MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009485	AAC	2	6	130530	130535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251747
3002	NC_009485	TGCC	2	8	130560	130567	0 %	25 %	25 %	50 %	148251747
3003	NC_009485	GCA	2	6	130586	130591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
3004	NC_009485	CGA	2	6	130622	130627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
3005	NC_009485	CCG	2	6	130648	130653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
3006	NC_009485	TTA	2	6	130670	130675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148251747
3007	NC_009485	GCG	2	6	130681	130686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251747
3008	NC_009485	CG	3	6	130685	130690	0 %	0 %	50 %	50 %	148251747
3009	NC_009485	TCGC	2	8	130722	130729	0 %	25 %	25 %	50 %	148251747
3010	NC_009485	CAG	2	6	130758	130763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
3011	NC_009485	CGC	2	6	130862	130867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
3012	NC_009485	AAC	2	6	130872	130877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251747
3013	NC_009485	CCT	2	6	130882	130887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251747
3014	NC_009485	GCC	2	6	130911	130916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
3015	NC_009485	ACA	2	6	130924	130929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251747
3016	NC_009485	AAG	2	6	130971	130976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251747
3017	NC_009485	AGG	2	6	130996	131001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251747
3018	NC_009485	GGC	2	6	131021	131026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251747
3019	NC_009485	GCC	2	6	131097	131102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
3020	NC_009485	CAA	2	6	131126	131131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251747
3021	NC_009485	TCG	2	6	131140	131145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251747
3022	NC_009485	CGA	2	6	131180	131185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
3023	NC_009485	CG	3	6	131389	131394	0 %	0 %	50 %	50 %	148251748
3024	NC_009485	CAT	2	6	131417	131422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251748
3025	NC_009485	CG	3	6	131423	131428	0 %	0 %	50 %	50 %	148251748
3026	NC_009485	TCGTCA	2	12	131461	131472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148251748
3027	NC_009485	GCC	2	6	131577	131582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251748
3028	NC_009485	CCT	2	6	131621	131626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251748
3029	NC_009485	TGC	2	6	131632	131637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251748
3030	NC_009485	CG	3	6	131647	131652	0 %	0 %	50 %	50 %	148251748
3031	NC_009485	AGA	2	6	131653	131658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251748
3032	NC_009485	TCGG	2	8	131733	131740	0 %	25 %	50 %	25 %	148251748
3033	NC_009485	TCGA	2	8	131826	131833	25 %	25 %	25 %	25 %	148251748
3034	NC_009485	CAT	2	6	131837	131842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251748
3035	NC_009485	CTT	2	6	131902	131907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251749
3036	NC_009485	CAG	2	6	132005	132010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3037	NC_009485	ATG	2	6	132011	132016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251749
3038	NC_009485	TCT	2	6	132030	132035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251749
3039	NC_009485	TTC	2	6	132053	132058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251749
3040	NC_009485	GCG	2	6	132066	132071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3041	NC_009485	TGC	2	6	132078	132083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3042	NC_009485	GGC	2	6	132086	132091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3043	NC_009485	TCG	2	6	132126	132131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3044	NC_009485	CGG	2	6	132142	132147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3045	NC_009485	CGT	2	6	132163	132168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3046	NC_009485	CGG	2	6	132184	132189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3047	NC_009485	TGA	2	6	132234	132239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251749
3048	NC_009485	GAT	2	6	132244	132249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251749
3049	NC_009485	GAA	2	6	132250	132255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251749
3050	NC_009485	CAC	2	6	132289	132294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251749
3051	NC_009485	ATC	2	6	132341	132346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251749
3052	NC_009485	CGC	2	6	132355	132360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3053	NC_009485	CGG	2	6	132361	132366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3054	NC_009485	GC	3	6	132381	132386	0 %	0 %	50 %	50 %	148251749
3055	NC_009485	CGC	2	6	132391	132396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3056	NC_009485	CGC	2	6	132439	132444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3057	NC_009485	GCG	2	6	132521	132526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3058	NC_009485	TCG	2	6	132543	132548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3059	NC_009485	CAT	2	6	132550	132555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251749
3060	NC_009485	CTG	2	6	132626	132631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3061	NC_009485	TTC	2	6	132635	132640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251749
3062	NC_009485	GC	3	6	132673	132678	0 %	0 %	50 %	50 %	148251749
3063	NC_009485	CGC	3	9	132676	132684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3064	NC_009485	GAC	2	6	132697	132702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3065	NC_009485	GTG	2	6	132707	132712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251749
3066	NC_009485	CGA	2	6	132732	132737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3067	NC_009485	TGA	2	6	132789	132794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251749
3068	NC_009485	ATC	2	6	132818	132823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251749
3069	NC_009485	TCA	2	6	132831	132836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251749
3070	NC_009485	GGC	2	6	132874	132879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3071	NC_009485	ATGCTG	2	12	132953	132964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148251749
3072	NC_009485	CCG	2	6	132992	132997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3073	NC_009485	CAC	2	6	133003	133008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251749
3074	NC_009485	TCG	2	6	133014	133019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251749
3075	NC_009485	CGG	2	6	133030	133035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251749
3076	NC_009485	TCGG	2	8	133040	133047	0 %	25 %	50 %	25 %	148251749
3077	NC_009485	CGC	2	6	133078	133083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251749
3078	NC_009485	CCT	2	6	133144	133149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251749
3079	NC_009485	ACG	2	6	133975	133980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3080	NC_009485	GCC	3	9	133982	133990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3081	NC_009485	GAC	2	6	134006	134011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3082	NC_009485	GCCGAC	2	12	134084	134095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251750
3083	NC_009485	GAG	2	6	134097	134102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251750
3084	NC_009485	GAC	2	6	134105	134110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3085	NC_009485	GTC	2	6	134117	134122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3086	NC_009485	GGC	2	6	134144	134149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251750
3087	NC_009485	GGC	2	6	134168	134173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251750
3088	NC_009485	AGG	2	6	134176	134181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251750
3089	NC_009485	CGGCAT	2	12	134209	134220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3090	NC_009485	GCC	2	6	134303	134308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3091	NC_009485	CG	3	6	134350	134355	0 %	0 %	50 %	50 %	148251750
3092	NC_009485	CGC	2	6	134452	134457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3093	NC_009485	GATG	2	8	134464	134471	25 %	25 %	50 %	0 %	148251750
3094	NC_009485	GCC	2	6	134543	134548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3095	NC_009485	GTCG	2	8	134588	134595	0 %	25 %	50 %	25 %	148251750
3096	NC_009485	GCGCC	2	10	134653	134662	0 %	0 %	40 %	60 %	148251750
3097	NC_009485	TCGCCG	2	12	134697	134708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148251750
3098	NC_009485	AGC	2	6	134710	134715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3099	NC_009485	GGTCG	2	10	134747	134756	0 %	20 %	60 %	20 %	148251750
3100	NC_009485	CGC	2	6	134758	134763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3101	NC_009485	GTT	3	9	134822	134830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251750
3102	NC_009485	GCT	2	6	134977	134982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3103	NC_009485	CAG	2	6	135023	135028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3104	NC_009485	CGC	2	6	135055	135060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3105	NC_009485	GC	3	6	135145	135150	0 %	0 %	50 %	50 %	148251750
3106	NC_009485	GGT	2	6	135155	135160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251750
3107	NC_009485	GCC	2	6	135167	135172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3108	NC_009485	TCC	2	6	135201	135206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251750
3109	NC_009485	ACC	2	6	135213	135218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251750
3110	NC_009485	GAG	2	6	135237	135242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251750
3111	NC_009485	GGT	2	6	135251	135256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251750
3112	NC_009485	GAA	2	6	135272	135277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251750
3113	NC_009485	TTC	2	6	135285	135290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251750
3114	NC_009485	GC	3	6	135316	135321	0 %	0 %	50 %	50 %	148251750
3115	NC_009485	CGCGTG	2	12	135375	135386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148251750
3116	NC_009485	TCG	2	6	135429	135434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3117	NC_009485	CGC	2	6	135478	135483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251750
3118	NC_009485	CGG	2	6	135513	135518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251750
3119	NC_009485	GCT	2	6	135556	135561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251750
3120	NC_009485	GC	3	6	135574	135579	0 %	0 %	50 %	50 %	148251750
3121	NC_009485	TCG	2	6	135675	135680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251750
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3232	NC_009485	GACC	2	8	140359	140366	25 %	0 %	25 %	50 %	148251752
3233	NC_009485	CGT	2	6	140377	140382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251752
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3237	NC_009485	CAA	2	6	140488	140493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251752
3238	NC_009485	GAG	2	6	140498	140503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251752
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3240	NC_009485	TCA	2	6	140598	140603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251752
3241	NC_009485	TCG	2	6	140604	140609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251752
3242	NC_009485	TGA	2	6	140625	140630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251752
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3244	NC_009485	GTCG	2	8	140725	140732	0 %	25 %	50 %	25 %	148251752
3245	NC_009485	TCA	2	6	140736	140741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251752
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3361	NC_009485	GGA	2	6	145028	145033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251755
3362	NC_009485	GCG	2	6	145044	145049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251755
3363	NC_009485	GGAG	2	8	145253	145260	25 %	0 %	75 %	0 %	148251756
3364	NC_009485	CCCG	2	8	145326	145333	0 %	0 %	25 %	75 %	148251756
3365	NC_009485	CGA	2	6	145346	145351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251756
3366	NC_009485	GTC	3	9	145371	145379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251756
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3369	NC_009485	AC	3	6	145465	145470	50 %	0 %	0 %	50 %	148251756
3370	NC_009485	GACG	2	8	145499	145506	25 %	0 %	50 %	25 %	148251756
3371	NC_009485	CGTCG	2	10	145562	145571	0 %	20 %	40 %	40 %	148251756
3372	NC_009485	ACG	2	6	145591	145596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251756
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3382	NC_009485	ATC	2	6	146150	146155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251757
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3385	NC_009485	GC	3	6	146250	146255	0 %	0 %	50 %	50 %	148251757
3386	NC_009485	CG	3	6	146271	146276	0 %	0 %	50 %	50 %	148251757
3387	NC_009485	GCA	2	6	146368	146373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251757
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3394	NC_009485	GCT	2	6	146626	146631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251757
3395	NC_009485	ATT	2	6	146634	146639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148251757
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3482	NC_009485	CAG	2	6	149985	149990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3483	NC_009485	ACC	2	6	150013	150018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251760
3484	NC_009485	GCC	3	9	150090	150098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251760
3485	NC_009485	CGG	2	6	150158	150163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251760
3486	NC_009485	CCT	2	6	150164	150169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251760
3487	NC_009485	CGCGC	2	10	150179	150188	0 %	0 %	40 %	60 %	148251760
3488	NC_009485	CGG	2	6	150191	150196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251760
3489	NC_009485	GCA	2	6	150230	150235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3490	NC_009485	GTC	2	6	150246	150251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3491	NC_009485	CGC	3	9	150263	150271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251760
3492	NC_009485	CCG	2	6	150299	150304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251760
3493	NC_009485	GAC	2	6	150312	150317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3494	NC_009485	ATG	2	6	150325	150330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251760
3495	NC_009485	TCG	2	6	150373	150378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3496	NC_009485	CGG	2	6	150383	150388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251760
3497	NC_009485	GAC	2	6	150456	150461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251760
3498	NC_009485	CCGT	2	8	150462	150469	0 %	25 %	25 %	50 %	148251760
3499	NC_009485	AGA	2	6	150553	150558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251761
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