MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009485	CTT	2	6	150737	150742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251761
3502	NC_009485	CGT	2	6	150766	150771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251761
3503	NC_009485	GAAG	2	8	150781	150788	50 %	0 %	50 %	0 %	148251761
3504	NC_009485	TGC	2	6	150873	150878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251762
3505	NC_009485	GAA	2	6	150891	150896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251762
3506	NC_009485	TGT	2	6	150911	150916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251762
3507	NC_009485	ATC	2	6	150976	150981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251762
3508	NC_009485	GGAGC	2	10	150989	150998	20 %	0 %	60 %	20 %	148251762
3509	NC_009485	CGGA	2	8	151028	151035	25 %	0 %	50 %	25 %	148251762
3510	NC_009485	CCAG	2	8	151085	151092	25 %	0 %	25 %	50 %	148251762
3511	NC_009485	GC	3	6	151187	151192	0 %	0 %	50 %	50 %	148251763
3512	NC_009485	CG	3	6	151193	151198	0 %	0 %	50 %	50 %	148251763
3513	NC_009485	CAGCGC	2	12	151202	151213	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251763
3514	NC_009485	GCC	2	6	151228	151233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251763
3515	NC_009485	GC	3	6	151243	151248	0 %	0 %	50 %	50 %	148251763
3516	NC_009485	GC	3	6	151278	151283	0 %	0 %	50 %	50 %	148251763
3517	NC_009485	TCGA	2	8	151308	151315	25 %	25 %	25 %	25 %	148251763
3518	NC_009485	GCC	2	6	151322	151327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251763
3519	NC_009485	CAG	2	6	151394	151399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251763
3520	NC_009485	GAT	2	6	151424	151429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251763
3521	NC_009485	CGC	2	6	151565	151570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251763
3522	NC_009485	GAT	2	6	151610	151615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251763
3523	NC_009485	TTG	2	6	151632	151637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251763
3524	NC_009485	GCC	3	9	151670	151678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251763
3525	NC_009485	GAC	2	6	151697	151702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251763
3526	NC_009485	CGA	2	6	151765	151770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251763
3527	NC_009485	GCG	2	6	151815	151820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251763
3528	NC_009485	TTC	2	6	151884	151889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251763
3529	NC_009485	ATC	2	6	151911	151916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251763
3530	NC_009485	CGA	2	6	152070	152075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251764
3531	NC_009485	GC	4	8	152102	152109	0 %	0 %	50 %	50 %	148251764
3532	NC_009485	CGT	2	6	152115	152120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251764
3533	NC_009485	TCG	2	6	152261	152266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251764
3534	NC_009485	TCT	2	6	152277	152282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251764
3535	NC_009485	GGT	2	6	152314	152319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251764
3536	NC_009485	GAA	2	6	152371	152376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251764
3537	NC_009485	CGG	2	6	152444	152449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251764
3538	NC_009485	GCA	2	6	152475	152480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251764
3539	NC_009485	CAC	2	6	152521	152526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251764
3540	NC_009485	TCC	2	6	152540	152545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251764
3541	NC_009485	TGC	2	6	152547	152552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251764
3542	NC_009485	GCGCG	2	10	152553	152562	0 %	0 %	60 %	40 %	148251764
3543	NC_009485	CGG	2	6	152577	152582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251764
3544	NC_009485	GAT	2	6	152608	152613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251764
3545	NC_009485	GCG	4	12	152675	152686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251765
3546	NC_009485	CGG	3	9	152709	152717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251765
3547	NC_009485	GC	3	6	152763	152768	0 %	0 %	50 %	50 %	148251765
3548	NC_009485	GAA	2	6	152781	152786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251765
3549	NC_009485	CGG	2	6	152795	152800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251765
3550	NC_009485	TCG	2	6	152809	152814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251765
3551	NC_009485	CGA	3	9	152816	152824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251765
3552	NC_009485	CG	3	6	152846	152851	0 %	0 %	50 %	50 %	148251765
3553	NC_009485	GATC	2	8	152909	152916	25 %	25 %	25 %	25 %	148251765
3554	NC_009485	GCG	2	6	152917	152922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251765
3555	NC_009485	CGATCA	2	12	152963	152974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148251765
3556	NC_009485	GCCA	2	8	152998	153005	25 %	0 %	25 %	50 %	148251765
3557	NC_009485	AGCC	2	8	153018	153025	25 %	0 %	25 %	50 %	148251765
3558	NC_009485	CGG	2	6	153107	153112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251765
3559	NC_009485	GCC	2	6	153172	153177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251766
3560	NC_009485	TGG	2	6	153189	153194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251766
3561	NC_009485	GATC	2	8	153219	153226	25 %	25 %	25 %	25 %	148251766
3562	NC_009485	ATG	2	6	153280	153285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251766
3563	NC_009485	CG	3	6	153393	153398	0 %	0 %	50 %	50 %	148251766
3564	NC_009485	CGGC	2	8	153424	153431	0 %	0 %	50 %	50 %	148251766
3565	NC_009485	ACG	2	6	153446	153451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251766
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3568	NC_009485	GAA	2	6	153655	153660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251766
3569	NC_009485	CAC	2	6	153682	153687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251766
3570	NC_009485	CCG	2	6	153979	153984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251767
3571	NC_009485	GGCAC	2	10	153988	153997	20 %	0 %	40 %	40 %	148251767
3572	NC_009485	GGT	2	6	154028	154033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251767
3573	NC_009485	CGG	2	6	154037	154042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251767
3574	NC_009485	TCA	2	6	154072	154077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251767
3575	NC_009485	CGG	2	6	154124	154129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251767
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3577	NC_009485	ACCG	2	8	154245	154252	25 %	0 %	25 %	50 %	148251767
3578	NC_009485	GAT	3	9	154274	154282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251767
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3584	NC_009485	CTCG	2	8	154442	154449	0 %	25 %	25 %	50 %	148251767
3585	NC_009485	GCC	2	6	154455	154460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251767
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3587	NC_009485	CGA	2	6	154551	154556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251768
3588	NC_009485	GCT	2	6	154589	154594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251768
3589	NC_009485	TGC	2	6	154597	154602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251768
3590	NC_009485	GTG	2	6	154674	154679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251768
3591	NC_009485	CAT	2	6	154730	154735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251768
3592	NC_009485	ATC	2	6	154803	154808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251768
3593	NC_009485	TCA	2	6	154855	154860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251768
3594	NC_009485	CGC	2	6	154874	154879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251768
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3599	NC_009485	TGC	2	6	154969	154974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251768
3600	NC_009485	CCGA	2	8	155073	155080	25 %	0 %	25 %	50 %	148251768
3601	NC_009485	CCG	2	6	155106	155111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251768
3602	NC_009485	TGT	2	6	155113	155118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251768
3603	NC_009485	GGC	2	6	155128	155133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251769
3604	NC_009485	TGG	2	6	155216	155221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251769
3605	NC_009485	CTG	2	6	155291	155296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251769
3606	NC_009485	GAT	2	6	155300	155305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251769
3607	NC_009485	CGGC	2	8	155310	155317	0 %	0 %	50 %	50 %	148251769
3608	NC_009485	CG	3	6	155436	155441	0 %	0 %	50 %	50 %	148251769
3609	NC_009485	TCG	2	6	155490	155495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251769
3610	NC_009485	AAGG	2	8	155540	155547	50 %	0 %	50 %	0 %	148251769
3611	NC_009485	CTAG	2	8	155644	155651	25 %	25 %	25 %	25 %	148251769
3612	NC_009485	TCG	2	6	155706	155711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251770
3613	NC_009485	GC	3	6	155728	155733	0 %	0 %	50 %	50 %	148251770
3614	NC_009485	TGC	2	6	155799	155804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251770
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3616	NC_009485	TGA	2	6	155817	155822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251770
3617	NC_009485	CG	3	6	155854	155859	0 %	0 %	50 %	50 %	148251770
3618	NC_009485	GC	3	6	155880	155885	0 %	0 %	50 %	50 %	148251770
3619	NC_009485	CCA	2	6	155904	155909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251770
3620	NC_009485	ATC	2	6	155951	155956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251770
3621	NC_009485	TCG	2	6	155964	155969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251770
3622	NC_009485	AGCGCA	2	12	155994	156005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251770
3623	NC_009485	CG	3	6	156016	156021	0 %	0 %	50 %	50 %	148251770
3624	NC_009485	GCG	2	6	156080	156085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251770
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3626	NC_009485	GC	3	6	156112	156117	0 %	0 %	50 %	50 %	148251770
3627	NC_009485	ATCGAG	2	12	156140	156151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148251770
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3651	NC_009485	CGC	2	6	157246	157251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251771
3652	NC_009485	GCC	2	6	157288	157293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251771
3653	NC_009485	CTG	2	6	157313	157318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251771
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3657	NC_009485	TCG	2	6	157365	157370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251771
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3733	NC_009485	CG	3	6	160734	160739	0 %	0 %	50 %	50 %	148251774
3734	NC_009485	CG	4	8	160749	160756	0 %	0 %	50 %	50 %	148251774
3735	NC_009485	CGA	2	6	160803	160808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251774
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3737	NC_009485	ATC	2	6	160838	160843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251774
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3742	NC_009485	GC	3	6	161016	161021	0 %	0 %	50 %	50 %	148251774
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3983	NC_009485	GTC	2	6	172756	172761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251785
3984	NC_009485	ACA	2	6	172796	172801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251785
3985	NC_009485	GAT	2	6	172803	172808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251785
3986	NC_009485	AGCGCG	2	12	172922	172933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148251785
3987	NC_009485	GC	3	6	172938	172943	0 %	0 %	50 %	50 %	148251785
3988	NC_009485	GGCG	2	8	173178	173185	0 %	0 %	75 %	25 %	148251786
3989	NC_009485	CGC	2	6	173186	173191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251786
3990	NC_009485	AGC	2	6	173306	173311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251786
3991	NC_009485	GTG	2	6	173332	173337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251786
3992	NC_009485	CAG	2	6	173353	173358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251786
3993	NC_009485	ATC	2	6	173371	173376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251786
3994	NC_009485	GGCG	2	8	173393	173400	0 %	0 %	75 %	25 %	148251786
3995	NC_009485	CAGCGA	2	12	173448	173459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251786
3996	NC_009485	ATC	2	6	173476	173481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251786
3997	NC_009485	GGA	2	6	173514	173519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251786
3998	NC_009485	ATG	2	6	173614	173619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251786
3999	NC_009485	GCCG	2	8	173634	173641	0 %	0 %	50 %	50 %	148251786
4000	NC_009485	CGGC	2	8	173675	173682	0 %	0 %	50 %	50 %	148251786

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