MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009445	GCA	2	6	261196	261201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6002	NC_009445	GAT	2	6	261245	261250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337407
6003	NC_009445	GGC	2	6	261286	261291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337407
6004	NC_009445	CAC	2	6	261380	261385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337407
6005	NC_009445	GTCG	2	8	261515	261522	0 %	25 %	50 %	25 %	146337407
6006	NC_009445	GCC	2	6	261593	261598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337407
6007	NC_009445	TCG	2	6	261603	261608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6008	NC_009445	CTG	2	6	261614	261619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6009	NC_009445	CAG	2	6	261659	261664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6010	NC_009445	TCC	2	6	261735	261740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337407
6011	NC_009445	CCA	2	6	261751	261756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337407
6012	NC_009445	GCG	2	6	261784	261789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337407
6013	NC_009445	CGC	2	6	261808	261813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337407
6014	NC_009445	GC	3	6	261890	261895	0 %	0 %	50 %	50 %	146337407
6015	NC_009445	TCG	2	6	261948	261953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6016	NC_009445	AGC	2	6	261982	261987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6017	NC_009445	GC	4	8	261986	261993	0 %	0 %	50 %	50 %	146337407
6018	NC_009445	AGC	2	6	262011	262016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337407
6019	NC_009445	GCC	2	6	262034	262039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337407
6020	NC_009445	AGGC	2	8	262070	262077	25 %	0 %	50 %	25 %	146337407
6021	NC_009445	GCT	2	6	262208	262213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6022	NC_009445	GCG	3	9	262223	262231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337408
6023	NC_009445	GCA	2	6	262342	262347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6024	NC_009445	CGG	3	9	262375	262383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337408
6025	NC_009445	GAA	2	6	262394	262399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337408
6026	NC_009445	GCC	2	6	262403	262408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337408
6027	NC_009445	GCA	2	6	262420	262425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6028	NC_009445	CGGA	2	8	262469	262476	25 %	0 %	50 %	25 %	146337408
6029	NC_009445	CGG	2	6	262481	262486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337408
6030	NC_009445	GAA	2	6	262538	262543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337408
6031	NC_009445	GCC	2	6	262562	262567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337408
6032	NC_009445	CAC	2	6	262578	262583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337408
6033	NC_009445	CGC	2	6	262600	262605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337408
6034	NC_009445	GAC	3	9	262616	262624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6035	NC_009445	CGGC	2	8	262631	262638	0 %	0 %	50 %	50 %	146337408
6036	NC_009445	AGC	2	6	262695	262700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6037	NC_009445	CAG	2	6	262727	262732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337408
6038	NC_009445	CAC	2	6	262757	262762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337408
6039	NC_009445	GAT	2	6	262769	262774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337408
6040	NC_009445	CGC	2	6	262808	262813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337408
6041	NC_009445	CG	4	8	262816	262823	0 %	0 %	50 %	50 %	146337408
6042	NC_009445	GCG	2	6	262884	262889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337408
6043	NC_009445	CGAGCG	2	12	262936	262947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146337408
6044	NC_009445	CCGGT	2	10	262965	262974	0 %	20 %	40 %	40 %	146337408
6045	NC_009445	GGC	2	6	263043	263048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337409
6046	NC_009445	GCG	2	6	263059	263064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337409
6047	NC_009445	CGGC	2	8	263079	263086	0 %	0 %	50 %	50 %	146337409
6048	NC_009445	CGGC	2	8	263091	263098	0 %	0 %	50 %	50 %	146337409
6049	NC_009445	GGC	2	6	263155	263160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337409
6050	NC_009445	CGC	2	6	263233	263238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337409
6051	NC_009445	TGA	2	6	263284	263289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337409
6052	NC_009445	CAG	2	6	263297	263302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337409
6053	NC_009445	GAAGCC	2	12	263336	263347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337409
6054	NC_009445	ATG	2	6	263349	263354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337409
6055	NC_009445	CAC	2	6	263423	263428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337409
6056	NC_009445	CGA	2	6	263440	263445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337409
6057	NC_009445	CGATCA	2	12	263470	263481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146337409
6058	NC_009445	GGC	2	6	263482	263487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337409
6059	NC_009445	AATC	2	8	263652	263659	50 %	25 %	0 %	25 %	146337410
6060	NC_009445	CATCGC	2	12	263663	263674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337410
6061	NC_009445	GC	3	6	263673	263678	0 %	0 %	50 %	50 %	146337410
6062	NC_009445	GGC	2	6	263735	263740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337410
6063	NC_009445	G	6	6	263758	263763	0 %	0 %	100 %	0 %	146337410
6064	NC_009445	GAG	2	6	263775	263780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337410
6065	NC_009445	AGC	2	6	263901	263906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6066	NC_009445	CAG	2	6	263912	263917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6067	NC_009445	CGT	2	6	263923	263928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6068	NC_009445	GCG	2	6	263975	263980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337410
6069	NC_009445	GCA	2	6	264016	264021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6070	NC_009445	TCG	2	6	264072	264077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6071	NC_009445	GC	3	6	264126	264131	0 %	0 %	50 %	50 %	146337410
6072	NC_009445	ACG	2	6	264144	264149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6073	NC_009445	GCG	3	9	264170	264178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337410
6074	NC_009445	GATGCC	2	12	264182	264193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337410
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6076	NC_009445	GCCCAT	2	12	264254	264265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337410
6077	NC_009445	TGA	2	6	264280	264285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337410
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6079	NC_009445	CGA	2	6	264355	264360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6080	NC_009445	CGGT	2	8	264462	264469	0 %	25 %	50 %	25 %	146337410
6081	NC_009445	GTC	2	6	264512	264517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6082	NC_009445	AGC	2	6	264534	264539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337410
6083	NC_009445	TCG	2	6	264648	264653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337410
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6087	NC_009445	CG	4	8	264758	264765	0 %	0 %	50 %	50 %	146337410
6088	NC_009445	CGG	2	6	264791	264796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337410
6089	NC_009445	GCG	3	9	264831	264839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337410
6090	NC_009445	GCG	2	6	264984	264989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337411
6091	NC_009445	CGTC	2	8	265043	265050	0 %	25 %	25 %	50 %	146337411
6092	NC_009445	TCC	3	9	265123	265131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337411
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6095	NC_009445	GGA	2	6	265329	265334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337411
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6099	NC_009445	GCG	3	9	266052	266060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337412
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6101	NC_009445	TGA	2	6	266080	266085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337412
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6105	NC_009445	GC	4	8	266224	266231	0 %	0 %	50 %	50 %	146337412
6106	NC_009445	ATC	2	6	266275	266280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337412
6107	NC_009445	GCC	2	6	266295	266300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337412
6108	NC_009445	CAT	4	12	266303	266314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337412
6109	NC_009445	ACGGC	2	10	266317	266326	20 %	0 %	40 %	40 %	146337412
6110	NC_009445	CGGC	2	8	266389	266396	0 %	0 %	50 %	50 %	146337412
6111	NC_009445	CCT	2	6	266458	266463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337412
6112	NC_009445	GAAG	2	8	266534	266541	50 %	0 %	50 %	0 %	146337412
6113	NC_009445	CAT	2	6	266576	266581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337412
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6118	NC_009445	CCG	2	6	266857	266862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337412
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6120	NC_009445	GAC	2	6	267448	267453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337413
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6362	NC_009445	GTC	2	6	277400	277405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337422
6363	NC_009445	CTG	2	6	277445	277450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337422
6364	NC_009445	CCGT	2	8	277455	277462	0 %	25 %	25 %	50 %	146337422
6365	NC_009445	GCG	2	6	277585	277590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337422
6366	NC_009445	ATC	2	6	277593	277598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337422
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6477	NC_009445	GATC	2	8	282320	282327	25 %	25 %	25 %	25 %	146337428
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6480	NC_009445	CGA	2	6	282416	282421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337428
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6482	NC_009445	ACA	2	6	282490	282495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337428
6483	NC_009445	ACC	2	6	282523	282528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337428
6484	NC_009445	GCA	2	6	282556	282561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337428
6485	NC_009445	CG	3	6	282566	282571	0 %	0 %	50 %	50 %	146337428
6486	NC_009445	CGG	2	6	282626	282631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337428
6487	NC_009445	GGC	2	6	282653	282658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337428
6488	NC_009445	CGA	2	6	282689	282694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337428
6489	NC_009445	GCT	2	6	282704	282709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337428
6490	NC_009445	GC	3	6	282818	282823	0 %	0 %	50 %	50 %	146337428
6491	NC_009445	CGC	2	6	282830	282835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337428
6492	NC_009445	GAT	2	6	282843	282848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337428
6493	NC_009445	GGCGA	2	10	282864	282873	20 %	0 %	60 %	20 %	146337428
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6495	NC_009445	GC	3	6	282906	282911	0 %	0 %	50 %	50 %	146337428
6496	NC_009445	GC	3	6	282923	282928	0 %	0 %	50 %	50 %	146337428
6497	NC_009445	CCA	2	6	283132	283137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337429
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6499	NC_009445	CAG	2	6	283232	283237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337429
6500	NC_009445	C	6	6	283249	283254	0 %	0 %	0 %	100 %	146337429

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