MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	GA	3	6	508	513	50 %	0 %	50 %	0 %	134287419
2	NC_009226	GC	3	6	1191	1196	0 %	0 %	50 %	50 %	134287419
3	NC_009226	CT	3	6	1270	1275	0 %	50 %	0 %	50 %	134287419
4	NC_009226	CG	3	6	1418	1423	0 %	0 %	50 %	50 %	134287419
5	NC_009226	CG	3	6	1528	1533	0 %	0 %	50 %	50 %	134287420
6	NC_009226	CG	3	6	1746	1751	0 %	0 %	50 %	50 %	134287420
7	NC_009226	GC	3	6	2288	2293	0 %	0 %	50 %	50 %	134287422
8	NC_009226	CG	3	6	2709	2714	0 %	0 %	50 %	50 %	134287423
9	NC_009226	GC	3	6	2755	2760	0 %	0 %	50 %	50 %	134287423
10	NC_009226	GC	3	6	3521	3526	0 %	0 %	50 %	50 %	134287424
11	NC_009226	GC	3	6	3599	3604	0 %	0 %	50 %	50 %	134287424
12	NC_009226	GC	3	6	3820	3825	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
13	NC_009226	GC	4	8	3882	3889	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
14	NC_009226	CG	3	6	4033	4038	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
15	NC_009226	CG	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
16	NC_009226	CG	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
17	NC_009226	GC	3	6	4688	4693	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
18	NC_009226	GC	3	6	4752	4757	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
19	NC_009226	GC	3	6	5015	5020	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
20	NC_009226	GC	3	6	5202	5207	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
21	NC_009226	GC	3	6	5248	5253	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
22	NC_009226	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	134287427
23	NC_009226	CG	3	6	5977	5982	0 %	0 %	50 %	50 %	134287427
24	NC_009226	TG	3	6	7254	7259	0 %	50 %	50 %	0 %	134287428
25	NC_009226	CG	3	6	7401	7406	0 %	0 %	50 %	50 %	134287428
26	NC_009226	GC	3	6	7829	7834	0 %	0 %	50 %	50 %	134287429
27	NC_009226	TG	3	6	7899	7904	0 %	50 %	50 %	0 %	134287429
28	NC_009226	CG	3	6	8942	8947	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
29	NC_009226	GC	3	6	9019	9024	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
30	NC_009226	GC	3	6	9114	9119	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
31	NC_009226	CG	3	6	9219	9224	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
32	NC_009226	CG	3	6	9831	9836	0 %	0 %	50 %	50 %	134287431
33	NC_009226	GC	3	6	10373	10378	0 %	0 %	50 %	50 %	134287432
34	NC_009226	GC	3	6	10427	10432	0 %	0 %	50 %	50 %	134287432
35	NC_009226	CG	3	6	10656	10661	0 %	0 %	50 %	50 %	134287432
36	NC_009226	CG	3	6	10917	10922	0 %	0 %	50 %	50 %	134287433
37	NC_009226	GC	3	6	10924	10929	0 %	0 %	50 %	50 %	134287433
38	NC_009226	CG	3	6	11181	11186	0 %	0 %	50 %	50 %	134287433
39	NC_009226	CG	3	6	11402	11407	0 %	0 %	50 %	50 %	134287434
40	NC_009226	CG	3	6	11511	11516	0 %	0 %	50 %	50 %	134287434
41	NC_009226	GA	3	6	11543	11548	50 %	0 %	50 %	0 %	134287434
42	NC_009226	GC	3	6	11633	11638	0 %	0 %	50 %	50 %	134287435
43	NC_009226	CG	3	6	11676	11681	0 %	0 %	50 %	50 %	134287435
44	NC_009226	GC	4	8	11739	11746	0 %	0 %	50 %	50 %	134287435
45	NC_009226	CG	3	6	11809	11814	0 %	0 %	50 %	50 %	134287435
46	NC_009226	CG	3	6	12593	12598	0 %	0 %	50 %	50 %	134287436
47	NC_009226	CG	3	6	13255	13260	0 %	0 %	50 %	50 %	134287439
48	NC_009226	CG	3	6	13286	13291	0 %	0 %	50 %	50 %	134287439
49	NC_009226	GC	3	6	13410	13415	0 %	0 %	50 %	50 %	134287439
50	NC_009226	GC	3	6	13467	13472	0 %	0 %	50 %	50 %	134287439
51	NC_009226	GC	3	6	13553	13558	0 %	0 %	50 %	50 %	134287440
52	NC_009226	GC	3	6	14060	14065	0 %	0 %	50 %	50 %	134287441
53	NC_009226	CG	3	6	14137	14142	0 %	0 %	50 %	50 %	134287441
54	NC_009226	GC	3	6	14360	14365	0 %	0 %	50 %	50 %	134287442
55	NC_009226	GC	3	6	15315	15320	0 %	0 %	50 %	50 %	134287443
56	NC_009226	CG	3	6	15331	15336	0 %	0 %	50 %	50 %	134287443
57	NC_009226	CG	3	6	15432	15437	0 %	0 %	50 %	50 %	134287443
58	NC_009226	GC	3	6	15476	15481	0 %	0 %	50 %	50 %	134287443
59	NC_009226	CG	3	6	15873	15878	0 %	0 %	50 %	50 %	134287443
60	NC_009226	CG	3	6	16013	16018	0 %	0 %	50 %	50 %	134287444
61	NC_009226	CG	3	6	16180	16185	0 %	0 %	50 %	50 %	134287444
62	NC_009226	GC	3	6	16360	16365	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
63	NC_009226	CG	3	6	16553	16558	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
64	NC_009226	GC	3	6	16623	16628	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
65	NC_009226	GC	4	8	16674	16681	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
66	NC_009226	CG	4	8	16871	16878	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
67	NC_009226	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	134287447
68	NC_009226	CG	3	6	18003	18008	0 %	0 %	50 %	50 %	134287448
69	NC_009226	GC	3	6	18565	18570	0 %	0 %	50 %	50 %	134287449
70	NC_009226	GC	3	6	18617	18622	0 %	0 %	50 %	50 %	134287449
71	NC_009226	GC	3	6	19225	19230	0 %	0 %	50 %	50 %	134287450
72	NC_009226	GC	3	6	19844	19849	0 %	0 %	50 %	50 %	134287452
73	NC_009226	CG	4	8	19877	19884	0 %	0 %	50 %	50 %	134287452
74	NC_009226	GC	3	6	20163	20168	0 %	0 %	50 %	50 %	134287452
75	NC_009226	GC	3	6	20312	20317	0 %	0 %	50 %	50 %	134287452
76	NC_009226	GC	3	6	20738	20743	0 %	0 %	50 %	50 %	134287453
77	NC_009226	CG	3	6	20744	20749	0 %	0 %	50 %	50 %	134287453
78	NC_009226	CG	3	6	20788	20793	0 %	0 %	50 %	50 %	134287453
79	NC_009226	CG	3	6	20996	21001	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
80	NC_009226	GC	3	6	21151	21156	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
81	NC_009226	GC	4	8	21285	21292	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
82	NC_009226	CG	4	8	21444	21451	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
83	NC_009226	GC	4	8	21522	21529	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
84	NC_009226	GC	3	6	21851	21856	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
85	NC_009226	GC	3	6	22020	22025	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
86	NC_009226	CG	3	6	22047	22052	0 %	0 %	50 %	50 %	134287454
87	NC_009226	CG	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	134287455
88	NC_009226	CG	7	14	22754	22767	0 %	0 %	50 %	50 %	134287455
89	NC_009226	GC	3	6	23205	23210	0 %	0 %	50 %	50 %	134287455
90	NC_009226	GC	3	6	23332	23337	0 %	0 %	50 %	50 %	134287455
91	NC_009226	GC	3	6	23555	23560	0 %	0 %	50 %	50 %	134287456
92	NC_009226	CG	3	6	23738	23743	0 %	0 %	50 %	50 %	134287456
93	NC_009226	CG	4	8	23828	23835	0 %	0 %	50 %	50 %	134287456
94	NC_009226	CG	3	6	23960	23965	0 %	0 %	50 %	50 %	134287456
95	NC_009226	GC	3	6	24285	24290	0 %	0 %	50 %	50 %	134287457
96	NC_009226	GC	3	6	24860	24865	0 %	0 %	50 %	50 %	134287458
97	NC_009226	GC	3	6	24932	24937	0 %	0 %	50 %	50 %	134287458
98	NC_009226	GC	4	8	26117	26124	0 %	0 %	50 %	50 %	134287461
99	NC_009226	AG	3	6	26175	26180	50 %	0 %	50 %	0 %	134287461
100	NC_009226	GC	3	6	26223	26228	0 %	0 %	50 %	50 %	134287461
101	NC_009226	GC	4	8	26973	26980	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
102	NC_009226	GC	3	6	27058	27063	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
103	NC_009226	GC	3	6	27065	27070	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
104	NC_009226	CG	3	6	27508	27513	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
105	NC_009226	CG	3	6	27582	27587	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
106	NC_009226	GC	3	6	27733	27738	0 %	0 %	50 %	50 %	134287463
107	NC_009226	CG	5	10	27954	27963	0 %	0 %	50 %	50 %	134287464
108	NC_009226	TG	3	6	27995	28000	0 %	50 %	50 %	0 %	134287464
109	NC_009226	GC	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	134287464
110	NC_009226	CG	3	6	28074	28079	0 %	0 %	50 %	50 %	134287464
111	NC_009226	CG	5	10	28816	28825	0 %	0 %	50 %	50 %	134287465
112	NC_009226	CG	3	6	29134	29139	0 %	0 %	50 %	50 %	134287466
113	NC_009226	CG	3	6	29185	29190	0 %	0 %	50 %	50 %	134287466
114	NC_009226	GC	4	8	29202	29209	0 %	0 %	50 %	50 %	134287466
115	NC_009226	CG	3	6	29292	29297	0 %	0 %	50 %	50 %	134287466
116	NC_009226	GC	3	6	29483	29488	0 %	0 %	50 %	50 %	134287466
117	NC_009226	CA	3	6	29594	29599	50 %	0 %	0 %	50 %	134287467
118	NC_009226	GC	3	6	29693	29698	0 %	0 %	50 %	50 %	134287467
119	NC_009226	TG	3	6	29757	29762	0 %	50 %	50 %	0 %	134287467
120	NC_009226	CG	4	8	30015	30022	0 %	0 %	50 %	50 %	134287468
121	NC_009226	TC	3	6	30050	30055	0 %	50 %	0 %	50 %	134287468
122	NC_009226	GC	3	6	30212	30217	0 %	0 %	50 %	50 %	134287468
123	NC_009226	GC	3	6	30567	30572	0 %	0 %	50 %	50 %	134287468
124	NC_009226	CT	3	6	30589	30594	0 %	50 %	0 %	50 %	134287468
125	NC_009226	GC	3	6	30990	30995	0 %	0 %	50 %	50 %	134287469
126	NC_009226	GC	3	6	31925	31930	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
127	NC_009226	GC	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
128	NC_009226	GC	3	6	32077	32082	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
129	NC_009226	GC	4	8	32333	32340	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
130	NC_009226	CG	3	6	32398	32403	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
131	NC_009226	CG	3	6	32538	32543	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
132	NC_009226	GC	3	6	32556	32561	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
133	NC_009226	GC	3	6	32871	32876	0 %	0 %	50 %	50 %	134287471
134	NC_009226	GC	3	6	33023	33028	0 %	0 %	50 %	50 %	134287471
135	NC_009226	CG	3	6	33428	33433	0 %	0 %	50 %	50 %	134287472
136	NC_009226	GC	3	6	34029	34034	0 %	0 %	50 %	50 %	134287472
137	NC_009226	GC	3	6	34401	34406	0 %	0 %	50 %	50 %	134287473
138	NC_009226	CG	3	6	34407	34412	0 %	0 %	50 %	50 %	134287473
139	NC_009226	GC	3	6	34603	34608	0 %	0 %	50 %	50 %	134287473
140	NC_009226	GC	3	6	34613	34618	0 %	0 %	50 %	50 %	134287473
141	NC_009226	GC	3	6	35123	35128	0 %	0 %	50 %	50 %	134287473
142	NC_009226	CG	4	8	35370	35377	0 %	0 %	50 %	50 %	134287474
143	NC_009226	CG	4	8	35401	35408	0 %	0 %	50 %	50 %	134287474
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.