MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009445	TCG	2	6	129014	129019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3002	NC_009445	AGC	2	6	129020	129025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3003	NC_009445	GC	5	10	129048	129057	0 %	0 %	50 %	50 %	146337287
3004	NC_009445	CGG	2	6	129068	129073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337287
3005	NC_009445	CGC	2	6	129078	129083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337287
3006	NC_009445	TCC	2	6	129131	129136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337287
3007	NC_009445	AGC	2	6	129137	129142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3008	NC_009445	GCTCGC	2	12	129150	129161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146337287
3009	NC_009445	CTT	2	6	129163	129168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337287
3010	NC_009445	ACC	2	6	129182	129187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337287
3011	NC_009445	CCT	2	6	129240	129245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337287
3012	NC_009445	GC	3	6	129272	129277	0 %	0 %	50 %	50 %	146337287
3013	NC_009445	CGT	2	6	129300	129305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3014	NC_009445	CGC	2	6	129324	129329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337287
3015	NC_009445	GGT	2	6	129367	129372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337287
3016	NC_009445	ACCG	2	8	129400	129407	25 %	0 %	25 %	50 %	146337287
3017	NC_009445	CGC	2	6	129411	129416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337287
3018	NC_009445	CGC	2	6	129435	129440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337287
3019	NC_009445	TCGA	2	8	129470	129477	25 %	25 %	25 %	25 %	146337287
3020	NC_009445	GCG	2	6	129600	129605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337287
3021	NC_009445	GCG	2	6	129621	129626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337287
3022	NC_009445	GCT	3	9	129630	129638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3023	NC_009445	CGC	2	6	129639	129644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337287
3024	NC_009445	GC	3	6	129643	129648	0 %	0 %	50 %	50 %	146337287
3025	NC_009445	CGGA	2	8	129659	129666	25 %	0 %	50 %	25 %	146337287
3026	NC_009445	CGGA	2	8	129674	129681	25 %	0 %	50 %	25 %	146337287
3027	NC_009445	GCG	2	6	129692	129697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337287
3028	NC_009445	TCG	2	6	129704	129709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3029	NC_009445	GTC	2	6	129748	129753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3030	NC_009445	CCA	2	6	129819	129824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337287
3031	NC_009445	TTG	2	6	130199	130204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337288
3032	NC_009445	GCG	2	6	130218	130223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337288
3033	NC_009445	CCGA	2	8	130226	130233	25 %	0 %	25 %	50 %	146337288
3034	NC_009445	GCC	2	6	130249	130254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3035	NC_009445	GAT	2	6	130259	130264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337288
3036	NC_009445	GCC	2	6	130270	130275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3037	NC_009445	GCC	2	6	130279	130284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3038	NC_009445	GCA	3	9	130305	130313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337288
3039	NC_009445	CGC	2	6	130320	130325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3040	NC_009445	CCG	2	6	130328	130333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3041	NC_009445	GGT	2	6	130357	130362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337288
3042	NC_009445	CGC	2	6	130383	130388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3043	NC_009445	CAC	2	6	130414	130419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337288
3044	NC_009445	GCC	2	6	130420	130425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3045	NC_009445	CGC	2	6	130509	130514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3046	NC_009445	GC	3	6	130513	130518	0 %	0 %	50 %	50 %	146337288
3047	NC_009445	GCC	2	6	130524	130529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3048	NC_009445	CGGC	2	8	130563	130570	0 %	0 %	50 %	50 %	146337288
3049	NC_009445	CGC	2	6	130590	130595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3050	NC_009445	CTG	2	6	130597	130602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337288
3051	NC_009445	GCC	2	6	130606	130611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3052	NC_009445	ACC	2	6	130622	130627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337288
3053	NC_009445	TGG	2	6	130644	130649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337288
3054	NC_009445	CCT	2	6	130689	130694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337288
3055	NC_009445	TCT	2	6	130695	130700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337288
3056	NC_009445	GCC	2	6	130721	130726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337288
3057	NC_009445	GGT	2	6	130786	130791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337288
3058	NC_009445	CCAGCG	2	12	130827	130838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337288
3059	NC_009445	GTG	2	6	130935	130940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337289
3060	NC_009445	TGT	2	6	130966	130971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337289
3061	NC_009445	TCA	2	6	130978	130983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337289
3062	NC_009445	GTC	2	6	131151	131156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337289
3063	NC_009445	CTT	2	6	131168	131173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337289
3064	NC_009445	TGC	2	6	131187	131192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337289
3065	NC_009445	TCC	2	6	131241	131246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337289
3066	NC_009445	GGA	2	6	131263	131268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337289
3067	NC_009445	CGA	2	6	131320	131325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337289
3068	NC_009445	GCG	2	6	131365	131370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337289
3069	NC_009445	GAA	2	6	131450	131455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337289
3070	NC_009445	ACG	2	6	131490	131495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337289
3071	NC_009445	GC	4	8	131515	131522	0 %	0 %	50 %	50 %	146337289
3072	NC_009445	GC	3	6	131537	131542	0 %	0 %	50 %	50 %	146337289
3073	NC_009445	GC	3	6	131555	131560	0 %	0 %	50 %	50 %	146337289
3074	NC_009445	GTC	2	6	131779	131784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337290
3075	NC_009445	CG	3	6	131812	131817	0 %	0 %	50 %	50 %	146337290
3076	NC_009445	GCGCCA	2	12	131844	131855	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337290
3077	NC_009445	CG	3	6	131865	131870	0 %	0 %	50 %	50 %	146337290
3078	NC_009445	ATGCAG	2	12	131902	131913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146337290
3079	NC_009445	CTCA	2	8	131944	131951	25 %	25 %	0 %	50 %	146337290
3080	NC_009445	CTG	3	9	131977	131985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337290
3081	NC_009445	AGC	2	6	132005	132010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337290
3082	NC_009445	CGGT	2	8	132038	132045	0 %	25 %	50 %	25 %	146337290
3083	NC_009445	GTGC	2	8	132050	132057	0 %	25 %	50 %	25 %	146337290
3084	NC_009445	CGCGA	2	10	132062	132071	20 %	0 %	40 %	40 %	146337290
3085	NC_009445	GC	3	6	132136	132141	0 %	0 %	50 %	50 %	146337290
3086	NC_009445	CAC	2	6	132223	132228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337290
3087	NC_009445	CAC	2	6	132259	132264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337290
3088	NC_009445	CGAC	2	8	132315	132322	25 %	0 %	25 %	50 %	146337290
3089	NC_009445	GA	3	6	132335	132340	50 %	0 %	50 %	0 %	146337290
3090	NC_009445	GCC	2	6	132895	132900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
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3092	NC_009445	TCCGC	2	10	132941	132950	0 %	20 %	20 %	60 %	146337291
3093	NC_009445	CCG	2	6	132962	132967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
3094	NC_009445	AGC	2	6	133004	133009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3095	NC_009445	GCG	2	6	133022	133027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337291
3096	NC_009445	AGC	2	6	133088	133093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3097	NC_009445	GC	3	6	133103	133108	0 %	0 %	50 %	50 %	146337291
3098	NC_009445	ATG	2	6	133114	133119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337291
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3100	NC_009445	TGCC	2	8	133171	133178	0 %	25 %	25 %	50 %	146337291
3101	NC_009445	GCA	2	6	133197	133202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3102	NC_009445	CGA	2	6	133233	133238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3103	NC_009445	GCC	2	6	133246	133251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
3104	NC_009445	AGCC	2	8	133256	133263	25 %	0 %	25 %	50 %	146337291
3105	NC_009445	CTA	2	6	133281	133286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337291
3106	NC_009445	GCG	2	6	133292	133297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337291
3107	NC_009445	CG	3	6	133296	133301	0 %	0 %	50 %	50 %	146337291
3108	NC_009445	GCA	2	6	133368	133373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3109	NC_009445	TCG	2	6	133466	133471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3110	NC_009445	CGC	2	6	133473	133478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
3111	NC_009445	AAC	2	6	133483	133488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337291
3112	NC_009445	GCC	2	6	133522	133527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
3113	NC_009445	ACA	2	6	133535	133540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337291
3114	NC_009445	CTCG	2	8	133551	133558	0 %	25 %	25 %	50 %	146337291
3115	NC_009445	AAG	2	6	133582	133587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337291
3116	NC_009445	GAC	2	6	133609	133614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3117	NC_009445	GAT	2	6	133620	133625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337291
3118	NC_009445	GGC	2	6	133632	133637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337291
3119	NC_009445	GCC	2	6	133708	133713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337291
3120	NC_009445	TCA	2	6	133724	133729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337291
3121	NC_009445	CAA	2	6	133737	133742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337291
3122	NC_009445	TCG	2	6	133751	133756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3123	NC_009445	CGA	2	6	133791	133796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337291
3124	NC_009445	GGGA	2	8	133982	133989	25 %	0 %	75 %	0 %	146337292
3125	NC_009445	CG	3	6	134031	134036	0 %	0 %	50 %	50 %	146337292
3126	NC_009445	TCGTCA	2	12	134069	134080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146337292
3127	NC_009445	TGC	2	6	134240	134245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337292
3128	NC_009445	CG	3	6	134255	134260	0 %	0 %	50 %	50 %	146337292
3129	NC_009445	AGA	2	6	134261	134266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337292
3130	NC_009445	GTC	2	6	134383	134388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337292
3131	NC_009445	CAT	2	6	134445	134450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337292
3132	NC_009445	CTG	2	6	134455	134460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337292
3133	NC_009445	GTC	2	6	134473	134478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337292
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3137	NC_009445	TCT	2	6	134638	134643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337293
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3140	NC_009445	TGC	2	6	134686	134691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337293
3141	NC_009445	GGC	2	6	134694	134699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337293
3142	NC_009445	CGG	2	6	134750	134755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337293
3143	NC_009445	CGT	2	6	134771	134776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337293
3144	NC_009445	CGG	2	6	134792	134797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337293
3145	NC_009445	TGA	2	6	134842	134847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337293
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3150	NC_009445	ATC	2	6	134949	134954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337293
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3153	NC_009445	GC	3	6	134989	134994	0 %	0 %	50 %	50 %	146337293
3154	NC_009445	CGC	2	6	134999	135004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337293
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3158	NC_009445	GCTC	2	8	135114	135121	0 %	25 %	25 %	50 %	146337293
3159	NC_009445	CGG	2	6	135127	135132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337293
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3195	NC_009445	TAG	2	6	136530	136535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337294
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3200	NC_009445	CG	3	6	136669	136674	0 %	0 %	50 %	50 %	146337294
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3231	NC_009445	CGA	2	6	138535	138540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337296
3232	NC_009445	GC	4	8	138562	138569	0 %	0 %	50 %	50 %	146337296
3233	NC_009445	CGC	2	6	138585	138590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337296
3234	NC_009445	GCG	2	6	138606	138611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337296
3235	NC_009445	CCA	2	6	138628	138633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337296
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3237	NC_009445	CCG	3	9	138680	138688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337296
3238	NC_009445	TCG	2	6	138725	138730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337296
3239	NC_009445	CTT	2	6	138757	138762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337296
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3241	NC_009445	CGC	2	6	138813	138818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337296
3242	NC_009445	GC	3	6	138822	138827	0 %	0 %	50 %	50 %	146337296
3243	NC_009445	GCG	2	6	138855	138860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337296
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3246	NC_009445	CGA	2	6	138966	138971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337296
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3484	NC_009445	CAT	2	6	152208	152213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337309
3485	NC_009445	GCT	2	6	152331	152336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337310
3486	NC_009445	CG	4	8	152352	152359	0 %	0 %	50 %	50 %	146337310
3487	NC_009445	CCG	2	6	152366	152371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337310
3488	NC_009445	AGC	2	6	152372	152377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337310
3489	NC_009445	GC	3	6	152429	152434	0 %	0 %	50 %	50 %	146337310
3490	NC_009445	GCG	2	6	152450	152455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337310
3491	NC_009445	GCGG	2	8	152466	152473	0 %	0 %	75 %	25 %	146337310
3492	NC_009445	CGC	2	6	152492	152497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337310
3493	NC_009445	GTCG	2	8	152532	152539	0 %	25 %	50 %	25 %	146337310
3494	NC_009445	ACG	2	6	152609	152614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337310
3495	NC_009445	CAT	2	6	152616	152621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337310
3496	NC_009445	GCCG	2	8	152628	152635	0 %	0 %	50 %	50 %	146337310
3497	NC_009445	CG	4	8	152742	152749	0 %	0 %	50 %	50 %	146337310
3498	NC_009445	CGC	3	9	152754	152762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337310
3499	NC_009445	GCG	2	6	152882	152887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337310
3500	NC_009445	GCA	2	6	152916	152921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337310

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