_010553	ACG	2	6	190120	190125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064688
3492	NC_010553	TCGA	2	8	190152	190159	25 %	25 %	25 %	25 %	172064688
3493	NC_010553	AGC	2	6	190168	190173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064688
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3497	NC_010553	CGT	2	6	190406	190411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064689
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3499	NC_010553	GC	3	6	190511	190516	0 %	0 %	50 %	50 %	172064689
3500	NC_010553	GAGCA	2	10	190555	190564	40 %	0 %	40 %	20 %	172064689

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