MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010180	AGGAC	2	10	5594	5603	40 %	0 %	40 %	20 %	163943173
2	NC_010180	ATCAA	2	10	6404	6413	60 %	20 %	0 %	20 %	163943173
3	NC_010180	AATGC	2	10	7356	7365	40 %	20 %	20 %	20 %	163943173
4	NC_010180	ATGGA	2	10	7531	7540	40 %	20 %	40 %	0 %	163943173
5	NC_010180	TTAAA	2	10	7642	7651	60 %	40 %	0 %	0 %	163943173
6	NC_010180	TAGTT	2	10	8274	8283	20 %	60 %	20 %	0 %	163943173
7	NC_010180	CTTCT	2	10	11244	11253	0 %	60 %	0 %	40 %	163943175
8	NC_010180	AGGCA	2	10	14529	14538	40 %	0 %	40 %	20 %	163943175
9	NC_010180	CATTT	2	10	14715	14724	20 %	60 %	0 %	20 %	163943175
10	NC_010180	AATTC	2	10	14968	14977	40 %	40 %	0 %	20 %	163943175
11	NC_010180	TCATG	2	10	15963	15972	20 %	40 %	20 %	20 %	163943176
12	NC_010180	TGGAT	2	10	23195	23204	20 %	40 %	40 %	0 %	163943178
13	NC_010180	TGACA	2	10	24285	24294	40 %	20 %	20 %	20 %	163943178
14	NC_010180	AGTTG	2	10	25401	25410	20 %	40 %	40 %	0 %	163943178
15	NC_010180	TGGAA	2	10	25462	25471	40 %	20 %	40 %	0 %	163943178
16	NC_010180	TGGTT	2	10	25821	25830	0 %	60 %	40 %	0 %	163943178
17	NC_010180	AAACC	2	10	27740	27749	60 %	0 %	0 %	40 %	163943179
18	NC_010180	ATTCA	2	10	29910	29919	40 %	40 %	0 %	20 %	163943179
19	NC_010180	TGGCA	2	10	29930	29939	20 %	20 %	40 %	20 %	163943179
20	NC_010180	AGAAA	2	10	32003	32012	80 %	0 %	20 %	0 %	163943183
21	NC_010180	AAAGA	2	10	32279	32288	80 %	0 %	20 %	0 %	163943183
22	NC_010180	ACAAT	2	10	34289	34298	60 %	20 %	0 %	20 %	163943185
23	NC_010180	TATTC	2	10	35710	35719	20 %	60 %	0 %	20 %	163943186
24	NC_010180	CGTTA	2	10	36112	36121	20 %	40 %	20 %	20 %	163943186
25	NC_010180	ACAGA	2	10	36571	36580	60 %	0 %	20 %	20 %	163943186
26	NC_010180	AGAGG	2	10	37579	37588	40 %	0 %	60 %	0 %	163943187
27	NC_010180	ACCTA	2	10	37764	37773	40 %	20 %	0 %	40 %	163943187
28	NC_010180	AGAAA	2	10	38836	38845	80 %	0 %	20 %	0 %	163943188
29	NC_010180	CGATA	2	10	39591	39600	40 %	20 %	20 %	20 %	163943188
30	NC_010180	AAACA	2	10	40090	40099	80 %	0 %	0 %	20 %	163943189
31	NC_010180	TTACC	2	10	40827	40836	20 %	40 %	0 %	40 %	163943189
32	NC_010180	AGAAA	2	10	43483	43492	80 %	0 %	20 %	0 %	163943191
33	NC_010180	ACAGA	2	10	45914	45923	60 %	0 %	20 %	20 %	163943192
34	NC_010180	AACAA	2	10	45966	45975	80 %	0 %	0 %	20 %	163943192
35	NC_010180	ACGAA	2	10	46053	46062	60 %	0 %	20 %	20 %	163943192
36	NC_010180	TTTTC	2	10	46912	46921	0 %	80 %	0 %	20 %	163943193
37	NC_010180	CTTAG	2	10	46978	46987	20 %	40 %	20 %	20 %	163943193
38	NC_010180	CGAAA	2	10	47234	47243	60 %	0 %	20 %	20 %	163943193
39	NC_010180	GGATT	2	10	50099	50108	20 %	40 %	40 %	0 %	163943196
40	NC_010180	ATTTT	2	10	51303	51312	20 %	80 %	0 %	0 %	163943197
41	NC_010180	TATCT	2	10	53468	53477	20 %	60 %	0 %	20 %	163943201
42	NC_010180	TTTTG	2	10	54647	54656	0 %	80 %	20 %	0 %	163943201
43	NC_010180	TCCCT	2	10	55224	55233	0 %	40 %	0 %	60 %	163943202
44	NC_010180	CATGG	2	10	55512	55521	20 %	20 %	40 %	20 %	163943202
45	NC_010180	GTAAT	2	10	55681	55690	40 %	40 %	20 %	0 %	163943202
46	NC_010180	CTATT	2	10	58270	58279	20 %	60 %	0 %	20 %	163943203
47	NC_010180	ACAAA	2	10	59178	59187	80 %	0 %	0 %	20 %	163943204
48	NC_010180	GAAAA	2	10	60261	60270	80 %	0 %	20 %	0 %	163943204
49	NC_010180	TTTTG	2	10	60814	60823	0 %	80 %	20 %	0 %	163943205
50	NC_010180	AATCA	2	10	62509	62518	60 %	20 %	0 %	20 %	163943206
51	NC_010180	AGTGA	2	10	64717	64726	40 %	20 %	40 %	0 %	163943207
52	NC_010180	ATCTT	2	10	64983	64992	20 %	60 %	0 %	20 %	163943207
53	NC_010180	TAGAG	2	10	66786	66795	40 %	20 %	40 %	0 %	163943207
54	NC_010180	AATTT	2	10	68562	68571	40 %	60 %	0 %	0 %	163943209
55	NC_010180	TTGTT	2	10	78594	78603	0 %	80 %	20 %	0 %	163943220
56	NC_010180	AAGCA	2	10	81330	81339	60 %	0 %	20 %	20 %	163943222
57	NC_010180	ATTTA	2	10	84024	84033	40 %	60 %	0 %	0 %	163943223
58	NC_010180	CAAAT	2	10	85118	85127	60 %	20 %	0 %	20 %	163943223
59	NC_010180	TCAAA	2	10	85180	85189	60 %	20 %	0 %	20 %	163943223
60	NC_010180	GAATA	2	10	85340	85349	60 %	20 %	20 %	0 %	163943223
61	NC_010180	AATTT	2	10	85601	85610	40 %	60 %	0 %	0 %	163943223
62	NC_010180	ATTTG	2	10	86937	86946	20 %	60 %	20 %	0 %	163943223
63	NC_010180	GAGTG	2	10	87037	87046	20 %	20 %	60 %	0 %	163943223
64	NC_010180	GAATT	2	10	89231	89240	40 %	40 %	20 %	0 %	163943223
65	NC_010180	TTAAA	2	10	89657	89666	60 %	40 %	0 %	0 %	163943223
66	NC_010180	ATTTT	2	10	90021	90030	20 %	80 %	0 %	0 %	163943223
67	NC_010180	TCAAT	2	10	90489	90498	40 %	40 %	0 %	20 %	163943223
68	NC_010180	TGAGA	2	10	92561	92570	40 %	20 %	40 %	0 %	163943225
69	NC_010180	TTATT	2	10	92642	92651	20 %	80 %	0 %	0 %	163943225
70	NC_010180	AAACA	2	10	93880	93889	80 %	0 %	0 %	20 %	163943226
71	NC_010180	TATTT	2	10	96142	96151	20 %	80 %	0 %	0 %	163943229
72	NC_010180	TGCTT	2	10	99283	99292	0 %	60 %	20 %	20 %	163943231
73	NC_010180	CGTAA	2	10	99471	99480	40 %	20 %	20 %	20 %	163943231
74	NC_010180	TTTCT	2	10	100039	100048	0 %	80 %	0 %	20 %	163943231
75	NC_010180	AAAGA	2	10	100112	100121	80 %	0 %	20 %	0 %	163943231
76	NC_010180	TGAGG	2	10	102496	102505	20 %	20 %	60 %	0 %	163943234
77	NC_010180	AAGAA	2	10	103324	103333	80 %	0 %	20 %	0 %	163943235
78	NC_010180	GTGAA	2	10	103399	103408	40 %	20 %	40 %	0 %	163943235
79	NC_010180	TGCAA	2	10	103643	103652	40 %	20 %	20 %	20 %	163943235
80	NC_010180	TTTGA	2	10	104264	104273	20 %	60 %	20 %	0 %	163943236
81	NC_010180	AAAAT	2	10	106869	106878	80 %	20 %	0 %	0 %	163943237
82	NC_010180	CAATC	2	10	108053	108062	40 %	20 %	0 %	40 %	163943238
83	NC_010180	TGTCA	2	10	109048	109057	20 %	40 %	20 %	20 %	163943239
84	NC_010180	CAGTA	2	10	111297	111306	40 %	20 %	20 %	20 %	163943241
85	NC_010180	CATCA	2	10	115203	115212	40 %	20 %	0 %	40 %	163943243
86	NC_010180	GAAAA	2	10	115325	115334	80 %	0 %	20 %	0 %	163943244
87	NC_010180	AAAAC	2	10	115461	115470	80 %	0 %	0 %	20 %	163943244
88	NC_010180	TTGGA	2	10	118565	118574	20 %	40 %	40 %	0 %	163943246
89	NC_010180	TATCA	2	10	118612	118621	40 %	40 %	0 %	20 %	163943246
90	NC_010180	AATCC	2	10	119587	119596	40 %	20 %	0 %	40 %	163943246
91	NC_010180	AACTT	2	10	119644	119653	40 %	40 %	0 %	20 %	163943246
92	NC_010180	GATTT	2	10	126329	126338	20 %	60 %	20 %	0 %	163943253
93	NC_010180	AGAAA	2	10	129251	129260	80 %	0 %	20 %	0 %	163943256
94	NC_010180	AAATG	2	10	130802	130811	60 %	20 %	20 %	0 %	163943257
95	NC_010180	TACCT	2	10	131088	131097	20 %	40 %	0 %	40 %	163943257
96	NC_010180	CAAAT	2	10	134226	134235	60 %	20 %	0 %	20 %	163943259
97	NC_010180	ACATG	2	10	134351	134360	40 %	20 %	20 %	20 %	163943259
98	NC_010180	TTTTC	2	10	135329	135338	0 %	80 %	0 %	20 %	163943260
99	NC_010180	ATACT	2	10	135865	135874	40 %	40 %	0 %	20 %	163943261
100	NC_010180	CAATC	2	10	138831	138840	40 %	20 %	0 %	40 %	163943265
101	NC_010180	CTATT	2	10	144065	144074	20 %	60 %	0 %	20 %	163943268
102	NC_010180	TTAAC	2	10	144229	144238	40 %	40 %	0 %	20 %	163943268
103	NC_010180	CTATT	2	10	150241	150250	20 %	60 %	0 %	20 %	163943272
104	NC_010180	TAAAA	2	10	150545	150554	80 %	20 %	0 %	0 %	163943272
105	NC_010180	CAATT	2	10	152076	152085	40 %	40 %	0 %	20 %	163943273
106	NC_010180	TAAAT	2	10	152244	152253	60 %	40 %	0 %	0 %	163943274
107	NC_010180	TAAAA	2	10	152430	152439	80 %	20 %	0 %	0 %	163943274
108	NC_010180	TTATC	2	10	153014	153023	20 %	60 %	0 %	20 %	163943274
109	NC_010180	TTTTC	2	10	154947	154956	0 %	80 %	0 %	20 %	163943276
110	NC_010180	TCTCC	2	10	155284	155293	0 %	40 %	0 %	60 %	163943277
111	NC_010180	AATAT	2	10	156066	156075	60 %	40 %	0 %	0 %	163943277
112	NC_010180	TTGTA	2	10	156396	156405	20 %	60 %	20 %	0 %	163943278
113	NC_010180	GATTG	2	10	157490	157499	20 %	40 %	40 %	0 %	163943279
114	NC_010180	TTGTA	2	10	157770	157779	20 %	60 %	20 %	0 %	163943279
115	NC_010180	AAAAG	2	10	158227	158236	80 %	0 %	20 %	0 %	163943280
116	NC_010180	ACTTA	2	10	159714	159723	40 %	40 %	0 %	20 %	163943281
117	NC_010180	TATTC	2	10	160602	160611	20 %	60 %	0 %	20 %	163943282
118	NC_010180	TTCAC	2	10	161750	161759	20 %	40 %	0 %	40 %	163943283
119	NC_010180	AATTG	2	10	164534	164543	40 %	40 %	20 %	0 %	163943286
120	NC_010180	GTAAT	2	10	171878	171887	40 %	40 %	20 %	0 %	163943291
121	NC_010180	ATTTT	2	10	172408	172417	20 %	80 %	0 %	0 %	163943292
122	NC_010180	TTTAT	2	10	175118	175127	20 %	80 %	0 %	0 %	163943294
123	NC_010180	TTATT	2	10	177598	177607	20 %	80 %	0 %	0 %	163943296
124	NC_010180	GAAAA	2	10	178019	178028	80 %	0 %	20 %	0 %	163943296
125	NC_010180	TAAAG	2	10	178781	178790	60 %	20 %	20 %	0 %	163943297
126	NC_010180	TTAAT	2	10	181244	181253	40 %	60 %	0 %	0 %	163943300
127	NC_010180	TGTAA	2	10	185787	185796	40 %	40 %	20 %	0 %	163943305
128	NC_010180	ACATC	2	10	188878	188887	40 %	20 %	0 %	40 %	163943307
129	NC_010180	TAATA	2	10	188891	188900	60 %	40 %	0 %	0 %	163943307
130	NC_010180	TTTCA	2	10	192213	192222	20 %	60 %	0 %	20 %	163943311
131	NC_010180	AAATT	2	10	194241	194250	60 %	40 %	0 %	0 %	163943312
132	NC_010180	TCTTT	2	10	194897	194906	0 %	80 %	0 %	20 %	163943313
133	NC_010180	ATTAC	2	10	200789	200798	40 %	40 %	0 %	20 %	163943316
134	NC_010180	ATTCA	2	10	202399	202408	40 %	40 %	0 %	20 %	163943318
135	NC_010180	TCATA	2	10	203028	203037	40 %	40 %	0 %	20 %	163943318
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.