MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009485	AGC	2	6	44915	44920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251668
1002	NC_009485	CCG	2	6	44982	44987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251668
1003	NC_009485	CGA	2	6	45000	45005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251668
1004	NC_009485	CAT	2	6	45060	45065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251668
1005	NC_009485	CAT	2	6	45121	45126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251668
1006	NC_009485	TCG	2	6	45227	45232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251668
1007	NC_009485	ACC	2	6	45233	45238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251668
1008	NC_009485	CGA	2	6	45264	45269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251668
1009	NC_009485	ACGC	2	8	45364	45371	25 %	0 %	25 %	50 %	148251669
1010	NC_009485	CGT	2	6	45421	45426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251669
1011	NC_009485	CGA	2	6	45492	45497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251669
1012	NC_009485	C	6	6	45674	45679	0 %	0 %	0 %	100 %	148251669
1013	NC_009485	TCT	2	6	45683	45688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251669
1014	NC_009485	CCTGTT	2	12	45726	45737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148251669
1015	NC_009485	CGC	2	6	45738	45743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251669
1016	NC_009485	GTG	3	9	45775	45783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251669
1017	NC_009485	CGGC	2	8	45794	45801	0 %	0 %	50 %	50 %	148251669
1018	NC_009485	CGC	2	6	45816	45821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251669
1019	NC_009485	GGC	2	6	45847	45852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251669
1020	NC_009485	GAC	2	6	45877	45882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251669
1021	NC_009485	CGA	2	6	45912	45917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251669
1022	NC_009485	CGCT	2	8	45968	45975	0 %	25 %	25 %	50 %	148251669
1023	NC_009485	CGC	3	9	46053	46061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1024	NC_009485	TGG	2	6	46119	46124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251670
1025	NC_009485	TCG	2	6	46146	46151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251670
1026	NC_009485	CCG	2	6	46155	46160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1027	NC_009485	GGCG	2	8	46162	46169	0 %	0 %	75 %	25 %	148251670
1028	NC_009485	GGC	2	6	46242	46247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251670
1029	NC_009485	AGG	3	9	46260	46268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251670
1030	NC_009485	CG	3	6	46283	46288	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1031	NC_009485	TG	3	6	46310	46315	0 %	50 %	50 %	0 %	148251670
1032	NC_009485	CGT	2	6	46363	46368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251670
1033	NC_009485	GCCG	2	8	46415	46422	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1034	NC_009485	AGG	2	6	46536	46541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251670
1035	NC_009485	GTG	2	6	46568	46573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251670
1036	NC_009485	CG	3	6	46581	46586	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1037	NC_009485	GC	3	6	46610	46615	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1038	NC_009485	CGA	2	6	46621	46626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251670
1039	NC_009485	GCA	2	6	46713	46718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251670
1040	NC_009485	GCC	2	6	46731	46736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1041	NC_009485	CGC	2	6	46822	46827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1042	NC_009485	TGA	2	6	46902	46907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251670
1043	NC_009485	CG	3	6	46955	46960	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1044	NC_009485	TCG	2	6	46995	47000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251670
1045	NC_009485	CGC	2	6	47091	47096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1046	NC_009485	CGG	3	9	47109	47117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251670
1047	NC_009485	CAGC	2	8	47185	47192	25 %	0 %	25 %	50 %	148251670
1048	NC_009485	CAA	2	6	47203	47208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251670
1049	NC_009485	GTT	2	6	47236	47241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251670
1050	NC_009485	CG	3	6	47251	47256	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
1051	NC_009485	TGG	2	6	47271	47276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251670
1052	NC_009485	GACG	2	8	47277	47284	25 %	0 %	50 %	25 %	148251670
1053	NC_009485	ACA	2	6	47319	47324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251670
1054	NC_009485	GCC	2	6	47417	47422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251670
1055	NC_009485	C	6	6	47523	47528	0 %	0 %	0 %	100 %	148251671
1056	NC_009485	GTC	2	6	47538	47543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1057	NC_009485	CGA	2	6	47552	47557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1058	NC_009485	CCGCG	2	10	47561	47570	0 %	0 %	40 %	60 %	148251671
1059	NC_009485	CGT	2	6	47627	47632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1060	NC_009485	ATCAC	2	10	47650	47659	40 %	20 %	0 %	40 %	148251671
1061	NC_009485	CGG	2	6	47663	47668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251671
1062	NC_009485	GCG	2	6	47693	47698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251671
1063	NC_009485	CGT	2	6	47777	47782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1064	NC_009485	GTTCGA	2	12	47798	47809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148251671
1065	NC_009485	CCG	2	6	47875	47880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251671
1066	NC_009485	CG	3	6	47898	47903	0 %	0 %	50 %	50 %	148251671
1067	NC_009485	CGGCC	2	10	47933	47942	0 %	0 %	40 %	60 %	148251671
1068	NC_009485	CAT	2	6	48011	48016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251671
1069	NC_009485	CCG	2	6	48028	48033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251671
1070	NC_009485	CGGCT	2	10	48048	48057	0 %	20 %	40 %	40 %	148251671
1071	NC_009485	ACG	2	6	48109	48114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1072	NC_009485	GATG	2	8	48128	48135	25 %	25 %	50 %	0 %	148251671
1073	NC_009485	GC	4	8	48149	48156	0 %	0 %	50 %	50 %	148251671
1074	NC_009485	CGAGAT	2	12	48167	48178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148251671
1075	NC_009485	CGC	2	6	48181	48186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251671
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1077	NC_009485	ATC	2	6	48225	48230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251671
1078	NC_009485	CGA	2	6	48233	48238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1079	NC_009485	ATC	2	6	48306	48311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251671
1080	NC_009485	GC	3	6	48372	48377	0 %	0 %	50 %	50 %	148251671
1081	NC_009485	CTG	2	6	48378	48383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251671
1082	NC_009485	CAGGT	2	10	48405	48414	20 %	20 %	40 %	20 %	148251671
1083	NC_009485	TGG	2	6	48445	48450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251671
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1085	NC_009485	ACC	2	6	48578	48583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251672
1086	NC_009485	ATC	2	6	48590	48595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251672
1087	NC_009485	CTG	2	6	48604	48609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251672
1088	NC_009485	CG	3	6	48644	48649	0 %	0 %	50 %	50 %	148251672
1089	NC_009485	CGC	3	9	48655	48663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251672
1090	NC_009485	GACG	2	8	48712	48719	25 %	0 %	50 %	25 %	148251672
1091	NC_009485	CGA	2	6	48817	48822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251672
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1093	NC_009485	CGA	2	6	48883	48888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251672
1094	NC_009485	ACC	2	6	48906	48911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251672
1095	NC_009485	GAG	2	6	48983	48988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251672
1096	NC_009485	GCCG	2	8	49119	49126	0 %	0 %	50 %	50 %	148251673
1097	NC_009485	GCCG	2	8	49134	49141	0 %	0 %	50 %	50 %	148251673
1098	NC_009485	CGAG	2	8	49157	49164	25 %	0 %	50 %	25 %	148251673
1099	NC_009485	GCG	2	6	49208	49213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251673
1100	NC_009485	ACGC	2	8	49287	49294	25 %	0 %	25 %	50 %	148251673
1101	NC_009485	GCG	2	6	49323	49328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251673
1102	NC_009485	TCG	2	6	49361	49366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251673
1103	NC_009485	TGA	2	6	49397	49402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251673
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1106	NC_009485	CGA	2	6	49524	49529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1108	NC_009485	CCG	2	6	49559	49564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251673
1109	NC_009485	CAT	2	6	49614	49619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251673
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1111	NC_009485	GCC	2	6	49638	49643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251673
1112	NC_009485	GC	3	6	49650	49655	0 %	0 %	50 %	50 %	148251673
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1114	NC_009485	CATC	2	8	49689	49696	25 %	25 %	0 %	50 %	148251673
1115	NC_009485	TCG	2	6	49703	49708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1117	NC_009485	TCGA	2	8	49741	49748	25 %	25 %	25 %	25 %	148251673
1118	NC_009485	TCG	2	6	49754	49759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1120	NC_009485	CGA	2	6	49797	49802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1122	NC_009485	CGA	2	6	49863	49868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
1123	NC_009485	GAG	2	6	49888	49893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251673
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1125	NC_009485	CGCGC	2	10	50055	50064	0 %	0 %	40 %	60 %	148251673
1126	NC_009485	CCG	2	6	50086	50091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251673
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1497	NC_009485	GCC	3	9	66436	66444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251686
1498	NC_009485	GCT	2	6	66464	66469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251686
1499	NC_009485	CGA	2	6	66473	66478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251686
1500	NC_009485	GCTGC	2	10	66485	66494	0 %	20 %	40 %	40 %	148251686

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