MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM300

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010010	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
2	NC_010010	A	7	7	200	206	100 %	0 %	0 %	0 %	161376720
3	NC_010010	ACA	3	9	242	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
4	NC_010010	A	6	6	276	281	100 %	0 %	0 %	0 %	161376720
5	NC_010010	TGA	2	6	355	360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376720
6	NC_010010	A	6	6	360	365	100 %	0 %	0 %	0 %	161376720
7	NC_010010	AGA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
8	NC_010010	ACA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
9	NC_010010	T	6	6	534	539	0 %	100 %	0 %	0 %	161376720
10	NC_010010	ACA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376720
11	NC_010010	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
12	NC_010010	AG	3	6	650	655	50 %	0 %	50 %	0 %	161376720
13	NC_010010	A	6	6	658	663	100 %	0 %	0 %	0 %	161376720
14	NC_010010	TTA	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376720
15	NC_010010	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
16	NC_010010	A	6	6	762	767	100 %	0 %	0 %	0 %	161376720
17	NC_010010	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161376720
18	NC_010010	TAC	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
19	NC_010010	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
20	NC_010010	AGA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
21	NC_010010	ACAT	2	8	1060	1067	50 %	25 %	0 %	25 %	161376720
22	NC_010010	CAG	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
23	NC_010010	ATC	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
24	NC_010010	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376720
25	NC_010010	AAT	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376720
26	NC_010010	GAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376720
27	NC_010010	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376720
28	NC_010010	GAA	3	9	1663	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
29	NC_010010	AGA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376721
30	NC_010010	TGA	2	6	1737	1742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
31	NC_010010	TTTC	2	8	1770	1777	0 %	75 %	0 %	25 %	161376721
32	NC_010010	TGA	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376721
33	NC_010010	GGA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
34	NC_010010	TCCG	2	8	1988	1995	0 %	25 %	25 %	50 %	161376721
35	NC_010010	GGA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161376721
36	NC_010010	ATTTT	2	10	2010	2019	20 %	80 %	0 %	0 %	161376721
37	NC_010010	ATTA	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	161376721
38	NC_010010	ACCG	2	8	2092	2099	25 %	0 %	25 %	50 %	161376721
39	NC_010010	ACTT	2	8	2121	2128	25 %	50 %	0 %	25 %	161376721
40	NC_010010	A	6	6	3092	3097	100 %	0 %	0 %	0 %	294672679
41	NC_010010	ATTGT	2	10	3388	3397	20 %	60 %	20 %	0 %	294672680
42	NC_010010	AG	3	6	3448	3453	50 %	0 %	50 %	0 %	294672680
43	NC_010010	T	7	7	3454	3460	0 %	100 %	0 %	0 %	294672680
44	NC_010010	TA	3	6	3480	3485	50 %	50 %	0 %	0 %	294672680
45	NC_010010	TA	4	8	3505	3512	50 %	50 %	0 %	0 %	294672680
46	NC_010010	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
47	NC_010010	TAC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161376722
48	NC_010010	ATTCA	2	10	3585	3594	40 %	40 %	0 %	20 %	161376722
49	NC_010010	TAG	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
50	NC_010010	CCG	2	6	3823	3828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161376722
51	NC_010010	AT	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	161376722
52	NC_010010	ATTTCC	2	12	3894	3905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161376722
53	NC_010010	ATTTT	2	10	3947	3956	20 %	80 %	0 %	0 %	161376722
54	NC_010010	TAAG	2	8	3978	3985	50 %	25 %	25 %	0 %	161376722
55	NC_010010	ATA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376722
56	NC_010010	AGA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376722
57	NC_010010	ATT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
58	NC_010010	T	7	7	4139	4145	0 %	100 %	0 %	0 %	161376722
59	NC_010010	TAGT	2	8	4181	4188	25 %	50 %	25 %	0 %	161376722
60	NC_010010	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376722
61	NC_010010	TC	3	6	4374	4379	0 %	50 %	0 %	50 %	161376722
62	NC_010010	T	9	9	4419	4427	0 %	100 %	0 %	0 %	161376722
63	NC_010010	A	7	7	4454	4460	100 %	0 %	0 %	0 %	161376722
64	NC_010010	T	7	7	4503	4509	0 %	100 %	0 %	0 %	161376722
65	NC_010010	GAT	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376722
66	NC_010010	AAAT	2	8	4749	4756	75 %	25 %	0 %	0 %	294672681
67	NC_010010	AGC	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
68	NC_010010	AAAC	2	8	4788	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	294672681
69	NC_010010	A	7	7	4827	4833	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
70	NC_010010	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
71	NC_010010	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672681
72	NC_010010	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
73	NC_010010	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
74	NC_010010	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
75	NC_010010	AC	3	6	5087	5092	50 %	0 %	0 %	50 %	294672681
76	NC_010010	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
77	NC_010010	GAA	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
78	NC_010010	TAT	2	6	5213	5218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
79	NC_010010	A	7	7	5265	5271	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
80	NC_010010	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
81	NC_010010	TGGA	2	8	5306	5313	25 %	25 %	50 %	0 %	294672681
82	NC_010010	TAT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
83	NC_010010	TTA	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
84	NC_010010	TAT	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
85	NC_010010	ATG	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672681
86	NC_010010	AATT	2	8	5549	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	294672681
87	NC_010010	CCTT	2	8	5662	5669	0 %	50 %	0 %	50 %	294672681
88	NC_010010	ATT	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672681
89	NC_010010	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672681
90	NC_010010	TA	3	6	5788	5793	50 %	50 %	0 %	0 %	294672681
91	NC_010010	ACCT	2	8	5823	5830	25 %	25 %	0 %	50 %	294672681
92	NC_010010	AT	3	6	5850	5855	50 %	50 %	0 %	0 %	294672681
93	NC_010010	CAT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672681
94	NC_010010	A	6	6	5875	5880	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
95	NC_010010	A	7	7	5887	5893	100 %	0 %	0 %	0 %	294672681
96	NC_010010	AGC	2	6	5904	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672681
97	NC_010010	TCC	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161376725
98	NC_010010	ATT	2	6	6910	6915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376725
99	NC_010010	TCT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376725
100	NC_010010	TAA	3	9	6940	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376725
101	NC_010010	TGG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376725
102	NC_010010	ACG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
103	NC_010010	TGA	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161376725
104	NC_010010	CGA	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376725
105	NC_010010	AAAGC	2	10	7173	7182	60 %	0 %	20 %	20 %	161376725
106	NC_010010	GTT	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376725
107	NC_010010	T	8	8	7343	7350	0 %	100 %	0 %	0 %	161376725
108	NC_010010	TTTG	2	8	7366	7373	0 %	75 %	25 %	0 %	161376725
109	NC_010010	T	6	6	7388	7393	0 %	100 %	0 %	0 %	161376725
110	NC_010010	TTTG	2	8	7411	7418	0 %	75 %	25 %	0 %	161376725
111	NC_010010	T	6	6	7433	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	161376725
112	NC_010010	TCACTT	2	12	7440	7451	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161376725
113	NC_010010	T	7	7	7561	7567	0 %	100 %	0 %	0 %	294672682
114	NC_010010	TTTTG	2	10	7571	7580	0 %	80 %	20 %	0 %	294672682
115	NC_010010	G	7	7	7599	7605	0 %	0 %	100 %	0 %	294672682
116	NC_010010	AAC	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672682
117	NC_010010	ACT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672682
118	NC_010010	TA	3	6	8420	8425	50 %	50 %	0 %	0 %	294672683
119	NC_010010	TTG	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672683
120	NC_010010	TCT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672683
121	NC_010010	GAAAA	2	10	8522	8531	80 %	0 %	20 %	0 %	294672683
122	NC_010010	TAA	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672683
123	NC_010010	AATA	2	8	8595	8602	75 %	25 %	0 %	0 %	294672683
124	NC_010010	TTG	2	6	9061	9066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
125	NC_010010	TTG	3	9	9076	9084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672684
126	NC_010010	CCA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672684
127	NC_010010	CCT	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672684
128	NC_010010	CAG	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
129	NC_010010	CAG	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
130	NC_010010	CAG	2	6	9684	9689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
131	NC_010010	CAG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
132	NC_010010	CAG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
133	NC_010010	CAG	2	6	9864	9869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672684
134	NC_010010	TGG	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672685
135	NC_010010	TAT	2	6	10158	10163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672685
136	NC_010010	AGT	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672685
137	NC_010010	CGT	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672685
138	NC_010010	GGA	2	6	10376	10381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672685
139	NC_010010	AT	3	6	10936	10941	50 %	50 %	0 %	0 %	294672686
140	NC_010010	T	6	6	10956	10961	0 %	100 %	0 %	0 %	294672686
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142	NC_010010	GTT	2	6	11013	11018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672686
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149	NC_010010	CTT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672688
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159	NC_010010	TTTA	2	8	12057	12064	25 %	75 %	0 %	0 %	161376728
160	NC_010010	T	6	6	12078	12083	0 %	100 %	0 %	0 %	161376728
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396	NC_010010	AAG	2	6	26035	26040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161376739
397	NC_010010	AAT	2	6	26056	26061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161376739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.