MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010553	CG	3	6	50701	50706	0 %	0 %	50 %	50 %	172064585
1002	NC_010553	TCG	2	6	50783	50788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1003	NC_010553	CGTC	2	8	50844	50851	0 %	25 %	25 %	50 %	172064585
1004	NC_010553	CGC	2	6	50861	50866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064585
1005	NC_010553	GCA	2	6	50970	50975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1006	NC_010553	CGT	2	6	50977	50982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1007	NC_010553	GAT	2	6	51046	51051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064585
1008	NC_010553	GGCTC	2	10	51060	51069	0 %	20 %	40 %	40 %	172064585
1009	NC_010553	TCC	2	6	51080	51085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064585
1010	NC_010553	CGA	2	6	51150	51155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1011	NC_010553	GCG	2	6	51156	51161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1012	NC_010553	TG	3	6	51192	51197	0 %	50 %	50 %	0 %	172064585
1013	NC_010553	ATC	2	6	51209	51214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064585
1014	NC_010553	GCG	2	6	51222	51227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1015	NC_010553	GC	3	6	51294	51299	0 %	0 %	50 %	50 %	172064585
1016	NC_010553	TCG	2	6	51371	51376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1017	NC_010553	TCGC	2	8	51404	51411	0 %	25 %	25 %	50 %	172064585
1018	NC_010553	CG	3	6	51457	51462	0 %	0 %	50 %	50 %	172064585
1019	NC_010553	GAC	2	6	51464	51469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1020	NC_010553	CG	3	6	51487	51492	0 %	0 %	50 %	50 %	172064585
1021	NC_010553	TTC	2	6	51544	51549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064585
1022	NC_010553	CG	5	10	51565	51574	0 %	0 %	50 %	50 %	172064585
1023	NC_010553	CGT	2	6	51622	51627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1024	NC_010553	CCTG	2	8	51644	51651	0 %	25 %	25 %	50 %	172064585
1025	NC_010553	CGC	2	6	51679	51684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064585
1026	NC_010553	CGG	2	6	51750	51755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1027	NC_010553	AACC	2	8	51757	51764	50 %	0 %	0 %	50 %	172064585
1028	NC_010553	CGACGC	2	12	51810	51821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	172064585
1029	NC_010553	TCG	2	6	51828	51833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1030	NC_010553	CGG	3	9	51843	51851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1031	NC_010553	CAG	2	6	51888	51893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1032	NC_010553	TGG	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064585
1033	NC_010553	GTCGA	2	10	51959	51968	20 %	20 %	40 %	20 %	172064585
1034	NC_010553	CGG	2	6	51969	51974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1035	NC_010553	CGG	2	6	51988	51993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1036	NC_010553	CAG	2	6	52020	52025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1037	NC_010553	TCA	2	6	52067	52072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064585
1038	NC_010553	GCC	2	6	52172	52177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064585
1039	NC_010553	CGAA	2	8	52230	52237	50 %	0 %	25 %	25 %	172064585
1040	NC_010553	TCG	2	6	52247	52252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064585
1041	NC_010553	CGG	2	6	52287	52292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064585
1042	NC_010553	C	7	7	52394	52400	0 %	0 %	0 %	100 %	172064586
1043	NC_010553	GCC	2	6	52422	52427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064586
1044	NC_010553	GATC	2	8	52448	52455	25 %	25 %	25 %	25 %	172064586
1045	NC_010553	CGGA	2	8	52462	52469	25 %	0 %	50 %	25 %	172064586
1046	NC_010553	TCG	2	6	52472	52477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064586
1047	NC_010553	AGC	2	6	52585	52590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064586
1048	NC_010553	CG	4	8	52601	52608	0 %	0 %	50 %	50 %	172064586
1049	NC_010553	TCG	2	6	52654	52659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064586
1050	NC_010553	CG	3	6	52658	52663	0 %	0 %	50 %	50 %	172064586
1051	NC_010553	GGC	2	6	52707	52712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064586
1052	NC_010553	GCT	2	6	52720	52725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064586
1053	NC_010553	CCG	2	6	52789	52794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064586
1054	NC_010553	GAG	2	6	52813	52818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064586
1055	NC_010553	GTC	2	6	52875	52880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064586
1056	NC_010553	CCAGC	2	10	52925	52934	20 %	0 %	20 %	60 %	172064586
1057	NC_010553	CGC	2	6	52938	52943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064586
1058	NC_010553	GTGC	2	8	52949	52956	0 %	25 %	50 %	25 %	172064586
1059	NC_010553	GCT	2	6	53023	53028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1060	NC_010553	CGT	2	6	53029	53034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1061	NC_010553	GGC	2	6	53093	53098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064587
1062	NC_010553	TGA	2	6	53157	53162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064587
1063	NC_010553	C	8	8	53177	53184	0 %	0 %	0 %	100 %	172064587
1064	NC_010553	GCG	3	9	53283	53291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064587
1065	NC_010553	CCG	2	6	53370	53375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064587
1066	NC_010553	CGC	2	6	53437	53442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064587
1067	NC_010553	GCC	2	6	53464	53469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064587
1068	NC_010553	GCC	2	6	53472	53477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064587
1069	NC_010553	GCCG	2	8	53497	53504	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1070	NC_010553	ACGC	2	8	53592	53599	25 %	0 %	25 %	50 %	172064587
1071	NC_010553	GC	3	6	53604	53609	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1072	NC_010553	TGC	2	6	53619	53624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1073	NC_010553	GCG	3	9	53664	53672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064587
1074	NC_010553	GGC	3	9	53675	53683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064587
1075	NC_010553	CAG	2	6	53737	53742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1076	NC_010553	CGGC	2	8	53783	53790	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1077	NC_010553	GCTC	2	8	53808	53815	0 %	25 %	25 %	50 %	172064587
1078	NC_010553	TCG	2	6	53828	53833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1079	NC_010553	GC	3	6	53914	53919	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1080	NC_010553	ACA	2	6	53937	53942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064587
1081	NC_010553	TCG	2	6	53945	53950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1082	NC_010553	CCGCG	2	10	53958	53967	0 %	0 %	40 %	60 %	172064587
1083	NC_010553	CAC	2	6	53968	53973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064587
1084	NC_010553	GCA	3	9	54003	54011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1085	NC_010553	CG	3	6	54077	54082	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1086	NC_010553	GCC	2	6	54115	54120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064587
1087	NC_010553	CGA	2	6	54147	54152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064587
1088	NC_010553	GCG	3	9	54181	54189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064587
1089	NC_010553	CGGCC	2	10	54192	54201	0 %	0 %	40 %	60 %	172064587
1090	NC_010553	CG	4	8	54245	54252	0 %	0 %	50 %	50 %	172064587
1091	NC_010553	CAT	2	6	54283	54288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064587
1092	NC_010553	ATG	2	6	54324	54329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064588
1093	NC_010553	TCG	2	6	54385	54390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1094	NC_010553	AG	3	6	54443	54448	50 %	0 %	50 %	0 %	172064588
1095	NC_010553	CCG	2	6	54601	54606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1096	NC_010553	GCA	2	6	54607	54612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1097	NC_010553	GTG	2	6	54630	54635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064588
1098	NC_010553	CAC	2	6	54661	54666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064588
1099	NC_010553	GTC	2	6	54716	54721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1100	NC_010553	CGAC	2	8	54736	54743	25 %	0 %	25 %	50 %	172064588
1101	NC_010553	CGC	2	6	54821	54826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1102	NC_010553	CCGA	2	8	54870	54877	25 %	0 %	25 %	50 %	172064588
1103	NC_010553	GCC	3	9	54878	54886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1104	NC_010553	GCGAA	2	10	54904	54913	40 %	0 %	40 %	20 %	172064588
1105	NC_010553	GC	3	6	54926	54931	0 %	0 %	50 %	50 %	172064588
1106	NC_010553	TGCA	2	8	54938	54945	25 %	25 %	25 %	25 %	172064588
1107	NC_010553	ACA	2	6	54957	54962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064588
1108	NC_010553	CGCC	2	8	54973	54980	0 %	0 %	25 %	75 %	172064588
1109	NC_010553	TGC	2	6	55056	55061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1110	NC_010553	AAC	2	6	55062	55067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064588
1111	NC_010553	TGT	2	6	55075	55080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064588
1112	NC_010553	CCG	2	6	55081	55086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1113	NC_010553	CGG	2	6	55171	55176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064588
1114	NC_010553	GCC	2	6	55247	55252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1115	NC_010553	GCC	2	6	55259	55264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064588
1116	NC_010553	GCT	2	6	55265	55270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1117	NC_010553	GATT	2	8	55278	55285	25 %	50 %	25 %	0 %	172064588
1118	NC_010553	TCG	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1119	NC_010553	TTGA	2	8	55386	55393	25 %	50 %	25 %	0 %	172064588
1120	NC_010553	CGA	2	6	55501	55506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1121	NC_010553	CG	3	6	55555	55560	0 %	0 %	50 %	50 %	172064588
1122	NC_010553	GTGCG	2	10	55791	55800	0 %	20 %	60 %	20 %	172064588
1123	NC_010553	CGT	2	6	55804	55809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
1124	NC_010553	CTG	2	6	55826	55831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064588
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1126	NC_010553	CGG	2	6	55876	55881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064588
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1245	NC_010553	CTT	2	6	60030	60035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064593
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1249	NC_010553	CGG	2	6	60238	60243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064594
1250	NC_010553	CG	4	8	60270	60277	0 %	0 %	50 %	50 %	172064594
1251	NC_010553	GCT	2	6	60299	60304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064594
1252	NC_010553	CT	3	6	60360	60365	0 %	50 %	0 %	50 %	172064594
1253	NC_010553	CGT	2	6	60422	60427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064594
1254	NC_010553	GCC	2	6	60564	60569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064594
1255	NC_010553	CG	3	6	60575	60580	0 %	0 %	50 %	50 %	172064594
1256	NC_010553	GACT	2	8	60621	60628	25 %	25 %	25 %	25 %	172064594
1257	NC_010553	GCC	2	6	60639	60644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064594
1258	NC_010553	CGA	2	6	60651	60656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064594
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1260	NC_010553	TGGA	2	8	60772	60779	25 %	25 %	50 %	0 %	172064594
1261	NC_010553	CGC	2	6	60812	60817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064594
1262	NC_010553	GC	3	6	60816	60821	0 %	0 %	50 %	50 %	172064594
1263	NC_010553	GC	3	6	60900	60905	0 %	0 %	50 %	50 %	172064594
1264	NC_010553	GAT	2	6	60972	60977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064594
1265	NC_010553	TCGGTG	2	12	60995	61006	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	172064594
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1281	NC_010553	ACC	2	6	61602	61607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064595
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1285	NC_010553	CTT	2	6	61778	61783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064595
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1289	NC_010553	CCGA	2	8	62326	62333	25 %	0 %	25 %	50 %	172064596
1290	NC_010553	GTA	2	6	62445	62450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064596
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1366	NC_010553	GTCGCC	2	12	67584	67595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	172064600
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1369	NC_010553	AG	3	6	67820	67825	50 %	0 %	50 %	0 %	172064600
1370	NC_010553	TTGC	2	8	67836	67843	0 %	50 %	25 %	25 %	172064600
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1373	NC_010553	GTG	2	6	68424	68429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064601
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