MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brucella ovis ATCC 25840 chromosome II

Total Repeats: 604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009504	GCGAA	2	10	287	296	40 %	0 %	40 %	20 %	148558266
2	NC_009504	CATGG	2	10	430	439	20 %	20 %	40 %	20 %	148558266
3	NC_009504	CCGCG	2	10	781	790	0 %	0 %	40 %	60 %	148558266
4	NC_009504	GCCGC	2	10	4434	4443	0 %	0 %	40 %	60 %	148557965
5	NC_009504	ACCGA	2	10	8462	8471	40 %	0 %	20 %	40 %	148558348
6	NC_009504	CGGCG	2	10	11669	11678	0 %	0 %	60 %	40 %	148558790
7	NC_009504	CCCCG	2	10	13848	13857	0 %	0 %	20 %	80 %	148558766
8	NC_009504	CATCA	2	10	15500	15509	40 %	20 %	0 %	40 %	148558109
9	NC_009504	AGGCG	2	10	18831	18840	20 %	0 %	60 %	20 %	148558369
10	NC_009504	GCCAT	2	10	19095	19104	20 %	20 %	20 %	40 %	148558229
11	NC_009504	TGAGG	2	10	19381	19390	20 %	20 %	60 %	0 %	148558229
12	NC_009504	GCTTC	2	10	19463	19472	0 %	40 %	20 %	40 %	148558229
13	NC_009504	TCTCG	2	10	23051	23060	0 %	40 %	20 %	40 %	148557921
14	NC_009504	CGGCC	2	10	23765	23774	0 %	0 %	40 %	60 %	148557921
15	NC_009504	CGGCC	2	10	24253	24262	0 %	0 %	40 %	60 %	148557968
16	NC_009504	ATCCG	2	10	24700	24709	20 %	20 %	20 %	40 %	148557968
17	NC_009504	GGCGA	2	10	25054	25063	20 %	0 %	60 %	20 %	148558045
18	NC_009504	ACGGC	2	10	27052	27061	20 %	0 %	40 %	40 %	148558133
19	NC_009504	GCGCA	2	10	28159	28168	20 %	0 %	40 %	40 %	148558786
20	NC_009504	TCGGT	2	10	28376	28385	0 %	40 %	40 %	20 %	148558786
21	NC_009504	CCGCG	2	10	33561	33570	0 %	0 %	40 %	60 %	148558615
22	NC_009504	CTGCC	2	10	35592	35601	0 %	20 %	20 %	60 %	148558615
23	NC_009504	GGCCT	2	10	37330	37339	0 %	20 %	40 %	40 %	148558508
24	NC_009504	CGGAA	2	10	38620	38629	40 %	0 %	40 %	20 %	148558301
25	NC_009504	CATGC	2	10	40849	40858	20 %	20 %	20 %	40 %	148558365
26	NC_009504	GCGCC	2	10	41594	41603	0 %	0 %	40 %	60 %	148557902
27	NC_009504	CAGCG	2	10	42476	42485	20 %	0 %	40 %	40 %	148558687
28	NC_009504	CGGCG	2	10	43375	43384	0 %	0 %	60 %	40 %	148557883
29	NC_009504	GCAAA	2	10	43962	43971	60 %	0 %	20 %	20 %	148558297
30	NC_009504	TGCGC	2	10	48016	48025	0 %	20 %	40 %	40 %	148557839
31	NC_009504	CCGCT	2	10	50031	50040	0 %	20 %	20 %	60 %	148557839
32	NC_009504	GGTAA	2	10	51362	51371	40 %	20 %	40 %	0 %	148558389
33	NC_009504	CCGGC	2	10	51816	51825	0 %	0 %	40 %	60 %	148558389
34	NC_009504	CGGAA	2	10	52516	52525	40 %	0 %	40 %	20 %	148558389
35	NC_009504	GCCGT	2	10	54811	54820	0 %	20 %	40 %	40 %	148558575
36	NC_009504	CATTC	2	10	55060	55069	20 %	40 %	0 %	40 %	148558575
37	NC_009504	CTTCG	2	10	56937	56946	0 %	40 %	20 %	40 %	148558165
38	NC_009504	TTTGC	2	10	58889	58898	0 %	60 %	20 %	20 %	148558751
39	NC_009504	TGCCC	2	10	60286	60295	0 %	20 %	20 %	60 %	148558296
40	NC_009504	ATGCG	2	10	62227	62236	20 %	20 %	40 %	20 %	148558741
41	NC_009504	ATGTG	2	10	64065	64074	20 %	40 %	40 %	0 %	148558211
42	NC_009504	ATCGC	2	10	68235	68244	20 %	20 %	20 %	40 %	148558066
43	NC_009504	GACGG	2	10	68546	68555	20 %	0 %	60 %	20 %	148558066
44	NC_009504	GTGCC	2	10	68593	68602	0 %	20 %	40 %	40 %	148558066
45	NC_009504	AGGGC	2	10	78207	78216	20 %	0 %	60 %	20 %	148558559
46	NC_009504	AATTC	2	10	78327	78336	40 %	40 %	0 %	20 %	148558559
47	NC_009504	AGCCA	2	10	86566	86575	40 %	0 %	20 %	40 %	148558286
48	NC_009504	GCCGG	2	10	93172	93181	0 %	0 %	60 %	40 %	148558639
49	NC_009504	TGCGG	2	10	93196	93205	0 %	20 %	60 %	20 %	148558639
50	NC_009504	ATGAA	2	10	93425	93434	60 %	20 %	20 %	0 %	148558639
51	NC_009504	CTTTC	2	10	93794	93803	0 %	60 %	0 %	40 %	148558483
52	NC_009504	GCAAT	2	10	94420	94429	40 %	20 %	20 %	20 %	148558483
53	NC_009504	GTAAT	2	10	95552	95561	40 %	40 %	20 %	0 %	148558743
54	NC_009504	CCGAG	2	10	96239	96248	20 %	0 %	40 %	40 %	148558743
55	NC_009504	TCGCT	2	10	97389	97398	0 %	40 %	20 %	40 %	148558692
56	NC_009504	ATGGC	2	10	97905	97914	20 %	20 %	40 %	20 %	148558692
57	NC_009504	TTCGC	2	10	99291	99300	0 %	40 %	20 %	40 %	148558272
58	NC_009504	GCTCT	2	10	99404	99413	0 %	40 %	20 %	40 %	148558272
59	NC_009504	ATGAG	2	10	99498	99507	40 %	20 %	40 %	0 %	148558272
60	NC_009504	GTTCC	2	10	99610	99619	0 %	40 %	20 %	40 %	148558272
61	NC_009504	CCGCT	2	10	103426	103435	0 %	20 %	20 %	60 %	148558597
62	NC_009504	CCGAT	2	10	103579	103588	20 %	20 %	20 %	40 %	148558597
63	NC_009504	TCCTT	2	10	106434	106443	0 %	60 %	0 %	40 %	148558166
64	NC_009504	GGCGA	2	10	107415	107424	20 %	0 %	60 %	20 %	148557878
65	NC_009504	CCGCG	2	10	112950	112959	0 %	0 %	40 %	60 %	148558584
66	NC_009504	CGGTG	2	10	114538	114547	0 %	20 %	60 %	20 %	148558457
67	NC_009504	GCACA	2	10	116866	116875	40 %	0 %	20 %	40 %	148558373
68	NC_009504	GCCAT	2	10	117497	117506	20 %	20 %	20 %	40 %	148558287
69	NC_009504	CGATA	2	10	121054	121063	40 %	20 %	20 %	20 %	148558047
70	NC_009504	GCCCG	2	10	121468	121477	0 %	0 %	40 %	60 %	148558047
71	NC_009504	CATCG	2	10	124989	124998	20 %	20 %	20 %	40 %	148558502
72	NC_009504	CGCGG	2	10	127711	127720	0 %	0 %	60 %	40 %	148558470
73	NC_009504	AATCA	2	10	128832	128841	60 %	20 %	0 %	20 %	148558054
74	NC_009504	TGGGC	2	10	132478	132487	0 %	20 %	60 %	20 %	148558377
75	NC_009504	CAAGA	2	10	132590	132599	60 %	0 %	20 %	20 %	148558377
76	NC_009504	TGGGA	2	10	135769	135778	20 %	20 %	60 %	0 %	148558239
77	NC_009504	GGGCA	3	15	140348	140362	20 %	0 %	60 %	20 %	148558118
78	NC_009504	GCCGC	2	10	141214	141223	0 %	0 %	40 %	60 %	148558338
79	NC_009504	CCGCA	2	10	142865	142874	20 %	0 %	20 %	60 %	148558234
80	NC_009504	ATGAA	2	10	143916	143925	60 %	20 %	20 %	0 %	148557926
81	NC_009504	CGCAG	2	10	146376	146385	20 %	0 %	40 %	40 %	148558232
82	NC_009504	CCGGC	2	10	149758	149767	0 %	0 %	40 %	60 %	148558183
83	NC_009504	CGCAT	2	10	149836	149845	20 %	20 %	20 %	40 %	148558183
84	NC_009504	CTATA	2	10	151313	151322	40 %	40 %	0 %	20 %	148558552
85	NC_009504	GCTTT	2	10	152297	152306	0 %	60 %	20 %	20 %	148558276
86	NC_009504	CGCGG	2	10	152376	152385	0 %	0 %	60 %	40 %	148558276
87	NC_009504	AGCGG	2	10	161687	161696	20 %	0 %	60 %	20 %	148557931
88	NC_009504	TCGCA	2	10	162109	162118	20 %	20 %	20 %	40 %	148558366
89	NC_009504	GGCCG	2	10	168945	168954	0 %	0 %	60 %	40 %	148558107
90	NC_009504	GTTCG	2	10	171820	171829	0 %	40 %	40 %	20 %	148557840
91	NC_009504	GTCTC	2	10	171855	171864	0 %	40 %	20 %	40 %	148557840
92	NC_009504	CTTCA	2	10	179250	179259	20 %	40 %	0 %	40 %	148558491
93	NC_009504	TGACC	2	10	179519	179528	20 %	20 %	20 %	40 %	148558491
94	NC_009504	GTGAA	2	10	189669	189678	40 %	20 %	40 %	0 %	148558125
95	NC_009504	GAAGA	2	10	190001	190010	60 %	0 %	40 %	0 %	148558125
96	NC_009504	GCCGC	2	10	190504	190513	0 %	0 %	40 %	60 %	148558125
97	NC_009504	GATCA	2	10	192655	192664	40 %	20 %	20 %	20 %	148558412
98	NC_009504	GCGCC	2	10	196620	196629	0 %	0 %	40 %	60 %	148558586
99	NC_009504	GTTCA	2	10	196696	196705	20 %	40 %	20 %	20 %	148558586
100	NC_009504	AGCAG	2	10	203008	203017	40 %	0 %	40 %	20 %	148557872
101	NC_009504	CGTGT	2	10	203290	203299	0 %	40 %	40 %	20 %	148558497
102	NC_009504	CGGCA	2	10	203707	203716	20 %	0 %	40 %	40 %	148558497
103	NC_009504	GGCGT	2	10	204494	204503	0 %	20 %	60 %	20 %	148558497
104	NC_009504	AGGGC	2	10	204654	204663	20 %	0 %	60 %	20 %	148558497
105	NC_009504	CGCCT	2	10	209739	209748	0 %	20 %	20 %	60 %	148558451
106	NC_009504	CGGGC	2	10	210181	210190	0 %	0 %	60 %	40 %	148558451
107	NC_009504	TCGCA	2	10	211208	211217	20 %	20 %	20 %	40 %	148558028
108	NC_009504	GGCCG	2	10	212244	212253	0 %	0 %	60 %	40 %	148558519
109	NC_009504	CGCCA	2	10	216244	216253	20 %	0 %	20 %	60 %	148558769
110	NC_009504	GCCCG	2	10	217822	217831	0 %	0 %	40 %	60 %	148558729
111	NC_009504	TGTTT	2	10	221590	221599	0 %	80 %	20 %	0 %	148557909
112	NC_009504	GCGTG	2	10	222335	222344	0 %	20 %	60 %	20 %	148558168
113	NC_009504	GCCGC	2	10	224837	224846	0 %	0 %	40 %	60 %	148558725
114	NC_009504	GTCCT	2	10	225844	225853	0 %	40 %	20 %	40 %	148558346
115	NC_009504	CGCGG	2	10	226646	226655	0 %	0 %	60 %	40 %	148557843
116	NC_009504	TGCGC	2	10	230139	230148	0 %	20 %	40 %	40 %	148558711
117	NC_009504	CATCG	2	10	234599	234608	20 %	20 %	20 %	40 %	148558518
118	NC_009504	GTCAA	2	10	235131	235140	40 %	20 %	20 %	20 %	148558607
119	NC_009504	TCGGT	2	10	237963	237972	0 %	40 %	40 %	20 %	148557884
120	NC_009504	CCATG	2	10	240842	240851	20 %	20 %	20 %	40 %	148558350
121	NC_009504	GAATG	2	10	241638	241647	40 %	20 %	40 %	0 %	148558350
122	NC_009504	GCGCT	2	10	242254	242263	0 %	20 %	40 %	40 %	148557928
123	NC_009504	GCAAC	2	10	242995	243004	40 %	0 %	20 %	40 %	148558161
124	NC_009504	TGCTG	2	10	243199	243208	0 %	40 %	40 %	20 %	148558161
125	NC_009504	CGCGC	2	10	247798	247807	0 %	0 %	40 %	60 %	148558701
126	NC_009504	TTCGC	2	10	248310	248319	0 %	40 %	20 %	40 %	148558701
127	NC_009504	CAAGC	2	10	249279	249288	40 %	0 %	20 %	40 %	148558278
128	NC_009504	CGGGC	2	10	249480	249489	0 %	0 %	60 %	40 %	148558382
129	NC_009504	CAAGG	2	10	250467	250476	40 %	0 %	40 %	20 %	148558382
130	NC_009504	GGCGC	2	10	250764	250773	0 %	0 %	60 %	40 %	148558382
131	NC_009504	GCTCG	2	10	250853	250862	0 %	20 %	40 %	40 %	148558382
132	NC_009504	CGTCC	2	10	253504	253513	0 %	20 %	20 %	60 %	148558225
133	NC_009504	GCGCC	2	10	256085	256094	0 %	0 %	40 %	60 %	148558253
134	NC_009504	CGATC	2	10	258420	258429	20 %	20 %	20 %	40 %	148558347
135	NC_009504	AGGCA	2	10	259168	259177	40 %	0 %	40 %	20 %	148558788
136	NC_009504	AGCCG	2	10	259223	259232	20 %	0 %	40 %	40 %	148558788
137	NC_009504	TGATC	2	10	260294	260303	20 %	40 %	20 %	20 %	148558788
138	NC_009504	AAGGT	2	10	261161	261170	40 %	20 %	40 %	0 %	148558676
139	NC_009504	GCCGT	2	10	262688	262697	0 %	20 %	40 %	40 %	148558065
140	NC_009504	GAAGT	2	10	265132	265141	40 %	20 %	40 %	0 %	148558215
141	NC_009504	TGCGA	2	10	270352	270361	20 %	20 %	40 %	20 %	148558554
142	NC_009504	CCGGC	2	10	271502	271511	0 %	0 %	40 %	60 %	148557848
143	NC_009504	GGCGC	2	10	274173	274182	0 %	0 %	60 %	40 %	148557867
144	NC_009504	GATGT	2	10	274276	274285	20 %	40 %	40 %	0 %	148557867
145	NC_009504	TCGCC	2	10	274361	274370	0 %	20 %	20 %	60 %	148557867
146	NC_009504	AGGAG	2	10	277715	277724	40 %	0 %	60 %	0 %	148558543
147	NC_009504	CACGG	2	10	279598	279607	20 %	0 %	40 %	40 %	148558779
148	NC_009504	GTGGA	2	10	279746	279755	20 %	20 %	60 %	0 %	148558779
149	NC_009504	TCCAG	2	10	280440	280449	20 %	20 %	20 %	40 %	148558779
150	NC_009504	CCGCA	2	10	287540	287549	20 %	0 %	20 %	60 %	148558194
151	NC_009504	GACGG	2	10	291386	291395	20 %	0 %	60 %	20 %	148558536
152	NC_009504	GGAAC	2	10	293994	294003	40 %	0 %	40 %	20 %	148557864
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154	NC_009504	GCATC	2	10	309112	309121	20 %	20 %	20 %	40 %	148558233
155	NC_009504	AAAGC	2	10	311739	311748	60 %	0 %	20 %	20 %	148557997
156	NC_009504	GGCCG	2	10	314755	314764	0 %	0 %	60 %	40 %	148558131
157	NC_009504	GGTCA	2	10	318184	318193	20 %	20 %	40 %	20 %	148557893
158	NC_009504	TGGGT	2	10	321545	321554	0 %	40 %	60 %	0 %	148558655
159	NC_009504	TGCCG	2	10	326125	326134	0 %	20 %	40 %	40 %	148558633
160	NC_009504	GAAAA	2	10	327163	327172	80 %	0 %	20 %	0 %	148558633
161	NC_009504	TGCCG	2	10	331078	331087	0 %	20 %	40 %	40 %	148558271
162	NC_009504	ACCAG	2	10	331127	331136	40 %	0 %	20 %	40 %	148558271
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164	NC_009504	CCATG	2	10	334658	334667	20 %	20 %	20 %	40 %	148558571
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166	NC_009504	ACGTG	2	10	335850	335859	20 %	20 %	40 %	20 %	148558440
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168	NC_009504	CATCT	2	10	344470	344479	20 %	40 %	0 %	40 %	148558690
169	NC_009504	GCCCG	2	10	348431	348440	0 %	0 %	40 %	60 %	148558581
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173	NC_009504	GGTGC	2	10	353152	353161	0 %	20 %	60 %	20 %	148558530
174	NC_009504	CGCGC	2	10	354458	354467	0 %	0 %	40 %	60 %	148557952
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178	NC_009504	CGCGG	2	10	367971	367980	0 %	0 %	60 %	40 %	148557922
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184	NC_009504	CCTGT	2	10	381554	381563	0 %	40 %	20 %	40 %	148558592
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194	NC_009504	CGAAC	2	10	395754	395763	40 %	0 %	20 %	40 %	148558356
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196	NC_009504	GCGCG	2	10	398048	398057	0 %	0 %	60 %	40 %	148558466
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199	NC_009504	GACCT	2	10	400372	400381	20 %	20 %	20 %	40 %	148557917
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244	NC_009504	CCCGG	2	10	476777	476786	0 %	0 %	40 %	60 %	148558303
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246	NC_009504	TGGAA	2	10	478390	478399	40 %	20 %	40 %	0 %	148558309
247	NC_009504	CGGCG	2	10	480072	480081	0 %	0 %	60 %	40 %	148558452
248	NC_009504	TTTGC	2	10	480250	480259	0 %	60 %	20 %	20 %	148558452
249	NC_009504	AACGC	2	10	484286	484295	40 %	0 %	20 %	40 %	148558263
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251	NC_009504	CGTGC	2	10	491080	491089	0 %	20 %	40 %	40 %	148558585
252	NC_009504	ACGCC	2	10	491678	491687	20 %	0 %	20 %	60 %	148558585
253	NC_009504	GGCGC	2	10	491731	491740	0 %	0 %	60 %	40 %	148558585
254	NC_009504	ATTTT	2	10	492740	492749	20 %	80 %	0 %	0 %	148558181
255	NC_009504	TGCGA	2	10	495405	495414	20 %	20 %	40 %	20 %	148558339
256	NC_009504	ATTCA	2	10	496744	496753	40 %	40 %	0 %	20 %	148558163
257	NC_009504	GCAGA	2	10	497528	497537	40 %	0 %	40 %	20 %	148558163
258	NC_009504	TGCGC	2	10	501430	501439	0 %	20 %	40 %	40 %	148558252
259	NC_009504	CGATC	2	10	501646	501655	20 %	20 %	20 %	40 %	148558252
260	NC_009504	GCCGC	2	10	501885	501894	0 %	0 %	40 %	60 %	148558252
261	NC_009504	GCCGG	2	10	502086	502095	0 %	0 %	60 %	40 %	148558691
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263	NC_009504	TCGCA	2	10	506291	506300	20 %	20 %	20 %	40 %	148558111
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390	NC_009504	GATCG	2	10	792187	792196	20 %	20 %	40 %	20 %	148558072
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