MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 15786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009445	CGCC	2	8	1201	1208	0 %	0 %	25 %	75 %	146337176
2	NC_009445	CCGC	2	8	2060	2067	0 %	0 %	25 %	75 %	146337176
3	NC_009445	GCCG	2	8	2962	2969	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
4	NC_009445	CGCA	2	8	3082	3089	25 %	0 %	25 %	50 %	146337177
5	NC_009445	ATCT	2	8	3133	3140	25 %	50 %	0 %	25 %	146337177
6	NC_009445	AGCG	2	8	3499	3506	25 %	0 %	50 %	25 %	146337177
7	NC_009445	TGGA	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	146337178
8	NC_009445	CCCG	2	8	5443	5450	0 %	0 %	25 %	75 %	146337179
9	NC_009445	GAAT	2	8	5484	5491	50 %	25 %	25 %	0 %	146337179
10	NC_009445	CGGC	2	8	6758	6765	0 %	0 %	50 %	50 %	146337179
11	NC_009445	GCGT	2	8	6842	6849	0 %	25 %	50 %	25 %	146337179
12	NC_009445	CGAG	2	8	6866	6873	25 %	0 %	50 %	25 %	146337179
13	NC_009445	TCGG	2	8	8217	8224	0 %	25 %	50 %	25 %	146337180
14	NC_009445	GCGG	2	8	8242	8249	0 %	0 %	75 %	25 %	146337180
15	NC_009445	CGAC	2	8	8461	8468	25 %	0 %	25 %	50 %	146337180
16	NC_009445	CGAA	2	8	9598	9605	50 %	0 %	25 %	25 %	146337181
17	NC_009445	ACGC	2	8	9696	9703	25 %	0 %	25 %	50 %	146337181
18	NC_009445	ATCT	2	8	9881	9888	25 %	50 %	0 %	25 %	146337181
19	NC_009445	CGCT	2	8	10203	10210	0 %	25 %	25 %	50 %	146337182
20	NC_009445	CAGC	2	8	10364	10371	25 %	0 %	25 %	50 %	146337182
21	NC_009445	CCGG	2	8	10724	10731	0 %	0 %	50 %	50 %	146337182
22	NC_009445	GCTG	2	8	11107	11114	0 %	25 %	50 %	25 %	146337183
23	NC_009445	CACC	2	8	11534	11541	25 %	0 %	0 %	75 %	146337183
24	NC_009445	GATC	2	8	14347	14354	25 %	25 %	25 %	25 %	146337185
25	NC_009445	CGAG	2	8	14374	14381	25 %	0 %	50 %	25 %	146337185
26	NC_009445	GGCC	2	8	14824	14831	0 %	0 %	50 %	50 %	146337185
27	NC_009445	CCCG	2	8	15568	15575	0 %	0 %	25 %	75 %	146337186
28	NC_009445	GCTC	2	8	16089	16096	0 %	25 %	25 %	50 %	146337186
29	NC_009445	GGTC	2	8	17613	17620	0 %	25 %	50 %	25 %	146337187
30	NC_009445	GCAG	2	8	18220	18227	25 %	0 %	50 %	25 %	146337187
31	NC_009445	TCGG	2	8	18467	18474	0 %	25 %	50 %	25 %	146337188
32	NC_009445	CCGG	2	8	19160	19167	0 %	0 %	50 %	50 %	146337188
33	NC_009445	GCCG	2	8	19404	19411	0 %	0 %	50 %	50 %	146337188
34	NC_009445	ATCG	2	8	19667	19674	25 %	25 %	25 %	25 %	146337189
35	NC_009445	GGAA	2	8	20983	20990	50 %	0 %	50 %	0 %	146337190
36	NC_009445	GCCG	2	8	21405	21412	0 %	0 %	50 %	50 %	146337190
37	NC_009445	ACTC	2	8	22330	22337	25 %	25 %	0 %	50 %	146337191
38	NC_009445	GCCG	2	8	22353	22360	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
39	NC_009445	CGGC	2	8	22658	22665	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
40	NC_009445	CGCC	2	8	23735	23742	0 %	0 %	25 %	75 %	146337192
41	NC_009445	GTGC	2	8	23773	23780	0 %	25 %	50 %	25 %	146337192
42	NC_009445	AAGC	2	8	24057	24064	50 %	0 %	25 %	25 %	146337192
43	NC_009445	GGCG	2	8	24349	24356	0 %	0 %	75 %	25 %	146337193
44	NC_009445	AGAT	2	8	25873	25880	50 %	25 %	25 %	0 %	146337195
45	NC_009445	CGGG	2	8	26423	26430	0 %	0 %	75 %	25 %	146337196
46	NC_009445	ATCG	2	8	26637	26644	25 %	25 %	25 %	25 %	146337196
47	NC_009445	CGGC	2	8	26687	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
48	NC_009445	GCCA	2	8	26996	27003	25 %	0 %	25 %	50 %	146337196
49	NC_009445	GGCC	2	8	27646	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
50	NC_009445	CTGG	2	8	27952	27959	0 %	25 %	50 %	25 %	146337197
51	NC_009445	CGGC	2	8	28029	28036	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
52	NC_009445	CAGC	2	8	29670	29677	25 %	0 %	25 %	50 %	146337199
53	NC_009445	CGCC	2	8	30660	30667	0 %	0 %	25 %	75 %	146337200
54	NC_009445	CCGG	2	8	30987	30994	0 %	0 %	50 %	50 %	146337200
55	NC_009445	TCGA	2	8	31323	31330	25 %	25 %	25 %	25 %	146337200
56	NC_009445	ACGC	2	8	31603	31610	25 %	0 %	25 %	50 %	146337200
57	NC_009445	GCCG	2	8	31846	31853	0 %	0 %	50 %	50 %	146337200
58	NC_009445	AGCG	2	8	32337	32344	25 %	0 %	50 %	25 %	146337201
59	NC_009445	CGGC	2	8	32572	32579	0 %	0 %	50 %	50 %	146337201
60	NC_009445	GCCG	2	8	34604	34611	0 %	0 %	50 %	50 %	146337203
61	NC_009445	GACC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	25 %	50 %	146337203
62	NC_009445	CGAA	2	8	34769	34776	50 %	0 %	25 %	25 %	146337203
63	NC_009445	CGGG	2	8	34854	34861	0 %	0 %	75 %	25 %	146337203
64	NC_009445	ACGC	2	8	35284	35291	25 %	0 %	25 %	50 %	146337204
65	NC_009445	ATGC	2	8	35901	35908	25 %	25 %	25 %	25 %	146337204
66	NC_009445	GGCC	2	8	36260	36267	0 %	0 %	50 %	50 %	146337204
67	NC_009445	CGGC	2	8	36406	36413	0 %	0 %	50 %	50 %	146337204
68	NC_009445	GCCG	2	8	37446	37453	0 %	0 %	50 %	50 %	146337205
69	NC_009445	GTCA	2	8	37737	37744	25 %	25 %	25 %	25 %	146337205
70	NC_009445	GCCG	2	8	38059	38066	0 %	0 %	50 %	50 %	146337206
71	NC_009445	TCGC	2	8	38104	38111	0 %	25 %	25 %	50 %	146337206
72	NC_009445	GATG	2	8	38475	38482	25 %	25 %	50 %	0 %	146337206
73	NC_009445	TCCG	2	8	38583	38590	0 %	25 %	25 %	50 %	146337206
74	NC_009445	CGCT	2	8	39155	39162	0 %	25 %	25 %	50 %	146337206
75	NC_009445	GGCT	2	8	39758	39765	0 %	25 %	50 %	25 %	161353771
76	NC_009445	TCGG	2	8	39818	39825	0 %	25 %	50 %	25 %	161353771
77	NC_009445	CGAG	2	8	40179	40186	25 %	0 %	50 %	25 %	161353771
78	NC_009445	GCCG	2	8	41385	41392	0 %	0 %	50 %	50 %	146337209
79	NC_009445	CGTC	2	8	41700	41707	0 %	25 %	25 %	50 %	146337209
80	NC_009445	GCCG	2	8	42538	42545	0 %	0 %	50 %	50 %	146337210
81	NC_009445	TCGC	2	8	42743	42750	0 %	25 %	25 %	50 %	146337210
82	NC_009445	TGCC	2	8	42944	42951	0 %	25 %	25 %	50 %	146337210
83	NC_009445	CGAG	2	8	43222	43229	25 %	0 %	50 %	25 %	146337210
84	NC_009445	GCAG	2	8	44753	44760	25 %	0 %	50 %	25 %	146337211
85	NC_009445	ATCG	2	8	44830	44837	25 %	25 %	25 %	25 %	146337212
86	NC_009445	GCGA	2	8	45435	45442	25 %	0 %	50 %	25 %	146337213
87	NC_009445	CTGC	2	8	46256	46263	0 %	25 %	25 %	50 %	146337214
88	NC_009445	GGCT	2	8	46436	46443	0 %	25 %	50 %	25 %	146337214
89	NC_009445	CGGC	2	8	47218	47225	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
90	NC_009445	GATC	2	8	47536	47543	25 %	25 %	25 %	25 %	146337215
91	NC_009445	CAGC	2	8	47674	47681	25 %	0 %	25 %	50 %	146337215
92	NC_009445	CAGC	2	8	47783	47790	25 %	0 %	25 %	50 %	146337215
93	NC_009445	GATG	2	8	48620	48627	25 %	25 %	50 %	0 %	146337216
94	NC_009445	CCAT	2	8	49572	49579	25 %	25 %	0 %	50 %	146337218
95	NC_009445	GCCG	2	8	49606	49613	0 %	0 %	50 %	50 %	146337218
96	NC_009445	CGAG	2	8	49644	49651	25 %	0 %	50 %	25 %	146337218
97	NC_009445	CTGC	2	8	50042	50049	0 %	25 %	25 %	50 %	146337218
98	NC_009445	TCGA	2	8	50228	50235	25 %	25 %	25 %	25 %	146337218
99	NC_009445	CGGC	2	8	50443	50450	0 %	0 %	50 %	50 %	146337218
100	NC_009445	GCTC	2	8	51120	51127	0 %	25 %	25 %	50 %	146337219
101	NC_009445	GCTG	2	8	51165	51172	0 %	25 %	50 %	25 %	146337219
102	NC_009445	CCGG	2	8	51691	51698	0 %	0 %	50 %	50 %	146337219
103	NC_009445	GATC	2	8	51783	51790	25 %	25 %	25 %	25 %	146337219
104	NC_009445	GATC	2	8	52170	52177	25 %	25 %	25 %	25 %	146337219
105	NC_009445	CCGA	2	8	53411	53418	25 %	0 %	25 %	50 %	146337221
106	NC_009445	TCGA	2	8	53627	53634	25 %	25 %	25 %	25 %	146337221
107	NC_009445	TCGA	2	8	54413	54420	25 %	25 %	25 %	25 %	146337221
108	NC_009445	GATC	2	8	54885	54892	25 %	25 %	25 %	25 %	146337222
109	NC_009445	TCAT	2	8	54893	54900	25 %	50 %	0 %	25 %	146337222
110	NC_009445	CGAG	2	8	55688	55695	25 %	0 %	50 %	25 %	146337223
111	NC_009445	GCCG	2	8	55900	55907	0 %	0 %	50 %	50 %	146337223
112	NC_009445	GCCG	2	8	56033	56040	0 %	0 %	50 %	50 %	146337223
113	NC_009445	CGGA	2	8	56160	56167	25 %	0 %	50 %	25 %	146337223
114	NC_009445	GCTC	2	8	57312	57319	0 %	25 %	25 %	50 %	146337224
115	NC_009445	CCGA	2	8	57406	57413	25 %	0 %	25 %	50 %	146337224
116	NC_009445	GATC	2	8	57459	57466	25 %	25 %	25 %	25 %	146337224
117	NC_009445	TCGA	2	8	57552	57559	25 %	25 %	25 %	25 %	146337225
118	NC_009445	CGCC	2	8	57740	57747	0 %	0 %	25 %	75 %	146337225
119	NC_009445	GCCG	2	8	58367	58374	0 %	0 %	50 %	50 %	146337225
120	NC_009445	AGCA	2	8	60103	60110	50 %	0 %	25 %	25 %	146337227
121	NC_009445	GGCC	2	8	60604	60611	0 %	0 %	50 %	50 %	146337227
122	NC_009445	GCCC	2	8	60688	60695	0 %	0 %	25 %	75 %	146337227
123	NC_009445	CGGC	2	8	60710	60717	0 %	0 %	50 %	50 %	146337227
124	NC_009445	CGCC	2	8	61590	61597	0 %	0 %	25 %	75 %	146337227
125	NC_009445	GCTC	2	8	62099	62106	0 %	25 %	25 %	50 %	146337227
126	NC_009445	GGCC	2	8	62652	62659	0 %	0 %	50 %	50 %	146337227
127	NC_009445	CCGG	2	8	63768	63775	0 %	0 %	50 %	50 %	146337229
128	NC_009445	CCGG	2	8	63812	63819	0 %	0 %	50 %	50 %	146337229
129	NC_009445	GGTC	2	8	64080	64087	0 %	25 %	50 %	25 %	146337229
130	NC_009445	GACT	2	8	64394	64401	25 %	25 %	25 %	25 %	146337229
131	NC_009445	CCGA	2	8	65309	65316	25 %	0 %	25 %	50 %	146337231
132	NC_009445	CCGC	2	8	65356	65363	0 %	0 %	25 %	75 %	146337231
133	NC_009445	TCGG	2	8	66218	66225	0 %	25 %	50 %	25 %	146337231
134	NC_009445	GATG	2	8	66412	66419	25 %	25 %	50 %	0 %	146337231
135	NC_009445	AAGG	2	8	67061	67068	50 %	0 %	50 %	0 %	146337231
136	NC_009445	TGGA	2	8	67485	67492	25 %	25 %	50 %	0 %	146337232
137	NC_009445	CGAG	2	8	67522	67529	25 %	0 %	50 %	25 %	146337232
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