MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009445	GGA	2	6	174598	174603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337331
4002	NC_009445	TCG	2	6	174612	174617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337331
4003	NC_009445	ACGC	2	8	174640	174647	25 %	0 %	25 %	50 %	146337331
4004	NC_009445	GAA	2	6	174903	174908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337332
4005	NC_009445	GAA	2	6	174924	174929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337332
4006	NC_009445	CGG	2	6	174932	174937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4007	NC_009445	GAC	2	6	174958	174963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4008	NC_009445	CTG	2	6	174990	174995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4009	NC_009445	CTT	2	6	174996	175001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337332
4010	NC_009445	GCG	2	6	175013	175018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4011	NC_009445	GCA	2	6	175064	175069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4012	NC_009445	GGC	2	6	175083	175088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4013	NC_009445	GCG	2	6	175098	175103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4014	NC_009445	CGG	2	6	175118	175123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4015	NC_009445	TCG	2	6	175154	175159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4016	NC_009445	CGC	2	6	175172	175177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337332
4017	NC_009445	CGG	2	6	175284	175289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4018	NC_009445	CCG	2	6	175291	175296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337332
4019	NC_009445	GGCC	2	8	175301	175308	0 %	0 %	50 %	50 %	146337332
4020	NC_009445	CG	3	6	175382	175387	0 %	0 %	50 %	50 %	146337332
4021	NC_009445	GCCGGA	2	12	175395	175406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146337332
4022	NC_009445	ATC	2	6	175429	175434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337332
4023	NC_009445	GAA	2	6	175476	175481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337332
4024	NC_009445	CGGC	2	8	175501	175508	0 %	0 %	50 %	50 %	146337332
4025	NC_009445	GCC	2	6	175509	175514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337332
4026	NC_009445	CCT	2	6	175625	175630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337332
4027	NC_009445	TGT	2	6	175646	175651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337332
4028	NC_009445	GCC	2	6	175683	175688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337332
4029	NC_009445	GCG	2	6	175689	175694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4030	NC_009445	GAC	2	6	175738	175743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4031	NC_009445	CCG	2	6	175774	175779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337332
4032	NC_009445	GGC	2	6	175818	175823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337332
4033	NC_009445	GC	3	6	175822	175827	0 %	0 %	50 %	50 %	146337332
4034	NC_009445	GCA	2	6	175841	175846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4035	NC_009445	TCG	2	6	175960	175965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337332
4036	NC_009445	GTA	2	6	175992	175997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337332
4037	NC_009445	TGG	2	6	176006	176011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337332
4038	NC_009445	ATCA	2	8	176014	176021	50 %	25 %	0 %	25 %	146337332
4039	NC_009445	TCT	2	6	176169	176174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337333
4040	NC_009445	GTC	3	9	176176	176184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337333
4041	NC_009445	GGC	2	6	176221	176226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337333
4042	NC_009445	CTG	2	6	176251	176256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337333
4043	NC_009445	TTGGTC	2	12	176303	176314	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146337333
4044	NC_009445	TCG	2	6	176330	176335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337333
4045	NC_009445	CTT	2	6	176485	176490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337333
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4047	NC_009445	CTG	2	6	176575	176580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337333
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4049	NC_009445	CGG	2	6	176677	176682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337333
4050	NC_009445	TTG	2	6	176714	176719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337333
4051	NC_009445	GCC	2	6	176723	176728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337333
4052	NC_009445	CGG	2	6	176781	176786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337333
4053	NC_009445	CTT	2	6	176803	176808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337333
4054	NC_009445	GTG	2	6	176819	176824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337333
4055	NC_009445	GAT	2	6	176833	176838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337333
4056	NC_009445	CGC	2	6	176850	176855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337333
4057	NC_009445	AGC	3	9	176894	176902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337333
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4059	NC_009445	CGC	2	6	176941	176946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337333
4060	NC_009445	CCA	2	6	176955	176960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337333
4061	NC_009445	TCG	2	6	176963	176968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337333
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4065	NC_009445	CGG	2	6	177075	177080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337333
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4069	NC_009445	CGGAC	2	10	177190	177199	20 %	0 %	40 %	40 %	146337333
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4090	NC_009445	CACG	2	8	178006	178013	25 %	0 %	25 %	50 %	146337333
4091	NC_009445	GTG	2	6	178019	178024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337333
4092	NC_009445	GATC	2	8	178029	178036	25 %	25 %	25 %	25 %	146337333
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4102	NC_009445	CGA	2	6	179013	179018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337334
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4105	NC_009445	CGA	2	6	179070	179075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337334
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4107	NC_009445	GC	3	6	179147	179152	0 %	0 %	50 %	50 %	146337334
4108	NC_009445	CGA	2	6	179169	179174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337334
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4111	NC_009445	TGG	2	6	179216	179221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337334
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4118	NC_009445	CAT	2	6	179439	179444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337334
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4120	NC_009445	CGG	2	6	179471	179476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337334
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4240	NC_009445	CTG	2	6	184133	184138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337339
4241	NC_009445	CTT	2	6	184175	184180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337339
4242	NC_009445	TTC	2	6	184188	184193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337339
4243	NC_009445	AGC	2	6	184206	184211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337339
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4245	NC_009445	GC	4	8	184297	184304	0 %	0 %	50 %	50 %	146337339
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4247	NC_009445	GCA	2	6	184423	184428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337339
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4271	NC_009445	CGAC	2	8	185446	185453	25 %	0 %	25 %	50 %	146337340
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4314	NC_009445	GC	3	6	186976	186981	0 %	0 %	50 %	50 %	146337342
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4335	NC_009445	GATCT	2	10	187817	187826	20 %	40 %	20 %	20 %	146337343
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4338	NC_009445	GCC	2	6	187889	187894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337343
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4343	NC_009445	ACG	2	6	188004	188009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337343
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4347	NC_009445	CGAC	2	8	188184	188191	25 %	0 %	25 %	50 %	146337343
4348	NC_009445	TGA	2	6	188241	188246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337343
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4351	NC_009445	CGA	2	6	188278	188283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337343
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4355	NC_009445	CGGC	2	8	188416	188423	0 %	0 %	50 %	50 %	146337343
4356	NC_009445	CGT	2	6	188461	188466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337343
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4358	NC_009445	GC	3	6	188822	188827	0 %	0 %	50 %	50 %	146337344
4359	NC_009445	CCG	2	6	188842	188847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337344
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4361	NC_009445	GC	3	6	188969	188974	0 %	0 %	50 %	50 %	146337344
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4482	NC_009445	GGC	2	6	194106	194111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337349
4483	NC_009445	GTCGCC	2	12	194185	194196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146337349
4484	NC_009445	GCG	2	6	194199	194204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337349
4485	NC_009445	AGC	2	6	194215	194220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337349
4486	NC_009445	TCG	2	6	194272	194277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337349
4487	NC_009445	CGCGC	2	10	194289	194298	0 %	0 %	40 %	60 %	146337349
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4490	NC_009445	GCT	2	6	194366	194371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337349
4491	NC_009445	ATC	2	6	194386	194391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337349
4492	NC_009445	TCT	2	6	194600	194605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337350
4493	NC_009445	GTG	2	6	194641	194646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337350
4494	NC_009445	CCT	2	6	194669	194674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337350
4495	NC_009445	CG	3	6	194687	194692	0 %	0 %	50 %	50 %	146337350
4496	NC_009445	GCT	2	6	194699	194704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337350
4497	NC_009445	CCGA	2	8	194815	194822	25 %	0 %	25 %	50 %	146337350
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4499	NC_009445	ATG	2	6	194974	194979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337350
4500	NC_009445	GCC	2	6	194994	194999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337350

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