MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE02

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009227	CGGTG	2	10	1779	1788	0 %	20 %	60 %	20 %	134287532
2	NC_009227	GCGCC	2	10	6135	6144	0 %	0 %	40 %	60 %	134287535
3	NC_009227	TCGCC	2	10	8260	8269	0 %	20 %	20 %	60 %	134287538
4	NC_009227	CAGGT	2	10	8369	8378	20 %	20 %	40 %	20 %	134287538
5	NC_009227	GGTCG	2	10	9381	9390	0 %	20 %	60 %	20 %	134287540
6	NC_009227	GCCAT	2	10	10794	10803	20 %	20 %	20 %	40 %	134287541
7	NC_009227	GCCGA	2	10	14632	14641	20 %	0 %	40 %	40 %	134287545
8	NC_009227	TGCAG	2	10	15038	15047	20 %	20 %	40 %	20 %	134287545
9	NC_009227	CACCG	2	10	15232	15241	20 %	0 %	20 %	60 %	134287545
10	NC_009227	CGAAG	2	10	16333	16342	40 %	0 %	40 %	20 %	134287546
11	NC_009227	CGCGG	2	10	16733	16742	0 %	0 %	60 %	40 %	134287546
12	NC_009227	ACGCG	2	10	17223	17232	20 %	0 %	40 %	40 %	134287546
13	NC_009227	CGACA	2	10	23141	23150	40 %	0 %	20 %	40 %	134287552
14	NC_009227	CTTTG	2	10	25279	25288	0 %	60 %	20 %	20 %	134287553
15	NC_009227	GATCA	2	10	26728	26737	40 %	20 %	20 %	20 %	134287554
16	NC_009227	GCGAT	2	10	27109	27118	20 %	20 %	40 %	20 %	134287555
17	NC_009227	TGCCG	2	10	27689	27698	0 %	20 %	40 %	40 %	134287555
18	NC_009227	CGAAT	2	10	29566	29575	40 %	20 %	20 %	20 %	134287557
19	NC_009227	CTGGA	2	10	30408	30417	20 %	20 %	40 %	20 %	134287558
20	NC_009227	GATTC	2	10	30738	30747	20 %	40 %	20 %	20 %	134287558
21	NC_009227	GAGCG	2	10	30845	30854	20 %	0 %	60 %	20 %	134287558
22	NC_009227	GCACC	2	10	32289	32298	20 %	0 %	20 %	60 %	134287561
23	NC_009227	TCACG	2	10	34693	34702	20 %	20 %	20 %	40 %	134287562
24	NC_009227	CGAGT	2	10	34742	34751	20 %	20 %	40 %	20 %	134287562
25	NC_009227	CGTGG	2	10	35563	35572	0 %	20 %	60 %	20 %	134287563
26	NC_009227	GCCGA	2	10	35895	35904	20 %	0 %	40 %	40 %	134287564
27	NC_009227	ACGTG	2	10	37499	37508	20 %	20 %	40 %	20 %	134287564
28	NC_009227	TGCGC	2	10	37999	38008	0 %	20 %	40 %	40 %	134287565
29	NC_009227	CGATG	2	10	38581	38590	20 %	20 %	40 %	20 %	134287565
30	NC_009227	ATTCG	2	10	39573	39582	20 %	40 %	20 %	20 %	134287566
31	NC_009227	GACCG	2	10	39936	39945	20 %	0 %	40 %	40 %	134287567
32	NC_009227	CTCGG	2	10	40055	40064	0 %	20 %	40 %	40 %	134287567
33	NC_009227	CGATC	2	10	40605	40614	20 %	20 %	20 %	40 %	134287567
34	NC_009227	GCAAT	2	10	41118	41127	40 %	20 %	20 %	20 %	134287568
35	NC_009227	TGGAA	2	10	41182	41191	40 %	20 %	40 %	0 %	134287568
36	NC_009227	GCGCT	2	10	42137	42146	0 %	20 %	40 %	40 %	134287569
37	NC_009227	CCCGG	2	10	46631	46640	0 %	0 %	40 %	60 %	134287573
38	NC_009227	GCGTC	2	10	49562	49571	0 %	20 %	40 %	40 %	134287578
39	NC_009227	CGACG	2	10	50017	50026	20 %	0 %	40 %	40 %	134287579
40	NC_009227	TGGCT	2	10	51552	51561	0 %	40 %	40 %	20 %	134287581
41	NC_009227	GCGCC	2	10	52633	52642	0 %	0 %	40 %	60 %	134287584
42	NC_009227	GACGA	2	10	55940	55949	40 %	0 %	40 %	20 %	134287586
43	NC_009227	TGCGC	2	10	56703	56712	0 %	20 %	40 %	40 %	134287587
44	NC_009227	AATCG	2	10	57048	57057	40 %	20 %	20 %	20 %	134287587
45	NC_009227	ATGCC	2	10	57420	57429	20 %	20 %	20 %	40 %	134287587
46	NC_009227	GCCGC	2	10	58827	58836	0 %	0 %	40 %	60 %	134287588
47	NC_009227	GGCAG	2	10	60604	60613	20 %	0 %	60 %	20 %	134287590
48	NC_009227	CGGTT	2	10	63811	63820	0 %	40 %	40 %	20 %	134287594
49	NC_009227	GACGC	2	10	63950	63959	20 %	0 %	40 %	40 %	134287594
50	NC_009227	AAGCG	2	10	65141	65150	40 %	0 %	40 %	20 %	134287595
51	NC_009227	CATCG	2	10	65646	65655	20 %	20 %	20 %	40 %	134287596
52	NC_009227	CGTTG	2	10	65889	65898	0 %	40 %	40 %	20 %	134287596
53	NC_009227	GGTCA	2	10	66627	66636	20 %	20 %	40 %	20 %	134287597
54	NC_009227	AGCCG	2	10	68321	68330	20 %	0 %	40 %	40 %	134287600
55	NC_009227	TGGGA	2	10	68741	68750	20 %	20 %	60 %	0 %	134287601
56	NC_009227	TGATC	2	10	70638	70647	20 %	40 %	20 %	20 %	134287603
57	NC_009227	CTGGT	2	10	72649	72658	0 %	40 %	40 %	20 %	134287606
58	NC_009227	CGAGC	2	10	73176	73185	20 %	0 %	40 %	40 %	134287606
59	NC_009227	GCGTC	2	10	77305	77314	0 %	20 %	40 %	40 %	134287610
60	NC_009227	ATCAC	2	10	78073	78082	40 %	20 %	0 %	40 %	134287612
61	NC_009227	AGTCG	2	10	82891	82900	20 %	20 %	40 %	20 %	134287615
62	NC_009227	CGAAC	2	10	86234	86243	40 %	0 %	20 %	40 %	134287618
63	NC_009227	GACGG	2	10	86452	86461	20 %	0 %	60 %	20 %	134287618
64	NC_009227	GGCCG	2	10	88338	88347	0 %	0 %	60 %	40 %	134287620
65	NC_009227	TCGAG	2	10	89614	89623	20 %	20 %	40 %	20 %	134287620
66	NC_009227	AGGGC	2	10	93172	93181	20 %	0 %	60 %	20 %	134287625
67	NC_009227	CTTCG	2	10	93932	93941	0 %	40 %	20 %	40 %	134287625
68	NC_009227	ACTTC	2	10	94067	94076	20 %	40 %	0 %	40 %	134287625
69	NC_009227	GCACG	2	10	95432	95441	20 %	0 %	40 %	40 %	134287627
70	NC_009227	CGGGA	2	10	96960	96969	20 %	0 %	60 %	20 %	134287629
71	NC_009227	GCGAG	2	10	98441	98450	20 %	0 %	60 %	20 %	134287629
72	NC_009227	GCTGT	2	10	99822	99831	0 %	40 %	40 %	20 %	134287630
73	NC_009227	CATGC	2	10	101526	101535	20 %	20 %	20 %	40 %	134287632
74	NC_009227	CAAGC	2	10	102295	102304	40 %	0 %	20 %	40 %	134287633
75	NC_009227	GCCGA	2	10	102559	102568	20 %	0 %	40 %	40 %	134287633
76	NC_009227	CGATT	2	10	103662	103671	20 %	40 %	20 %	20 %	134287635
77	NC_009227	GCCGA	2	10	104570	104579	20 %	0 %	40 %	40 %	134287636
78	NC_009227	CGCGA	2	10	107749	107758	20 %	0 %	40 %	40 %	134287639
79	NC_009227	AGCCG	2	10	108034	108043	20 %	0 %	40 %	40 %	134287639
80	NC_009227	GAGCC	2	10	109481	109490	20 %	0 %	40 %	40 %	134287640
81	NC_009227	TCGCC	2	10	113929	113938	0 %	20 %	20 %	60 %	134287648
82	NC_009227	GCGCG	2	10	116541	116550	0 %	0 %	60 %	40 %	134287652
83	NC_009227	GCCAT	2	10	117562	117571	20 %	20 %	20 %	40 %	134287653
84	NC_009227	CGCGG	2	10	118539	118548	0 %	0 %	60 %	40 %	134287654
85	NC_009227	AGCGA	2	10	120140	120149	40 %	0 %	40 %	20 %	134287656
86	NC_009227	CGCGC	2	10	121838	121847	0 %	0 %	40 %	60 %	134287658
87	NC_009227	CGGGC	2	10	121933	121942	0 %	0 %	60 %	40 %	134287658
88	NC_009227	GCGCA	2	10	122345	122354	20 %	0 %	40 %	40 %	134287658
89	NC_009227	CGTGC	2	10	122552	122561	0 %	20 %	40 %	40 %	134287658
90	NC_009227	CAGAT	2	10	123459	123468	40 %	20 %	20 %	20 %	134287658
91	NC_009227	GCGCG	2	10	123757	123766	0 %	0 %	60 %	40 %	134287658
92	NC_009227	GTGGC	2	10	124335	124344	0 %	20 %	60 %	20 %	134287658
93	NC_009227	CGCGC	2	10	124901	124910	0 %	0 %	40 %	60 %	134287658
94	NC_009227	TGCGT	2	10	125206	125215	0 %	40 %	40 %	20 %	134287658
95	NC_009227	TCGCG	2	10	127858	127867	0 %	20 %	40 %	40 %	134287661
96	NC_009227	CAGCC	2	10	131362	131371	20 %	0 %	20 %	60 %	134287664
97	NC_009227	CGGCT	2	10	135863	135872	0 %	20 %	40 %	40 %	134287667
98	NC_009227	GCTAC	2	10	136087	136096	20 %	20 %	20 %	40 %	134287667
99	NC_009227	CGTCT	2	10	137417	137426	0 %	40 %	20 %	40 %	134287669
100	NC_009227	CCATT	2	10	138427	138436	20 %	40 %	0 %	40 %	134287670
101	NC_009227	CGGCG	2	10	138868	138877	0 %	0 %	60 %	40 %	134287671
102	NC_009227	GGCAA	2	10	140980	140989	40 %	0 %	40 %	20 %	134287672
103	NC_009227	CGCTG	2	10	141944	141953	0 %	20 %	40 %	40 %	134287672
104	NC_009227	CGGGC	2	10	142175	142184	0 %	0 %	60 %	40 %	134287672
105	NC_009227	CTTCG	2	10	144043	144052	0 %	40 %	20 %	40 %	134287674
106	NC_009227	ATGGA	2	10	150499	150508	40 %	20 %	40 %	0 %	134287680
107	NC_009227	CTGGC	2	10	150986	150995	0 %	20 %	40 %	40 %	134287681
108	NC_009227	CGCGC	2	10	153254	153263	0 %	0 %	40 %	60 %	134287684
109	NC_009227	GCACG	2	10	153419	153428	20 %	0 %	40 %	40 %	134287684
110	NC_009227	GGCAT	2	10	154860	154869	20 %	20 %	40 %	20 %	134287685
111	NC_009227	GGCTG	2	10	156891	156900	0 %	20 %	60 %	20 %	134287686
112	NC_009227	TCGAG	2	10	158037	158046	20 %	20 %	40 %	20 %	134287686
113	NC_009227	TGTGG	2	10	161066	161075	0 %	40 %	60 %	0 %	134287690
114	NC_009227	AAGCG	2	10	162571	162580	40 %	0 %	40 %	20 %	134287692
115	NC_009227	GGCGC	2	10	163288	163297	0 %	0 %	60 %	40 %	134287692
116	NC_009227	GCTCA	2	10	164656	164665	20 %	20 %	20 %	40 %	134287694
117	NC_009227	CCGGC	2	10	166859	166868	0 %	0 %	40 %	60 %	134287695
118	NC_009227	CGATG	2	10	167279	167288	20 %	20 %	40 %	20 %	134287695
119	NC_009227	ATTGT	2	10	168794	168803	20 %	60 %	20 %	0 %	134287695
120	NC_009227	CGCTG	2	10	171294	171303	0 %	20 %	40 %	40 %	134287698
121	NC_009227	GGCCG	2	10	171965	171974	0 %	0 %	60 %	40 %	134287698
122	NC_009227	TTCGC	2	10	173001	173010	0 %	40 %	20 %	40 %	134287699
123	NC_009227	GTCGT	2	10	174017	174026	0 %	40 %	40 %	20 %	134287700
124	NC_009227	GATCG	2	10	177514	177523	20 %	20 %	40 %	20 %	134287702
125	NC_009227	GAGGC	2	10	177640	177649	20 %	0 %	60 %	20 %	134287702
126	NC_009227	TCGGC	2	10	180705	180714	0 %	20 %	40 %	40 %	134287706
127	NC_009227	GCTTG	2	10	180969	180978	0 %	40 %	40 %	20 %	134287706
128	NC_009227	AGGTG	2	10	181614	181623	20 %	20 %	60 %	0 %	134287707
129	NC_009227	TGCCC	2	10	182018	182027	0 %	20 %	20 %	60 %	134287707
130	NC_009227	AGCGC	2	10	182271	182280	20 %	0 %	40 %	40 %	134287707
131	NC_009227	ATGCC	2	10	184042	184051	20 %	20 %	20 %	40 %	134287709
132	NC_009227	GCGTT	2	10	185355	185364	0 %	40 %	40 %	20 %	134287710
133	NC_009227	CGGCA	2	10	185881	185890	20 %	0 %	40 %	40 %	134287711
134	NC_009227	CGCAA	2	10	186748	186757	40 %	0 %	20 %	40 %	134287711
135	NC_009227	TGCCA	2	10	187495	187504	20 %	20 %	20 %	40 %	134287712
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167	NC_009227	CGTGG	2	10	239788	239797	0 %	20 %	60 %	20 %	134287767
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174	NC_009227	GCCGC	2	10	255626	255635	0 %	0 %	40 %	60 %	134287783
175	NC_009227	GGCAT	2	10	261099	261108	20 %	20 %	40 %	20 %	134287789
176	NC_009227	ACGGC	2	10	261127	261136	20 %	0 %	40 %	40 %	134287789
177	NC_009227	CCTGA	2	10	261850	261859	20 %	20 %	20 %	40 %	134287791
178	NC_009227	GACGT	2	10	262511	262520	20 %	20 %	40 %	20 %	134287792
179	NC_009227	GCCGC	2	10	263135	263144	0 %	0 %	40 %	60 %	134287792
180	NC_009227	CCGGC	2	10	264364	264373	0 %	0 %	40 %	60 %	134287792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.