MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009475	GGC	2	6	52573	52578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240930
1002	NC_009475	TCA	2	6	52619	52624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240930
1003	NC_009475	ATG	2	6	52636	52641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240930
1004	NC_009475	TGA	2	6	52670	52675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240930
1005	NC_009475	TCT	2	6	52715	52720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240930
1006	NC_009475	GAA	2	6	52788	52793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240930
1007	NC_009475	GC	3	6	52871	52876	0 %	0 %	50 %	50 %	148240930
1008	NC_009475	CGA	2	6	52896	52901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1009	NC_009475	GAGC	2	8	52907	52914	25 %	0 %	50 %	25 %	148240930
1010	NC_009475	CGA	2	6	52955	52960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1011	NC_009475	CGC	2	6	52961	52966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240930
1012	NC_009475	CGC	2	6	52971	52976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240930
1013	NC_009475	TTG	2	6	52999	53004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240930
1014	NC_009475	GCC	2	6	53079	53084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240930
1015	NC_009475	CGG	2	6	53111	53116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240930
1016	NC_009475	CGC	2	6	53144	53149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240930
1017	NC_009475	ACG	2	6	53162	53167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1018	NC_009475	CG	4	8	53178	53185	0 %	0 %	50 %	50 %	148240930
1019	NC_009475	ACA	2	6	53297	53302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240930
1020	NC_009475	ACG	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1021	NC_009475	GATG	2	8	53421	53428	25 %	25 %	50 %	0 %	148240930
1022	NC_009475	GGCC	2	8	53429	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	148240930
1023	NC_009475	GCA	2	6	53541	53546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1024	NC_009475	CGATA	2	10	53736	53745	40 %	20 %	20 %	20 %	148240930
1025	NC_009475	GAAC	2	8	53786	53793	50 %	0 %	25 %	25 %	148240930
1026	NC_009475	CGG	2	6	53823	53828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240930
1027	NC_009475	GTC	2	6	53839	53844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1028	NC_009475	GC	3	6	53873	53878	0 %	0 %	50 %	50 %	148240930
1029	NC_009475	ACG	2	6	53921	53926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240930
1030	NC_009475	TGGT	2	8	53956	53963	0 %	50 %	50 %	0 %	148240930
1031	NC_009475	CAA	3	9	53991	53999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240930
1032	NC_009475	G	6	6	54012	54017	0 %	0 %	100 %	0 %	148240930
1033	NC_009475	ATC	2	6	54301	54306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240931
1034	NC_009475	GC	3	6	54311	54316	0 %	0 %	50 %	50 %	148240931
1035	NC_009475	GCT	2	6	54369	54374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240931
1036	NC_009475	CAC	2	6	54403	54408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240931
1037	NC_009475	GGC	2	6	54409	54414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240931
1038	NC_009475	CAT	2	6	54421	54426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240931
1039	NC_009475	GACG	2	8	54444	54451	25 %	0 %	50 %	25 %	148240931
1040	NC_009475	GGT	2	6	54518	54523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240932
1041	NC_009475	CTT	2	6	54545	54550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240932
1042	NC_009475	CG	3	6	54565	54570	0 %	0 %	50 %	50 %	148240932
1043	NC_009475	TGG	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240932
1044	NC_009475	GCTG	2	8	54661	54668	0 %	25 %	50 %	25 %	148240932
1045	NC_009475	GAT	2	6	54725	54730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240932
1046	NC_009475	CTTCAT	2	12	54779	54790	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148240932
1047	NC_009475	CCG	2	6	54814	54819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240932
1048	NC_009475	GCA	2	6	54842	54847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240932
1049	NC_009475	CTG	2	6	54933	54938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240932
1050	NC_009475	CGA	2	6	54946	54951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240932
1051	NC_009475	GC	3	6	55002	55007	0 %	0 %	50 %	50 %	148240932
1052	NC_009475	GAG	2	6	55011	55016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240932
1053	NC_009475	TCC	2	6	55183	55188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240933
1054	NC_009475	GCT	2	6	55257	55262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240933
1055	NC_009475	TCG	2	6	55370	55375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240933
1056	NC_009475	GGC	2	6	55401	55406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240933
1057	NC_009475	ACC	2	6	55421	55426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240933
1058	NC_009475	CGCT	2	8	55430	55437	0 %	25 %	25 %	50 %	148240933
1059	NC_009475	TGC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240933
1060	NC_009475	GGC	2	6	55578	55583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240933
1061	NC_009475	AGGTGA	2	12	55645	55656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148240934
1062	NC_009475	ACG	2	6	55666	55671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1063	NC_009475	AGG	2	6	55693	55698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240934
1064	NC_009475	GTG	2	6	55701	55706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240934
1065	NC_009475	CTG	2	6	55707	55712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1066	NC_009475	GTCC	2	8	55714	55721	0 %	25 %	25 %	50 %	148240934
1067	NC_009475	GAC	2	6	55733	55738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1068	NC_009475	CAT	2	6	55748	55753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240934
1069	NC_009475	GTT	2	6	55784	55789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240934
1070	NC_009475	CGACCT	2	12	55796	55807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148240934
1071	NC_009475	CCG	2	6	55841	55846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240934
1072	NC_009475	ACCG	2	8	55936	55943	25 %	0 %	25 %	50 %	148240934
1073	NC_009475	TGG	2	6	55969	55974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240934
1074	NC_009475	GGA	2	6	55979	55984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240934
1075	NC_009475	CAC	2	6	55992	55997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240934
1076	NC_009475	CGG	2	6	56015	56020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240934
1077	NC_009475	AGC	3	9	56023	56031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1078	NC_009475	CG	3	6	56046	56051	0 %	0 %	50 %	50 %	148240934
1079	NC_009475	CGG	2	6	56065	56070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240934
1080	NC_009475	TGC	2	6	56071	56076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1081	NC_009475	CGA	2	6	56081	56086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1082	NC_009475	GCT	2	6	56135	56140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240934
1083	NC_009475	CAC	2	6	56162	56167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240934
1084	NC_009475	TCA	3	9	56173	56181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240934
1085	NC_009475	TTC	2	6	56223	56228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240934
1086	NC_009475	AGA	2	6	56254	56259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240934
1087	NC_009475	CGG	2	6	56268	56273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240934
1088	NC_009475	GTG	2	6	56291	56296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240934
1089	NC_009475	GGC	2	6	56339	56344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240935
1090	NC_009475	GTC	2	6	56374	56379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1091	NC_009475	ATCG	2	8	56420	56427	25 %	25 %	25 %	25 %	148240935
1092	NC_009475	GGA	2	6	56430	56435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240935
1093	NC_009475	TAC	2	6	56449	56454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240935
1094	NC_009475	GC	3	6	56493	56498	0 %	0 %	50 %	50 %	148240935
1095	NC_009475	CGC	2	6	56541	56546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
1096	NC_009475	GC	3	6	56609	56614	0 %	0 %	50 %	50 %	148240935
1097	NC_009475	GCG	2	6	56636	56641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240935
1098	NC_009475	GAA	2	6	56701	56706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240935
1099	NC_009475	AAG	2	6	56782	56787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240935
1100	NC_009475	TCG	2	6	56801	56806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1101	NC_009475	CGGGC	2	10	56841	56850	0 %	0 %	60 %	40 %	148240935
1102	NC_009475	CCG	2	6	56868	56873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
1103	NC_009475	CGG	2	6	56939	56944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240935
1104	NC_009475	CG	3	6	56988	56993	0 %	0 %	50 %	50 %	148240935
1105	NC_009475	CGG	2	6	57018	57023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240935
1106	NC_009475	GGC	2	6	57027	57032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240935
1107	NC_009475	CAA	2	6	57090	57095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240935
1108	NC_009475	GCC	2	6	57111	57116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
1109	NC_009475	CTG	2	6	57124	57129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1110	NC_009475	GCC	2	6	57133	57138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
1111	NC_009475	CCT	2	6	57195	57200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240935
1112	NC_009475	GCA	2	6	57224	57229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1113	NC_009475	TGC	2	6	57233	57238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1114	NC_009475	ACT	2	6	57239	57244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240935
1115	NC_009475	TCG	2	6	57251	57256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1116	NC_009475	TCG	2	6	57263	57268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1117	NC_009475	TCG	2	6	57293	57298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240935
1118	NC_009475	CTT	2	6	57339	57344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240935
1119	NC_009475	GC	3	6	57398	57403	0 %	0 %	50 %	50 %	148240935
1120	NC_009475	GCC	3	9	57412	57420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
1121	NC_009475	GC	3	6	57428	57433	0 %	0 %	50 %	50 %	148240935
1122	NC_009475	GTG	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240935
1123	NC_009475	GCC	2	6	57462	57467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
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1125	NC_009475	CCG	2	6	57493	57498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240935
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1247	NC_009475	TCCG	2	8	65985	65992	0 %	25 %	25 %	50 %	148240943
1248	NC_009475	CAT	3	9	66015	66023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240943
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1499	NC_009475	CGG	2	6	79128	79133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240953
1500	NC_009475	AAC	2	6	79135	79140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240953

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