MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 183817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009485	GAT	2	6	260311	260316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251868
6002	NC_009485	GAC	2	6	260332	260337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6003	NC_009485	ACA	2	6	260358	260363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251868
6004	NC_009485	CTG	2	6	260366	260371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6005	NC_009485	GCG	2	6	260429	260434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251868
6006	NC_009485	CGA	2	6	260461	260466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6007	NC_009485	TGG	2	6	260514	260519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251868
6008	NC_009485	TGG	2	6	260553	260558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251868
6009	NC_009485	GGC	2	6	260576	260581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251868
6010	NC_009485	CCTG	2	8	260599	260606	0 %	25 %	25 %	50 %	148251868
6011	NC_009485	TCG	2	6	260619	260624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6012	NC_009485	CGG	2	6	260632	260637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251868
6013	NC_009485	CGC	2	6	260668	260673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251868
6014	NC_009485	CCAT	2	8	260766	260773	25 %	25 %	0 %	50 %	148251868
6015	NC_009485	TCGA	2	8	260774	260781	25 %	25 %	25 %	25 %	148251868
6016	NC_009485	TCG	2	6	260802	260807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6017	NC_009485	GTC	2	6	260903	260908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251868
6018	NC_009485	CGCGG	2	10	260940	260949	0 %	0 %	60 %	40 %	148251868
6019	NC_009485	CCTG	2	8	260991	260998	0 %	25 %	25 %	50 %	148251868
6020	NC_009485	GAG	2	6	261026	261031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251868
6021	NC_009485	CCGA	2	8	261050	261057	25 %	0 %	25 %	50 %	148251868
6022	NC_009485	GATCC	2	10	261075	261084	20 %	20 %	20 %	40 %	148251868
6023	NC_009485	GGCA	2	8	261151	261158	25 %	0 %	50 %	25 %	148251869
6024	NC_009485	GCG	2	6	261209	261214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251869
6025	NC_009485	GCC	2	6	261215	261220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251869
6026	NC_009485	TGG	2	6	261224	261229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251869
6027	NC_009485	CG	3	6	261232	261237	0 %	0 %	50 %	50 %	148251869
6028	NC_009485	GGC	2	6	261242	261247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251869
6029	NC_009485	CGC	2	6	261286	261291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251869
6030	NC_009485	GC	3	6	261368	261373	0 %	0 %	50 %	50 %	148251869
6031	NC_009485	GC	3	6	261384	261389	0 %	0 %	50 %	50 %	148251869
6032	NC_009485	CGG	2	6	261394	261399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251869
6033	NC_009485	GC	3	6	261455	261460	0 %	0 %	50 %	50 %	148251869
6034	NC_009485	GCT	2	6	261504	261509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251869
6035	NC_009485	CGA	2	6	261523	261528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251869
6036	NC_009485	GCC	3	9	261635	261643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251869
6037	NC_009485	TCG	2	6	261648	261653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251869
6038	NC_009485	GCG	2	6	261671	261676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251869
6039	NC_009485	GTC	2	6	261761	261766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251869
6040	NC_009485	CTG	2	6	261788	261793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251869
6041	NC_009485	TCGC	2	8	261794	261801	0 %	25 %	25 %	50 %	148251869
6042	NC_009485	CGC	2	6	261837	261842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251869
6043	NC_009485	CGC	2	6	261865	261870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251869
6044	NC_009485	AGATCC	2	12	261949	261960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148251870
6045	NC_009485	GGC	2	6	262042	262047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251870
6046	NC_009485	TCA	2	6	262060	262065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251870
6047	NC_009485	CGC	2	6	262078	262083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251870
6048	NC_009485	AGC	2	6	262147	262152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6049	NC_009485	CCTG	2	8	262156	262163	0 %	25 %	25 %	50 %	148251870
6050	NC_009485	ACCTG	2	10	262192	262201	20 %	20 %	20 %	40 %	148251870
6051	NC_009485	GT	3	6	262206	262211	0 %	50 %	50 %	0 %	148251870
6052	NC_009485	CGC	2	6	262225	262230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251870
6053	NC_009485	CGC	2	6	262246	262251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251870
6054	NC_009485	CGG	2	6	262322	262327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251870
6055	NC_009485	TTC	2	6	262350	262355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251870
6056	NC_009485	GCC	2	6	262365	262370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251870
6057	NC_009485	GC	4	8	262373	262380	0 %	0 %	50 %	50 %	148251870
6058	NC_009485	CG	4	8	262424	262431	0 %	0 %	50 %	50 %	148251870
6059	NC_009485	TCG	2	6	262441	262446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6060	NC_009485	CG	3	6	262504	262509	0 %	0 %	50 %	50 %	148251870
6061	NC_009485	CAG	2	6	262554	262559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6062	NC_009485	GAC	2	6	262629	262634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6063	NC_009485	TGCG	2	8	262674	262681	0 %	25 %	50 %	25 %	148251870
6064	NC_009485	GCCG	2	8	262710	262717	0 %	0 %	50 %	50 %	148251870
6065	NC_009485	CAT	2	6	262748	262753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251870
6066	NC_009485	CCG	3	9	262766	262774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251870
6067	NC_009485	CGT	2	6	262775	262780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6068	NC_009485	TGC	2	6	262876	262881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6069	NC_009485	AGG	2	6	262903	262908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251870
6070	NC_009485	GCT	2	6	262910	262915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6071	NC_009485	TGC	2	6	262957	262962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6072	NC_009485	TCG	2	6	262972	262977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6073	NC_009485	GTC	2	6	262991	262996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6074	NC_009485	AGCG	2	8	263013	263020	25 %	0 %	50 %	25 %	148251870
6075	NC_009485	CTG	2	6	263036	263041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251870
6076	NC_009485	GCG	2	6	263176	263181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251870
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6079	NC_009485	CCG	3	9	263294	263302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251871
6080	NC_009485	AGC	2	6	263313	263318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251871
6081	NC_009485	CGG	2	6	263346	263351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251871
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6086	NC_009485	GGC	2	6	263514	263519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251871
6087	NC_009485	TGAT	2	8	263574	263581	25 %	50 %	25 %	0 %	148251872
6088	NC_009485	C	6	6	263594	263599	0 %	0 %	0 %	100 %	148251872
6089	NC_009485	CAG	2	6	263612	263617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251872
6090	NC_009485	GC	3	6	263618	263623	0 %	0 %	50 %	50 %	148251872
6091	NC_009485	CTG	2	6	263666	263671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251872
6092	NC_009485	TCG	2	6	263727	263732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251872
6093	NC_009485	CTG	2	6	263744	263749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251872
6094	NC_009485	TCG	2	6	263751	263756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251872
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6098	NC_009485	TGC	2	6	263877	263882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251873
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6102	NC_009485	CTG	2	6	263996	264001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251873
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6105	NC_009485	CGC	2	6	264035	264040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251873
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6114	NC_009485	CG	3	6	264428	264433	0 %	0 %	50 %	50 %	148251875
6115	NC_009485	CTT	2	6	264516	264521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251875
6116	NC_009485	CTT	2	6	264552	264557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251875
6117	NC_009485	TCG	2	6	264581	264586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251875
6118	NC_009485	CAC	2	6	264610	264615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251875
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6120	NC_009485	TGC	4	12	264695	264706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251875
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6233	NC_009485	TGAA	2	8	269191	269198	50 %	25 %	25 %	0 %	148251878
6234	NC_009485	GCCAGC	2	12	269236	269247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251878
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6236	NC_009485	GC	4	8	269299	269306	0 %	0 %	50 %	50 %	148251878
6237	NC_009485	GCCG	2	8	269340	269347	0 %	0 %	50 %	50 %	148251878
6238	NC_009485	GCG	2	6	269361	269366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251878
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6483	NC_009485	GCG	2	6	281127	281132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251892
6484	NC_009485	GGC	2	6	281201	281206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251892
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