MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009485	GCGATC	2	12	107795	107806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148251723
2502	NC_009485	CGA	2	6	107814	107819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251723
2503	NC_009485	GCG	2	6	107839	107844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251723
2504	NC_009485	GCG	2	6	107851	107856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251723
2505	NC_009485	CGA	2	6	107859	107864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251723
2506	NC_009485	TCGCG	2	10	108122	108131	0 %	20 %	40 %	40 %	148251724
2507	NC_009485	CTTC	2	8	108203	108210	0 %	50 %	0 %	50 %	148251724
2508	NC_009485	CTT	2	6	108258	108263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251724
2509	NC_009485	CG	3	6	108335	108340	0 %	0 %	50 %	50 %	148251724
2510	NC_009485	TGA	2	6	108356	108361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251724
2511	NC_009485	CGA	2	6	108380	108385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2512	NC_009485	GCC	2	6	108399	108404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251724
2513	NC_009485	GAC	2	6	108432	108437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2514	NC_009485	CTT	2	6	108444	108449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251724
2515	NC_009485	GCT	2	6	108485	108490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2516	NC_009485	CGAG	2	8	108497	108504	25 %	0 %	50 %	25 %	148251724
2517	NC_009485	CAC	2	6	108534	108539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251724
2518	NC_009485	CTT	2	6	108558	108563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251724
2519	NC_009485	ACC	2	6	108691	108696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251724
2520	NC_009485	CGA	2	6	108716	108721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2521	NC_009485	CGAG	2	8	108758	108765	25 %	0 %	50 %	25 %	148251724
2522	NC_009485	GCG	2	6	108768	108773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251724
2523	NC_009485	CCT	2	6	108809	108814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251724
2524	NC_009485	TTC	2	6	108847	108852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251724
2525	NC_009485	GCTCGA	2	12	108899	108910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2526	NC_009485	CAG	2	6	109002	109007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2527	NC_009485	TGA	2	6	109052	109057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251724
2528	NC_009485	CTTGAC	2	12	109059	109070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148251724
2529	NC_009485	TCGG	2	8	109093	109100	0 %	25 %	50 %	25 %	148251724
2530	NC_009485	GCA	2	6	109136	109141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2531	NC_009485	GCC	2	6	109152	109157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251724
2532	NC_009485	CGA	2	6	109163	109168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2533	NC_009485	GAC	2	6	109194	109199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2534	NC_009485	GCT	2	6	109247	109252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2535	NC_009485	ACG	2	6	109288	109293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2536	NC_009485	TCA	2	6	109346	109351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251724
2537	NC_009485	GCG	2	6	109352	109357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251724
2538	NC_009485	CGGA	2	8	109371	109378	25 %	0 %	50 %	25 %	148251724
2539	NC_009485	GCC	2	6	109434	109439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251724
2540	NC_009485	GTT	2	6	109476	109481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251724
2541	NC_009485	CT	3	6	109510	109515	0 %	50 %	0 %	50 %	148251724
2542	NC_009485	CGG	2	6	109519	109524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251724
2543	NC_009485	CG	3	6	109532	109537	0 %	0 %	50 %	50 %	148251724
2544	NC_009485	TCG	2	6	109591	109596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2545	NC_009485	GAC	2	6	109719	109724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251724
2546	NC_009485	ATC	2	6	109779	109784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251724
2547	NC_009485	GGC	2	6	110088	110093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251725
2548	NC_009485	CGA	2	6	110109	110114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251725
2549	NC_009485	GGC	2	6	110122	110127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251725
2550	NC_009485	CGC	2	6	110133	110138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2551	NC_009485	CAAG	2	8	110163	110170	50 %	0 %	25 %	25 %	148251725
2552	NC_009485	TCG	2	6	110222	110227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251725
2553	NC_009485	GCC	2	6	110252	110257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2554	NC_009485	CCG	2	6	110262	110267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2555	NC_009485	CGC	2	6	110271	110276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2556	NC_009485	CCA	2	6	110325	110330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251725
2557	NC_009485	CGG	2	6	110398	110403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251725
2558	NC_009485	CCA	2	6	110430	110435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251725
2559	NC_009485	GGC	2	6	110473	110478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251725
2560	NC_009485	CGT	2	6	110487	110492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251725
2561	NC_009485	CCG	2	6	110547	110552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2562	NC_009485	CGG	2	6	110580	110585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251725
2563	NC_009485	GCC	2	6	110687	110692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251725
2564	NC_009485	GAT	2	6	110707	110712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251725
2565	NC_009485	TGG	2	6	110765	110770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251726
2566	NC_009485	GTC	2	6	110784	110789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251726
2567	NC_009485	GGT	2	6	110846	110851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251726
2568	NC_009485	CGC	2	6	110873	110878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251726
2569	NC_009485	CGA	2	6	110900	110905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251726
2570	NC_009485	GCA	2	6	110948	110953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251726
2571	NC_009485	ATG	2	6	111013	111018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251726
2572	NC_009485	GCG	2	6	111037	111042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251726
2573	NC_009485	TCG	2	6	111064	111069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251726
2574	NC_009485	ATC	2	6	111070	111075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251726
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2578	NC_009485	TCGA	2	8	111178	111185	25 %	25 %	25 %	25 %	148251726
2579	NC_009485	CGA	2	6	111269	111274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251726
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2581	NC_009485	GC	3	6	111332	111337	0 %	0 %	50 %	50 %	148251726
2582	NC_009485	GCG	2	6	111369	111374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251726
2583	NC_009485	GTG	2	6	111394	111399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251726
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2585	NC_009485	GGT	2	6	111468	111473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251726
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2587	NC_009485	GCCA	2	8	111492	111499	25 %	0 %	25 %	50 %	148251726
2588	NC_009485	GCA	2	6	111500	111505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251726
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2590	NC_009485	GGC	2	6	111662	111667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251726
2591	NC_009485	CGC	2	6	111771	111776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251726
2592	NC_009485	GCC	2	6	111789	111794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251726
2593	NC_009485	GACGCC	2	12	111795	111806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251726
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2595	NC_009485	GC	3	6	112040	112045	0 %	0 %	50 %	50 %	148251726
2596	NC_009485	CGG	2	6	112049	112054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251726
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2599	NC_009485	GCG	2	6	112342	112347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251727
2600	NC_009485	GCT	2	6	112350	112355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251727
2601	NC_009485	GCC	2	6	112368	112373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251727
2602	NC_009485	GCCGAG	2	12	112389	112400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148251727
2603	NC_009485	GAG	2	6	112416	112421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251727
2604	NC_009485	CGT	2	6	112457	112462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251727
2605	NC_009485	GAC	2	6	112476	112481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251727
2606	NC_009485	CGA	2	6	112490	112495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251727
2607	NC_009485	CGA	4	12	112502	112513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251727
2608	NC_009485	GAT	3	9	112515	112523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251727
2609	NC_009485	CGA	2	6	112538	112543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251727
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2615	NC_009485	CAT	2	6	113024	113029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251728
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2617	NC_009485	GCCG	2	8	113106	113113	0 %	0 %	50 %	50 %	148251728
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2619	NC_009485	GAA	2	6	113234	113239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251728
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2740	NC_009485	TGC	2	6	118360	118365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251734
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2744	NC_009485	TCA	2	6	118489	118494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251734
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2851	NC_009485	CGGCG	2	10	123678	123687	0 %	0 %	60 %	40 %	148251741
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2861	NC_009485	GAAGCC	2	12	124090	124101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251741
2862	NC_009485	TCG	2	6	124160	124165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251741
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2979	NC_009485	GA	3	6	129102	129107	50 %	0 %	50 %	0 %	148251746
2980	NC_009485	AGC	2	6	129117	129122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251746
2981	NC_009485	CGGT	2	8	129150	129157	0 %	25 %	50 %	25 %	148251746
2982	NC_009485	GC	3	6	129164	129169	0 %	0 %	50 %	50 %	148251746
2983	NC_009485	CG	3	6	129249	129254	0 %	0 %	50 %	50 %	148251746
2984	NC_009485	AGC	2	6	129288	129293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251746
2985	NC_009485	CAC	2	6	129335	129340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251746
2986	NC_009485	CAC	2	6	129371	129376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251746
2987	NC_009485	CGA	2	6	129431	129436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251746
2988	NC_009485	CAGG	2	8	129454	129461	25 %	0 %	50 %	25 %	148251746
2989	NC_009485	CGC	2	6	129463	129468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251746
2990	NC_009485	ATC	2	6	130275	130280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251747
2991	NC_009485	GCC	2	6	130284	130289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
2992	NC_009485	CG	4	8	130319	130326	0 %	0 %	50 %	50 %	148251747
2993	NC_009485	TCCGC	2	10	130330	130339	0 %	20 %	20 %	60 %	148251747
2994	NC_009485	CCG	2	6	130351	130356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251747
2995	NC_009485	AGC	2	6	130393	130398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
2996	NC_009485	GCG	2	6	130411	130416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251747
2997	NC_009485	AGC	2	6	130477	130482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251747
2998	NC_009485	GC	3	6	130492	130497	0 %	0 %	50 %	50 %	148251747
2999	NC_009485	ATG	2	6	130503	130508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251747
3000	NC_009485	CTC	2	6	130517	130522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251747

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