MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009445	GAC	2	6	23617	23622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
502	NC_009445	GCT	2	6	23676	23681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
503	NC_009445	CGCC	2	8	23735	23742	0 %	0 %	25 %	75 %	146337192
504	NC_009445	GTGC	2	8	23773	23780	0 %	25 %	50 %	25 %	146337192
505	NC_009445	CG	3	6	23784	23789	0 %	0 %	50 %	50 %	146337192
506	NC_009445	TCG	2	6	23867	23872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
507	NC_009445	CGC	2	6	23889	23894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337192
508	NC_009445	GCA	3	9	23895	23903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
509	NC_009445	GCT	2	6	23907	23912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
510	NC_009445	CGA	2	6	23958	23963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
511	NC_009445	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
512	NC_009445	CGA	2	6	23994	23999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
513	NC_009445	TCG	2	6	24029	24034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
514	NC_009445	AAGC	2	8	24057	24064	50 %	0 %	25 %	25 %	146337192
515	NC_009445	TCA	2	6	24185	24190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337193
516	NC_009445	TCT	2	6	24205	24210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337193
517	NC_009445	GC	3	6	24256	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	146337193
518	NC_009445	TCG	2	6	24282	24287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
519	NC_009445	CGT	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
520	NC_009445	GGCG	2	8	24349	24356	0 %	0 %	75 %	25 %	146337193
521	NC_009445	TTCGTC	2	12	24383	24394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146337193
522	NC_009445	TCG	2	6	24498	24503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
523	NC_009445	CG	3	6	24514	24519	0 %	0 %	50 %	50 %	146337193
524	NC_009445	CGG	2	6	24540	24545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337193
525	NC_009445	ACT	2	6	24760	24765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337194
526	NC_009445	ATG	2	6	24870	24875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
527	NC_009445	CGG	2	6	24883	24888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337194
528	NC_009445	ACG	2	6	24909	24914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
529	NC_009445	ATG	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
530	NC_009445	TGA	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
531	NC_009445	CG	3	6	24958	24963	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
532	NC_009445	GGC	2	6	24968	24973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337194
533	NC_009445	GTC	2	6	24987	24992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
534	NC_009445	GTC	2	6	25016	25021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
535	NC_009445	GAT	2	6	25052	25057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
536	NC_009445	GCA	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
537	NC_009445	GTC	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
538	NC_009445	GC	3	6	25124	25129	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
539	NC_009445	TGC	2	6	25182	25187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
540	NC_009445	CG	3	6	25216	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
541	NC_009445	TGA	2	6	25288	25293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
542	NC_009445	CGA	2	6	25322	25327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
543	NC_009445	GC	3	6	25332	25337	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
544	NC_009445	TGC	2	6	25402	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
545	NC_009445	GGC	2	6	25408	25413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337194
546	NC_009445	CAC	2	6	25548	25553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337195
547	NC_009445	GCC	2	6	25558	25563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337195
548	NC_009445	CCA	2	6	25580	25585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337195
549	NC_009445	CTC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337195
550	NC_009445	GC	3	6	25667	25672	0 %	0 %	50 %	50 %	146337195
551	NC_009445	GAC	2	6	25685	25690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337195
552	NC_009445	GCG	2	6	25714	25719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337195
553	NC_009445	ACG	2	6	25811	25816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337195
554	NC_009445	GC	3	6	25842	25847	0 %	0 %	50 %	50 %	146337195
555	NC_009445	AGAT	2	8	25873	25880	50 %	25 %	25 %	0 %	146337195
556	NC_009445	TCG	2	6	25990	25995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337195
557	NC_009445	CGC	2	6	26003	26008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337195
558	NC_009445	GCA	2	6	26030	26035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337195
559	NC_009445	CAT	2	6	26043	26048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337195
560	NC_009445	CGC	2	6	26121	26126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337195
561	NC_009445	GC	3	6	26129	26134	0 %	0 %	50 %	50 %	146337195
562	NC_009445	GTCGAG	2	12	26172	26183	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146337195
563	NC_009445	CG	3	6	26367	26372	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
564	NC_009445	CGT	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337196
565	NC_009445	CGGG	2	8	26423	26430	0 %	0 %	75 %	25 %	146337196
566	NC_009445	CCT	2	6	26507	26512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337196
567	NC_009445	TGA	2	6	26534	26539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337196
568	NC_009445	CGG	2	6	26546	26551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337196
569	NC_009445	GCG	2	6	26588	26593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337196
570	NC_009445	GC	3	6	26613	26618	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
571	NC_009445	ATCG	2	8	26637	26644	25 %	25 %	25 %	25 %	146337196
572	NC_009445	CGGC	2	8	26687	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
573	NC_009445	CCA	2	6	26696	26701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337196
574	NC_009445	CGCGC	2	10	26724	26733	0 %	0 %	40 %	60 %	146337196
575	NC_009445	CG	3	6	26791	26796	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
576	NC_009445	ACC	2	6	26800	26805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337196
577	NC_009445	AGC	2	6	26836	26841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337196
578	NC_009445	ACC	2	6	26863	26868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337196
579	NC_009445	GGC	2	6	26892	26897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337196
580	NC_009445	TCC	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337196
581	NC_009445	GCC	2	6	26952	26957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337196
582	NC_009445	GGT	2	6	26985	26990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337196
583	NC_009445	GCCA	2	8	26996	27003	25 %	0 %	25 %	50 %	146337196
584	NC_009445	CAT	2	6	27005	27010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337196
585	NC_009445	GC	3	6	27057	27062	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
586	NC_009445	CAG	2	6	27067	27072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337196
587	NC_009445	CGC	2	6	27304	27309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337197
588	NC_009445	CTACAC	2	12	27436	27447	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146337197
589	NC_009445	TCG	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337197
590	NC_009445	CGA	2	6	27523	27528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337197
591	NC_009445	GTG	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337197
592	NC_009445	GGC	2	6	27572	27577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
593	NC_009445	CGG	2	6	27580	27585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
594	NC_009445	GGT	2	6	27589	27594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337197
595	NC_009445	GCG	2	6	27640	27645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
596	NC_009445	GGCC	2	8	27646	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
597	NC_009445	CTG	2	6	27668	27673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337197
598	NC_009445	GGC	2	6	27674	27679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
599	NC_009445	CGTGC	2	10	27691	27700	0 %	20 %	40 %	40 %	146337197
600	NC_009445	CGG	2	6	27706	27711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
601	NC_009445	TC	3	6	27724	27729	0 %	50 %	0 %	50 %	146337197
602	NC_009445	GCT	2	6	27739	27744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337197
603	NC_009445	CGA	2	6	27754	27759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337197
604	NC_009445	CG	3	6	27779	27784	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
605	NC_009445	GGC	2	6	27815	27820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
606	NC_009445	CG	4	8	27826	27833	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
607	NC_009445	GAG	2	6	27905	27910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337197
608	NC_009445	CCGCG	2	10	27916	27925	0 %	0 %	40 %	60 %	146337197
609	NC_009445	CG	4	8	27922	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
610	NC_009445	CTGG	2	8	27952	27959	0 %	25 %	50 %	25 %	146337197
611	NC_009445	CGA	2	6	27976	27981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337197
612	NC_009445	GC	3	6	27995	28000	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
613	NC_009445	GCC	2	6	28007	28012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337197
614	NC_009445	CGGC	2	8	28029	28036	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
615	NC_009445	CGC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337197
616	NC_009445	GCG	3	9	28119	28127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
617	NC_009445	CG	3	6	28147	28152	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
618	NC_009445	GC	3	6	28191	28196	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
619	NC_009445	CTG	2	6	28214	28219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337197
620	NC_009445	GCG	2	6	28220	28225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337197
621	NC_009445	CGT	3	9	28439	28447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337198
622	NC_009445	GAT	2	6	28469	28474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337198
623	NC_009445	CGG	2	6	28476	28481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337198
624	NC_009445	CG	3	6	28579	28584	0 %	0 %	50 %	50 %	146337198
625	NC_009445	GCG	2	6	28606	28611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337198
626	NC_009445	CGGGC	2	10	28659	28668	0 %	0 %	60 %	40 %	146337198
627	NC_009445	GC	3	6	28672	28677	0 %	0 %	50 %	50 %	146337198
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754	NC_009445	GC	3	6	33957	33962	0 %	0 %	50 %	50 %	146337202
755	NC_009445	GC	3	6	34002	34007	0 %	0 %	50 %	50 %	146337202
756	NC_009445	CTC	2	6	34008	34013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337202
757	NC_009445	GAA	2	6	34017	34022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337202
758	NC_009445	GGC	2	6	34032	34037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337202
759	NC_009445	GC	4	8	34195	34202	0 %	0 %	50 %	50 %	146337202
760	NC_009445	GGC	2	6	34203	34208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337202
761	NC_009445	CGT	2	6	34221	34226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337202
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764	NC_009445	GCG	3	9	34396	34404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337202
765	NC_009445	GCCGC	2	10	34579	34588	0 %	0 %	40 %	60 %	146337203
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768	NC_009445	CGG	2	6	34699	34704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337203
769	NC_009445	GACC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	25 %	50 %	146337203
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779	NC_009445	CGA	2	6	35375	35380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337204
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781	NC_009445	GCC	2	6	35439	35444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337204
782	NC_009445	TGC	2	6	35500	35505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337204
783	NC_009445	CGC	2	6	35513	35518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337204
784	NC_009445	CCG	2	6	35611	35616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337204
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793	NC_009445	ATGC	2	8	35901	35908	25 %	25 %	25 %	25 %	146337204
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810	NC_009445	AAG	2	6	36417	36422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337204
811	NC_009445	GCG	2	6	36423	36428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337204
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832	NC_009445	CGA	2	6	37541	37546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337205
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1000	NC_009445	ATC	2	6	44425	44430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337211

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