MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE01

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009230	CGATC	2	10	1583	1592	20 %	20 %	20 %	40 %	134288154
2	NC_009230	CTCGT	2	10	2811	2820	0 %	40 %	20 %	40 %	134288156
3	NC_009230	CGGCC	2	10	7009	7018	0 %	0 %	40 %	60 %	134288161
4	NC_009230	GCAAG	2	10	7335	7344	40 %	0 %	40 %	20 %	134288161
5	NC_009230	CGCTG	2	10	9771	9780	0 %	20 %	40 %	40 %	134288162
6	NC_009230	TGCCG	2	10	9956	9965	0 %	20 %	40 %	40 %	134288163
7	NC_009230	GTCCG	2	10	11425	11434	0 %	20 %	40 %	40 %	134288165
8	NC_009230	CCGGG	2	10	11979	11988	0 %	0 %	60 %	40 %	134288165
9	NC_009230	GAAGC	2	10	12286	12295	40 %	0 %	40 %	20 %	134288166
10	NC_009230	CCGGG	2	10	13922	13931	0 %	0 %	60 %	40 %	134288168
11	NC_009230	GTCTT	2	10	16215	16224	0 %	60 %	20 %	20 %	134288170
12	NC_009230	CCGGA	2	10	16400	16409	20 %	0 %	40 %	40 %	134288170
13	NC_009230	GCTGG	2	10	17248	17257	0 %	20 %	60 %	20 %	134288172
14	NC_009230	TTTGT	2	10	17603	17612	0 %	80 %	20 %	0 %	134288172
15	NC_009230	CAGAT	2	10	17745	17754	40 %	20 %	20 %	20 %	134288172
16	NC_009230	GTGGG	2	10	18004	18013	0 %	20 %	80 %	0 %	134288172
17	NC_009230	TGTCC	2	10	18556	18565	0 %	40 %	20 %	40 %	134288173
18	NC_009230	CAATC	2	10	18838	18847	40 %	20 %	0 %	40 %	134288173
19	NC_009230	ACGTG	2	10	20153	20162	20 %	20 %	40 %	20 %	134288174
20	NC_009230	TCTGA	2	10	20488	20497	20 %	40 %	20 %	20 %	134288174
21	NC_009230	GTTGC	2	10	21246	21255	0 %	40 %	40 %	20 %	134288175
22	NC_009230	GTGCT	2	10	23964	23973	0 %	40 %	40 %	20 %	134288177
23	NC_009230	GCGCA	2	10	25845	25854	20 %	0 %	40 %	40 %	134288178
24	NC_009230	GCACG	2	10	26192	26201	20 %	0 %	40 %	40 %	134288178
25	NC_009230	CAGCG	2	10	29592	29601	20 %	0 %	40 %	40 %	134288181
26	NC_009230	CGGCG	2	10	30228	30237	0 %	0 %	60 %	40 %	134288181
27	NC_009230	GTCGA	2	10	37805	37814	20 %	20 %	40 %	20 %	134288191
28	NC_009230	CGACG	2	10	39617	39626	20 %	0 %	40 %	40 %	134288192
29	NC_009230	CTGCT	2	10	40244	40253	0 %	40 %	20 %	40 %	134288192
30	NC_009230	TCGGC	2	10	41228	41237	0 %	20 %	40 %	40 %	134288193
31	NC_009230	GCTTG	2	10	41492	41501	0 %	40 %	40 %	20 %	134288193
32	NC_009230	CCCGA	2	10	42385	42394	20 %	0 %	20 %	60 %	134288194
33	NC_009230	GCCGC	2	10	43373	43382	0 %	0 %	40 %	60 %	134288195
34	NC_009230	CGTGA	2	10	44272	44281	20 %	20 %	40 %	20 %	134288196
35	NC_009230	GATCC	2	10	47026	47035	20 %	20 %	20 %	40 %	134288199
36	NC_009230	AGCGT	2	10	50035	50044	20 %	20 %	40 %	20 %	134288201
37	NC_009230	CATGT	2	10	50904	50913	20 %	40 %	20 %	20 %	134288202
38	NC_009230	GAGTT	2	10	51541	51550	20 %	40 %	40 %	0 %	134288202
39	NC_009230	TTCGA	2	10	58801	58810	20 %	40 %	20 %	20 %	134288209
40	NC_009230	CGGCG	2	10	60914	60923	0 %	0 %	60 %	40 %	134288209
41	NC_009230	ACGGA	2	10	61934	61943	40 %	0 %	40 %	20 %	134288210
42	NC_009230	GAGCC	2	10	62062	62071	20 %	0 %	40 %	40 %	134288210
43	NC_009230	CGCGC	2	10	62352	62361	0 %	0 %	40 %	60 %	134288211
44	NC_009230	CGCGA	2	10	62496	62505	20 %	0 %	40 %	40 %	134288211
45	NC_009230	CGACC	2	10	67372	67381	20 %	0 %	20 %	60 %	134288214
46	NC_009230	TTCGC	2	10	69851	69860	0 %	40 %	20 %	40 %	134288216
47	NC_009230	CAAGT	2	10	71628	71637	40 %	20 %	20 %	20 %	134288218
48	NC_009230	ACCGC	2	10	75506	75515	20 %	0 %	20 %	60 %	134288220
49	NC_009230	AAGAC	2	10	76100	76109	60 %	0 %	20 %	20 %	134288220
50	NC_009230	TCGAT	2	10	77738	77747	20 %	40 %	20 %	20 %	134288222
51	NC_009230	ATCGC	2	10	78761	78770	20 %	20 %	20 %	40 %	134288223
52	NC_009230	TCGCC	2	10	83570	83579	0 %	20 %	20 %	60 %	134288228
53	NC_009230	GCGCC	2	10	84644	84653	0 %	0 %	40 %	60 %	134288229
54	NC_009230	GCAGC	2	10	84949	84958	20 %	0 %	40 %	40 %	134288229
55	NC_009230	CGCTC	2	10	87212	87221	0 %	20 %	20 %	60 %	134288231
56	NC_009230	CAACG	2	10	88912	88921	40 %	0 %	20 %	40 %	134288232
57	NC_009230	GCGCC	2	10	89939	89948	0 %	0 %	40 %	60 %	134288233
58	NC_009230	AACGG	2	10	90938	90947	40 %	0 %	40 %	20 %	134288234
59	NC_009230	GGCAG	2	10	91723	91732	20 %	0 %	60 %	20 %	134288234
60	NC_009230	GCTGC	2	10	91931	91940	0 %	20 %	40 %	40 %	134288234
61	NC_009230	CTGAT	2	10	92280	92289	20 %	40 %	20 %	20 %	134288235
62	NC_009230	ATGCG	2	10	92637	92646	20 %	20 %	40 %	20 %	134288235
63	NC_009230	GCTTC	2	10	93636	93645	0 %	40 %	20 %	40 %	134288236
64	NC_009230	AGGCG	2	10	97066	97075	20 %	0 %	60 %	20 %	134288238
65	NC_009230	CGGAT	2	10	97250	97259	20 %	20 %	40 %	20 %	134288238
66	NC_009230	GCTGA	2	10	99645	99654	20 %	20 %	40 %	20 %	134288239
67	NC_009230	AAGCC	2	10	100393	100402	40 %	0 %	20 %	40 %	134288239
68	NC_009230	AAAAC	2	10	101841	101850	80 %	0 %	0 %	20 %	134288241
69	NC_009230	TCTGA	2	10	105296	105305	20 %	40 %	20 %	20 %	134288246
70	NC_009230	CCCGC	2	10	111190	111199	0 %	0 %	20 %	80 %	134288250
71	NC_009230	GATGA	2	10	111393	111402	40 %	20 %	40 %	0 %	134288250
72	NC_009230	CGGAC	2	10	111840	111849	20 %	0 %	40 %	40 %	134288251
73	NC_009230	CCATT	2	10	115528	115537	20 %	40 %	0 %	40 %	134288255
74	NC_009230	CGCGG	2	10	116955	116964	0 %	0 %	60 %	40 %	134288256
75	NC_009230	AGCAC	2	10	121438	121447	40 %	0 %	20 %	40 %	134288259
76	NC_009230	CCGCG	2	10	121793	121802	0 %	0 %	40 %	60 %	134288259
77	NC_009230	CCCGA	2	10	123997	124006	20 %	0 %	20 %	60 %	134288262
78	NC_009230	AGCCG	2	10	125415	125424	20 %	0 %	40 %	40 %	134288262
79	NC_009230	CTTGC	2	10	126481	126490	0 %	40 %	20 %	40 %	134288264
80	NC_009230	AAAGC	2	10	126704	126713	60 %	0 %	20 %	20 %	134288264
81	NC_009230	CTTGC	2	10	130494	130503	0 %	40 %	20 %	40 %	134288268
82	NC_009230	TCGGT	2	10	133023	133032	0 %	40 %	40 %	20 %	134288270
83	NC_009230	TCAAA	2	10	133980	133989	60 %	20 %	0 %	20 %	134288271
84	NC_009230	TCGGG	2	10	136082	136091	0 %	20 %	60 %	20 %	134288272
85	NC_009230	CGGAG	2	10	136135	136144	20 %	0 %	60 %	20 %	134288272
86	NC_009230	CAGAA	2	10	136407	136416	60 %	0 %	20 %	20 %	134288273
87	NC_009230	TTCAT	2	10	138683	138692	20 %	60 %	0 %	20 %	134288276
88	NC_009230	CGACG	2	10	139039	139048	20 %	0 %	40 %	40 %	134288276
89	NC_009230	ATGGT	2	10	139131	139140	20 %	40 %	40 %	0 %	134288276
90	NC_009230	AAGCC	2	10	141084	141093	40 %	0 %	20 %	40 %	134288277
91	NC_009230	GAGAA	2	10	142434	142443	60 %	0 %	40 %	0 %	134288277
92	NC_009230	TCGAA	2	10	144782	144791	40 %	20 %	20 %	20 %	134288279
93	NC_009230	TCGCT	2	10	146779	146788	0 %	40 %	20 %	40 %	134288282
94	NC_009230	CCCTT	2	10	148051	148060	0 %	40 %	0 %	60 %	134288282
95	NC_009230	AATGC	2	10	152247	152256	40 %	20 %	20 %	20 %	134288286
96	NC_009230	CCCAG	2	10	153105	153114	20 %	0 %	20 %	60 %	134288288
97	NC_009230	TGCGA	2	10	153882	153891	20 %	20 %	40 %	20 %	134288289
98	NC_009230	TCGAA	2	10	155413	155422	40 %	20 %	20 %	20 %	134288291
99	NC_009230	GCTCG	2	10	156365	156374	0 %	20 %	40 %	40 %	134288291
100	NC_009230	CAGCA	2	10	157787	157796	40 %	0 %	20 %	40 %	134288292
101	NC_009230	TCCAT	2	10	159605	159614	20 %	40 %	0 %	40 %	134288294
102	NC_009230	GGCTT	2	10	160177	160186	0 %	40 %	40 %	20 %	134288295
103	NC_009230	GGCGA	2	10	161250	161259	20 %	0 %	60 %	20 %	134288295
104	NC_009230	TCCCT	2	10	162892	162901	0 %	40 %	0 %	60 %	134288296
105	NC_009230	CCTTC	2	10	164127	164136	0 %	40 %	0 %	60 %	134288296
106	NC_009230	TCACC	2	10	165891	165900	20 %	20 %	0 %	60 %	134288298
107	NC_009230	CTTCG	2	10	166057	166066	0 %	40 %	20 %	40 %	134288298
108	NC_009230	GATCG	2	10	166854	166863	20 %	20 %	40 %	20 %	134288299
109	NC_009230	GCTCG	2	10	170082	170091	0 %	20 %	40 %	40 %	134288304
110	NC_009230	TAGTG	2	10	172239	172248	20 %	40 %	40 %	0 %	134288305
111	NC_009230	GGATG	2	10	174740	174749	20 %	20 %	60 %	0 %	134288307
112	NC_009230	TCGGC	2	10	176298	176307	0 %	20 %	40 %	40 %	134288308
113	NC_009230	GCTTG	2	10	176562	176571	0 %	40 %	40 %	20 %	134288308
114	NC_009230	GAACT	2	10	181668	181677	40 %	20 %	20 %	20 %	134288312
115	NC_009230	ATTCG	2	10	184193	184202	20 %	40 %	20 %	20 %	134288314
116	NC_009230	GACCG	2	10	187449	187458	20 %	0 %	40 %	40 %	134288316
117	NC_009230	TCGCC	2	10	189997	190006	0 %	20 %	20 %	60 %	134288318
118	NC_009230	CAAGC	2	10	191206	191215	40 %	0 %	20 %	40 %	134288319
119	NC_009230	GCCGA	2	10	191470	191479	20 %	0 %	40 %	40 %	134288319
120	NC_009230	CCCGG	2	10	192680	192689	0 %	0 %	40 %	60 %	134288321
121	NC_009230	GCGCG	2	10	192955	192964	0 %	0 %	60 %	40 %	134288321
122	NC_009230	CGATC	2	10	193204	193213	20 %	20 %	20 %	40 %	134288321
123	NC_009230	CGCGT	2	10	193802	193811	0 %	20 %	40 %	40 %	134288321
124	NC_009230	CGCGT	2	10	196504	196513	0 %	20 %	40 %	40 %	134288322
125	NC_009230	CGCTG	2	10	198680	198689	0 %	20 %	40 %	40 %	134288324
126	NC_009230	CTCGC	2	10	199628	199637	0 %	20 %	20 %	60 %	134288325
127	NC_009230	GATTC	2	10	202988	202997	20 %	40 %	20 %	20 %	134288327
128	NC_009230	GACGG	2	10	206110	206119	20 %	0 %	60 %	20 %	134288328
129	NC_009230	CCGAT	2	10	206300	206309	20 %	20 %	20 %	40 %	134288328
130	NC_009230	TTTTC	2	10	209439	209448	0 %	80 %	0 %	20 %	134288329
131	NC_009230	GAAGA	2	10	210195	210204	60 %	0 %	40 %	0 %	134288329
132	NC_009230	CGAGC	2	10	210338	210347	20 %	0 %	40 %	40 %	134288329
133	NC_009230	CGTGT	2	10	210879	210888	0 %	40 %	40 %	20 %	134288330
134	NC_009230	ATCGA	2	10	212723	212732	40 %	20 %	20 %	20 %	134288332
135	NC_009230	ATGAA	2	10	214568	214577	60 %	20 %	20 %	0 %	134288333
136	NC_009230	CAAGC	2	10	216761	216770	40 %	0 %	20 %	40 %	134288336
137	NC_009230	GCCGA	2	10	217025	217034	20 %	0 %	40 %	40 %	134288336
138	NC_009230	GCTCT	2	10	217571	217580	0 %	40 %	20 %	40 %	134288337
139	NC_009230	GAGGT	2	10	219830	219839	20 %	20 %	60 %	0 %	134288339
140	NC_009230	CGGCG	2	10	220755	220764	0 %	0 %	60 %	40 %	134288340
141	NC_009230	CACTA	2	10	223271	223280	40 %	20 %	0 %	40 %	134288343
142	NC_009230	AACGG	2	10	227258	227267	40 %	0 %	40 %	20 %	134288346
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144	NC_009230	GCATC	2	10	228546	228555	20 %	20 %	20 %	40 %	134288348
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150	NC_009230	GCCGA	2	10	239458	239467	20 %	0 %	40 %	40 %	134288362
151	NC_009230	CAGCC	2	10	241037	241046	20 %	0 %	20 %	60 %	134288365
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156	NC_009230	GGGCG	2	10	252291	252300	0 %	0 %	80 %	20 %	134288380
157	NC_009230	CTGGG	2	10	252472	252481	0 %	20 %	60 %	20 %	134288380
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160	NC_009230	GTGTC	2	10	253360	253369	0 %	40 %	40 %	20 %	134288381
161	NC_009230	GGTGA	2	10	253635	253644	20 %	20 %	60 %	0 %	134288381
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166	NC_009230	TGAAG	2	10	261024	261033	40 %	20 %	40 %	0 %	134288392
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172	NC_009230	GATCG	2	10	270429	270438	20 %	20 %	40 %	20 %	134288408
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178	NC_009230	CGGGA	2	10	280061	280070	20 %	0 %	60 %	20 %	134288417
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194	NC_009230	GTGGC	2	10	306731	306740	0 %	20 %	60 %	20 %	134288443
195	NC_009230	GAGCT	2	10	307439	307448	20 %	20 %	40 %	20 %	134288443
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244	NC_009230	TGTCA	2	10	391558	391567	20 %	40 %	20 %	20 %	134288548
245	NC_009230	GTCGA	2	10	393974	393983	20 %	20 %	40 %	20 %	134288550
246	NC_009230	ATGGC	2	10	394438	394447	20 %	20 %	40 %	20 %	134288551

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.