MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 3695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	CAAAT	2	10	1321	1330	60 %	20 %	0 %	20 %	118475779
2	NC_008600	TTCAA	2	10	1935	1944	40 %	40 %	0 %	20 %	118475780
3	NC_008600	AATTT	2	10	2261	2270	40 %	60 %	0 %	0 %	118475780
4	NC_008600	ATTGA	2	10	4316	4325	40 %	40 %	20 %	0 %	118475782
5	NC_008600	AGCAA	2	10	5895	5904	60 %	0 %	20 %	20 %	118475783
6	NC_008600	ATTCT	2	10	8267	8276	20 %	60 %	0 %	20 %	118475784
7	NC_008600	TTGAA	2	10	15151	15160	40 %	40 %	20 %	0 %	118475785
8	NC_008600	TGAAA	2	10	17961	17970	60 %	20 %	20 %	0 %	118475787
9	NC_008600	GTCAA	2	10	19017	19026	40 %	20 %	20 %	20 %	118475788
10	NC_008600	TTTTA	2	10	21933	21942	20 %	80 %	0 %	0 %	118475791
11	NC_008600	AAGTA	2	10	22277	22286	60 %	20 %	20 %	0 %	118475791
12	NC_008600	AGATG	2	10	26322	26331	40 %	20 %	40 %	0 %	118475796
13	NC_008600	AAAAG	2	10	35396	35405	80 %	0 %	20 %	0 %	118475801
14	NC_008600	AAGAC	2	10	35692	35701	60 %	0 %	20 %	20 %	118475801
15	NC_008600	GTGAA	2	10	36440	36449	40 %	20 %	40 %	0 %	118475802
16	NC_008600	GTATT	2	10	36530	36539	20 %	60 %	20 %	0 %	118475802
17	NC_008600	AATGA	2	10	42207	42216	60 %	20 %	20 %	0 %	118475810
18	NC_008600	ATCGT	2	10	45400	45409	20 %	40 %	20 %	20 %	118475813
19	NC_008600	ATTAG	2	10	46388	46397	40 %	40 %	20 %	0 %	118475814
20	NC_008600	AAGTG	2	10	46561	46570	40 %	20 %	40 %	0 %	118475814
21	NC_008600	AAGAC	2	10	48169	48178	60 %	0 %	20 %	20 %	118475816
22	NC_008600	CATCT	2	10	55490	55499	20 %	40 %	0 %	40 %	118475824
23	NC_008600	CAAAA	2	10	56262	56271	80 %	0 %	0 %	20 %	118475824
24	NC_008600	TGCGA	2	10	57438	57447	20 %	20 %	40 %	20 %	118475824
25	NC_008600	GATTT	2	10	57515	57524	20 %	60 %	20 %	0 %	118475824
26	NC_008600	TGCTA	2	10	59537	59546	20 %	40 %	20 %	20 %	118475826
27	NC_008600	AAGGT	2	10	59928	59937	40 %	20 %	40 %	0 %	118475826
28	NC_008600	TATTT	2	10	60068	60077	20 %	80 %	0 %	0 %	118475826
29	NC_008600	TTGGA	2	10	62749	62758	20 %	40 %	40 %	0 %	118475830
30	NC_008600	AAAGA	2	10	63583	63592	80 %	0 %	20 %	0 %	118475831
31	NC_008600	TTATG	2	10	65069	65078	20 %	60 %	20 %	0 %	118475833
32	NC_008600	TTCCA	2	10	65233	65242	20 %	40 %	0 %	40 %	118475833
33	NC_008600	AATGA	2	10	68980	68989	60 %	20 %	20 %	0 %	118475834
34	NC_008600	CGTTA	2	10	69360	69369	20 %	40 %	20 %	20 %	118475835
35	NC_008600	GATTA	2	10	69455	69464	40 %	40 %	20 %	0 %	118475835
36	NC_008600	GAAAA	2	10	70076	70085	80 %	0 %	20 %	0 %	118475836
37	NC_008600	GAACA	2	10	72830	72839	60 %	0 %	20 %	20 %	118475838
38	NC_008600	GAAAA	2	10	75214	75223	80 %	0 %	20 %	0 %	118475840
39	NC_008600	GACAA	2	10	75321	75330	60 %	0 %	20 %	20 %	118475840
40	NC_008600	AGAGC	2	10	75574	75583	40 %	0 %	40 %	20 %	118475840
41	NC_008600	ATTTA	2	10	76097	76106	40 %	60 %	0 %	0 %	118475841
42	NC_008600	AAAAC	2	10	79117	79126	80 %	0 %	0 %	20 %	118475845
43	NC_008600	AAATA	2	10	79763	79772	80 %	20 %	0 %	0 %	118475847
44	NC_008600	GTATG	2	10	81938	81947	20 %	40 %	40 %	0 %	118475848
45	NC_008600	TGTTA	2	10	81986	81995	20 %	60 %	20 %	0 %	118475848
46	NC_008600	GAACA	2	10	95502	95511	60 %	0 %	20 %	20 %	118475852
47	NC_008600	GAACA	2	10	95724	95733	60 %	0 %	20 %	20 %	118475852
48	NC_008600	TGAAG	2	10	96664	96673	40 %	20 %	40 %	0 %	118475852
49	NC_008600	AGAAA	2	10	96686	96695	80 %	0 %	20 %	0 %	118475852
50	NC_008600	GAAAA	2	10	96810	96819	80 %	0 %	20 %	0 %	118475852
51	NC_008600	AATTG	2	10	97630	97639	40 %	40 %	20 %	0 %	118475852
52	NC_008600	TGAAA	2	10	98746	98755	60 %	20 %	20 %	0 %	118475853
53	NC_008600	CGTAA	2	10	99710	99719	40 %	20 %	20 %	20 %	118475854
54	NC_008600	TACGT	2	10	101787	101796	20 %	40 %	20 %	20 %	118475856
55	NC_008600	CATTC	2	10	103573	103582	20 %	40 %	0 %	40 %	118475858
56	NC_008600	GAAAA	2	10	104461	104470	80 %	0 %	20 %	0 %	118475858
57	NC_008600	AAAAG	2	10	108560	108569	80 %	0 %	20 %	0 %	118475863
58	NC_008600	GATTG	2	10	108909	108918	20 %	40 %	40 %	0 %	118475864
59	NC_008600	GAAAA	2	10	110157	110166	80 %	0 %	20 %	0 %	118475865
60	NC_008600	AAAGA	2	10	113204	113213	80 %	0 %	20 %	0 %	118475870
61	NC_008600	AGAAA	2	10	113777	113786	80 %	0 %	20 %	0 %	118475870
62	NC_008600	AATCA	2	10	119972	119981	60 %	20 %	0 %	20 %	118475872
63	NC_008600	AACAT	2	10	121563	121572	60 %	20 %	0 %	20 %	118475873
64	NC_008600	ACGTG	2	10	122253	122262	20 %	20 %	40 %	20 %	118475875
65	NC_008600	TCGTA	2	10	123291	123300	20 %	40 %	20 %	20 %	118475876
66	NC_008600	TGGTA	2	10	130377	130386	20 %	40 %	40 %	0 %	118475885
67	NC_008600	GTGCG	2	10	137617	137626	0 %	20 %	60 %	20 %	118475900
68	NC_008600	GAAAT	2	10	142242	142251	60 %	20 %	20 %	0 %	118475907
69	NC_008600	TTATT	2	10	144415	144424	20 %	80 %	0 %	0 %	118475910
70	NC_008600	GAGCA	2	10	145256	145265	40 %	0 %	40 %	20 %	118475911
71	NC_008600	GGGCT	2	10	147227	147236	0 %	20 %	60 %	20 %	118475914
72	NC_008600	AAAAC	2	10	161254	161263	80 %	0 %	0 %	20 %	118475922
73	NC_008600	ATTAC	2	10	162762	162771	40 %	40 %	0 %	20 %	118475923
74	NC_008600	ATTGA	2	10	164202	164211	40 %	40 %	20 %	0 %	118475924
75	NC_008600	ACAGC	2	10	164799	164808	40 %	0 %	20 %	40 %	118475924
76	NC_008600	CGTAG	2	10	164994	165003	20 %	20 %	40 %	20 %	118475924
77	NC_008600	CAACA	2	10	166509	166518	60 %	0 %	0 %	40 %	118475926
78	NC_008600	TTTCA	2	10	166571	166580	20 %	60 %	0 %	20 %	118475926
79	NC_008600	AAAAT	2	10	167038	167047	80 %	20 %	0 %	0 %	118475927
80	NC_008600	TAAAT	2	10	169343	169352	60 %	40 %	0 %	0 %	118475929
81	NC_008600	AGCGC	2	10	172226	172235	20 %	0 %	40 %	40 %	118475930
82	NC_008600	GAAGC	2	10	174847	174856	40 %	0 %	40 %	20 %	118475932
83	NC_008600	TGTTT	2	10	180142	180151	0 %	80 %	20 %	0 %	118475938
84	NC_008600	ATTTT	2	10	182024	182033	20 %	80 %	0 %	0 %	118475940
85	NC_008600	AGAAT	2	10	182667	182676	60 %	20 %	20 %	0 %	118475941
86	NC_008600	CCGCT	2	10	183994	184003	0 %	20 %	20 %	60 %	118475942
87	NC_008600	AAAAG	2	10	185476	185485	80 %	0 %	20 %	0 %	118475944
88	NC_008600	AGAGA	2	10	186782	186791	60 %	0 %	40 %	0 %	118475945
89	NC_008600	ACGTA	2	10	187324	187333	40 %	20 %	20 %	20 %	118475945
90	NC_008600	GTGAA	2	10	189176	189185	40 %	20 %	40 %	0 %	118475947
91	NC_008600	AAAGG	2	10	189196	189205	60 %	0 %	40 %	0 %	118475947
92	NC_008600	TTACT	2	10	189387	189396	20 %	60 %	0 %	20 %	118475947
93	NC_008600	AAAAG	2	10	191846	191855	80 %	0 %	20 %	0 %	118475949
94	NC_008600	TTTTA	2	10	193212	193221	20 %	80 %	0 %	0 %	118475950
95	NC_008600	TGGCA	2	10	194278	194287	20 %	20 %	40 %	20 %	118475951
96	NC_008600	TCAAT	2	10	194862	194871	40 %	40 %	0 %	20 %	118475952
97	NC_008600	ATGGG	2	10	197778	197787	20 %	20 %	60 %	0 %	118475954
98	NC_008600	TATTT	2	10	198104	198113	20 %	80 %	0 %	0 %	118475955
99	NC_008600	CTAAA	2	10	198405	198414	60 %	20 %	0 %	20 %	118475955
100	NC_008600	ATAGT	2	10	198555	198564	40 %	40 %	20 %	0 %	118475955
101	NC_008600	TGCAA	2	10	198976	198985	40 %	20 %	20 %	20 %	118475956
102	NC_008600	GCAAA	2	10	200927	200936	60 %	0 %	20 %	20 %	118475958
103	NC_008600	TATTG	2	10	201607	201616	20 %	60 %	20 %	0 %	118475958
104	NC_008600	ATAAA	2	10	201694	201703	80 %	20 %	0 %	0 %	118475958
105	NC_008600	TAAAT	2	10	202739	202748	60 %	40 %	0 %	0 %	118475959
106	NC_008600	TTTGT	2	10	204493	204502	0 %	80 %	20 %	0 %	118475960
107	NC_008600	ATGTT	2	10	206083	206092	20 %	60 %	20 %	0 %	118475961
108	NC_008600	CGTTT	2	10	208395	208404	0 %	60 %	20 %	20 %	118475964
109	NC_008600	TAATT	2	10	213398	213407	40 %	60 %	0 %	0 %	118475969
110	NC_008600	AATCA	2	10	215692	215701	60 %	20 %	0 %	20 %	118475971
111	NC_008600	GTTAA	2	10	218497	218506	40 %	40 %	20 %	0 %	118475973
112	NC_008600	ATCTT	2	10	219972	219981	20 %	60 %	0 %	20 %	118475975
113	NC_008600	AAGAA	2	10	220133	220142	80 %	0 %	20 %	0 %	118475975
114	NC_008600	GAAGA	2	10	221124	221133	60 %	0 %	40 %	0 %	118475976
115	NC_008600	TGTTA	2	10	223760	223769	20 %	60 %	20 %	0 %	118475977
116	NC_008600	TGGAA	2	10	226610	226619	40 %	20 %	40 %	0 %	118475981
117	NC_008600	AACGG	2	10	227085	227094	40 %	0 %	40 %	20 %	118475981
118	NC_008600	TTTTA	2	10	227767	227776	20 %	80 %	0 %	0 %	118475981
119	NC_008600	AAAAG	2	10	229402	229411	80 %	0 %	20 %	0 %	118475982
120	NC_008600	TGGAT	2	10	229724	229733	20 %	40 %	40 %	0 %	118475982
121	NC_008600	TTATT	2	10	230848	230857	20 %	80 %	0 %	0 %	118475982
122	NC_008600	AATTA	2	10	231521	231530	60 %	40 %	0 %	0 %	118475983
123	NC_008600	ATTAC	2	10	231804	231813	40 %	40 %	0 %	20 %	118475983
124	NC_008600	GTAGT	2	10	233165	233174	20 %	40 %	40 %	0 %	118475985
125	NC_008600	TATTC	2	10	233785	233794	20 %	60 %	0 %	20 %	118475985
126	NC_008600	CATAT	2	10	234391	234400	40 %	40 %	0 %	20 %	118475986
127	NC_008600	GTGAT	2	10	239253	239262	20 %	40 %	40 %	0 %	118475989
128	NC_008600	GTACT	2	10	240324	240333	20 %	40 %	20 %	20 %	118475990
129	NC_008600	AATGA	2	10	243069	243078	60 %	20 %	20 %	0 %	118475992
130	NC_008600	GTTGT	2	10	243138	243147	0 %	60 %	40 %	0 %	118475992
131	NC_008600	TCGTT	2	10	243557	243566	0 %	60 %	20 %	20 %	118475992
132	NC_008600	AAATT	2	10	243998	244007	60 %	40 %	0 %	0 %	118475993
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134	NC_008600	AAGAA	2	10	247486	247495	80 %	0 %	20 %	0 %	118475995
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