MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	CTG	2	6	765	770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
2	NC_009485	GCATC	2	10	792	801	20 %	20 %	20 %	40 %	148251627
3	NC_009485	TC	3	6	804	809	0 %	50 %	0 %	50 %	148251627
4	NC_009485	TGCGC	2	10	824	833	0 %	20 %	40 %	40 %	148251627
5	NC_009485	CGCC	2	8	836	843	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
6	NC_009485	AGG	2	6	845	850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251627
7	NC_009485	GC	3	6	868	873	0 %	0 %	50 %	50 %	148251627
8	NC_009485	TGA	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251627
9	NC_009485	GCCA	2	8	937	944	25 %	0 %	25 %	50 %	148251627
10	NC_009485	GGC	2	6	955	960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
11	NC_009485	CGC	2	6	962	967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
12	NC_009485	GCC	3	9	1027	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
13	NC_009485	GCC	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
14	NC_009485	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
15	NC_009485	CTG	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
16	NC_009485	CGG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
17	NC_009485	CCG	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
18	NC_009485	GCG	2	6	1213	1218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
19	NC_009485	AGG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251627
20	NC_009485	CGA	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
21	NC_009485	GGT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251627
22	NC_009485	CCGC	2	8	1383	1390	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
23	NC_009485	CGA	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
24	NC_009485	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
25	NC_009485	GTC	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
26	NC_009485	CG	3	6	1499	1504	0 %	0 %	50 %	50 %	148251627
27	NC_009485	CGG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
28	NC_009485	CG	3	6	1514	1519	0 %	0 %	50 %	50 %	148251627
29	NC_009485	CAT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251627
30	NC_009485	CTG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
31	NC_009485	CAA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251627
32	NC_009485	CGT	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
33	NC_009485	TGT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251627
34	NC_009485	CGT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
35	NC_009485	CCGC	2	8	1806	1813	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
36	NC_009485	GCC	2	6	1871	1876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
37	NC_009485	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
38	NC_009485	ACCAC	2	10	1892	1901	40 %	0 %	0 %	60 %	148251627
39	NC_009485	TGC	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
40	NC_009485	ACG	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
41	NC_009485	ACG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
42	NC_009485	CG	3	6	2312	2317	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
43	NC_009485	GGT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251628
44	NC_009485	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
45	NC_009485	GTGC	2	8	2396	2403	0 %	25 %	50 %	25 %	148251628
46	NC_009485	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
47	NC_009485	GGC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
48	NC_009485	ACC	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251628
49	NC_009485	GC	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
50	NC_009485	GCCG	2	8	2597	2604	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
51	NC_009485	CGC	2	6	2653	2658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
52	NC_009485	GAG	2	6	2741	2746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251628
53	NC_009485	ATCT	2	8	2768	2775	25 %	50 %	0 %	25 %	148251628
54	NC_009485	CGG	2	6	2782	2787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
55	NC_009485	AGC	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251628
56	NC_009485	GC	3	6	2809	2814	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
57	NC_009485	CGAC	2	8	2820	2827	25 %	0 %	25 %	50 %	148251628
58	NC_009485	GCC	2	6	2870	2875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
59	NC_009485	AAC	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251628
60	NC_009485	TCG	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251628
61	NC_009485	CGC	2	6	3100	3105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
62	NC_009485	CCA	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251628
63	NC_009485	CGAG	2	8	3132	3139	25 %	0 %	50 %	25 %	148251628
64	NC_009485	CGC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
65	NC_009485	CGC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
66	NC_009485	CGG	2	6	3519	3524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251629
67	NC_009485	CCA	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251629
68	NC_009485	GCG	2	6	3621	3626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251629
69	NC_009485	CGC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251629
70	NC_009485	GAA	2	6	3675	3680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251629
71	NC_009485	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251629
72	NC_009485	ATG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251629
73	NC_009485	CG	3	6	3886	3891	0 %	0 %	50 %	50 %	148251630
74	NC_009485	CAGCGT	2	12	3894	3905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148251630
75	NC_009485	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251630
76	NC_009485	TTC	2	6	3976	3981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251630
77	NC_009485	GCGCC	2	10	3999	4008	0 %	0 %	40 %	60 %	148251630
78	NC_009485	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
79	NC_009485	GC	3	6	4073	4078	0 %	0 %	50 %	50 %	148251630
80	NC_009485	GCC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
81	NC_009485	ACG	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
82	NC_009485	TCGGC	2	10	4166	4175	0 %	20 %	40 %	40 %	148251630
83	NC_009485	GCC	2	6	4256	4261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
84	NC_009485	CTT	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251630
85	NC_009485	GCT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
86	NC_009485	CGA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
87	NC_009485	CGG	2	6	4406	4411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
88	NC_009485	CGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
89	NC_009485	CGC	2	6	4461	4466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
90	NC_009485	TGC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
91	NC_009485	CCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
92	NC_009485	TGGA	2	8	4528	4535	25 %	25 %	50 %	0 %	148251630
93	NC_009485	GCT	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
94	NC_009485	CTG	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
95	NC_009485	CG	5	10	4603	4612	0 %	0 %	50 %	50 %	148251630
96	NC_009485	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
97	NC_009485	GC	3	6	4690	4695	0 %	0 %	50 %	50 %	148251630
98	NC_009485	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
99	NC_009485	TGC	3	9	4787	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
100	NC_009485	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
101	NC_009485	TCG	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
102	NC_009485	GCC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
103	NC_009485	GTT	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251630
104	NC_009485	GC	3	6	4958	4963	0 %	0 %	50 %	50 %	148251630
105	NC_009485	GCTC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	148251630
106	NC_009485	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251631
107	NC_009485	AAG	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251631
108	NC_009485	CGGC	2	8	5161	5168	0 %	0 %	50 %	50 %	148251631
109	NC_009485	TCT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251631
110	NC_009485	ACA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251631
111	NC_009485	AAG	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251631
112	NC_009485	CTC	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251631
113	NC_009485	ATC	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251631
114	NC_009485	CGC	2	6	5395	5400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251631
115	NC_009485	GGT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251631
116	NC_009485	GGA	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251631
117	NC_009485	GCC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
118	NC_009485	GGCG	2	8	5638	5645	0 %	0 %	75 %	25 %	148251632
119	NC_009485	CT	3	6	5699	5704	0 %	50 %	0 %	50 %	148251632
120	NC_009485	CTT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251632
121	NC_009485	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251632
122	NC_009485	CCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
123	NC_009485	CCG	2	6	5801	5806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
124	NC_009485	CCG	2	6	5881	5886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
125	NC_009485	GC	3	6	5904	5909	0 %	0 %	50 %	50 %	148251633
126	NC_009485	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251633
127	NC_009485	GGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
128	NC_009485	CGGCTG	2	12	5978	5989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148251633
129	NC_009485	TGC	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
130	NC_009485	TCG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
131	NC_009485	CGT	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
132	NC_009485	CAG	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
133	NC_009485	CCGC	2	8	6208	6215	0 %	0 %	25 %	75 %	148251633
134	NC_009485	AGCGC	2	10	6222	6231	20 %	0 %	40 %	40 %	148251633
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262	NC_009485	CGA	2	6	10514	10519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
263	NC_009485	GC	3	6	10527	10532	0 %	0 %	50 %	50 %	148251634
264	NC_009485	AGG	2	6	10537	10542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251634
265	NC_009485	ACCG	2	8	10580	10587	25 %	0 %	25 %	50 %	148251634
266	NC_009485	GCCG	2	8	10629	10636	0 %	0 %	50 %	50 %	148251634
267	NC_009485	GCA	2	6	10685	10690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
268	NC_009485	GC	3	6	10719	10724	0 %	0 %	50 %	50 %	148251634
269	NC_009485	GCT	2	6	10727	10732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
270	NC_009485	AGG	2	6	10747	10752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251634
271	NC_009485	CGA	2	6	10754	10759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
272	NC_009485	CGA	2	6	10763	10768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
273	NC_009485	CGT	2	6	10793	10798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
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280	NC_009485	TGC	2	6	11103	11108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251635
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286	NC_009485	GAC	2	6	11395	11400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251635
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290	NC_009485	TG	3	6	11618	11623	0 %	50 %	50 %	0 %	148251635
291	NC_009485	CG	4	8	11681	11688	0 %	0 %	50 %	50 %	148251636
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298	NC_009485	GCT	2	6	11837	11842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251636
299	NC_009485	GCC	2	6	11871	11876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251636
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301	NC_009485	GCC	2	6	11930	11935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251636
302	NC_009485	TTCCG	2	10	11953	11962	0 %	40 %	20 %	40 %	148251636
303	NC_009485	GAC	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251636
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389	NC_009485	CCG	2	6	17084	17089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251641
390	NC_009485	CG	3	6	17105	17110	0 %	0 %	50 %	50 %	148251641
391	NC_009485	CGG	2	6	17184	17189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251641
392	NC_009485	CG	3	6	17252	17257	0 %	0 %	50 %	50 %	148251641
393	NC_009485	CAC	2	6	17301	17306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251641
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491	NC_009485	GCT	2	6	21314	21319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251644
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499	NC_009485	CCG	3	9	21654	21662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
500	NC_009485	GCA	2	6	21676	21681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644

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