MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 127658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010170	CAC	2	6	115673	115678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854407
3002	NC_010170	GC	3	6	115716	115721	0 %	0 %	50 %	50 %	163854407
3003	NC_010170	GTG	2	6	115731	115736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854407
3004	NC_010170	GCA	2	6	115828	115833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854407
3005	NC_010170	A	7	7	115848	115854	100 %	0 %	0 %	0 %	163854407
3006	NC_010170	GAC	2	6	116001	116006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3007	NC_010170	CGT	2	6	116024	116029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3008	NC_010170	GC	3	6	116032	116037	0 %	0 %	50 %	50 %	163854408
3009	NC_010170	GCT	2	6	116078	116083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3010	NC_010170	TTG	2	6	116179	116184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854408
3011	NC_010170	TCG	2	6	116191	116196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3012	NC_010170	GCC	2	6	116214	116219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854408
3013	NC_010170	CGC	2	6	116235	116240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854408
3014	NC_010170	CAG	2	6	116271	116276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3015	NC_010170	CTGGT	2	10	116326	116335	0 %	40 %	40 %	20 %	163854408
3016	NC_010170	GCA	2	6	116345	116350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3017	NC_010170	ACTTGG	2	12	116366	116377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163854408
3018	NC_010170	CG	3	6	116408	116413	0 %	0 %	50 %	50 %	163854408
3019	NC_010170	TCG	2	6	116446	116451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3020	NC_010170	CAG	2	6	116517	116522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3021	NC_010170	CTT	2	6	116523	116528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854408
3022	NC_010170	GTC	2	6	116568	116573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3023	NC_010170	CCA	2	6	116594	116599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854408
3024	NC_010170	GGC	2	6	116616	116621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854408
3025	NC_010170	TCT	2	6	116633	116638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854408
3026	NC_010170	CAC	2	6	116667	116672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854408
3027	NC_010170	CG	4	8	116684	116691	0 %	0 %	50 %	50 %	163854408
3028	NC_010170	CAG	2	6	116727	116732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3029	NC_010170	TCG	2	6	116734	116739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3030	NC_010170	GC	4	8	116767	116774	0 %	0 %	50 %	50 %	163854408
3031	NC_010170	GCACCG	2	12	116831	116842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163854408
3032	NC_010170	GCC	2	6	116875	116880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854408
3033	NC_010170	TCG	2	6	116920	116925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3034	NC_010170	CGT	2	6	116957	116962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3035	NC_010170	TGG	2	6	117071	117076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854408
3036	NC_010170	GGT	2	6	117081	117086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854408
3037	NC_010170	TTC	2	6	117091	117096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854408
3038	NC_010170	ATG	2	6	117115	117120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854408
3039	NC_010170	TGGGCG	2	12	117155	117166	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	163854408
3040	NC_010170	GTC	2	6	117186	117191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3041	NC_010170	CGT	2	6	117275	117280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3042	NC_010170	CGG	2	6	117281	117286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854408
3043	NC_010170	CGT	2	6	117299	117304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3044	NC_010170	TGG	2	6	117341	117346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854408
3045	NC_010170	CAG	2	6	117372	117377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854408
3046	NC_010170	AGCGCC	2	12	117556	117567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163854408
3047	NC_010170	TGA	2	6	117575	117580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854408
3048	NC_010170	GAGC	2	8	118296	118303	25 %	0 %	50 %	25 %	163854409
3049	NC_010170	GGC	2	6	118312	118317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854409
3050	NC_010170	AGC	2	6	118324	118329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854409
3051	NC_010170	TCTTGC	2	12	118332	118343	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163854409
3052	NC_010170	CGG	2	6	118344	118349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854409
3053	NC_010170	CAG	2	6	118351	118356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854409
3054	NC_010170	GGCC	2	8	118460	118467	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3055	NC_010170	GCC	2	6	118517	118522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854409
3056	NC_010170	GCG	2	6	118530	118535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854409
3057	NC_010170	CCG	2	6	118593	118598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854409
3058	NC_010170	CAG	2	6	118609	118614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854409
3059	NC_010170	CG	3	6	118663	118668	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3060	NC_010170	TCGA	2	8	118712	118719	25 %	25 %	25 %	25 %	163854409
3061	NC_010170	CAG	2	6	118813	118818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854409
3062	NC_010170	CG	3	6	118819	118824	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3063	NC_010170	CG	3	6	118832	118837	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3064	NC_010170	GCG	2	6	118842	118847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854409
3065	NC_010170	CGG	2	6	118861	118866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854409
3066	NC_010170	CG	3	6	118950	118955	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3067	NC_010170	ATC	2	6	118970	118975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854409
3068	NC_010170	CAC	2	6	119044	119049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854409
3069	NC_010170	GC	3	6	119067	119072	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3070	NC_010170	CTTG	2	8	119073	119080	0 %	50 %	25 %	25 %	163854409
3071	NC_010170	CCA	2	6	119124	119129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854409
3072	NC_010170	GC	3	6	119166	119171	0 %	0 %	50 %	50 %	163854409
3073	NC_010170	A	6	6	119206	119211	100 %	0 %	0 %	0 %	163854409
3074	NC_010170	GC	3	6	119507	119512	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3075	NC_010170	GCG	2	6	119534	119539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3076	NC_010170	GC	3	6	119588	119593	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3077	NC_010170	GGC	2	6	119614	119619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3078	NC_010170	GC	3	6	119622	119627	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3079	NC_010170	CGGC	2	8	119638	119645	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3080	NC_010170	GGC	2	6	119669	119674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3081	NC_010170	CAG	2	6	119723	119728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3082	NC_010170	GCA	2	6	119731	119736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3083	NC_010170	GCC	2	6	119789	119794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854410
3084	NC_010170	GCCG	2	8	119822	119829	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3085	NC_010170	CCG	2	6	119884	119889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854410
3086	NC_010170	CGC	2	6	119906	119911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854410
3087	NC_010170	GCG	2	6	120020	120025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3088	NC_010170	CAG	2	6	120041	120046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3089	NC_010170	CGC	2	6	120072	120077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854410
3090	NC_010170	GGC	2	6	120095	120100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3091	NC_010170	CGG	2	6	120124	120129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3092	NC_010170	CGCAG	2	10	120141	120150	20 %	0 %	40 %	40 %	163854410
3093	NC_010170	CAG	2	6	120161	120166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3094	NC_010170	CGG	2	6	120169	120174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3095	NC_010170	GGC	2	6	120185	120190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3096	NC_010170	GGCGCT	2	12	120205	120216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163854410
3097	NC_010170	TCG	2	6	120222	120227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3098	NC_010170	CAG	2	6	120260	120265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3099	NC_010170	GCG	3	9	120304	120312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3100	NC_010170	CGG	2	6	120373	120378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3101	NC_010170	GGGC	2	8	120385	120392	0 %	0 %	75 %	25 %	163854410
3102	NC_010170	GCA	2	6	120415	120420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3103	NC_010170	GCGG	2	8	120421	120428	0 %	0 %	75 %	25 %	163854410
3104	NC_010170	TCG	2	6	120453	120458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3105	NC_010170	TGCT	2	8	120462	120469	0 %	50 %	25 %	25 %	163854410
3106	NC_010170	CG	3	6	120535	120540	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3107	NC_010170	GCG	2	6	120584	120589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854410
3108	NC_010170	GC	4	8	120611	120618	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3109	NC_010170	AGC	2	6	120648	120653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3110	NC_010170	CCGG	2	8	120697	120704	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3111	NC_010170	CAGCCG	2	12	120710	120721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163854410
3112	NC_010170	CG	3	6	120720	120725	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3113	NC_010170	GTG	2	6	120741	120746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854410
3114	NC_010170	CG	3	6	120781	120786	0 %	0 %	50 %	50 %	163854410
3115	NC_010170	GCA	2	6	120796	120801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854410
3116	NC_010170	CCAG	2	8	120875	120882	25 %	0 %	25 %	50 %	163854411
3117	NC_010170	GCC	2	6	120919	120924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854411
3118	NC_010170	CGG	3	9	120929	120937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854411
3119	NC_010170	GCCGG	2	10	120962	120971	0 %	0 %	60 %	40 %	163854411
3120	NC_010170	GCC	2	6	120979	120984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854411
3121	NC_010170	CG	3	6	121010	121015	0 %	0 %	50 %	50 %	163854411
3122	NC_010170	GGC	2	6	121038	121043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854411
3123	NC_010170	CAG	2	6	121095	121100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854411
3124	NC_010170	CG	3	6	121105	121110	0 %	0 %	50 %	50 %	163854411
3125	NC_010170	CAG	2	6	121131	121136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854411
3126	NC_010170	GCT	2	6	121145	121150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854411
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3128	NC_010170	CGG	2	6	121217	121222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854411
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3130	NC_010170	CGG	2	6	121304	121309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854411
3131	NC_010170	GCA	2	6	121340	121345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854411
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3153	NC_010170	CAG	2	6	121902	121907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854411
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3164	NC_010170	GTC	2	6	122421	122426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854412
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3220	NC_010170	CTG	2	6	124398	124403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854414
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3228	NC_010170	CGT	2	6	124859	124864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854415
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3230	NC_010170	TCG	2	6	124972	124977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854415
3231	NC_010170	GC	3	6	125020	125025	0 %	0 %	50 %	50 %	163854415
3232	NC_010170	ACG	2	6	125073	125078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854415
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3234	NC_010170	CGCGG	2	10	125219	125228	0 %	0 %	60 %	40 %	163854415
3235	NC_010170	C	6	6	125255	125260	0 %	0 %	0 %	100 %	163854415
3236	NC_010170	GCG	2	6	125323	125328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854415
3237	NC_010170	CGA	2	6	125338	125343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854415
3238	NC_010170	TTG	2	6	125369	125374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854415
3239	NC_010170	GCG	2	6	125389	125394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854415
3240	NC_010170	CGA	2	6	125396	125401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854415
3241	NC_010170	GTT	2	6	125402	125407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854415
3242	NC_010170	GGCG	2	8	125435	125442	0 %	0 %	75 %	25 %	163854415
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3244	NC_010170	TGA	2	6	125479	125484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854415
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3366	NC_010170	CG	3	6	130884	130889	0 %	0 %	50 %	50 %	163854419
3367	NC_010170	GC	3	6	130897	130902	0 %	0 %	50 %	50 %	163854419
3368	NC_010170	CGA	2	6	130949	130954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854419
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3373	NC_010170	TCA	2	6	131292	131297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854420
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3379	NC_010170	TCA	2	6	131858	131863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854421
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3484	NC_010170	GCCA	2	8	136032	136039	25 %	0 %	25 %	50 %	163854425
3485	NC_010170	TTG	2	6	136112	136117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854426
3486	NC_010170	CGA	2	6	136131	136136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854426
3487	NC_010170	CGG	2	6	136165	136170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854426
3488	NC_010170	GCC	2	6	136255	136260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854426
3489	NC_010170	CCG	5	15	136280	136294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854426
3490	NC_010170	AGC	2	6	136317	136322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854426
3491	NC_010170	GTGC	2	8	136327	136334	0 %	25 %	50 %	25 %	163854426
3492	NC_010170	ATGA	2	8	136480	136487	50 %	25 %	25 %	0 %	163854426
3493	NC_010170	CGG	2	6	136569	136574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854426
3494	NC_010170	CGG	2	6	136687	136692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854426
3495	NC_010170	CGTCAT	2	12	136713	136724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163854426
3496	NC_010170	ATC	2	6	136964	136969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854427
3497	NC_010170	CGT	2	6	136999	137004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854427
3498	NC_010170	TCA	2	6	137013	137018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854427
3499	NC_010170	CAA	2	6	137062	137067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854427
3500	NC_010170	CTGAC	2	10	137118	137127	20 %	20 %	20 %	40 %	163854427

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