MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pBMUL01

Total Repeats: 2912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010070	CAG	2	6	146580	146585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506612
2502	NC_010070	GCA	2	6	146594	146599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506612
2503	NC_010070	GCG	2	6	146620	146625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506612
2504	NC_010070	GCA	2	6	146684	146689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506612
2505	NC_010070	CGA	2	6	146708	146713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506612
2506	NC_010070	CAA	2	6	146715	146720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506612
2507	NC_010070	CAGCGC	2	12	146751	146762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506612
2508	NC_010070	ACA	2	6	146849	146854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506612
2509	NC_010070	GCC	2	6	146883	146888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506612
2510	NC_010070	GAGCAT	2	12	146979	146990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506612
2511	NC_010070	CCG	2	6	147161	147166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506612
2512	NC_010070	CAG	2	6	147210	147215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506612
2513	NC_010070	GGCC	2	8	147261	147268	0 %	0 %	50 %	50 %	161506612
2514	NC_010070	GCG	2	6	147387	147392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506612
2515	NC_010070	TGACG	2	10	147459	147468	20 %	20 %	40 %	20 %	161506612
2516	NC_010070	GCG	2	6	147469	147474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506612
2517	NC_010070	GAA	3	9	147482	147490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506612
2518	NC_010070	GGAG	2	8	147549	147556	25 %	0 %	75 %	0 %	161506612
2519	NC_010070	GC	3	6	147578	147583	0 %	0 %	50 %	50 %	161506612
2520	NC_010070	CCT	2	6	147653	147658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161506612
2521	NC_010070	CGAAG	2	10	147770	147779	40 %	0 %	40 %	20 %	161506612
2522	NC_010070	CTT	2	6	147965	147970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506613
2523	NC_010070	ACCTTG	2	12	147979	147990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506613
2524	NC_010070	CCTT	2	8	147994	148001	0 %	50 %	0 %	50 %	161506613
2525	NC_010070	CGG	2	6	148050	148055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506613
2526	NC_010070	GC	3	6	148073	148078	0 %	0 %	50 %	50 %	161506613
2527	NC_010070	CTT	2	6	148116	148121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506613
2528	NC_010070	GTT	2	6	148143	148148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506613
2529	NC_010070	CGA	2	6	148149	148154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506613
2530	NC_010070	GCCA	2	8	148191	148198	25 %	0 %	25 %	50 %	161506613
2531	NC_010070	CTT	2	6	148263	148268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506613
2532	NC_010070	GCA	2	6	148335	148340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2533	NC_010070	CG	4	8	148350	148357	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2534	NC_010070	GTG	2	6	148408	148413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506614
2535	NC_010070	GCC	2	6	148424	148429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2536	NC_010070	CGGCG	2	10	148436	148445	0 %	0 %	60 %	40 %	161506614
2537	NC_010070	ATG	2	6	148485	148490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506614
2538	NC_010070	ACG	2	6	148509	148514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2539	NC_010070	GCA	2	6	148543	148548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2540	NC_010070	CAG	2	6	148574	148579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2541	NC_010070	TCC	2	6	148602	148607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161506614
2542	NC_010070	GC	3	6	148621	148626	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2543	NC_010070	CAG	2	6	148637	148642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2544	NC_010070	CAC	2	6	148646	148651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161506614
2545	NC_010070	CCG	2	6	148743	148748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2546	NC_010070	ACGGT	2	10	148759	148768	20 %	20 %	40 %	20 %	161506614
2547	NC_010070	CAG	3	9	148775	148783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2548	NC_010070	CAG	2	6	148814	148819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2549	NC_010070	GAC	2	6	148829	148834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2550	NC_010070	ACC	2	6	148848	148853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161506614
2551	NC_010070	GCC	2	6	148866	148871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2552	NC_010070	CGG	2	6	148966	148971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2553	NC_010070	GACATA	2	12	148997	149008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506614
2554	NC_010070	ATC	2	6	149037	149042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506614
2555	NC_010070	GC	3	6	149092	149097	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2556	NC_010070	GAC	2	6	149108	149113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2557	NC_010070	CGAG	2	8	149134	149141	25 %	0 %	50 %	25 %	161506614
2558	NC_010070	CGC	2	6	149215	149220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2559	NC_010070	CCG	2	6	149224	149229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2560	NC_010070	CGAC	2	8	149236	149243	25 %	0 %	25 %	50 %	161506614
2561	NC_010070	CCG	2	6	149313	149318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2562	NC_010070	CGAT	2	8	149391	149398	25 %	25 %	25 %	25 %	161506614
2563	NC_010070	ACA	2	6	149455	149460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506614
2564	NC_010070	CGG	2	6	149480	149485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2565	NC_010070	GCC	2	6	149563	149568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2566	NC_010070	TGG	2	6	149593	149598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506614
2567	NC_010070	CG	3	6	149639	149644	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2568	NC_010070	CTG	2	6	149702	149707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2569	NC_010070	CAG	2	6	149708	149713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2570	NC_010070	TCGC	2	8	149715	149722	0 %	25 %	25 %	50 %	161506614
2571	NC_010070	ACA	2	6	149761	149766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506614
2572	NC_010070	TCG	2	6	149775	149780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2573	NC_010070	GTG	2	6	149782	149787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506614
2574	NC_010070	CGC	2	6	149797	149802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2575	NC_010070	CCG	2	6	149842	149847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2576	NC_010070	CCGC	2	8	149951	149958	0 %	0 %	25 %	75 %	161506614
2577	NC_010070	GCCG	2	8	150002	150009	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2578	NC_010070	CCG	3	9	150007	150015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2579	NC_010070	GCG	2	6	150043	150048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2580	NC_010070	CGAG	2	8	150073	150080	25 %	0 %	50 %	25 %	161506614
2581	NC_010070	TGA	3	9	150103	150111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506614
2582	NC_010070	CGG	2	6	150142	150147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2583	NC_010070	GCG	2	6	150177	150182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2584	NC_010070	ATC	2	6	150243	150248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506614
2585	NC_010070	CGATCG	2	12	150274	150285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2586	NC_010070	GCC	2	6	150290	150295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2587	NC_010070	CGA	2	6	150379	150384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2588	NC_010070	CGA	2	6	150427	150432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2589	NC_010070	TGA	2	6	150433	150438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506614
2590	NC_010070	CTC	2	6	150440	150445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161506614
2591	NC_010070	GGT	2	6	150503	150508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506614
2592	NC_010070	AGCG	2	8	150531	150538	25 %	0 %	50 %	25 %	161506614
2593	NC_010070	CGC	2	6	150613	150618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2594	NC_010070	TGCG	2	8	150682	150689	0 %	25 %	50 %	25 %	161506614
2595	NC_010070	CAG	2	6	150698	150703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2596	NC_010070	CGT	2	6	150718	150723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2597	NC_010070	TCG	2	6	150750	150755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2598	NC_010070	AGCG	2	8	150756	150763	25 %	0 %	50 %	25 %	161506614
2599	NC_010070	ACTCGG	2	12	150790	150801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2600	NC_010070	CCA	2	6	150808	150813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161506614
2601	NC_010070	GCC	2	6	150818	150823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2602	NC_010070	CG	3	6	150881	150886	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2603	NC_010070	GCC	2	6	150929	150934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506614
2604	NC_010070	GC	4	8	151000	151007	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2605	NC_010070	CGA	2	6	151039	151044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2606	NC_010070	CGAG	2	8	151087	151094	25 %	0 %	50 %	25 %	161506614
2607	NC_010070	GGC	2	6	151114	151119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2608	NC_010070	CG	3	6	151147	151152	0 %	0 %	50 %	50 %	161506614
2609	NC_010070	GGTC	2	8	151168	151175	0 %	25 %	50 %	25 %	161506614
2610	NC_010070	GTC	2	6	151178	151183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2611	NC_010070	ACG	2	6	151213	151218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2612	NC_010070	AGC	2	6	151254	151259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2613	NC_010070	GTC	2	6	151260	151265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2614	NC_010070	GCG	2	6	151300	151305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506614
2615	NC_010070	ACG	2	6	151318	151323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506614
2616	NC_010070	TGA	3	9	151327	151335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506614
2617	NC_010070	TGGA	2	8	151443	151450	25 %	25 %	50 %	0 %	161506614
2618	NC_010070	GC	3	6	151476	151481	0 %	0 %	50 %	50 %	161506615
2619	NC_010070	TTG	2	6	151589	151594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506615
2620	NC_010070	TGA	2	6	151637	151642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506615
2621	NC_010070	GA	3	6	151641	151646	50 %	0 %	50 %	0 %	161506615
2622	NC_010070	GCG	2	6	151658	151663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506615
2623	NC_010070	GGT	2	6	151684	151689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506615
2624	NC_010070	CGA	2	6	151818	151823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506615
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2626	NC_010070	GAC	2	6	151930	151935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506615
2627	NC_010070	TGA	2	6	151953	151958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506615
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2740	NC_010070	CATCTC	2	12	158212	158223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161506623
2741	NC_010070	TGC	2	6	158241	158246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506623
2742	NC_010070	TTG	2	6	158273	158278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506623
2743	NC_010070	GTG	2	6	158350	158355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506623
2744	NC_010070	CGG	2	6	158394	158399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506623
2745	NC_010070	GC	3	6	158411	158416	0 %	0 %	50 %	50 %	161506623
2746	NC_010070	CGGC	2	8	158460	158467	0 %	0 %	50 %	50 %	161506623
2747	NC_010070	GCC	2	6	158476	158481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506623
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2755	NC_010070	TTG	2	6	158957	158962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506623
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2760	NC_010070	GCG	2	6	159186	159191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506623
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2844	NC_010070	CGTCA	2	10	163827	163836	20 %	20 %	20 %	40 %	161506628
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2853	NC_010070	GAA	2	6	164466	164471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506629
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2859	NC_010070	CAT	2	6	164903	164908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506630
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2861	NC_010070	GCA	2	6	164980	164985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506630
2862	NC_010070	TCGA	2	8	164991	164998	25 %	25 %	25 %	25 %	161506630
2863	NC_010070	GTC	2	6	165005	165010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506630
2864	NC_010070	GGCGG	2	10	165017	165026	0 %	0 %	80 %	20 %	161506630
2865	NC_010070	CTTTC	2	10	165099	165108	0 %	60 %	0 %	40 %	161506631
2866	NC_010070	CAG	2	6	165152	165157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506631
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2869	NC_010070	TCG	2	6	165231	165236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506631
2870	NC_010070	CGA	2	6	165260	165265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506631
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2882	NC_010070	TCA	2	6	165917	165922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506632
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2884	NC_010070	CAG	2	6	166050	166055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506632
2885	NC_010070	GAC	2	6	166101	166106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506632
2886	NC_010070	CTC	2	6	166110	166115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161506632
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2889	NC_010070	AAC	2	6	166493	166498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506633
2890	NC_010070	GCA	2	6	166549	166554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506633
2891	NC_010070	CG	3	6	166589	166594	0 %	0 %	50 %	50 %	161506633
2892	NC_010070	TCG	2	6	166603	166608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506633
2893	NC_010070	CCCA	2	8	166653	166660	25 %	0 %	0 %	75 %	161506633
2894	NC_010070	CGG	2	6	166672	166677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506633
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2896	NC_010070	CGGC	2	8	166804	166811	0 %	0 %	50 %	50 %	161506633
2897	NC_010070	TGC	2	6	166938	166943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506633
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2899	NC_010070	CG	3	6	167012	167017	0 %	0 %	50 %	50 %	161506633
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2901	NC_010070	AG	3	6	167068	167073	50 %	0 %	50 %	0 %	161506633
2902	NC_010070	GCC	2	6	167160	167165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506633
2903	NC_010070	CCGC	2	8	167175	167182	0 %	0 %	25 %	75 %	161506633
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2912	NC_010070	TGCG	2	8	167393	167400	0 %	25 %	50 %	25 %	161506633

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.