MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009445	CGC	2	6	107423	107428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337263
2502	NC_009445	GC	3	6	107481	107486	0 %	0 %	50 %	50 %	146337263
2503	NC_009445	ATCC	2	8	107487	107494	25 %	25 %	0 %	50 %	146337263
2504	NC_009445	CGC	2	6	107557	107562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337264
2505	NC_009445	GAC	2	6	107576	107581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2506	NC_009445	GAT	2	6	107657	107662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337264
2507	NC_009445	CAG	3	9	107678	107686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2508	NC_009445	TCG	3	9	107703	107711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2509	NC_009445	GGCC	2	8	107785	107792	0 %	0 %	50 %	50 %	146337264
2510	NC_009445	CGT	3	9	107821	107829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2511	NC_009445	CAG	2	6	107834	107839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2512	NC_009445	GCA	2	6	107857	107862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2513	NC_009445	CGC	2	6	107888	107893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337264
2514	NC_009445	ATC	2	6	107951	107956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337264
2515	NC_009445	GCC	3	9	107990	107998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337264
2516	NC_009445	CCT	2	6	108037	108042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337264
2517	NC_009445	CAT	2	6	108092	108097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337264
2518	NC_009445	GGCC	2	8	108112	108119	0 %	0 %	50 %	50 %	146337264
2519	NC_009445	TGT	2	6	108142	108147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337264
2520	NC_009445	GCA	2	6	108250	108255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2521	NC_009445	GCT	2	6	108262	108267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2522	NC_009445	GC	4	8	108317	108324	0 %	0 %	50 %	50 %	146337264
2523	NC_009445	GAT	2	6	108371	108376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337264
2524	NC_009445	CTT	2	6	108380	108385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337264
2525	NC_009445	GC	3	6	108395	108400	0 %	0 %	50 %	50 %	146337264
2526	NC_009445	GTT	2	6	108422	108427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337264
2527	NC_009445	TCG	2	6	108456	108461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2528	NC_009445	GCC	2	6	108482	108487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337264
2529	NC_009445	GCG	2	6	108520	108525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337264
2530	NC_009445	GTC	2	6	108717	108722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337264
2531	NC_009445	GCG	2	6	108743	108748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337265
2532	NC_009445	CGCGC	2	10	108749	108758	0 %	0 %	40 %	60 %	146337265
2533	NC_009445	CGC	2	6	108828	108833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337265
2534	NC_009445	GC	3	6	108836	108841	0 %	0 %	50 %	50 %	146337265
2535	NC_009445	GCG	2	6	109029	109034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337265
2536	NC_009445	TGCG	2	8	109107	109114	0 %	25 %	50 %	25 %	146337265
2537	NC_009445	CT	3	6	109118	109123	0 %	50 %	0 %	50 %	146337265
2538	NC_009445	GC	3	6	109215	109220	0 %	0 %	50 %	50 %	146337265
2539	NC_009445	CTG	2	6	109231	109236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337265
2540	NC_009445	CG	3	6	109247	109252	0 %	0 %	50 %	50 %	146337265
2541	NC_009445	CGG	2	6	109279	109284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337265
2542	NC_009445	GCG	2	6	109325	109330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337265
2543	NC_009445	GCCGG	2	10	109503	109512	0 %	0 %	60 %	40 %	146337266
2544	NC_009445	GCG	2	6	109562	109567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337266
2545	NC_009445	GC	5	10	109581	109590	0 %	0 %	50 %	50 %	146337266
2546	NC_009445	GGC	2	6	109611	109616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337266
2547	NC_009445	GCG	2	6	109619	109624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337266
2548	NC_009445	GAT	2	6	109678	109683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337266
2549	NC_009445	ACCGAG	2	12	109715	109726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337266
2550	NC_009445	CAG	2	6	109801	109806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337266
2551	NC_009445	CAG	2	6	109810	109815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337266
2552	NC_009445	CGT	2	6	109941	109946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337267
2553	NC_009445	GAA	2	6	110008	110013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337267
2554	NC_009445	GCCCG	2	10	110064	110073	0 %	0 %	40 %	60 %	146337267
2555	NC_009445	CG	3	6	110132	110137	0 %	0 %	50 %	50 %	146337267
2556	NC_009445	GCG	2	6	110141	110146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337267
2557	NC_009445	ATC	2	6	110243	110248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337267
2558	NC_009445	CG	3	6	110506	110511	0 %	0 %	50 %	50 %	146337268
2559	NC_009445	GGA	2	6	110558	110563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337268
2560	NC_009445	AGGTC	2	10	110564	110573	20 %	20 %	40 %	20 %	146337268
2561	NC_009445	CTT	2	6	110616	110621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337268
2562	NC_009445	TTG	2	6	110629	110634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337268
2563	NC_009445	CGA	2	6	110636	110641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2564	NC_009445	TCT	2	6	110657	110662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337268
2565	NC_009445	TCG	2	6	110674	110679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2566	NC_009445	TCAGCT	2	12	110681	110692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146337268
2567	NC_009445	GCCG	2	8	110702	110709	0 %	0 %	50 %	50 %	146337268
2568	NC_009445	CAG	2	6	110739	110744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2569	NC_009445	CGT	2	6	110747	110752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2570	NC_009445	GCG	2	6	110760	110765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337268
2571	NC_009445	ATC	2	6	110811	110816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337268
2572	NC_009445	GCG	2	6	110873	110878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337268
2573	NC_009445	CCT	2	6	110888	110893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337268
2574	NC_009445	CAG	2	6	110916	110921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2575	NC_009445	CGAT	2	8	110954	110961	25 %	25 %	25 %	25 %	146337268
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2578	NC_009445	CGA	2	6	110984	110989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
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2583	NC_009445	GCT	2	6	111095	111100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337268
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2585	NC_009445	GCC	2	6	111117	111122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337268
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2587	NC_009445	CG	3	6	111266	111271	0 %	0 %	50 %	50 %	146337268
2588	NC_009445	CAC	2	6	111315	111320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337268
2589	NC_009445	ACG	2	6	111325	111330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
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2591	NC_009445	GCG	2	6	111360	111365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337268
2592	NC_009445	CGA	2	6	111368	111373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337268
2593	NC_009445	CTTC	2	8	111905	111912	0 %	50 %	0 %	50 %	146337269
2594	NC_009445	CTT	2	6	111960	111965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337269
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2601	NC_009445	GCT	2	6	112187	112192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2602	NC_009445	ACGTCG	2	12	112222	112233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2603	NC_009445	CAC	2	6	112236	112241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337269
2604	NC_009445	CTT	2	6	112260	112265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337269
2605	NC_009445	ACC	2	6	112393	112398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337269
2606	NC_009445	CGA	2	6	112418	112423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2607	NC_009445	CGAG	2	8	112460	112467	25 %	0 %	50 %	25 %	146337269
2608	NC_009445	GCG	2	6	112470	112475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337269
2609	NC_009445	TTC	2	6	112549	112554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337269
2610	NC_009445	GCTCGA	2	12	112601	112612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2611	NC_009445	CAG	2	6	112704	112709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2612	NC_009445	CGAG	2	8	112721	112728	25 %	0 %	50 %	25 %	146337269
2613	NC_009445	TGA	2	6	112754	112759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337269
2614	NC_009445	CTTGAC	2	12	112761	112772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146337269
2615	NC_009445	TCGG	2	8	112795	112802	0 %	25 %	50 %	25 %	146337269
2616	NC_009445	GCC	2	6	112854	112859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337269
2617	NC_009445	CGA	2	6	112865	112870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337269
2618	NC_009445	GAC	2	6	112896	112901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337269
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2745	NC_009445	GCC	2	6	118975	118980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337276
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2859	NC_009445	GCCG	2	8	123015	123022	0 %	0 %	50 %	50 %	146337280
2860	NC_009445	ACA	3	9	123080	123088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337280
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2979	NC_009445	GC	3	6	128160	128165	0 %	0 %	50 %	50 %	146337286
2980	NC_009445	CCG	2	6	128174	128179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337286
2981	NC_009445	CTC	2	6	128181	128186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337286
2982	NC_009445	GC	3	6	128270	128275	0 %	0 %	50 %	50 %	146337286
2983	NC_009445	CGC	3	9	128288	128296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337286
2984	NC_009445	TGC	2	6	128297	128302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337286
2985	NC_009445	ATC	2	6	128319	128324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337286
2986	NC_009445	CGC	2	6	128336	128341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337286
2987	NC_009445	CGC	2	6	128354	128359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337286
2988	NC_009445	CTG	2	6	128370	128375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337286
2989	NC_009445	CG	3	6	128409	128414	0 %	0 %	50 %	50 %	146337286
2990	NC_009445	AGC	2	6	128419	128424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337286
2991	NC_009445	CTT	2	6	128441	128446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337286
2992	NC_009445	CGA	2	6	128447	128452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337286
2993	NC_009445	GCA	2	6	128480	128485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337286
2994	NC_009445	GCG	2	6	128507	128512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337286
2995	NC_009445	TCA	2	6	128513	128518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337286
2996	NC_009445	CGA	2	6	128826	128831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337287
2997	NC_009445	CGGT	2	8	128885	128892	0 %	25 %	50 %	25 %	146337287
2998	NC_009445	TGA	2	6	128925	128930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337287
2999	NC_009445	GCT	2	6	128967	128972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337287
3000	NC_009445	GATCG	2	10	128989	128998	20 %	20 %	40 %	20 %	146337287

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