MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bartonella tribocorum CIP 105476 plasmid pBT01

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010160	GAG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659860
2	NC_010160	TAT	2	6	344	349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659860
3	NC_010160	TTC	2	6	378	383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659860
4	NC_010160	ATC	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659860
5	NC_010160	AAG	2	6	548	553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659860
6	NC_010160	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659860
7	NC_010160	AAC	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659861
8	NC_010160	CAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659861
9	NC_010160	TTG	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659861
10	NC_010160	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659861
11	NC_010160	CAA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659861
12	NC_010160	AGC	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659861
13	NC_010160	ATC	2	6	1477	1482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659861
14	NC_010160	AGG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659861
15	NC_010160	AAT	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659861
16	NC_010160	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659861
17	NC_010160	TTA	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659861
18	NC_010160	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659862
19	NC_010160	ATG	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
20	NC_010160	GTT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659863
21	NC_010160	GAT	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
22	NC_010160	TAG	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
23	NC_010160	ATT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659863
24	NC_010160	AAT	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659863
25	NC_010160	GGT	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659863
26	NC_010160	TAA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659863
27	NC_010160	CCA	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659863
28	NC_010160	GCT	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659863
29	NC_010160	CAT	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659863
30	NC_010160	GTT	2	6	2984	2989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659863
31	NC_010160	AGA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
32	NC_010160	GAA	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
33	NC_010160	TGC	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659864
34	NC_010160	GGT	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659864
35	NC_010160	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659864
36	NC_010160	GGA	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659864
37	NC_010160	TTA	2	6	3654	3659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659864
38	NC_010160	GGT	2	6	3668	3673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659864
39	NC_010160	ATC	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659864
40	NC_010160	AGA	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
41	NC_010160	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
42	NC_010160	AAT	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659864
43	NC_010160	GCA	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659865
44	NC_010160	CTT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659865
45	NC_010160	TTG	2	6	4045	4050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659865
46	NC_010160	ATT	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659865
47	NC_010160	AAG	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659865
48	NC_010160	AGC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659866
49	NC_010160	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659866
50	NC_010160	AAT	2	6	4957	4962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659866
51	NC_010160	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659866
52	NC_010160	TCA	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659866
53	NC_010160	CAA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659866
54	NC_010160	TAC	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659866
55	NC_010160	TGA	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659866
56	NC_010160	ACA	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659866
57	NC_010160	CAG	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659866
58	NC_010160	ATG	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659866
59	NC_010160	TTC	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659866
60	NC_010160	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659866
61	NC_010160	GAC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659867
62	NC_010160	TAA	2	6	7731	7736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659867
63	NC_010160	ATG	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659867
64	NC_010160	ACG	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659867
65	NC_010160	CAT	3	9	8088	8096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
66	NC_010160	CAT	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
67	NC_010160	CAT	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
68	NC_010160	TAG	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659868
69	NC_010160	GCC	2	6	8459	8464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659868
70	NC_010160	AAC	2	6	8639	8644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659868
71	NC_010160	CAG	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659868
72	NC_010160	CAT	3	9	8797	8805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659868
73	NC_010160	CAT	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659868
74	NC_010160	ATC	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
75	NC_010160	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
76	NC_010160	CAT	3	9	9233	9241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
77	NC_010160	AAT	2	6	9576	9581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659869
78	NC_010160	ACG	2	6	9613	9618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659869
79	NC_010160	CAT	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
80	NC_010160	ACC	2	6	9696	9701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659869
81	NC_010160	CAT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
82	NC_010160	ATT	2	6	9902	9907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
83	NC_010160	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659870
84	NC_010160	TGA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659870
85	NC_010160	TTA	2	6	10346	10351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
86	NC_010160	CAT	3	9	10398	10406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
87	NC_010160	CAG	2	6	10412	10417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659870
88	NC_010160	CAT	2	6	10422	10427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
89	NC_010160	GCC	2	6	10456	10461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659870
90	NC_010160	CAT	2	6	10479	10484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
91	NC_010160	ATT	2	6	10522	10527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
92	NC_010160	CTT	2	6	10558	10563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659870
93	NC_010160	TTA	2	6	10694	10699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
94	NC_010160	ATT	2	6	10711	10716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
95	NC_010160	TAA	2	6	10838	10843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659871
96	NC_010160	ATT	2	6	10978	10983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
97	NC_010160	CCG	2	6	11051	11056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659871
98	NC_010160	CAT	2	6	11070	11075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659871
99	NC_010160	TGT	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659871
100	NC_010160	TTA	2	6	11225	11230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
101	NC_010160	TGT	2	6	11271	11276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659871
102	NC_010160	ATT	2	6	13137	13142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659872
103	NC_010160	ATC	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659872
104	NC_010160	CTA	2	6	13296	13301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659872
105	NC_010160	GAC	2	6	13312	13317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659872
106	NC_010160	ATA	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659872
107	NC_010160	CAT	2	6	13449	13454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659872
108	NC_010160	AAC	2	6	13483	13488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659872
109	NC_010160	TAA	2	6	13758	13763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
110	NC_010160	CAT	2	6	13827	13832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
111	NC_010160	ATA	2	6	14026	14031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
112	NC_010160	CTG	2	6	14142	14147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659873
113	NC_010160	ATC	2	6	14164	14169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
114	NC_010160	ATC	2	6	14275	14280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
115	NC_010160	TCA	2	6	14330	14335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
116	NC_010160	TCT	2	6	14375	14380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
117	NC_010160	TAT	2	6	14817	14822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659873
118	NC_010160	TAT	2	6	14841	14846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659873
119	NC_010160	TTC	2	6	14870	14875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
120	NC_010160	ATC	2	6	15004	15009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
121	NC_010160	ACC	2	6	15076	15081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659873
122	NC_010160	ATT	2	6	15130	15135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659873
123	NC_010160	CTT	2	6	15243	15248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
124	NC_010160	TTG	2	6	15351	15356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659873
125	NC_010160	ATT	2	6	15392	15397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659873
126	NC_010160	AGG	2	6	15574	15579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659873
127	NC_010160	AAT	2	6	15644	15649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
128	NC_010160	TTC	2	6	15662	15667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
129	NC_010160	GCT	2	6	15764	15769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659873
130	NC_010160	TAA	2	6	15773	15778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
131	NC_010160	TGA	2	6	15843	15848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659873
132	NC_010160	CAT	2	6	15954	15959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
133	NC_010160	TAA	3	9	16065	16073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
134	NC_010160	TTC	2	6	16153	16158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
135	NC_010160	GTT	2	6	16327	16332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659873
136	NC_010160	TCA	2	6	16382	16387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
137	NC_010160	GAT	2	6	16404	16409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659873
138	NC_010160	AAT	2	6	16458	16463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
139	NC_010160	AAG	2	6	16486	16491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659873
140	NC_010160	AAT	2	6	16549	16554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
141	NC_010160	ATC	2	6	16691	16696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
142	NC_010160	TCA	2	6	16721	16726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
143	NC_010160	ACC	2	6	16757	16762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659873
144	NC_010160	TGT	2	6	16773	16778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659873
145	NC_010160	CAG	2	6	16794	16799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659873
146	NC_010160	CAG	2	6	16806	16811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659873
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150	NC_010160	TTC	2	6	17137	17142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
151	NC_010160	CGC	2	6	17204	17209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659873
152	NC_010160	TCA	2	6	17222	17227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
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154	NC_010160	TCA	2	6	17315	17320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
155	NC_010160	TCA	2	6	17322	17327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
156	NC_010160	AAT	2	6	17374	17379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659873
157	NC_010160	TCA	2	6	17456	17461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
158	NC_010160	CAT	2	6	17508	17513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
159	NC_010160	ATG	2	6	17564	17569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659873
160	NC_010160	TCA	2	6	17645	17650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
161	NC_010160	GAT	2	6	17653	17658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659873
162	NC_010160	GTT	2	6	17792	17797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659873
163	NC_010160	CAT	2	6	17835	17840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659873
164	NC_010160	TAT	2	6	17844	17849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659873
165	NC_010160	ACG	2	6	17854	17859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659873
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167	NC_010160	CTT	2	6	18069	18074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
168	NC_010160	CTT	2	6	18102	18107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659873
169	NC_010160	TGA	2	6	18110	18115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659873
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177	NC_010160	TGA	2	6	19419	19424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659874
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.