MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE04

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009228	GTACAC	2	12	6199	6210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287796
2	NC_009228	TCGGCA	2	12	6710	6721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287798
3	NC_009228	CGACTG	2	12	12816	12827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287807
4	NC_009228	CGGGGC	2	12	15704	15715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287810
5	NC_009228	TTGGGC	2	12	20048	20059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134287812
6	NC_009228	CCTTGC	2	12	20312	20323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	134287813
7	NC_009228	CGAGGT	2	12	21429	21440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134287815
8	NC_009228	CGTCGA	2	12	26489	26500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287820
9	NC_009228	ACTGGC	2	12	28338	28349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287821
10	NC_009228	TTCGCG	2	12	29467	29478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287821
11	NC_009228	AATCGT	2	12	29910	29921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134287821
12	NC_009228	CTGATG	2	12	30352	30363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287822
13	NC_009228	CAGCCA	2	12	30440	30451	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134287822
14	NC_009228	TGCGCG	2	12	34013	34024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134287824
15	NC_009228	ATCCGC	2	12	39622	39633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134287830
16	NC_009228	ATGCGA	2	12	40755	40766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134287831
17	NC_009228	CTATAA	2	12	45059	45070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134287836
18	NC_009228	GGTGCG	2	12	52944	52955	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	134287845
19	NC_009228	GCGGAA	2	12	55122	55133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134287849
20	NC_009228	TGCCGA	2	12	62341	62352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287855
21	NC_009228	TCGCAT	2	12	65457	65468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134287857
22	NC_009228	GCGCTG	2	12	66498	66509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134287859
23	NC_009228	CATGGC	2	12	67743	67754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287859
24	NC_009228	CGAACT	2	12	77783	77794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287871
25	NC_009228	CGTCAG	2	12	80805	80816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287874
26	NC_009228	GCCGCA	2	12	81272	81283	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134287874
27	NC_009228	ATCGGC	2	12	81360	81371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287874
28	NC_009228	TCCTCG	2	12	85846	85857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	134287881
29	NC_009228	GGCATC	2	12	86013	86024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287881
30	NC_009228	CGCCTT	2	12	91261	91272	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	134287887
31	NC_009228	TTGTCC	2	12	91412	91423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	134287887
32	NC_009228	CTGCGC	2	12	92496	92507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287888
33	NC_009228	TCAGGA	2	12	93554	93565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134287888
34	NC_009228	GAAGCC	2	12	98964	98975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287893
35	NC_009228	AGGACA	2	12	99751	99762	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134287893
36	NC_009228	TTCGAA	2	12	100653	100664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134287893
37	NC_009228	CGCGAG	2	12	102855	102866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287894
38	NC_009228	GCGCTC	2	12	103133	103144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287895
39	NC_009228	GCCGAG	2	12	103181	103192	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287895
40	NC_009228	GATCGC	2	12	103276	103287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287895

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.