MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009475	AGCAG	2	10	180637	180646	40 %	0 %	40 %	20 %	148241055
3002	NC_009475	CG	3	6	180726	180731	0 %	0 %	50 %	50 %	148241055
3003	NC_009475	ACG	2	6	180786	180791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241055
3004	NC_009475	CGA	2	6	180799	180804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241055
3005	NC_009475	CCA	2	6	180888	180893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241055
3006	NC_009475	CAG	3	9	180911	180919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241055
3007	NC_009475	AGC	2	6	180953	180958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241055
3008	NC_009475	GGT	2	6	180995	181000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241055
3009	NC_009475	ATA	2	6	181020	181025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241055
3010	NC_009475	GAC	2	6	181071	181076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3011	NC_009475	CGA	2	6	181079	181084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3012	NC_009475	AGC	2	6	181087	181092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3013	NC_009475	GAGC	2	8	181095	181102	25 %	0 %	50 %	25 %	148241056
3014	NC_009475	GTC	2	6	181107	181112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3015	NC_009475	CAA	2	6	181149	181154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241056
3016	NC_009475	GCT	2	6	181160	181165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3017	NC_009475	GATC	2	8	181203	181210	25 %	25 %	25 %	25 %	148241056
3018	NC_009475	AGA	2	6	181241	181246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241056
3019	NC_009475	CAGG	2	8	181299	181306	25 %	0 %	50 %	25 %	148241056
3020	NC_009475	GAG	2	6	181311	181316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241056
3021	NC_009475	CG	3	6	181319	181324	0 %	0 %	50 %	50 %	148241056
3022	NC_009475	AGC	2	6	181363	181368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3023	NC_009475	CGCA	2	8	181369	181376	25 %	0 %	25 %	50 %	148241056
3024	NC_009475	TGA	2	6	181381	181386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241056
3025	NC_009475	CGG	2	6	181400	181405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241056
3026	NC_009475	CGC	2	6	181443	181448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241056
3027	NC_009475	CGT	2	6	181467	181472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3028	NC_009475	GAT	2	6	181500	181505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241056
3029	NC_009475	CGA	2	6	181510	181515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3030	NC_009475	GGA	2	6	181532	181537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241056
3031	NC_009475	CTT	2	6	181556	181561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241056
3032	NC_009475	TCA	2	6	181618	181623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241056
3033	NC_009475	GC	3	6	181633	181638	0 %	0 %	50 %	50 %	148241056
3034	NC_009475	TGG	2	6	181713	181718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241056
3035	NC_009475	CTC	2	6	181737	181742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241056
3036	NC_009475	GTC	2	6	181753	181758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3037	NC_009475	CGG	2	6	181802	181807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241056
3038	NC_009475	GCC	2	6	181869	181874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241056
3039	NC_009475	GAC	2	6	181908	181913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241056
3040	NC_009475	GC	3	6	181965	181970	0 %	0 %	50 %	50 %	148241056
3041	NC_009475	CACT	2	8	182012	182019	25 %	25 %	0 %	50 %	148241056
3042	NC_009475	CAC	2	6	182024	182029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241057
3043	NC_009475	TGCG	2	8	182073	182080	0 %	25 %	50 %	25 %	148241057
3044	NC_009475	GAG	2	6	182109	182114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241057
3045	NC_009475	CG	4	8	182125	182132	0 %	0 %	50 %	50 %	148241057
3046	NC_009475	CGG	3	9	182209	182217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241057
3047	NC_009475	GTG	2	6	182232	182237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241057
3048	NC_009475	TTG	2	6	182238	182243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241057
3049	NC_009475	GCT	2	6	182266	182271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241057
3050	NC_009475	GAG	2	6	182283	182288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241057
3051	NC_009475	CAG	3	9	182306	182314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241057
3052	NC_009475	GCCGA	2	10	182316	182325	20 %	0 %	40 %	40 %	148241057
3053	NC_009475	AAG	2	6	182334	182339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241057
3054	NC_009475	GGCG	2	8	182387	182394	0 %	0 %	75 %	25 %	148241057
3055	NC_009475	GCCGC	2	10	182462	182471	0 %	0 %	40 %	60 %	148241057
3056	NC_009475	TG	3	6	182499	182504	0 %	50 %	50 %	0 %	148241057
3057	NC_009475	ACG	2	6	182520	182525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241057
3058	NC_009475	ACG	2	6	182556	182561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241057
3059	NC_009475	GCAC	2	8	182605	182612	25 %	0 %	25 %	50 %	148241057
3060	NC_009475	TGA	2	6	182632	182637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241057
3061	NC_009475	GGCG	2	8	182855	182862	0 %	0 %	75 %	25 %	148241057
3062	NC_009475	CGGC	2	8	182923	182930	0 %	0 %	50 %	50 %	148241057
3063	NC_009475	GCGG	2	8	182978	182985	0 %	0 %	75 %	25 %	148241057
3064	NC_009475	GAT	2	6	183023	183028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241057
3065	NC_009475	TCG	2	6	183079	183084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241057
3066	NC_009475	CCT	2	6	183099	183104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241057
3067	NC_009475	GAT	2	6	183194	183199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241058
3068	NC_009475	CGC	2	6	183209	183214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241058
3069	NC_009475	TCGA	2	8	183215	183222	25 %	25 %	25 %	25 %	148241058
3070	NC_009475	ACC	2	6	183335	183340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241058
3071	NC_009475	CGC	2	6	183348	183353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241058
3072	NC_009475	CGT	2	6	183453	183458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3073	NC_009475	ATG	2	6	183529	183534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241058
3074	NC_009475	GGTCT	2	10	183544	183553	0 %	40 %	40 %	20 %	148241058
3075	NC_009475	GCC	2	6	183587	183592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241058
3076	NC_009475	TCG	2	6	183614	183619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3077	NC_009475	GAC	2	6	183637	183642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3078	NC_009475	CGT	2	6	183661	183666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3079	NC_009475	GTG	2	6	183719	183724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241058
3080	NC_009475	CGG	2	6	183742	183747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241058
3081	NC_009475	ATCGC	2	10	183806	183815	20 %	20 %	20 %	40 %	148241058
3082	NC_009475	CCT	2	6	183834	183839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241058
3083	NC_009475	TCG	2	6	183842	183847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3084	NC_009475	ACA	2	6	183852	183857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241058
3085	NC_009475	CGT	2	6	183933	183938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241058
3086	NC_009475	CGG	2	6	184088	184093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241059
3087	NC_009475	CT	3	6	184171	184176	0 %	50 %	0 %	50 %	148241059
3088	NC_009475	AGC	2	6	184333	184338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241059
3089	NC_009475	CG	5	10	184385	184394	0 %	0 %	50 %	50 %	148241059
3090	NC_009475	TCA	2	6	184429	184434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241059
3091	NC_009475	GC	3	6	184437	184442	0 %	0 %	50 %	50 %	148241059
3092	NC_009475	GCG	2	6	184526	184531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241059
3093	NC_009475	GCGA	2	8	184607	184614	25 %	0 %	50 %	25 %	148241059
3094	NC_009475	GCC	2	6	184618	184623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241059
3095	NC_009475	AGC	2	6	184624	184629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241059
3096	NC_009475	GACC	2	8	184682	184689	25 %	0 %	25 %	50 %	148241059
3097	NC_009475	CCT	2	6	184698	184703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241060
3098	NC_009475	GGC	2	6	184732	184737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241060
3099	NC_009475	TGG	2	6	184739	184744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241060
3100	NC_009475	GCC	2	6	184890	184895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241060
3101	NC_009475	GCC	2	6	184942	184947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241060
3102	NC_009475	AAT	2	6	184969	184974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241060
3103	NC_009475	CGC	2	6	185045	185050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241061
3104	NC_009475	GCG	2	6	185072	185077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241061
3105	NC_009475	GCC	2	6	185084	185089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241061
3106	NC_009475	GGCT	2	8	185095	185102	0 %	25 %	50 %	25 %	148241061
3107	NC_009475	GCC	2	6	185163	185168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241061
3108	NC_009475	GCGA	2	8	185208	185215	25 %	0 %	50 %	25 %	148241061
3109	NC_009475	CCT	2	6	185235	185240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241061
3110	NC_009475	GAT	2	6	185243	185248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241061
3111	NC_009475	CCA	3	9	185308	185316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241061
3112	NC_009475	GCCG	2	8	185321	185328	0 %	0 %	50 %	50 %	148241061
3113	NC_009475	GTC	2	6	185370	185375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241061
3114	NC_009475	ACC	2	6	185397	185402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241061
3115	NC_009475	CAG	2	6	185408	185413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241061
3116	NC_009475	AAG	2	6	185556	185561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241061
3117	NC_009475	GCTT	2	8	185628	185635	0 %	50 %	25 %	25 %	148241061
3118	NC_009475	GAA	2	6	185753	185758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241061
3119	NC_009475	AGC	2	6	185802	185807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241061
3120	NC_009475	ACG	2	6	185808	185813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241061
3121	NC_009475	CGCC	2	8	185828	185835	0 %	0 %	25 %	75 %	148241061
3122	NC_009475	ATG	2	6	185847	185852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241061
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3232	NC_009475	GCAT	2	8	191617	191624	25 %	25 %	25 %	25 %	148241069
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3239	NC_009475	CAG	2	6	192050	192055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241069
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3366	NC_009475	TCG	2	6	198112	198117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3367	NC_009475	CGA	2	6	198119	198124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3368	NC_009475	CG	4	8	198161	198168	0 %	0 %	50 %	50 %	148241073
3369	NC_009475	GCGACC	2	12	198171	198182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241073
3370	NC_009475	ATC	3	9	198192	198200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241073
3371	NC_009475	TCG	2	6	198220	198225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3372	NC_009475	CGT	3	9	198232	198240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3373	NC_009475	AGC	2	6	198244	198249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241073
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3376	NC_009475	GAT	2	6	198306	198311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241073
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3378	NC_009475	CTG	2	6	198393	198398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3379	NC_009475	ATC	2	6	198426	198431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241073
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3381	NC_009475	GAA	2	6	198557	198562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241073
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3384	NC_009475	GGA	2	6	198833	198838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241073
3385	NC_009475	GAG	2	6	198960	198965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241073
3386	NC_009475	CG	3	6	198972	198977	0 %	0 %	50 %	50 %	148241073
3387	NC_009475	CGA	2	6	198989	198994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3388	NC_009475	CTG	2	6	198999	199004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241073
3389	NC_009475	TCA	2	6	199009	199014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241073
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3394	NC_009475	GAT	2	6	199190	199195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241073
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3432	NC_009475	CGA	2	6	202084	202089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241074
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3437	NC_009475	ATC	2	6	202645	202650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241075
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3441	NC_009475	GAT	2	6	202868	202873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241075
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3444	NC_009475	GAA	2	6	203013	203018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241075
3445	NC_009475	CGA	2	6	203021	203026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241075
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3453	NC_009475	CGA	2	6	203348	203353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241075
3454	NC_009475	GCATC	2	10	203354	203363	20 %	20 %	20 %	40 %	148241075
3455	NC_009475	TCG	2	6	203365	203370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241075
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3469	NC_009475	GC	3	6	204081	204086	0 %	0 %	50 %	50 %	148241075
3470	NC_009475	GC	4	8	204113	204120	0 %	0 %	50 %	50 %	148241075
3471	NC_009475	CGC	2	6	204138	204143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241075
3472	NC_009475	CGA	2	6	204182	204187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241075
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3475	NC_009475	CGC	2	6	204305	204310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241076
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3480	NC_009475	CGA	2	6	204547	204552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241076
3481	NC_009475	GGC	2	6	204596	204601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241076
3482	NC_009475	CTG	2	6	204732	204737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241076
3483	NC_009475	CGC	2	6	204805	204810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241076
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3485	NC_009475	CGC	2	6	204819	204824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241076
3486	NC_009475	CGG	2	6	204877	204882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241076
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3490	NC_009475	ACG	2	6	205114	205119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241076
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