MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010553	GCT	2	6	299003	299008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064795
5502	NC_010553	GTC	2	6	299020	299025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064795
5503	NC_010553	CCA	2	6	299103	299108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064795
5504	NC_010553	TCA	2	6	299189	299194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064795
5505	NC_010553	CGG	2	6	299212	299217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064795
5506	NC_010553	ATG	2	6	299224	299229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064795
5507	NC_010553	CGGC	2	8	299240	299247	0 %	0 %	50 %	50 %	172064795
5508	NC_010553	CG	3	6	299275	299280	0 %	0 %	50 %	50 %	172064795
5509	NC_010553	TCG	2	6	299296	299301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064795
5510	NC_010553	CGG	2	6	299306	299311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064795
5511	NC_010553	CGT	2	6	299384	299389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064795
5512	NC_010553	GTCG	2	8	299397	299404	0 %	25 %	50 %	25 %	172064795
5513	NC_010553	CG	3	6	299410	299415	0 %	0 %	50 %	50 %	172064795
5514	NC_010553	CCG	2	6	299443	299448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064795
5515	NC_010553	TCT	2	6	299492	299497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064795
5516	NC_010553	TCA	2	6	299543	299548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064795
5517	NC_010553	CG	4	8	299784	299791	0 %	0 %	50 %	50 %	172064796
5518	NC_010553	ACG	2	6	299912	299917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064796
5519	NC_010553	AC	4	8	299932	299939	50 %	0 %	0 %	50 %	172064796
5520	NC_010553	GAC	2	6	299940	299945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064796
5521	NC_010553	GA	3	6	299983	299988	50 %	0 %	50 %	0 %	172064796
5522	NC_010553	TCGG	2	8	299989	299996	0 %	25 %	50 %	25 %	172064796
5523	NC_010553	CTC	2	6	300003	300008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064796
5524	NC_010553	CCA	2	6	300028	300033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064796
5525	NC_010553	CG	5	10	300048	300057	0 %	0 %	50 %	50 %	172064796
5526	NC_010553	TCG	2	6	300064	300069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064796
5527	NC_010553	GAA	2	6	300147	300152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064796
5528	NC_010553	GAAT	2	8	300187	300194	50 %	25 %	25 %	0 %	172064796
5529	NC_010553	GCC	2	6	300247	300252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064797
5530	NC_010553	AGC	2	6	300259	300264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5531	NC_010553	GCGATC	2	12	300280	300291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5532	NC_010553	CAG	2	6	300351	300356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5533	NC_010553	GAAAC	2	10	300377	300386	60 %	0 %	20 %	20 %	172064797
5534	NC_010553	GCA	3	9	300403	300411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5535	NC_010553	CGA	2	6	300440	300445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5536	NC_010553	GCC	2	6	300524	300529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064797
5537	NC_010553	CCG	2	6	300568	300573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064797
5538	NC_010553	CG	3	6	300590	300595	0 %	0 %	50 %	50 %	172064797
5539	NC_010553	GCC	2	6	300610	300615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064797
5540	NC_010553	ACG	2	6	300616	300621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5541	NC_010553	AAC	2	6	300646	300651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064797
5542	NC_010553	TCG	2	6	300695	300700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064797
5543	NC_010553	CCA	2	6	300701	300706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064797
5544	NC_010553	TCGGT	2	10	300744	300753	0 %	40 %	40 %	20 %	172064797
5545	NC_010553	CCA	2	6	300776	300781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064797
5546	NC_010553	GAA	3	9	300789	300797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064797
5547	NC_010553	CAG	2	6	300856	300861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064798
5548	NC_010553	CGA	2	6	300900	300905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064798
5549	NC_010553	AGTGG	2	10	300927	300936	20 %	20 %	60 %	0 %	172064798
5550	NC_010553	GCG	2	6	300937	300942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064798
5551	NC_010553	CG	3	6	300986	300991	0 %	0 %	50 %	50 %	172064798
5552	NC_010553	CAT	2	6	301017	301022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064798
5553	NC_010553	GC	3	6	301051	301056	0 %	0 %	50 %	50 %	172064798
5554	NC_010553	CGT	3	9	301059	301067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064798
5555	NC_010553	CG	3	6	301155	301160	0 %	0 %	50 %	50 %	172064799
5556	NC_010553	GCG	2	6	301173	301178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064799
5557	NC_010553	CTGA	2	8	301184	301191	25 %	25 %	25 %	25 %	172064799
5558	NC_010553	TCG	2	6	301209	301214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064799
5559	NC_010553	ACC	2	6	301215	301220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064799
5560	NC_010553	TCGG	2	8	301221	301228	0 %	25 %	50 %	25 %	172064799
5561	NC_010553	CG	3	6	301303	301308	0 %	0 %	50 %	50 %	172064799
5562	NC_010553	CG	3	6	301483	301488	0 %	0 %	50 %	50 %	172064799
5563	NC_010553	GAT	2	6	301559	301564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064799
5564	NC_010553	T	7	7	301564	301570	0 %	100 %	0 %	0 %	172064799
5565	NC_010553	GAC	2	6	301574	301579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064799

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.