MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009445	GCC	2	6	668544	668549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337768
15002	NC_009445	CGG	2	6	668559	668564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337768
15003	NC_009445	CGG	2	6	668646	668651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337768
15004	NC_009445	CAA	2	6	668697	668702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337768
15005	NC_009445	CGC	2	6	668712	668717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337768
15006	NC_009445	CG	4	8	668724	668731	0 %	0 %	50 %	50 %	146337768
15007	NC_009445	GAT	2	6	668757	668762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337768
15008	NC_009445	CGC	2	6	668793	668798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337768
15009	NC_009445	ATC	3	9	668827	668835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337768
15010	NC_009445	TTC	2	6	668968	668973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337768
15011	NC_009445	CCG	2	6	668978	668983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337768
15012	NC_009445	GGT	3	9	669024	669032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337768
15013	NC_009445	GGC	2	6	669040	669045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337768
15014	NC_009445	CTG	2	6	669100	669105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337768
15015	NC_009445	CAGGCC	2	12	669106	669117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337768
15016	NC_009445	CCAAGG	2	12	669119	669130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337768
15017	NC_009445	CGG	2	6	669150	669155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337768
15018	NC_009445	GGC	2	6	669180	669185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337768
15019	NC_009445	CGC	2	6	669221	669226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337768
15020	NC_009445	TGG	2	6	669284	669289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337768
15021	NC_009445	ACG	2	6	669314	669319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337768
15022	NC_009445	CAC	2	6	669435	669440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337768
15023	NC_009445	GC	3	6	669468	669473	0 %	0 %	50 %	50 %	146337768
15024	NC_009445	GGGC	2	8	669501	669508	0 %	0 %	75 %	25 %	146337768
15025	NC_009445	GAA	2	6	669558	669563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337768
15026	NC_009445	CGA	2	6	669588	669593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337768
15027	NC_009445	GCT	2	6	669600	669605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337768
15028	NC_009445	GAA	2	6	669666	669671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337768
15029	NC_009445	CCG	2	6	669858	669863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337769
15030	NC_009445	GCA	2	6	669868	669873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15031	NC_009445	TCACGA	2	12	669891	669902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146337769
15032	NC_009445	GCG	2	6	669916	669921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337769
15033	NC_009445	GGC	2	6	669961	669966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337769
15034	NC_009445	GC	3	6	669970	669975	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15035	NC_009445	GC	3	6	669994	669999	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15036	NC_009445	TGC	2	6	670002	670007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15037	NC_009445	CGG	2	6	670018	670023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337769
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15039	NC_009445	CGT	2	6	670077	670082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15040	NC_009445	CGA	2	6	670095	670100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15041	NC_009445	GTC	2	6	670154	670159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15042	NC_009445	CGGC	2	8	670179	670186	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15043	NC_009445	ACG	2	6	670247	670252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15044	NC_009445	CGG	2	6	670285	670290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337769
15045	NC_009445	GCT	2	6	670309	670314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15046	NC_009445	GC	3	6	670328	670333	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15047	NC_009445	CG	4	8	670363	670370	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15048	NC_009445	GGT	2	6	670399	670404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337769
15049	NC_009445	GCC	2	6	670424	670429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337769
15050	NC_009445	GC	3	6	670430	670435	0 %	0 %	50 %	50 %	146337769
15051	NC_009445	CAA	2	6	670498	670503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337769
15052	NC_009445	CAC	2	6	670550	670555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337769
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15054	NC_009445	TCG	2	6	670602	670607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337769
15055	NC_009445	GTC	2	6	670873	670878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337770
15056	NC_009445	CGC	2	6	670887	670892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337770
15057	NC_009445	GCT	2	6	670956	670961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337770
15058	NC_009445	GTC	2	6	670987	670992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337770
15059	NC_009445	CGG	2	6	671012	671017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337770
15060	NC_009445	CGG	2	6	671040	671045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337770
15061	NC_009445	CGG	2	6	671049	671054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337770
15062	NC_009445	GAT	2	6	671077	671082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337770
15063	NC_009445	CAT	2	6	671133	671138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337770
15064	NC_009445	ATC	2	6	671141	671146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337770
15065	NC_009445	CG	3	6	671185	671190	0 %	0 %	50 %	50 %	146337770
15066	NC_009445	ACCAC	2	10	671207	671216	40 %	0 %	0 %	60 %	146337770
15067	NC_009445	CGA	2	6	671223	671228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337770
15068	NC_009445	CCG	2	6	671245	671250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337770
15069	NC_009445	CG	4	8	671267	671274	0 %	0 %	50 %	50 %	146337770
15070	NC_009445	CCG	2	6	671277	671282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337770
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15079	NC_009445	GCC	2	6	671527	671532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337770
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15081	NC_009445	TCAA	2	8	671695	671702	50 %	25 %	0 %	25 %	146337771
15082	NC_009445	CG	3	6	671726	671731	0 %	0 %	50 %	50 %	146337771
15083	NC_009445	CGC	2	6	671761	671766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337771
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15091	NC_009445	TGA	2	6	672469	672474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337772
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15102	NC_009445	TCG	2	6	672981	672986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337773
15103	NC_009445	GGC	2	6	673085	673090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337773
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15105	NC_009445	GAG	2	6	673175	673180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337773
15106	NC_009445	GGC	2	6	673219	673224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337773
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15109	NC_009445	GCT	2	6	673291	673296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337773
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15111	NC_009445	GCA	2	6	673324	673329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337773
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15115	NC_009445	CGGA	2	8	673576	673583	25 %	0 %	50 %	25 %	146337773
15116	NC_009445	GAC	2	6	673696	673701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337773
15117	NC_009445	GGC	2	6	673711	673716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337773
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15119	NC_009445	GC	3	6	673837	673842	0 %	0 %	50 %	50 %	146337773
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15241	NC_009445	TCG	2	6	679208	679213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337777
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15354	NC_009445	AGC	3	9	684064	684072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337781
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15475	NC_009445	GAC	2	6	690793	690798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337787
15476	NC_009445	CG	3	6	690805	690810	0 %	0 %	50 %	50 %	146337787
15477	NC_009445	CAG	2	6	690876	690881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337787
15478	NC_009445	CGG	2	6	690890	690895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337787
15479	NC_009445	GGT	2	6	690909	690914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337787
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15481	NC_009445	GCA	2	6	691001	691006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337787
15482	NC_009445	GGC	2	6	691022	691027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337787
15483	NC_009445	CG	4	8	691070	691077	0 %	0 %	50 %	50 %	146337787
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15489	NC_009445	CGT	2	6	691284	691289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337787
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15491	NC_009445	CGG	2	6	691307	691312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337787
15492	NC_009445	GCC	3	9	691392	691400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337787
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15498	NC_009445	CCTG	2	8	691617	691624	0 %	25 %	25 %	50 %	146337787
15499	NC_009445	GGC	2	6	691629	691634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337787
15500	NC_009445	CAT	2	6	691659	691664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337787

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