MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009445	CTA	2	6	44468	44473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337211
1002	NC_009445	AGCGGC	2	12	44484	44495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146337211
1003	NC_009445	CGA	2	6	44528	44533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337211
1004	NC_009445	TGG	2	6	44539	44544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337211
1005	NC_009445	CG	3	6	44546	44551	0 %	0 %	50 %	50 %	146337211
1006	NC_009445	TCG	2	6	44569	44574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337211
1007	NC_009445	CGGTCG	2	12	44626	44637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146337211
1008	NC_009445	CGGCG	2	10	44678	44687	0 %	0 %	60 %	40 %	146337211
1009	NC_009445	GC	4	8	44726	44733	0 %	0 %	50 %	50 %	146337211
1010	NC_009445	GCC	2	6	44744	44749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337211
1011	NC_009445	GCAG	2	8	44753	44760	25 %	0 %	50 %	25 %	146337211
1012	NC_009445	CCT	2	6	44782	44787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337211
1013	NC_009445	TTC	2	6	44801	44806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337212
1014	NC_009445	ATCG	2	8	44830	44837	25 %	25 %	25 %	25 %	146337212
1015	NC_009445	GCC	2	6	44840	44845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337212
1016	NC_009445	GC	3	6	44849	44854	0 %	0 %	50 %	50 %	146337212
1017	NC_009445	CGC	2	6	44881	44886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337212
1018	NC_009445	CGA	2	6	45010	45015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337212
1019	NC_009445	TTG	2	6	45077	45082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337212
1020	NC_009445	GAG	2	6	45140	45145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337212
1021	NC_009445	AAC	2	6	45146	45151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337212
1022	NC_009445	GC	3	6	45158	45163	0 %	0 %	50 %	50 %	146337212
1023	NC_009445	TCG	2	6	45192	45197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337212
1024	NC_009445	GCC	2	6	45198	45203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337212
1025	NC_009445	GCC	2	6	45375	45380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337213
1026	NC_009445	AGC	2	6	45400	45405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337213
1027	NC_009445	GCGA	2	8	45435	45442	25 %	0 %	50 %	25 %	146337213
1028	NC_009445	CGA	2	6	45485	45490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337213
1029	NC_009445	GATCTC	2	12	45494	45505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146337213
1030	NC_009445	CAT	2	6	45545	45550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337213
1031	NC_009445	ACC	2	6	45613	45618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337213
1032	NC_009445	GAG	2	6	45660	45665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337213
1033	NC_009445	ACC	2	6	45718	45723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337213
1034	NC_009445	CGA	2	6	45749	45754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337213
1035	NC_009445	TCC	2	6	45928	45933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337214
1036	NC_009445	TGGAGG	2	12	45947	45958	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	146337214
1037	NC_009445	CCG	2	6	45980	45985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337214
1038	NC_009445	TCG	2	6	46055	46060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337214
1039	NC_009445	CGT	2	6	46097	46102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337214
1040	NC_009445	TCT	2	6	46172	46177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337214
1041	NC_009445	CGT	2	6	46178	46183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337214
1042	NC_009445	CTGTTC	2	12	46216	46227	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146337214
1043	NC_009445	GCG	2	6	46228	46233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337214
1044	NC_009445	CTGC	2	8	46256	46263	0 %	25 %	25 %	50 %	146337214
1045	NC_009445	GTG	2	6	46264	46269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337214
1046	NC_009445	GCG	2	6	46298	46303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337214
1047	NC_009445	CGC	2	6	46305	46310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337214
1048	NC_009445	GGC	2	6	46336	46341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337214
1049	NC_009445	GC	3	6	46374	46379	0 %	0 %	50 %	50 %	146337214
1050	NC_009445	CGA	2	6	46401	46406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337214
1051	NC_009445	GGCT	2	8	46436	46443	0 %	25 %	50 %	25 %	146337214
1052	NC_009445	CGG	2	6	46472	46477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337214
1053	NC_009445	CGC	3	9	46542	46550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1054	NC_009445	TGG	2	6	46608	46613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337215
1055	NC_009445	TCG	2	6	46635	46640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1056	NC_009445	AGG	2	6	46752	46757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337215
1057	NC_009445	CG	3	6	46772	46777	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
1058	NC_009445	ATC	2	6	46826	46831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337215
1059	NC_009445	CG	3	6	46835	46840	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
1060	NC_009445	CGT	2	6	46852	46857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1061	NC_009445	GCT	2	6	46891	46896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1062	NC_009445	GC	3	6	46918	46923	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
1063	NC_009445	CCG	2	6	46941	46946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1064	NC_009445	AGG	2	6	47025	47030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337215
1065	NC_009445	GTG	2	6	47057	47062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337215
1066	NC_009445	AC	3	6	47067	47072	50 %	0 %	0 %	50 %	146337215
1067	NC_009445	GCG	2	6	47073	47078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337215
1068	NC_009445	CGA	2	6	47110	47115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1069	NC_009445	CGGC	2	8	47218	47225	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
1070	NC_009445	CCA	2	6	47274	47279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337215
1071	NC_009445	CGA	2	6	47296	47301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1072	NC_009445	CGC	2	6	47311	47316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1073	NC_009445	CCG	2	6	47331	47336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1074	NC_009445	CGG	2	6	47423	47428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337215
1075	NC_009445	GC	3	6	47448	47453	0 %	0 %	50 %	50 %	146337215
1076	NC_009445	GAC	2	6	47456	47461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1077	NC_009445	TCG	2	6	47484	47489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1078	NC_009445	GATC	2	8	47536	47543	25 %	25 %	25 %	25 %	146337215
1079	NC_009445	CGC	2	6	47580	47585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1080	NC_009445	CGG	3	9	47598	47606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337215
1081	NC_009445	CAGC	2	8	47674	47681	25 %	0 %	25 %	50 %	146337215
1082	NC_009445	CAA	2	6	47692	47697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337215
1083	NC_009445	GTC	2	6	47714	47719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1084	NC_009445	GTT	2	6	47725	47730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337215
1085	NC_009445	CAGC	2	8	47783	47790	25 %	0 %	25 %	50 %	146337215
1086	NC_009445	CAT	2	6	47812	47817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337215
1087	NC_009445	CGA	2	6	47883	47888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337215
1088	NC_009445	GCC	2	6	47909	47914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337215
1089	NC_009445	C	6	6	48015	48020	0 %	0 %	0 %	100 %	146337216
1090	NC_009445	GTC	2	6	48030	48035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1091	NC_009445	CGA	2	6	48044	48049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1092	NC_009445	GCC	2	6	48057	48062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337216
1093	NC_009445	GCC	2	6	48109	48114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337216
1094	NC_009445	CGT	3	9	48119	48127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1095	NC_009445	CG	3	6	48133	48138	0 %	0 %	50 %	50 %	146337216
1096	NC_009445	CGG	2	6	48155	48160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337216
1097	NC_009445	TC	3	6	48233	48238	0 %	50 %	0 %	50 %	146337216
1098	NC_009445	GTTCGA	2	12	48290	48301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146337216
1099	NC_009445	GC	3	6	48356	48361	0 %	0 %	50 %	50 %	146337216
1100	NC_009445	CG	3	6	48390	48395	0 %	0 %	50 %	50 %	146337216
1101	NC_009445	CGG	2	6	48430	48435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337216
1102	NC_009445	CGC	2	6	48467	48472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337216
1103	NC_009445	CAT	2	6	48503	48508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337216
1104	NC_009445	GGCTT	2	10	48541	48550	0 %	40 %	40 %	20 %	146337216
1105	NC_009445	ACG	2	6	48601	48606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1106	NC_009445	GATG	2	8	48620	48627	25 %	25 %	50 %	0 %	146337216
1107	NC_009445	GTC	2	6	48633	48638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1108	NC_009445	GC	4	8	48641	48648	0 %	0 %	50 %	50 %	146337216
1109	NC_009445	GAGATC	2	12	48660	48671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146337216
1110	NC_009445	CGA	2	6	48725	48730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337216
1111	NC_009445	ATC	2	6	48798	48803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337216
1112	NC_009445	CG	3	6	48863	48868	0 %	0 %	50 %	50 %	146337216
1113	NC_009445	CAGGT	2	10	48897	48906	20 %	20 %	40 %	20 %	146337216
1114	NC_009445	TGG	2	6	48937	48942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337216
1115	NC_009445	CGC	2	6	49082	49087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337217
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1117	NC_009445	CAT	2	6	49136	49141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337217
1118	NC_009445	CGC	3	9	49142	49150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337217
1119	NC_009445	GAT	2	6	49203	49208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337217
1120	NC_009445	GGC	2	6	49209	49214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337217
1121	NC_009445	CG	3	6	49297	49302	0 %	0 %	50 %	50 %	146337217
1122	NC_009445	CGA	2	6	49304	49309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337217
1123	NC_009445	CGCGC	2	10	49313	49322	0 %	0 %	40 %	60 %	146337217
1124	NC_009445	CATCGC	2	12	49334	49345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337217
1125	NC_009445	GAG	2	6	49374	49379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337217
1126	NC_009445	CAT	2	6	49395	49400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337217
1127	NC_009445	GAG	2	6	49470	49475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337217
1128	NC_009445	CCAT	2	8	49572	49579	25 %	25 %	0 %	50 %	146337218
1129	NC_009445	GCCG	2	8	49606	49613	0 %	0 %	50 %	50 %	146337218
1130	NC_009445	GCC	2	6	49618	49623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337218
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1132	NC_009445	GCT	2	6	49657	49662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337218
1133	NC_009445	GCG	2	6	49695	49700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337218
1134	NC_009445	CGA	2	6	49711	49716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337218
1135	NC_009445	CGA	2	6	49747	49752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337218
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1138	NC_009445	GCG	2	6	49858	49863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337218
1139	NC_009445	TGA	2	6	49884	49889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337218
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1141	NC_009445	CGA	2	6	49942	49947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337218
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1146	NC_009445	CAT	2	6	50101	50106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337218
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1242	NC_009445	CGG	2	6	54713	54718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337222
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1246	NC_009445	GCT	2	6	54849	54854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337222
1247	NC_009445	GATC	2	8	54885	54892	25 %	25 %	25 %	25 %	146337222
1248	NC_009445	TCAT	2	8	54893	54900	25 %	50 %	0 %	25 %	146337222
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1250	NC_009445	GCG	2	6	54933	54938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337222
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1495	NC_009445	GCC	2	6	64325	64330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337229
1496	NC_009445	GACT	2	8	64394	64401	25 %	25 %	25 %	25 %	146337229
1497	NC_009445	GA	4	8	64420	64427	50 %	0 %	50 %	0 %	146337229
1498	NC_009445	ATC	2	6	64464	64469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337230
1499	NC_009445	CCA	2	6	64480	64485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337230
1500	NC_009445	CAA	2	6	64541	64546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337230

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