MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	TCGG	2	8	325	332	0 %	25 %	50 %	25 %	134287419
2	NC_009226	GGTT	2	8	1375	1382	0 %	50 %	50 %	0 %	134287419
3	NC_009226	ATGA	2	8	2441	2448	50 %	25 %	25 %	0 %	134287422
4	NC_009226	CAAA	2	8	2452	2459	75 %	0 %	0 %	25 %	134287423
5	NC_009226	GCGA	2	8	2558	2565	25 %	0 %	50 %	25 %	134287423
6	NC_009226	TTGG	2	8	2574	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	134287423
7	NC_009226	GCGG	2	8	2769	2776	0 %	0 %	75 %	25 %	134287423
8	NC_009226	ACCG	2	8	2926	2933	25 %	0 %	25 %	50 %	134287423
9	NC_009226	ATCT	2	8	3058	3065	25 %	50 %	0 %	25 %	134287423
10	NC_009226	GACA	2	8	3205	3212	50 %	0 %	25 %	25 %	134287424
11	NC_009226	CCCG	2	8	3249	3256	0 %	0 %	25 %	75 %	134287424
12	NC_009226	CTCG	2	8	3744	3751	0 %	25 %	25 %	50 %	134287424
13	NC_009226	CTTG	2	8	3958	3965	0 %	50 %	25 %	25 %	134287425
14	NC_009226	AAGC	2	8	4533	4540	50 %	0 %	25 %	25 %	134287426
15	NC_009226	GCAG	2	8	4568	4575	25 %	0 %	50 %	25 %	134287426
16	NC_009226	CATT	2	8	5494	5501	25 %	50 %	0 %	25 %	134287426
17	NC_009226	TGCT	2	8	6211	6218	0 %	50 %	25 %	25 %	134287427
18	NC_009226	CGCT	2	8	6970	6977	0 %	25 %	25 %	50 %	134287428
19	NC_009226	CGCA	2	8	7172	7179	25 %	0 %	25 %	50 %	134287428
20	NC_009226	CCGA	2	8	8499	8506	25 %	0 %	25 %	50 %	134287430
21	NC_009226	GCCG	2	8	8614	8621	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
22	NC_009226	GCGG	2	8	8779	8786	0 %	0 %	75 %	25 %	134287430
23	NC_009226	GCTC	2	8	9333	9340	0 %	25 %	25 %	50 %	134287430
24	NC_009226	GCAG	2	8	9695	9702	25 %	0 %	50 %	25 %	134287431
25	NC_009226	GCAG	2	8	9863	9870	25 %	0 %	50 %	25 %	134287431
26	NC_009226	ACGG	2	8	10895	10902	25 %	0 %	50 %	25 %	134287433
27	NC_009226	CCGA	2	8	10964	10971	25 %	0 %	25 %	50 %	134287433
28	NC_009226	CTGC	2	8	10999	11006	0 %	25 %	25 %	50 %	134287433
29	NC_009226	ACGA	2	8	11497	11504	50 %	0 %	25 %	25 %	134287434
30	NC_009226	GATG	2	8	12804	12811	25 %	25 %	50 %	0 %	134287437
31	NC_009226	TGCG	2	8	12985	12992	0 %	25 %	50 %	25 %	134287438
32	NC_009226	TCGA	2	8	13031	13038	25 %	25 %	25 %	25 %	134287438
33	NC_009226	GATG	2	8	13067	13074	25 %	25 %	50 %	0 %	134287438
34	NC_009226	GGGC	2	8	13329	13336	0 %	0 %	75 %	25 %	134287439
35	NC_009226	ATCG	2	8	13342	13349	25 %	25 %	25 %	25 %	134287439
36	NC_009226	GTGG	2	8	13669	13676	0 %	25 %	75 %	0 %	134287440
37	NC_009226	TCCG	2	8	13709	13716	0 %	25 %	25 %	50 %	134287440
38	NC_009226	GGCG	2	8	16216	16223	0 %	0 %	75 %	25 %	134287444
39	NC_009226	CGGC	2	8	16477	16484	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
40	NC_009226	GGTC	2	8	16640	16647	0 %	25 %	50 %	25 %	134287445
41	NC_009226	AGGC	2	8	16725	16732	25 %	0 %	50 %	25 %	134287445
42	NC_009226	CATC	2	8	17074	17081	25 %	25 %	0 %	50 %	134287446
43	NC_009226	TGCG	2	8	18093	18100	0 %	25 %	50 %	25 %	134287448
44	NC_009226	GCGT	2	8	18138	18145	0 %	25 %	50 %	25 %	134287448
45	NC_009226	CTCG	2	8	18257	18264	0 %	25 %	25 %	50 %	134287449
46	NC_009226	CAGC	2	8	18698	18705	25 %	0 %	25 %	50 %	134287449
47	NC_009226	GCAG	2	8	18878	18885	25 %	0 %	50 %	25 %	134287450
48	NC_009226	ATCC	2	8	19343	19350	25 %	25 %	0 %	50 %	134287450
49	NC_009226	GACC	2	8	19384	19391	25 %	0 %	25 %	50 %	134287450
50	NC_009226	GCAC	2	8	19794	19801	25 %	0 %	25 %	50 %	134287452
51	NC_009226	TCCA	2	8	20112	20119	25 %	25 %	0 %	50 %	134287452
52	NC_009226	CAGT	2	8	20359	20366	25 %	25 %	25 %	25 %	134287452
53	NC_009226	TTTC	2	8	21111	21118	0 %	75 %	0 %	25 %	134287454
54	NC_009226	ACGA	2	8	21209	21216	50 %	0 %	25 %	25 %	134287454
55	NC_009226	GCGA	2	8	21262	21269	25 %	0 %	50 %	25 %	134287454
56	NC_009226	CCGC	2	8	21407	21414	0 %	0 %	25 %	75 %	134287454
57	NC_009226	GCCC	2	8	21840	21847	0 %	0 %	25 %	75 %	134287454
58	NC_009226	CTTG	2	8	22335	22342	0 %	50 %	25 %	25 %	134287454
59	NC_009226	GGTC	2	8	22604	22611	0 %	25 %	50 %	25 %	134287455
60	NC_009226	CTCG	2	8	22935	22942	0 %	25 %	25 %	50 %	134287455
61	NC_009226	AGAC	2	8	23027	23034	50 %	0 %	25 %	25 %	134287455
62	NC_009226	CGAC	2	8	23038	23045	25 %	0 %	25 %	50 %	134287455
63	NC_009226	GGAT	2	8	23702	23709	25 %	25 %	50 %	0 %	134287456
64	NC_009226	ACGA	2	8	24042	24049	50 %	0 %	25 %	25 %	134287456
65	NC_009226	CCGC	2	8	24178	24185	0 %	0 %	25 %	75 %	134287457
66	NC_009226	GTCG	2	8	24506	24513	0 %	25 %	50 %	25 %	134287457
67	NC_009226	GTAG	2	8	24902	24909	25 %	25 %	50 %	0 %	134287458
68	NC_009226	CCGG	2	8	25003	25010	0 %	0 %	50 %	50 %	134287458
69	NC_009226	CTTT	2	8	25066	25073	0 %	75 %	0 %	25 %	134287458
70	NC_009226	AGCC	2	8	26352	26359	25 %	0 %	25 %	50 %	134287461
71	NC_009226	GCCA	2	8	26785	26792	25 %	0 %	25 %	50 %	134287463
72	NC_009226	CTCG	2	8	26962	26969	0 %	25 %	25 %	50 %	134287463
73	NC_009226	ACGC	2	8	27024	27031	25 %	0 %	25 %	50 %	134287463
74	NC_009226	CAGT	2	8	27113	27120	25 %	25 %	25 %	25 %	134287463
75	NC_009226	CGGG	2	8	27780	27787	0 %	0 %	75 %	25 %	134287464
76	NC_009226	GCTC	2	8	27919	27926	0 %	25 %	25 %	50 %	134287464
77	NC_009226	GTCG	2	8	28029	28036	0 %	25 %	50 %	25 %	134287464
78	NC_009226	GCGT	2	8	28562	28569	0 %	25 %	50 %	25 %	134287465
79	NC_009226	CTGC	2	8	29053	29060	0 %	25 %	25 %	50 %	134287466
80	NC_009226	GAAA	2	8	29473	29480	75 %	0 %	25 %	0 %	134287466
81	NC_009226	TCGG	2	8	30007	30014	0 %	25 %	50 %	25 %	134287468
82	NC_009226	GCTG	2	8	30487	30494	0 %	25 %	50 %	25 %	134287468
83	NC_009226	AAAG	2	8	30844	30851	75 %	0 %	25 %	0 %	134287469
84	NC_009226	GCAA	2	8	30920	30927	50 %	0 %	25 %	25 %	134287469
85	NC_009226	CCAT	2	8	31031	31038	25 %	25 %	0 %	50 %	134287469
86	NC_009226	CGCT	2	8	31045	31052	0 %	25 %	25 %	50 %	134287469
87	NC_009226	GTGC	2	8	31220	31227	0 %	25 %	50 %	25 %	134287469
88	NC_009226	CACC	2	8	31352	31359	25 %	0 %	0 %	75 %	134287470
89	NC_009226	CGAG	2	8	31451	31458	25 %	0 %	50 %	25 %	134287470
90	NC_009226	CCGG	2	8	31621	31628	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
91	NC_009226	TTCG	2	8	31968	31975	0 %	50 %	25 %	25 %	134287470
92	NC_009226	CCCG	2	8	32700	32707	0 %	0 %	25 %	75 %	134287471
93	NC_009226	CTCG	2	8	32958	32965	0 %	25 %	25 %	50 %	134287471
94	NC_009226	AGTC	2	8	34276	34283	25 %	25 %	25 %	25 %	134287473
95	NC_009226	AGGC	2	8	34813	34820	25 %	0 %	50 %	25 %	134287473
96	NC_009226	TCGT	2	8	34863	34870	0 %	50 %	25 %	25 %	134287473
97	NC_009226	TTCG	2	8	34952	34959	0 %	50 %	25 %	25 %	134287473
98	NC_009226	GAGC	2	8	35422	35429	25 %	0 %	50 %	25 %	134287474
99	NC_009226	GGTC	2	8	35721	35728	0 %	25 %	50 %	25 %	134287474
100	NC_009226	ACGC	2	8	36125	36132	25 %	0 %	25 %	50 %	134287474
101	NC_009226	CGTC	2	8	36694	36701	0 %	25 %	25 %	50 %	134287476
102	NC_009226	CCGC	2	8	36766	36773	0 %	0 %	25 %	75 %	134287476
103	NC_009226	AACA	2	8	36963	36970	75 %	0 %	0 %	25 %	134287476
104	NC_009226	CGGG	2	8	38189	38196	0 %	0 %	75 %	25 %	134287477
105	NC_009226	CCGC	2	8	38736	38743	0 %	0 %	25 %	75 %	134287478
106	NC_009226	CTCG	2	8	39999	40006	0 %	25 %	25 %	50 %	134287480
107	NC_009226	AGAA	2	8	40944	40951	75 %	0 %	25 %	0 %	134287480
108	NC_009226	CGCA	2	8	41002	41009	25 %	0 %	25 %	50 %	134287480
109	NC_009226	CGAG	2	8	41146	41153	25 %	0 %	50 %	25 %	134287480
110	NC_009226	GGCA	2	8	41456	41463	25 %	0 %	50 %	25 %	134287481
111	NC_009226	GATG	2	8	41871	41878	25 %	25 %	50 %	0 %	134287482
112	NC_009226	CGCC	2	8	42038	42045	0 %	0 %	25 %	75 %	134287482
113	NC_009226	CTCA	2	8	42166	42173	25 %	25 %	0 %	50 %	134287482
114	NC_009226	GGCA	2	8	42323	42330	25 %	0 %	50 %	25 %	134287483
115	NC_009226	GTCG	2	8	42482	42489	0 %	25 %	50 %	25 %	134287483
116	NC_009226	CTGC	2	8	42913	42920	0 %	25 %	25 %	50 %	134287484
117	NC_009226	CGAC	2	8	43162	43169	25 %	0 %	25 %	50 %	134287484
118	NC_009226	CGCC	2	8	43976	43983	0 %	0 %	25 %	75 %	134287486
119	NC_009226	TCGG	2	8	44143	44150	0 %	25 %	50 %	25 %	134287486
120	NC_009226	TCGC	2	8	44410	44417	0 %	25 %	25 %	50 %	134287486
121	NC_009226	CCGT	2	8	45264	45271	0 %	25 %	25 %	50 %	134287487
122	NC_009226	GTGC	2	8	46391	46398	0 %	25 %	50 %	25 %	134287489
123	NC_009226	GCAC	3	12	47076	47087	25 %	0 %	25 %	50 %	134287489
124	NC_009226	GCTT	2	8	48112	48119	0 %	50 %	25 %	25 %	134287490
125	NC_009226	CGTG	2	8	48133	48140	0 %	25 %	50 %	25 %	134287490
126	NC_009226	TTCG	2	8	48257	48264	0 %	50 %	25 %	25 %	134287490
127	NC_009226	TTCG	2	8	48993	49000	0 %	50 %	25 %	25 %	134287491
128	NC_009226	AGCG	2	8	50123	50130	25 %	0 %	50 %	25 %	134287492
129	NC_009226	CAGT	2	8	50951	50958	25 %	25 %	25 %	25 %	134287493
130	NC_009226	GCTC	2	8	51069	51076	0 %	25 %	25 %	50 %	134287493
131	NC_009226	CATT	2	8	51231	51238	25 %	50 %	0 %	25 %	134287493
132	NC_009226	GAGC	2	8	51432	51439	25 %	0 %	50 %	25 %	134287494
133	NC_009226	CGAC	2	8	51518	51525	25 %	0 %	25 %	50 %	134287494
134	NC_009226	GCTT	2	8	52803	52810	0 %	50 %	25 %	25 %	134287496
135	NC_009226	GCCC	2	8	53076	53083	0 %	0 %	25 %	75 %	134287497
136	NC_009226	CGCC	2	8	53220	53227	0 %	0 %	25 %	75 %	134287497
137	NC_009226	CGCC	2	8	53766	53773	0 %	0 %	25 %	75 %	134287498
138	NC_009226	GCGG	2	8	54287	54294	0 %	0 %	75 %	25 %	134287499
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140	NC_009226	TTGC	2	8	55060	55067	0 %	50 %	25 %	25 %	134287499
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.