MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009475	GCC	2	6	29420	29425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240905
502	NC_009475	TAA	2	6	29437	29442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148240905
503	NC_009475	GCA	2	6	29490	29495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240905
504	NC_009475	GCT	2	6	30450	30455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240906
505	NC_009475	GCC	2	6	30469	30474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240906
506	NC_009475	GGC	2	6	30518	30523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240906
507	NC_009475	TGCGC	2	10	30598	30607	0 %	20 %	40 %	40 %	148240906
508	NC_009475	TCG	2	6	30642	30647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240906
509	NC_009475	TGC	2	6	30673	30678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240906
510	NC_009475	GCA	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240906
511	NC_009475	TTC	2	6	30713	30718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240906
512	NC_009475	GC	3	6	30757	30762	0 %	0 %	50 %	50 %	148240906
513	NC_009475	AG	3	6	30771	30776	50 %	0 %	50 %	0 %	148240906
514	NC_009475	GCA	2	6	30843	30848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240907
515	NC_009475	GCC	2	6	30895	30900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240907
516	NC_009475	AACG	2	8	30913	30920	50 %	0 %	25 %	25 %	148240907
517	NC_009475	GTGCA	2	10	30935	30944	20 %	20 %	40 %	20 %	148240907
518	NC_009475	ACGA	2	8	30981	30988	50 %	0 %	25 %	25 %	148240907
519	NC_009475	GCC	2	6	31186	31191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240908
520	NC_009475	CGC	3	9	31199	31207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240908
521	NC_009475	GCA	2	6	31215	31220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240908
522	NC_009475	GAT	2	6	31240	31245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240908
523	NC_009475	TGG	2	6	31266	31271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240908
524	NC_009475	CGG	2	6	31382	31387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240908
525	NC_009475	CTG	2	6	31418	31423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240908
526	NC_009475	GGC	2	6	31857	31862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240909
527	NC_009475	GGC	2	6	31956	31961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240909
528	NC_009475	CGGC	2	8	31987	31994	0 %	0 %	50 %	50 %	148240909
529	NC_009475	ATC	2	6	32022	32027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240909
530	NC_009475	GAT	2	6	32036	32041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240909
531	NC_009475	TCC	2	6	32178	32183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240909
532	NC_009475	GAC	2	6	32228	32233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240909
533	NC_009475	TCG	2	6	32325	32330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240909
534	NC_009475	CCA	2	6	32362	32367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240909
535	NC_009475	AAC	2	6	32375	32380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240909
536	NC_009475	GGC	2	6	32522	32527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240909
537	NC_009475	GGC	2	6	32608	32613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240909
538	NC_009475	GCC	2	6	32706	32711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240909
539	NC_009475	CCA	2	6	32721	32726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240909
540	NC_009475	CCGC	2	8	32883	32890	0 %	0 %	25 %	75 %	148240910
541	NC_009475	GCA	2	6	32897	32902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240910
542	NC_009475	GC	3	6	32933	32938	0 %	0 %	50 %	50 %	148240910
543	NC_009475	CGA	2	6	33028	33033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240910
544	NC_009475	GGC	2	6	33071	33076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240910
545	NC_009475	TCG	2	6	33085	33090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240910
546	NC_009475	GGC	2	6	33104	33109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240910
547	NC_009475	CGA	2	6	33121	33126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240910
548	NC_009475	CGA	2	6	33275	33280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240910
549	NC_009475	TCG	2	6	33349	33354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240910
550	NC_009475	AAG	2	6	33363	33368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240910
551	NC_009475	GTTG	2	8	33377	33384	0 %	50 %	50 %	0 %	148240910
552	NC_009475	CCT	2	6	33410	33415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240910
553	NC_009475	CGG	2	6	33473	33478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240910
554	NC_009475	GCTC	2	8	33499	33506	0 %	25 %	25 %	50 %	148240910
555	NC_009475	CGG	2	6	33531	33536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240910
556	NC_009475	TGA	2	6	33607	33612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240910
557	NC_009475	TCGC	2	8	33688	33695	0 %	25 %	25 %	50 %	148240910
558	NC_009475	TCT	2	6	33769	33774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240910
559	NC_009475	GAGC	2	8	33847	33854	25 %	0 %	50 %	25 %	148240910
560	NC_009475	G	7	7	33856	33862	0 %	0 %	100 %	0 %	148240910
561	NC_009475	TCC	2	6	34000	34005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240910
562	NC_009475	GCG	2	6	34024	34029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240910
563	NC_009475	CTC	2	6	34118	34123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240911
564	NC_009475	GGCGC	2	10	34124	34133	0 %	0 %	60 %	40 %	148240911
565	NC_009475	CCG	3	9	34137	34145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240911
566	NC_009475	CGT	2	6	34174	34179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240911
567	NC_009475	AGC	2	6	34191	34196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
568	NC_009475	GCG	2	6	34212	34217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240911
569	NC_009475	TC	3	6	34237	34242	0 %	50 %	0 %	50 %	148240911
570	NC_009475	CGA	2	6	34249	34254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
571	NC_009475	TTA	2	6	34261	34266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148240911
572	NC_009475	CGG	2	6	34302	34307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240911
573	NC_009475	GACAAG	2	12	34319	34330	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148240911
574	NC_009475	GGT	2	6	34435	34440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240911
575	NC_009475	AGC	2	6	34515	34520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
576	NC_009475	CTGC	2	8	34537	34544	0 %	25 %	25 %	50 %	148240911
577	NC_009475	GCG	2	6	34548	34553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240911
578	NC_009475	TCGA	2	8	34571	34578	25 %	25 %	25 %	25 %	148240911
579	NC_009475	GAA	2	6	34589	34594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240911
580	NC_009475	GAA	2	6	34609	34614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240911
581	NC_009475	TCGAC	2	10	34623	34632	20 %	20 %	20 %	40 %	148240911
582	NC_009475	GC	3	6	34640	34645	0 %	0 %	50 %	50 %	148240911
583	NC_009475	CTT	2	6	34651	34656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240911
584	NC_009475	CGG	2	6	34657	34662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240911
585	NC_009475	GCC	3	9	34694	34702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240911
586	NC_009475	GAC	2	6	34733	34738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
587	NC_009475	CAT	2	6	34744	34749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240911
588	NC_009475	GCCGA	2	10	34766	34775	20 %	0 %	40 %	40 %	148240911
589	NC_009475	GTCGCG	2	12	34781	34792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240911
590	NC_009475	CG	4	8	34789	34796	0 %	0 %	50 %	50 %	148240911
591	NC_009475	CTC	2	6	34841	34846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240911
592	NC_009475	CGA	2	6	34882	34887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
593	NC_009475	GATC	2	8	34902	34909	25 %	25 %	25 %	25 %	148240911
594	NC_009475	CGA	2	6	34963	34968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
595	NC_009475	CGT	2	6	34984	34989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240911
596	NC_009475	ACA	2	6	35022	35027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240911
597	NC_009475	AGC	2	6	35039	35044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240911
598	NC_009475	GATC	2	8	35053	35060	25 %	25 %	25 %	25 %	148240911
599	NC_009475	CT	3	6	35073	35078	0 %	50 %	0 %	50 %	148240911
600	NC_009475	GGC	2	6	35087	35092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240911
601	NC_009475	CTACCC	2	12	35098	35109	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	148240911
602	NC_009475	GATC	2	8	35207	35214	25 %	25 %	25 %	25 %	148240912
603	NC_009475	TGG	2	6	35231	35236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240912
604	NC_009475	CAC	2	6	35268	35273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240912
605	NC_009475	CG	3	6	35294	35299	0 %	0 %	50 %	50 %	148240912
606	NC_009475	TCG	3	9	35399	35407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240912
607	NC_009475	TCT	2	6	35447	35452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240912
608	NC_009475	TCG	3	9	35468	35476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240912
609	NC_009475	AGC	2	6	35491	35496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240912
610	NC_009475	CGC	2	6	35505	35510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240912
611	NC_009475	CG	3	6	35538	35543	0 %	0 %	50 %	50 %	148240912
612	NC_009475	CGC	2	6	35549	35554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240912
613	NC_009475	CTG	2	6	35563	35568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240912
614	NC_009475	TGG	2	6	35587	35592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240912
615	NC_009475	TCC	2	6	35597	35602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240912
616	NC_009475	TCCG	2	8	35621	35628	0 %	25 %	25 %	50 %	148240912
617	NC_009475	CAG	2	6	35693	35698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240912
618	NC_009475	ATC	2	6	35710	35715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240912
619	NC_009475	CTC	2	6	35738	35743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240912
620	NC_009475	GCCC	2	8	35772	35779	0 %	0 %	25 %	75 %	148240912
621	NC_009475	GGGC	2	8	35877	35884	0 %	0 %	75 %	25 %	148240912
622	NC_009475	GGC	2	6	35965	35970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240912
623	NC_009475	GTCG	2	8	35976	35983	0 %	25 %	50 %	25 %	148240912
624	NC_009475	GCCG	2	8	36001	36008	0 %	0 %	50 %	50 %	148240912
625	NC_009475	TCGG	2	8	36010	36017	0 %	25 %	50 %	25 %	148240912
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627	NC_009475	CCA	2	6	36079	36084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240912
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750	NC_009475	GCG	2	6	41009	41014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240916
751	NC_009475	GTC	2	6	41056	41061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240916
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