MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009475	TTG	2	6	115776	115781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240990
2002	NC_009475	AGCA	2	8	115877	115884	50 %	0 %	25 %	25 %	148240990
2003	NC_009475	TCG	2	6	115914	115919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240990
2004	NC_009475	CG	3	6	116036	116041	0 %	0 %	50 %	50 %	148240990
2005	NC_009475	CGC	2	6	116083	116088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240990
2006	NC_009475	CGCC	2	8	116170	116177	0 %	0 %	25 %	75 %	148240990
2007	NC_009475	TTC	2	6	116178	116183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240990
2008	NC_009475	GC	3	6	116186	116191	0 %	0 %	50 %	50 %	148240990
2009	NC_009475	GGC	2	6	116246	116251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240990
2010	NC_009475	CGAT	2	8	116260	116267	25 %	25 %	25 %	25 %	148240990
2011	NC_009475	TGG	2	6	116319	116324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240990
2012	NC_009475	CCGA	2	8	116331	116338	25 %	0 %	25 %	50 %	148240990
2013	NC_009475	CTTGC	2	10	116342	116351	0 %	40 %	20 %	40 %	148240990
2014	NC_009475	GTC	2	6	116366	116371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240990
2015	NC_009475	GAT	2	6	116372	116377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240990
2016	NC_009475	CTC	2	6	116397	116402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240990
2017	NC_009475	GCA	2	6	116413	116418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240990
2018	NC_009475	CAA	2	6	116470	116475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240990
2019	NC_009475	GCA	2	6	116479	116484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240990
2020	NC_009475	GC	3	6	116522	116527	0 %	0 %	50 %	50 %	148240990
2021	NC_009475	GCA	2	6	116560	116565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240990
2022	NC_009475	GCG	2	6	117103	117108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240991
2023	NC_009475	GCGA	2	8	117194	117201	25 %	0 %	50 %	25 %	148240991
2024	NC_009475	CTT	2	6	117381	117386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240991
2025	NC_009475	TGA	2	6	117474	117479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240991
2026	NC_009475	TCC	2	6	117487	117492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240991
2027	NC_009475	ACC	2	6	117560	117565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240991
2028	NC_009475	AAC	2	6	117569	117574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240991
2029	NC_009475	TCG	2	6	117707	117712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2030	NC_009475	CGT	2	6	117826	117831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2031	NC_009475	GTA	2	6	117844	117849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240991
2032	NC_009475	CG	3	6	117938	117943	0 %	0 %	50 %	50 %	148240991
2033	NC_009475	TCG	2	6	117987	117992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2034	NC_009475	GCC	2	6	118068	118073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240991
2035	NC_009475	CCG	3	9	118104	118112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240991
2036	NC_009475	GCCG	2	8	118248	118255	0 %	0 %	50 %	50 %	148240991
2037	NC_009475	AG	3	6	118303	118308	50 %	0 %	50 %	0 %	148240991
2038	NC_009475	CG	3	6	118319	118324	0 %	0 %	50 %	50 %	148240991
2039	NC_009475	CGT	2	6	118359	118364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2040	NC_009475	TCC	2	6	118411	118416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240991
2041	NC_009475	GCC	2	6	118478	118483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240991
2042	NC_009475	CGA	2	6	118486	118491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2043	NC_009475	CCCG	2	8	118500	118507	0 %	0 %	25 %	75 %	148240991
2044	NC_009475	GAC	2	6	118522	118527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240991
2045	NC_009475	GCC	2	6	119060	119065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240992
2046	NC_009475	TGA	2	6	119119	119124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240992
2047	NC_009475	GC	3	6	119134	119139	0 %	0 %	50 %	50 %	148240992
2048	NC_009475	ATG	2	6	119166	119171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240992
2049	NC_009475	GAC	2	6	119172	119177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240992
2050	NC_009475	CGC	2	6	119204	119209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240992
2051	NC_009475	CCG	2	6	119257	119262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240992
2052	NC_009475	TGG	2	6	119282	119287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240992
2053	NC_009475	GCT	2	6	119299	119304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240992
2054	NC_009475	CGGCT	2	10	119336	119345	0 %	20 %	40 %	40 %	148240992
2055	NC_009475	AACC	2	8	119369	119376	50 %	0 %	0 %	50 %	148240992
2056	NC_009475	AGC	2	6	119578	119583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240992
2057	NC_009475	GCA	2	6	119673	119678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240992
2058	NC_009475	GTG	2	6	119706	119711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240992
2059	NC_009475	GCG	2	6	120274	120279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240993
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2061	NC_009475	GCG	2	6	120320	120325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240993
2062	NC_009475	CGA	2	6	120403	120408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240993
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2066	NC_009475	CGG	2	6	121390	121395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240994
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2070	NC_009475	ACT	2	6	121592	121597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240994
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2092	NC_009475	CGCGA	2	10	122795	122804	20 %	0 %	40 %	40 %	148240996
2093	NC_009475	ACA	2	6	122847	122852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240996
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2099	NC_009475	CAT	2	6	123838	123843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240998
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2102	NC_009475	ACG	2	6	123939	123944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240998
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2119	NC_009475	GGCA	2	8	125040	125047	25 %	0 %	50 %	25 %	148240999
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2242	NC_009475	GAC	2	6	131852	131857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241006
2243	NC_009475	TGC	2	6	131940	131945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241006
2244	NC_009475	ATC	2	6	132008	132013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241006
2245	NC_009475	GAT	2	6	132022	132027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241006
2246	NC_009475	CGAT	2	8	132180	132187	25 %	25 %	25 %	25 %	148241006
2247	NC_009475	AGCA	2	8	132242	132249	50 %	0 %	25 %	25 %	148241006
2248	NC_009475	CCT	2	6	132286	132291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241006
2249	NC_009475	CGA	2	6	132316	132321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241006
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2251	NC_009475	TCG	2	6	132396	132401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241006
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2253	NC_009475	TTC	2	6	132490	132495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241007
2254	NC_009475	CTG	2	6	132497	132502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241007
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2259	NC_009475	CATG	2	8	132854	132861	25 %	25 %	25 %	25 %	148241007
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2263	NC_009475	CG	3	6	133014	133019	0 %	0 %	50 %	50 %	148241008
2264	NC_009475	GC	3	6	133039	133044	0 %	0 %	50 %	50 %	148241008
2265	NC_009475	TCGA	2	8	133055	133062	25 %	25 %	25 %	25 %	148241008
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2272	NC_009475	AGCCG	2	10	133267	133276	20 %	0 %	40 %	40 %	148241009
2273	NC_009475	CG	3	6	133307	133312	0 %	0 %	50 %	50 %	148241009
2274	NC_009475	TGC	2	6	133314	133319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241009
2275	NC_009475	GTC	2	6	133393	133398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241009
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2281	NC_009475	GGCATC	2	12	133645	133656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241009
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2351	NC_009475	CG	3	6	136466	136471	0 %	0 %	50 %	50 %	148241011
2352	NC_009475	GCC	2	6	136495	136500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241011
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2355	NC_009475	TTGT	2	8	136636	136643	0 %	75 %	25 %	0 %	148241011
2356	NC_009475	TTGC	2	8	136658	136665	0 %	50 %	25 %	25 %	148241011
2357	NC_009475	AGG	2	6	136674	136679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241011
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2359	NC_009475	TAA	2	6	136715	136720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241011
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2361	NC_009475	ATC	2	6	136752	136757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241011
2362	NC_009475	ATGG	2	8	136762	136769	25 %	25 %	50 %	0 %	148241011
2363	NC_009475	GCT	2	6	136782	136787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241011
2364	NC_009475	CGA	2	6	136912	136917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241012
2365	NC_009475	CGT	2	6	136918	136923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241012
2366	NC_009475	GCC	2	6	136927	136932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241012
2367	NC_009475	CAT	2	6	136972	136977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241012
2368	NC_009475	GCATGG	2	12	137022	137033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241012
2369	NC_009475	ACG	2	6	137034	137039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241012
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2371	NC_009475	GCT	3	9	137061	137069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241012
2372	NC_009475	AGC	2	6	137107	137112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241012
2373	NC_009475	GGAAT	2	10	137160	137169	40 %	20 %	40 %	0 %	148241012
2374	NC_009475	GCC	2	6	137229	137234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241012
2375	NC_009475	GAC	2	6	138033	138038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241013
2376	NC_009475	GAC	2	6	138045	138050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241013
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2378	NC_009475	CGCAGG	2	12	138086	138097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148241013
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2382	NC_009475	GGC	2	6	138217	138222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241013
2383	NC_009475	CGG	2	6	138259	138264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241013
2384	NC_009475	TCGT	2	8	138273	138280	0 %	50 %	25 %	25 %	148241013
2385	NC_009475	GCC	2	6	138339	138344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241013
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2391	NC_009475	TCG	2	6	138612	138617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241014
2392	NC_009475	GCC	2	6	138713	138718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241014
2393	NC_009475	CTG	2	6	138914	138919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241015
2394	NC_009475	TCGG	2	8	138972	138979	0 %	25 %	50 %	25 %	148241015
2395	NC_009475	GGA	2	6	139021	139026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241015
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2419	NC_009475	CGA	2	6	140218	140223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241015
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2452	NC_009475	CAAG	2	8	142752	142759	50 %	0 %	25 %	25 %	148241018
2453	NC_009475	TGT	2	6	142767	142772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241018
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2471	NC_009475	CGG	2	6	143500	143505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241019
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2480	NC_009475	GCT	2	6	144274	144279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
2481	NC_009475	T	6	6	144283	144288	0 %	100 %	0 %	0 %	148241019
2482	NC_009475	TGA	2	6	144297	144302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
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