MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 102206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008600	GCT	2	6	118188	118193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2002	NC_008600	AAG	2	6	118243	118248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2003	NC_008600	CTT	2	6	118253	118258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475872
2004	NC_008600	AGA	2	6	118262	118267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2005	NC_008600	GAT	2	6	118361	118366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2006	NC_008600	CCA	2	6	118389	118394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118475872
2007	NC_008600	TGG	2	6	118421	118426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475872
2008	NC_008600	CGT	2	6	118461	118466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2009	NC_008600	AAC	2	6	118479	118484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2010	NC_008600	AAG	2	6	118552	118557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2011	NC_008600	GTC	2	6	118582	118587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2012	NC_008600	TTA	2	6	118677	118682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475872
2013	NC_008600	ACT	2	6	118696	118701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475872
2014	NC_008600	AGTT	2	8	118804	118811	25 %	50 %	25 %	0 %	118475872
2015	NC_008600	CA	3	6	118825	118830	50 %	0 %	0 %	50 %	118475872
2016	NC_008600	TAG	2	6	118975	118980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2017	NC_008600	TGTA	2	8	119009	119016	25 %	50 %	25 %	0 %	118475872
2018	NC_008600	ATC	2	6	119069	119074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475872
2019	NC_008600	TCT	2	6	119096	119101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475872
2020	NC_008600	GTT	2	6	119148	119153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475872
2021	NC_008600	ACT	3	9	119182	119190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475872
2022	NC_008600	CGAA	2	8	119242	119249	50 %	0 %	25 %	25 %	118475872
2023	NC_008600	AAC	2	6	119319	119324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2024	NC_008600	AAC	2	6	119363	119368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2025	NC_008600	CAA	2	6	119428	119433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2026	NC_008600	ATT	2	6	119499	119504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475872
2027	NC_008600	GAA	2	6	119514	119519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2028	NC_008600	CAT	2	6	119552	119557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475872
2029	NC_008600	GAA	3	9	119766	119774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2030	NC_008600	TGA	2	6	119833	119838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2031	NC_008600	ATG	2	6	119868	119873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2032	NC_008600	ATC	2	6	119958	119963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475872
2033	NC_008600	AATCA	2	10	119972	119981	60 %	20 %	0 %	20 %	118475872
2034	NC_008600	CGT	2	6	120090	120095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2035	NC_008600	TTG	2	6	120097	120102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475872
2036	NC_008600	TCGT	2	8	120121	120128	0 %	50 %	25 %	25 %	118475872
2037	NC_008600	GAT	2	6	120132	120137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2038	NC_008600	TTA	2	6	120156	120161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475872
2039	NC_008600	TTG	2	6	120214	120219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475872
2040	NC_008600	AATT	2	8	120283	120290	50 %	50 %	0 %	0 %	118475872
2041	NC_008600	TTG	2	6	120310	120315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475872
2042	NC_008600	AAG	2	6	120384	120389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2043	NC_008600	GGTA	2	8	120440	120447	25 %	25 %	50 %	0 %	118475872
2044	NC_008600	GAT	2	6	120525	120530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475872
2045	NC_008600	AAG	2	6	120649	120654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475872
2046	NC_008600	CGTA	2	8	120681	120688	25 %	25 %	25 %	25 %	118475872
2047	NC_008600	TTA	2	6	120822	120827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475872
2048	NC_008600	GTGA	2	8	120921	120928	25 %	25 %	50 %	0 %	118475872
2049	NC_008600	ATGCGA	2	12	120985	120996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475872
2050	NC_008600	AAC	2	6	121015	121020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2051	NC_008600	ATTC	2	8	121075	121082	25 %	50 %	0 %	25 %	118475872
2052	NC_008600	GCA	2	6	121089	121094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2053	NC_008600	AAC	2	6	121106	121111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475872
2054	NC_008600	GAAA	2	8	121166	121173	75 %	0 %	25 %	0 %	118475872
2055	NC_008600	TTA	2	6	121177	121182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475872
2056	NC_008600	CTG	2	6	121198	121203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475872
2057	NC_008600	GGA	2	6	121399	121404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475873
2058	NC_008600	AAG	2	6	121497	121502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475873
2059	NC_008600	AGA	2	6	121513	121518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475873
2060	NC_008600	AACAT	2	10	121563	121572	60 %	20 %	0 %	20 %	118475873
2061	NC_008600	AAT	2	6	121648	121653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475873
2062	NC_008600	CTA	2	6	121779	121784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162382788
2063	NC_008600	A	6	6	121871	121876	100 %	0 %	0 %	0 %	162382788
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2065	NC_008600	GTA	2	6	122048	122053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162382788
2066	NC_008600	GGT	2	6	122063	122068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162382788
2067	NC_008600	TCGT	2	8	122103	122110	0 %	50 %	25 %	25 %	162382788
2068	NC_008600	ATA	2	6	122194	122199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162382788
2069	NC_008600	ACGTG	2	10	122253	122262	20 %	20 %	40 %	20 %	118475875
2070	NC_008600	CAA	2	6	122307	122312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475875
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2072	NC_008600	A	6	6	122329	122334	100 %	0 %	0 %	0 %	118475875
2073	NC_008600	TCG	2	6	122457	122462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475875
2074	NC_008600	TGG	2	6	122466	122471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475875
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2077	NC_008600	AAC	2	6	122611	122616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475875
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2079	NC_008600	AG	3	6	122911	122916	50 %	0 %	50 %	0 %	118475876
2080	NC_008600	ACA	2	6	122974	122979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475876
2081	NC_008600	TAC	2	6	122998	123003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
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2083	NC_008600	GCAAGA	2	12	123066	123077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475876
2084	NC_008600	CTG	2	6	123098	123103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475876
2085	NC_008600	CAT	2	6	123138	123143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
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2087	NC_008600	GCAGTA	2	12	123208	123219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475876
2088	NC_008600	CTA	2	6	123272	123277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
2089	NC_008600	TCGTA	2	10	123291	123300	20 %	40 %	20 %	20 %	118475876
2090	NC_008600	TTG	2	6	123437	123442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475876
2091	NC_008600	GAA	2	6	123526	123531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475876
2092	NC_008600	TGA	2	6	123567	123572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2093	NC_008600	ATG	3	9	123577	123585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2094	NC_008600	GAA	2	6	123601	123606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475876
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2100	NC_008600	TGAC	2	8	123851	123858	25 %	25 %	25 %	25 %	118475876
2101	NC_008600	TTC	2	6	123880	123885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475876
2102	NC_008600	GT	3	6	123887	123892	0 %	50 %	50 %	0 %	118475876
2103	NC_008600	GT	3	6	123899	123904	0 %	50 %	50 %	0 %	118475876
2104	NC_008600	AGCGTG	2	12	123944	123955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475876
2105	NC_008600	GCT	3	9	124024	124032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475876
2106	NC_008600	TAC	3	9	124047	124055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
2107	NC_008600	GAA	2	6	124195	124200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475876
2108	NC_008600	ATC	2	6	124246	124251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
2109	NC_008600	ATC	2	6	124279	124284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475876
2110	NC_008600	CTC	2	6	124331	124336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118475876
2111	NC_008600	GCT	2	6	124363	124368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475876
2112	NC_008600	TGG	2	6	124401	124406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475876
2113	NC_008600	GAA	2	6	124450	124455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475876
2114	NC_008600	ATTCGA	2	12	124464	124475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475876
2115	NC_008600	TCG	2	6	124484	124489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475876
2116	NC_008600	GTG	2	6	124490	124495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475876
2117	NC_008600	AGT	2	6	124575	124580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2118	NC_008600	ATG	2	6	124616	124621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2119	NC_008600	ATG	2	6	124711	124716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2120	NC_008600	AAGTTG	2	12	124718	124729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
2121	NC_008600	TCG	2	6	124776	124781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475876
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2482	NC_008600	AATT	2	8	144522	144529	50 %	50 %	0 %	0 %	118475910
2483	NC_008600	TA	3	6	144555	144560	50 %	50 %	0 %	0 %	118475910
2484	NC_008600	ATT	2	6	144572	144577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475910
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